MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 8493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020050	GGC	2	6	174944	174949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_020050	TTA	2	6	174950	174955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_020050	A	6	6	174973	174978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_020050	TA	3	6	174988	174993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_020050	AAT	2	6	174997	175002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_020050	ACT	2	6	175018	175023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_020050	AAG	2	6	175024	175029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_020050	CAA	2	6	175035	175040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_020050	CGA	2	6	175058	175063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_020050	TAT	2	6	175109	175114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_020050	AT	3	6	175202	175207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_020050	N	100	100	175215	175314	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_020050	AGC	2	6	175315	175320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670097
3514	NC_020050	CAC	2	6	175373	175378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670097
3515	NC_020050	GGAC	2	8	175425	175432	25 %	0 %	50 %	25 %	436670097
3516	NC_020050	AT	3	6	175436	175441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_020050	TG	3	6	175453	175458	0 %	50 %	50 %	0 %	436670098
3518	NC_020050	T	6	6	175485	175490	0 %	100 %	0 %	0 %	436670098
3519	NC_020050	TTC	2	6	175523	175528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670098
3520	NC_020050	TCA	3	9	175587	175595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670098
3521	NC_020050	TTC	2	6	175652	175657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670098
3522	NC_020050	CAAA	2	8	175666	175673	75 %	0 %	0 %	25 %	436670098
3523	NC_020050	CTG	2	6	175711	175716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670098
3524	NC_020050	ACC	2	6	175754	175759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670098
3525	NC_020050	TTC	2	6	175832	175837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670098
3526	NC_020050	TAA	2	6	175838	175843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670098
3527	NC_020050	TAG	2	6	175851	175856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670098
3528	NC_020050	ATC	2	6	175862	175867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670098
3529	NC_020050	T	6	6	175931	175936	0 %	100 %	0 %	0 %	436670098
3530	NC_020050	GAAG	2	8	175939	175946	50 %	0 %	50 %	0 %	436670098
3531	NC_020050	GA	3	6	175978	175983	50 %	0 %	50 %	0 %	436670098
3532	NC_020050	GGC	2	6	175993	175998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670098
3533	NC_020050	CAAA	2	8	176056	176063	75 %	0 %	0 %	25 %	436670098
3534	NC_020050	TCAA	2	8	176208	176215	50 %	25 %	0 %	25 %	436670098
3535	NC_020050	CTG	2	6	176246	176251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670098
3536	NC_020050	CAG	2	6	176309	176314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670098
3537	NC_020050	CTC	2	6	176393	176398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670098
3538	NC_020050	ACA	2	6	176413	176418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670098
3539	NC_020050	GAT	2	6	176487	176492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670098
3540	NC_020050	TCT	2	6	176502	176507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670098
3541	NC_020050	GCA	2	6	176523	176528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670098
3542	NC_020050	AGC	2	6	176555	176560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670098
3543	NC_020050	T	6	6	176563	176568	0 %	100 %	0 %	0 %	436670098
3544	NC_020050	TAA	2	6	176603	176608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670098
3545	NC_020050	CTC	2	6	176626	176631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_020050	TGC	2	6	176792	176797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670099
3547	NC_020050	ACC	2	6	176868	176873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670099
3548	NC_020050	AT	3	6	176918	176923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_020050	CA	3	6	176924	176929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_020050	ATAG	2	8	177084	177091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_020050	CGT	2	6	177104	177109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_020050	CCG	2	6	177151	177156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_020050	AG	3	6	177159	177164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_020050	A	6	6	177237	177242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_020050	GTA	2	6	177247	177252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_020050	TAC	2	6	177262	177267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_020050	TAA	2	6	177268	177273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_020050	CGCC	2	8	177338	177345	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3559	NC_020050	T	6	6	177415	177420	0 %	100 %	0 %	0 %	436670100
3560	NC_020050	TCT	2	6	177450	177455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670100
3561	NC_020050	TCA	2	6	177489	177494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670100
3562	NC_020050	CAA	3	9	177554	177562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670100
3563	NC_020050	GGT	2	6	177592	177597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670100
3564	NC_020050	ACT	2	6	177609	177614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670100
3565	NC_020050	GCC	2	6	177783	177788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436670100
3566	NC_020050	TGG	2	6	177827	177832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670100
3567	NC_020050	T	6	6	177855	177860	0 %	100 %	0 %	0 %	436670100
3568	NC_020050	TGC	2	6	177884	177889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670100
3569	NC_020050	CAA	2	6	177894	177899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670100
3570	NC_020050	TTG	2	6	177961	177966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670100
3571	NC_020050	GAG	2	6	178000	178005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670100
3572	NC_020050	CTTT	2	8	178014	178021	0 %	75 %	0 %	25 %	436670100
3573	NC_020050	CTT	2	6	178030	178035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670100
3574	NC_020050	TTA	2	6	178146	178151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670100
3575	NC_020050	TGC	2	6	178157	178162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670100
3576	NC_020050	TGA	2	6	178311	178316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_020050	CAA	2	6	178361	178366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_020050	CCGC	2	8	178458	178465	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3579	NC_020050	GCTC	2	8	178473	178480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_020050	TGA	2	6	178532	178537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_020050	A	6	6	178572	178577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_020050	GA	3	6	178629	178634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_020050	T	6	6	178646	178651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_020050	TTG	2	6	178679	178684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_020050	TA	4	8	178732	178739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_020050	A	7	7	178803	178809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_020050	ATTC	2	8	178817	178824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_020050	CTT	2	6	178887	178892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_020050	T	6	6	178938	178943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_020050	TTC	2	6	178951	178956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_020050	CTT	2	6	178986	178991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_020050	T	6	6	179020	179025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_020050	ATTT	2	8	179026	179033	25 %	75 %	0 %	0 %	436670101
3594	NC_020050	AGC	2	6	179054	179059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670101
3595	NC_020050	GAG	2	6	179134	179139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670101
3596	NC_020050	AGA	2	6	179214	179219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670101
3597	NC_020050	AAG	2	6	179293	179298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670101
3598	NC_020050	CCAG	2	8	179323	179330	25 %	0 %	25 %	50 %	436670101
3599	NC_020050	A	6	6	179401	179406	100 %	0 %	0 %	0 %	436670101
3600	NC_020050	TCA	2	6	179464	179469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670101
3601	NC_020050	ACCTG	2	10	179526	179535	20 %	20 %	20 %	40 %	436670101
3602	NC_020050	ACT	2	6	179541	179546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670101
3603	NC_020050	GCA	2	6	179560	179565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670101
3604	NC_020050	GCT	2	6	179589	179594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670101
3605	NC_020050	CAA	2	6	179601	179606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670101
3606	NC_020050	TG	3	6	179692	179697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_020050	GTAAA	2	10	179759	179768	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_020050	CAG	2	6	179852	179857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670102
3609	NC_020050	CCA	2	6	180076	180081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670102
3610	NC_020050	CAGT	2	8	180137	180144	25 %	25 %	25 %	25 %	436670102
3611	NC_020050	TCA	2	6	180145	180150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670102
3612	NC_020050	AAT	2	6	180387	180392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670102
3613	NC_020050	TCA	2	6	180394	180399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670102
3614	NC_020050	ACC	2	6	180405	180410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670102
3615	NC_020050	ATC	2	6	180420	180425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670102
3616	NC_020050	CCA	2	6	180481	180486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670102
3617	NC_020050	ATA	2	6	180496	180501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670102
3618	NC_020050	CAT	2	6	180533	180538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670102
3619	NC_020050	CAA	2	6	180557	180562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670102
3620	NC_020050	A	6	6	180565	180570	100 %	0 %	0 %	0 %	436670102
3621	NC_020050	AAG	2	6	180605	180610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670102
3622	NC_020050	AAT	2	6	180615	180620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670102
3623	NC_020050	TCT	2	6	180661	180666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670102
3624	NC_020050	CTT	2	6	180668	180673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670102
3625	NC_020050	CTT	2	6	180731	180736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670102
3626	NC_020050	TAA	2	6	180798	180803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670102
3627	NC_020050	TCT	2	6	180892	180897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670102
3628	NC_020050	CTTCAC	2	12	181037	181048	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	436670102
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3631	NC_020050	CTTCAC	2	12	181193	181204	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	436670102
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3753	NC_020050	TGCGGA	2	12	186794	186805	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	436670106
3754	NC_020050	GCT	2	6	186832	186837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670106
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3762	NC_020050	GA	3	6	187199	187204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3763	NC_020050	C	6	6	187210	187215	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4000	NC_020050	GTT	2	6	200631	200636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670117

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