MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 8493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020050	TTGG	2	8	102910	102917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_020050	GGCG	2	8	102957	102964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2003	NC_020050	CTG	2	6	103075	103080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_020050	CTG	2	6	103121	103126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_020050	GTC	2	6	103183	103188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_020050	CAA	2	6	103237	103242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_020050	A	6	6	103292	103297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_020050	AC	3	6	103323	103328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_020050	AT	3	6	103341	103346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_020050	GTCC	2	8	103350	103357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2011	NC_020050	GTG	2	6	103404	103409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_020050	GCT	2	6	103462	103467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_020050	TAG	2	6	103471	103476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_020050	GC	3	6	103525	103530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2015	NC_020050	TCG	2	6	103645	103650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_020050	GC	3	6	103816	103821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2017	NC_020050	CTA	2	6	103870	103875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_020050	AGC	2	6	103879	103884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_020050	CAC	2	6	103937	103942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2020	NC_020050	GGAC	2	8	103989	103996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2021	NC_020050	AT	3	6	104000	104005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_020050	TG	3	6	104017	104022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_020050	T	6	6	104049	104054	0 %	100 %	0 %	0 %	436670039
2024	NC_020050	ATG	2	6	104113	104118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670039
2025	NC_020050	GCATC	2	10	104142	104151	20 %	20 %	20 %	40 %	436670039
2026	NC_020050	GAT	2	6	104166	104171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670039
2027	NC_020050	ATTC	2	8	104250	104257	25 %	50 %	0 %	25 %	436670039
2028	NC_020050	TTGTCA	2	12	104342	104353	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436670039
2029	NC_020050	ATG	2	6	104372	104377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670039
2030	NC_020050	TTA	2	6	104633	104638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_020050	TAAT	2	8	104726	104733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_020050	ATA	2	6	104749	104754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_020050	GGCG	2	8	104796	104803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2034	NC_020050	CTG	2	6	104914	104919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_020050	CTG	2	6	104960	104965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_020050	GTC	2	6	104995	105000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_020050	ATT	2	6	105085	105090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670040
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2039	NC_020050	GCTT	2	8	105206	105213	0 %	50 %	25 %	25 %	436670040
2040	NC_020050	TCT	2	6	105221	105226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670040
2041	NC_020050	CT	3	6	105322	105327	0 %	50 %	0 %	50 %	436670040
2042	NC_020050	A	7	7	105374	105380	100 %	0 %	0 %	0 %	436670040
2043	NC_020050	ACC	2	6	105410	105415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670040
2044	NC_020050	ATT	2	6	105464	105469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670040
2045	NC_020050	TCA	2	6	105488	105493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670040
2046	NC_020050	TCT	2	6	105584	105589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670040
2047	NC_020050	TTTG	2	8	105597	105604	0 %	75 %	25 %	0 %	436670040
2048	NC_020050	TAG	2	6	105627	105632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670040
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2050	NC_020050	CAAA	2	8	105647	105654	75 %	0 %	0 %	25 %	436670040
2051	NC_020050	ATTG	2	8	105776	105783	25 %	50 %	25 %	0 %	436670040
2052	NC_020050	TC	3	6	105806	105811	0 %	50 %	0 %	50 %	436670040
2053	NC_020050	T	7	7	105839	105845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_020050	T	6	6	105860	105865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_020050	AATAA	2	10	105868	105877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_020050	TGTTCC	2	12	106019	106030	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	436670041
2057	NC_020050	AGA	2	6	106056	106061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670041
2058	NC_020050	A	6	6	106074	106079	100 %	0 %	0 %	0 %	436670041
2059	NC_020050	TAT	2	6	106091	106096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670041
2060	NC_020050	CATG	2	8	106110	106117	25 %	25 %	25 %	25 %	436670041
2061	NC_020050	AT	3	6	106168	106173	50 %	50 %	0 %	0 %	436670041
2062	NC_020050	TAT	2	6	106198	106203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670041
2063	NC_020050	ATT	2	6	106205	106210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670041
2064	NC_020050	ATT	2	6	106212	106217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670041
2065	NC_020050	T	7	7	106273	106279	0 %	100 %	0 %	0 %	436670041
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2068	NC_020050	TAAC	2	8	106335	106342	50 %	25 %	0 %	25 %	436670041
2069	NC_020050	TGT	2	6	106356	106361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670041
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2073	NC_020050	TCT	2	6	106515	106520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670041
2074	NC_020050	GCT	2	6	106551	106556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670041
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2076	NC_020050	TCA	2	6	106617	106622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670041
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2079	NC_020050	ACTT	2	8	106844	106851	25 %	50 %	0 %	25 %	436670041
2080	NC_020050	CTTT	2	8	106903	106910	0 %	75 %	0 %	25 %	436670041
2081	NC_020050	CTT	2	6	106963	106968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2084	NC_020050	TTAA	2	8	107026	107033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2085	NC_020050	TAAG	2	8	107068	107075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2086	NC_020050	TTCT	2	8	107107	107114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2087	NC_020050	AAT	2	6	107129	107134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2098	NC_020050	ATG	2	6	107757	107762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670042
2099	NC_020050	TCT	2	6	107812	107817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670042
2100	NC_020050	CAG	2	6	107843	107848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670042
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2102	NC_020050	TC	3	6	108089	108094	0 %	50 %	0 %	50 %	436670042
2103	NC_020050	AT	3	6	108138	108143	50 %	50 %	0 %	0 %	436670042
2104	NC_020050	TGT	2	6	108181	108186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670042
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2106	NC_020050	TTC	2	6	108279	108284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670042
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2110	NC_020050	A	7	7	108500	108506	100 %	0 %	0 %	0 %	436670042
2111	NC_020050	ACTG	2	8	108684	108691	25 %	25 %	25 %	25 %	436670042
2112	NC_020050	T	6	6	108704	108709	0 %	100 %	0 %	0 %	436670042
2113	NC_020050	AGAC	2	8	108736	108743	50 %	0 %	25 %	25 %	436670042
2114	NC_020050	TCT	2	6	108814	108819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670042
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2126	NC_020050	TAC	2	6	109527	109532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670042
2127	NC_020050	GAT	2	6	109668	109673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670042
2128	NC_020050	ATA	3	9	109697	109705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670042
2129	NC_020050	TAA	2	6	109758	109763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670042
2130	NC_020050	GCT	2	6	109770	109775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670042
2131	NC_020050	TAC	2	6	109811	109816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670042
2132	NC_020050	TTC	2	6	109905	109910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670042
2133	NC_020050	GTT	2	6	109937	109942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670042
2134	NC_020050	TGA	2	6	109963	109968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670042
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2136	NC_020050	CTC	2	6	110097	110102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670042
2137	NC_020050	TCAG	2	8	110173	110180	25 %	25 %	25 %	25 %	436670042
2138	NC_020050	CAT	2	6	110183	110188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670042
2139	NC_020050	CT	3	6	110334	110339	0 %	50 %	0 %	50 %	436670042
2140	NC_020050	CTG	2	6	110448	110453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670042
2141	NC_020050	TCA	2	6	110473	110478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670042
2142	NC_020050	TAG	2	6	110508	110513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670042
2143	NC_020050	TTGC	2	8	110546	110553	0 %	50 %	25 %	25 %	436670042
2144	NC_020050	ACC	2	6	110567	110572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670042
2145	NC_020050	CAA	2	6	110659	110664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670042
2146	NC_020050	TAG	2	6	110671	110676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670042
2147	NC_020050	TAG	2	6	110700	110705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670042
2148	NC_020050	TAT	2	6	110750	110755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670042
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2150	NC_020050	TCC	2	6	110818	110823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670042
2151	NC_020050	TCAA	2	8	110842	110849	50 %	25 %	0 %	25 %	436670042
2152	NC_020050	TAA	3	9	110943	110951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670042
2153	NC_020050	ATG	2	6	111009	111014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670042
2154	NC_020050	CAA	2	6	111065	111070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670042
2155	NC_020050	TTG	2	6	111123	111128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670042
2156	NC_020050	AGAT	2	8	111161	111168	50 %	25 %	25 %	0 %	436670042
2157	NC_020050	TC	4	8	111218	111225	0 %	50 %	0 %	50 %	436670042
2158	NC_020050	GTT	2	6	111244	111249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670042
2159	NC_020050	CAG	2	6	111284	111289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670042
2160	NC_020050	TCAC	2	8	111314	111321	25 %	25 %	0 %	50 %	436670042
2161	NC_020050	CTAT	2	8	111366	111373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2162	NC_020050	TCAA	2	8	111383	111390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2163	NC_020050	TTTG	2	8	111427	111434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2164	NC_020050	TCT	2	6	111473	111478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2165	NC_020050	AAC	2	6	111488	111493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2166	NC_020050	ATT	2	6	111629	111634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2167	NC_020050	T	6	6	111633	111638	0 %	100 %	0 %	0 %	436670043
2168	NC_020050	AT	5	10	111672	111681	50 %	50 %	0 %	0 %	436670043
2169	NC_020050	ACATAG	2	12	111711	111722	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	436670043
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2172	NC_020050	GTA	2	6	111813	111818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670043
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2174	NC_020050	TGT	2	6	111829	111834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670043
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2186	NC_020050	AGT	2	6	112703	112708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670043
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2189	NC_020050	GAT	2	6	112830	112835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670043
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2191	NC_020050	AAT	2	6	112891	112896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670043
2192	NC_020050	AG	3	6	112900	112905	50 %	0 %	50 %	0 %	436670043
2193	NC_020050	CTC	2	6	112934	112939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670043
2194	NC_020050	AAG	2	6	112940	112945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670043
2195	NC_020050	GGGT	2	8	112958	112965	0 %	25 %	75 %	0 %	436670043
2196	NC_020050	TCA	2	6	112971	112976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670043
2197	NC_020050	TA	3	6	113068	113073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2198	NC_020050	GTAA	2	8	113098	113105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2199	NC_020050	ACATA	2	10	113140	113149	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2200	NC_020050	T	6	6	113152	113157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2201	NC_020050	GCT	2	6	113170	113175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2202	NC_020050	TTC	2	6	113203	113208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2203	NC_020050	AC	3	6	113221	113226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2204	NC_020050	TAC	2	6	113227	113232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2205	NC_020050	TAAA	2	8	113239	113246	75 %	25 %	0 %	0 %	436670044
2206	NC_020050	T	6	6	113251	113256	0 %	100 %	0 %	0 %	436670044
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2213	NC_020050	TAA	2	6	113531	113536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670044
2214	NC_020050	ATG	3	9	113552	113560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670044
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2223	NC_020050	T	6	6	113987	113992	0 %	100 %	0 %	0 %	436670044
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2230	NC_020050	AAAG	2	8	114183	114190	75 %	0 %	25 %	0 %	436670044
2231	NC_020050	AAT	2	6	114212	114217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670045
2232	NC_020050	TCA	2	6	114347	114352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670045
2233	NC_020050	GAT	2	6	114390	114395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670045
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2237	NC_020050	AAC	2	6	114523	114528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670045
2238	NC_020050	CTC	2	6	114600	114605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670045
2239	NC_020050	CAT	2	6	114639	114644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670045
2240	NC_020050	TGGAA	2	10	114773	114782	40 %	20 %	40 %	0 %	436670045
2241	NC_020050	T	7	7	114795	114801	0 %	100 %	0 %	0 %	436670045
2242	NC_020050	TTC	2	6	114877	114882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670045
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2244	NC_020050	CTG	2	6	114949	114954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670045
2245	NC_020050	GTT	2	6	114960	114965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670045
2246	NC_020050	TAG	2	6	115027	115032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670045
2247	NC_020050	ATT	2	6	115057	115062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670045
2248	NC_020050	GTC	2	6	115128	115133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670045
2249	NC_020050	ACT	2	6	115244	115249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670045
2250	NC_020050	CAT	2	6	115278	115283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670045
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2252	NC_020050	CT	3	6	115426	115431	0 %	50 %	0 %	50 %	436670045
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2255	NC_020050	ATT	2	6	115531	115536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2375	NC_020050	GAC	2	6	121139	121144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670050
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2377	NC_020050	TTTAA	2	10	121237	121246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2378	NC_020050	TTG	2	6	121281	121286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2379	NC_020050	CA	3	6	121320	121325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2380	NC_020050	AACC	2	8	121577	121584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2500	NC_020050	GAC	2	6	126478	126483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670054

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