MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 8493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020050	TAAA	2	8	200658	200665	75 %	25 %	0 %	0 %	436670117
4002	NC_020050	TCT	2	6	200721	200726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670117
4003	NC_020050	GAA	2	6	200756	200761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670117
4004	NC_020050	TAA	2	6	200828	200833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670118
4005	NC_020050	TTA	2	6	200900	200905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670118
4006	NC_020050	TCT	2	6	200915	200920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670118
4007	NC_020050	A	6	6	200939	200944	100 %	0 %	0 %	0 %	436670118
4008	NC_020050	CTTT	2	8	200945	200952	0 %	75 %	0 %	25 %	436670118
4009	NC_020050	TAA	2	6	200967	200972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670118
4010	NC_020050	CAG	2	6	201036	201041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670118
4011	NC_020050	TTGT	2	8	201082	201089	0 %	75 %	25 %	0 %	436670118
4012	NC_020050	CAG	2	6	201117	201122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670118
4013	NC_020050	GCCA	2	8	201125	201132	25 %	0 %	25 %	50 %	436670118
4014	NC_020050	ATA	2	6	201166	201171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670118
4015	NC_020050	ATAGGC	2	12	201205	201216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436670118
4016	NC_020050	AGT	2	6	201294	201299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670118
4017	NC_020050	TGT	2	6	201481	201486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670118
4018	NC_020050	TCA	2	6	201576	201581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670118
4019	NC_020050	T	7	7	201588	201594	0 %	100 %	0 %	0 %	436670118
4020	NC_020050	AGC	2	6	201682	201687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670118
4021	NC_020050	AGG	2	6	201688	201693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670118
4022	NC_020050	CAAA	2	8	201714	201721	75 %	0 %	0 %	25 %	436670118
4023	NC_020050	CAA	2	6	201724	201729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670118
4024	NC_020050	ATT	2	6	201776	201781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670118
4025	NC_020050	GCA	2	6	201816	201821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670118
4026	NC_020050	CAT	2	6	201823	201828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670118
4027	NC_020050	CCA	2	6	201894	201899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670118
4028	NC_020050	TG	3	6	201967	201972	0 %	50 %	50 %	0 %	436670118
4029	NC_020050	TAA	2	6	202119	202124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670118
4030	NC_020050	CGGTTG	2	12	202283	202294	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436670118
4031	NC_020050	T	6	6	202297	202302	0 %	100 %	0 %	0 %	436670118
4032	NC_020050	TGT	2	6	202346	202351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670118
4033	NC_020050	AATT	2	8	202674	202681	50 %	50 %	0 %	0 %	436670118
4034	NC_020050	CGA	2	6	202738	202743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670118
4035	NC_020050	GTT	2	6	202760	202765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670118
4036	NC_020050	A	6	6	202782	202787	100 %	0 %	0 %	0 %	436670118
4037	NC_020050	T	6	6	202839	202844	0 %	100 %	0 %	0 %	436670118
4038	NC_020050	TTA	2	6	202883	202888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670118
4039	NC_020050	TA	3	6	202893	202898	50 %	50 %	0 %	0 %	436670118
4040	NC_020050	GTT	2	6	202923	202928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670118
4041	NC_020050	ATT	2	6	202934	202939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670118
4042	NC_020050	TCT	2	6	202997	203002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670118
4043	NC_020050	AATT	2	8	203031	203038	50 %	50 %	0 %	0 %	436670118
4044	NC_020050	CTGCG	2	10	203074	203083	0 %	20 %	40 %	40 %	436670118
4045	NC_020050	TGG	2	6	203095	203100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670118
4046	NC_020050	TCT	2	6	203117	203122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670118
4047	NC_020050	TGTT	2	8	203202	203209	0 %	75 %	25 %	0 %	436670118
4048	NC_020050	TGA	2	6	203211	203216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670118
4049	NC_020050	A	6	6	203218	203223	100 %	0 %	0 %	0 %	436670118
4050	NC_020050	TAAT	2	8	203270	203277	50 %	50 %	0 %	0 %	436670118
4051	NC_020050	TCA	2	6	203318	203323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670118
4052	NC_020050	T	6	6	203417	203422	0 %	100 %	0 %	0 %	436670118
4053	NC_020050	CTCC	2	8	203423	203430	0 %	25 %	0 %	75 %	436670118
4054	NC_020050	TAG	2	6	203485	203490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670118
4055	NC_020050	GAC	2	6	203502	203507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670118
4056	NC_020050	T	6	6	203541	203546	0 %	100 %	0 %	0 %	436670118
4057	NC_020050	TTGAA	2	10	203560	203569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_020050	TTG	2	6	203592	203597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_020050	TAC	2	6	203677	203682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_020050	GGC	2	6	203888	203893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670119
4061	NC_020050	TCA	2	6	203932	203937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670119
4062	NC_020050	A	7	7	203957	203963	100 %	0 %	0 %	0 %	436670119
4063	NC_020050	GAT	2	6	204174	204179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670120
4064	NC_020050	TGT	2	6	204206	204211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670120
4065	NC_020050	ACT	2	6	204244	204249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670120
4066	NC_020050	AGC	2	6	204279	204284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670120
4067	NC_020050	GAG	2	6	204310	204315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670120
4068	NC_020050	CTC	2	6	204350	204355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670120
4069	NC_020050	TGC	2	6	204414	204419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670120
4070	NC_020050	GCA	2	6	204525	204530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670120
4071	NC_020050	AAG	2	6	204556	204561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670120
4072	NC_020050	TTA	2	6	204650	204655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670120
4073	NC_020050	TGC	2	6	204729	204734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670120
4074	NC_020050	GTG	2	6	204737	204742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670120
4075	NC_020050	TGA	2	6	204750	204755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670120
4076	NC_020050	AGTT	2	8	204800	204807	25 %	50 %	25 %	0 %	436670120
4077	NC_020050	TGCTG	2	10	204843	204852	0 %	40 %	40 %	20 %	436670120
4078	NC_020050	AGA	2	6	204959	204964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670120
4079	NC_020050	GAC	2	6	204981	204986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670120
4080	NC_020050	AGC	2	6	204987	204992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670120
4081	NC_020050	TTCA	2	8	205009	205016	25 %	50 %	0 %	25 %	436670120
4082	NC_020050	TGG	2	6	205082	205087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670120
4083	NC_020050	GAT	2	6	205099	205104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670120
4084	NC_020050	CGC	2	6	205108	205113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436670120
4085	NC_020050	TGA	2	6	205151	205156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670120
4086	NC_020050	TTG	2	6	205157	205162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670120
4087	NC_020050	ATT	2	6	205195	205200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670120
4088	NC_020050	AAG	2	6	205430	205435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670120
4089	NC_020050	TCA	2	6	205526	205531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670120
4090	NC_020050	ATT	2	6	205627	205632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670120
4091	NC_020050	AAC	2	6	205652	205657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670120
4092	NC_020050	AC	3	6	205685	205690	50 %	0 %	0 %	50 %	436670120
4093	NC_020050	TTGCCA	2	12	205786	205797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	436670120
4094	NC_020050	TAG	3	9	205827	205835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670120
4095	NC_020050	TTG	2	6	205929	205934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_020050	TGCT	2	8	205968	205975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_020050	T	7	7	205992	205998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_020050	TGC	2	6	206143	206148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670121
4099	NC_020050	ACCT	2	8	206182	206189	25 %	25 %	0 %	50 %	436670121
4100	NC_020050	GCA	2	6	206199	206204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670121
4101	NC_020050	AAT	2	6	206353	206358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670121
4102	NC_020050	TTC	2	6	206377	206382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670121
4103	NC_020050	TAA	2	6	206400	206405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670121
4104	NC_020050	CAG	2	6	206427	206432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670121
4105	NC_020050	CTG	2	6	206523	206528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670121
4106	NC_020050	AGT	2	6	206587	206592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670121
4107	NC_020050	ATA	2	6	206616	206621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670121
4108	NC_020050	TCT	2	6	206636	206641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670121
4109	NC_020050	CAA	2	6	206712	206717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670121
4110	NC_020050	A	7	7	206877	206883	100 %	0 %	0 %	0 %	436670121
4111	NC_020050	GCT	2	6	206997	207002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670121
4112	NC_020050	TCA	2	6	207053	207058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670121
4113	NC_020050	ACA	2	6	207066	207071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670121
4114	NC_020050	AAC	2	6	207136	207141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670121
4115	NC_020050	ACG	2	6	207163	207168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670121
4116	NC_020050	AAT	2	6	207203	207208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670121
4117	NC_020050	AT	3	6	207267	207272	50 %	50 %	0 %	0 %	436670121
4118	NC_020050	GTAA	2	8	207304	207311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020050	T	8	8	207330	207337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020050	TC	3	6	207340	207345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_020050	A	6	6	207369	207374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020050	TAAT	2	8	207379	207386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020050	TAAT	2	8	207393	207400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_020050	TCAA	2	8	207403	207410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_020050	AT	4	8	207525	207532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020050	T	6	6	207537	207542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020050	CTAC	2	8	207549	207556	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4242	NC_020050	CA	3	6	213456	213461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4243	NC_020050	AG	3	6	213468	213473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_020050	ATTT	2	8	213479	213486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_020050	CTA	2	6	213517	213522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_020050	ACAGT	2	10	213541	213550	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4248	NC_020050	TTA	2	6	213560	213565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_020050	ATTA	2	8	213580	213587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_020050	TAAT	2	8	213645	213652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_020050	CTG	3	9	213848	213856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670127
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