MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 8493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020050	TAC	2	6	126557	126562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670054
2502	NC_020050	CTT	2	6	126569	126574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670054
2503	NC_020050	AGAA	2	8	126586	126593	75 %	0 %	25 %	0 %	436670054
2504	NC_020050	CGT	2	6	126636	126641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670054
2505	NC_020050	CG	3	6	126778	126783	0 %	0 %	50 %	50 %	436670054
2506	NC_020050	GGCG	2	8	126857	126864	0 %	0 %	75 %	25 %	436670054
2507	NC_020050	TCA	2	6	126900	126905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670054
2508	NC_020050	CAG	2	6	126946	126951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670054
2509	NC_020050	TGT	2	6	126966	126971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670054
2510	NC_020050	CCAG	2	8	127081	127088	25 %	0 %	25 %	50 %	436670054
2511	NC_020050	CTT	2	6	127123	127128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670054
2512	NC_020050	CTT	2	6	127180	127185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670054
2513	NC_020050	TTG	2	6	127287	127292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670054
2514	NC_020050	GTT	2	6	127448	127453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670054
2515	NC_020050	CTA	2	6	127471	127476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670054
2516	NC_020050	CAC	2	6	127507	127512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670054
2517	NC_020050	TGT	2	6	127549	127554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670054
2518	NC_020050	CTG	2	6	127676	127681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670055
2519	NC_020050	CTT	2	6	127769	127774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670055
2520	NC_020050	GTT	2	6	127784	127789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670055
2521	NC_020050	TCG	2	6	127825	127830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670055
2522	NC_020050	AGC	2	6	127869	127874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670055
2523	NC_020050	CGT	2	6	127910	127915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670055
2524	NC_020050	TGC	2	6	127961	127966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670055
2525	NC_020050	CGT	2	6	128120	128125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670055
2526	NC_020050	TCT	2	6	128128	128133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670055
2527	NC_020050	C	6	6	128153	128158	0 %	0 %	0 %	100 %	436670055
2528	NC_020050	CCT	2	6	128226	128231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2529	NC_020050	CAG	2	6	128339	128344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670056
2530	NC_020050	CAG	2	6	128417	128422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670056
2531	NC_020050	GCG	2	6	128467	128472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670056
2532	NC_020050	CAG	2	6	128516	128521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670056
2533	NC_020050	AGG	2	6	128543	128548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670056
2534	NC_020050	AGT	2	6	128730	128735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670056
2535	NC_020050	GTAG	2	8	128771	128778	25 %	25 %	50 %	0 %	436670056
2536	NC_020050	CA	3	6	129026	129031	50 %	0 %	0 %	50 %	436670057
2537	NC_020050	TCC	2	6	129069	129074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670057
2538	NC_020050	TGG	2	6	129076	129081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670057
2539	NC_020050	GAAG	2	8	129232	129239	50 %	0 %	50 %	0 %	436670057
2540	NC_020050	TTAA	2	8	129253	129260	50 %	50 %	0 %	0 %	436670057
2541	NC_020050	CTG	2	6	129474	129479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_020050	CTT	2	6	129511	129516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_020050	GGAGG	2	10	129521	129530	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_020050	A	6	6	129540	129545	100 %	0 %	0 %	0 %	436670058
2545	NC_020050	CTT	2	6	129603	129608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670058
2546	NC_020050	T	6	6	129652	129657	0 %	100 %	0 %	0 %	436670058
2547	NC_020050	ATTTG	2	10	129754	129763	20 %	60 %	20 %	0 %	436670058
2548	NC_020050	CAA	2	6	129766	129771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670058
2549	NC_020050	TAAG	2	8	129822	129829	50 %	25 %	25 %	0 %	436670059
2550	NC_020050	TGCTG	2	10	129830	129839	0 %	40 %	40 %	20 %	436670059
2551	NC_020050	CAT	2	6	129841	129846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670059
2552	NC_020050	TTG	2	6	129923	129928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670059
2553	NC_020050	AAT	2	6	129999	130004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670060
2554	NC_020050	TAG	2	6	130021	130026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670060
2555	NC_020050	TCC	2	6	130094	130099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_020050	AGT	2	6	130149	130154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020050	T	7	7	130231	130237	0 %	100 %	0 %	0 %	436670061
2558	NC_020050	GTT	2	6	130301	130306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670061
2559	NC_020050	CTA	2	6	130320	130325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670061
2560	NC_020050	CTA	2	6	130386	130391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670061
2561	NC_020050	AACT	2	8	130456	130463	50 %	25 %	0 %	25 %	436670061
2562	NC_020050	TCC	2	6	130469	130474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670061
2563	NC_020050	GTT	2	6	130518	130523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670061
2564	NC_020050	CTG	3	9	130540	130548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670061
2565	NC_020050	GTG	2	6	130566	130571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670061
2566	NC_020050	GTTCTG	2	12	130587	130598	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	436670061
2567	NC_020050	G	6	6	130624	130629	0 %	0 %	100 %	0 %	436670061
2568	NC_020050	AGC	2	6	130631	130636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670061
2569	NC_020050	CCT	2	6	130734	130739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670061
2570	NC_020050	AATGGT	2	12	130771	130782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670061
2571	NC_020050	GTT	2	6	130788	130793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670061
2572	NC_020050	GTT	2	6	130797	130802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670061
2573	NC_020050	TTTGC	2	10	130886	130895	0 %	60 %	20 %	20 %	436670062
2574	NC_020050	CTT	2	6	130904	130909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670062
2575	NC_020050	TTG	2	6	130921	130926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670062
2576	NC_020050	TCTG	2	8	130995	131002	0 %	50 %	25 %	25 %	436670062
2577	NC_020050	T	6	6	131016	131021	0 %	100 %	0 %	0 %	436670062
2578	NC_020050	AAC	2	6	131076	131081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670062
2579	NC_020050	TTG	2	6	131123	131128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670062
2580	NC_020050	TGG	2	6	131222	131227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_020050	AGTC	2	8	131263	131270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2582	NC_020050	GTA	2	6	131298	131303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_020050	CAA	2	6	131352	131357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_020050	CAA	2	6	131371	131376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_020050	TTA	2	6	131380	131385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_020050	GATG	2	8	131413	131420	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_020050	TAGA	2	8	131432	131439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020050	CTA	2	6	131459	131464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670063
2589	NC_020050	AAC	2	6	131475	131480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670063
2590	NC_020050	TAA	2	6	131555	131560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670063
2591	NC_020050	GAA	2	6	131622	131627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670064
2592	NC_020050	AACC	2	8	131628	131635	50 %	0 %	0 %	50 %	436670064
2593	NC_020050	CAG	2	6	131686	131691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670064
2594	NC_020050	CAAA	2	8	131768	131775	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2595	NC_020050	CTA	2	6	131815	131820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_020050	ATA	2	6	131852	131857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_020050	AAG	2	6	131973	131978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_020050	CCA	2	6	132002	132007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2599	NC_020050	ATT	2	6	132023	132028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_020050	TGC	2	6	132032	132037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_020050	CAG	2	6	132040	132045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_020050	TCAT	2	8	132059	132066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2603	NC_020050	CGC	2	6	132078	132083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_020050	TG	3	6	132179	132184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_020050	ACC	2	6	132222	132227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_020050	TGCACC	2	12	132228	132239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_020050	ACC	2	6	132253	132258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_020050	ATT	2	6	132274	132279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_020050	AAGCA	2	10	132307	132316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2610	NC_020050	GCA	2	6	132340	132345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_020050	CTAA	2	8	132395	132402	50 %	25 %	0 %	25 %	436670065
2612	NC_020050	AAC	2	6	132514	132519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670065
2613	NC_020050	CGC	2	6	132557	132562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436670065
2614	NC_020050	TGG	2	6	132623	132628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670065
2615	NC_020050	ACCA	2	8	132657	132664	50 %	0 %	0 %	50 %	436670065
2616	NC_020050	CAA	2	6	132703	132708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670065
2617	NC_020050	AAG	2	6	132750	132755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670065
2618	NC_020050	CTT	2	6	132766	132771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670065
2619	NC_020050	GAA	2	6	132833	132838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670065
2620	NC_020050	GACA	2	8	132839	132846	50 %	0 %	25 %	25 %	436670065
2621	NC_020050	TGG	2	6	132853	132858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670065
2622	NC_020050	AAAG	2	8	132913	132920	75 %	0 %	25 %	0 %	436670065
2623	NC_020050	CAG	2	6	132921	132926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670065
2624	NC_020050	CTG	2	6	132936	132941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670065
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2993	NC_020050	GCG	2	6	151185	151190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670078
2994	NC_020050	AAGATG	2	12	151231	151242	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	436670078
2995	NC_020050	GCTG	2	8	151398	151405	0 %	25 %	50 %	25 %	436670078
2996	NC_020050	GAT	2	6	151434	151439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670078
2997	NC_020050	GA	3	6	151451	151456	50 %	0 %	50 %	0 %	436670078
2998	NC_020050	AG	3	6	151460	151465	50 %	0 %	50 %	0 %	436670078
2999	NC_020050	AG	3	6	151468	151473	50 %	0 %	50 %	0 %	436670078
3000	NC_020050	AG	3	6	151476	151481	50 %	0 %	50 %	0 %	436670078

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