MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 8493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020050	CGT	2	6	77686	77691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670026
1502	NC_020050	TCG	2	6	77712	77717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670026
1503	NC_020050	GAA	2	6	77758	77763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670026
1504	NC_020050	CTT	2	6	77823	77828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670026
1505	NC_020050	G	6	6	77836	77841	0 %	0 %	100 %	0 %	436670026
1506	NC_020050	TTA	2	6	77864	77869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670026
1507	NC_020050	AGCT	2	8	77939	77946	25 %	25 %	25 %	25 %	436670026
1508	NC_020050	A	6	6	77963	77968	100 %	0 %	0 %	0 %	436670026
1509	NC_020050	AGCA	2	8	77972	77979	50 %	0 %	25 %	25 %	436670026
1510	NC_020050	CGA	2	6	78015	78020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670026
1511	NC_020050	CA	3	6	78051	78056	50 %	0 %	0 %	50 %	436670026
1512	NC_020050	AATT	2	8	78150	78157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020050	A	7	7	78160	78166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020050	GTA	3	9	78205	78213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670027
1515	NC_020050	AAT	2	6	78300	78305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670027
1516	NC_020050	AGG	2	6	78366	78371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670027
1517	NC_020050	TTA	2	6	78377	78382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670027
1518	NC_020050	TGA	2	6	78402	78407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670027
1519	NC_020050	A	6	6	78536	78541	100 %	0 %	0 %	0 %	436670027
1520	NC_020050	ATC	2	6	78590	78595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670027
1521	NC_020050	GAT	2	6	78724	78729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670027
1522	NC_020050	GCT	2	6	78731	78736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670027
1523	NC_020050	TTA	2	6	78805	78810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670027
1524	NC_020050	GAA	2	6	78820	78825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670027
1525	NC_020050	CAT	2	6	78863	78868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670027
1526	NC_020050	AAG	2	6	78878	78883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670027
1527	NC_020050	AT	3	6	78903	78908	50 %	50 %	0 %	0 %	436670027
1528	NC_020050	TA	3	6	79060	79065	50 %	50 %	0 %	0 %	436670027
1529	NC_020050	ATC	2	6	79079	79084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670027
1530	NC_020050	TTA	2	6	79108	79113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670027
1531	NC_020050	AAT	2	6	79153	79158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670027
1532	NC_020050	GGC	2	6	79159	79164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670027
1533	NC_020050	TGA	2	6	79236	79241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670027
1534	NC_020050	AGG	2	6	79263	79268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670027
1535	NC_020050	ATT	2	6	79273	79278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670027
1536	NC_020050	T	7	7	79287	79293	0 %	100 %	0 %	0 %	436670027
1537	NC_020050	AAGG	2	8	79349	79356	50 %	0 %	50 %	0 %	436670027
1538	NC_020050	AGC	2	6	79368	79373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670027
1539	NC_020050	AAT	2	6	79381	79386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670027
1540	NC_020050	AT	3	6	79407	79412	50 %	50 %	0 %	0 %	436670027
1541	NC_020050	ATG	2	6	79430	79435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670027
1542	NC_020050	GGAAT	2	10	79453	79462	40 %	20 %	40 %	0 %	436670027
1543	NC_020050	GGA	2	6	79468	79473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670027
1544	NC_020050	ATCA	2	8	79529	79536	50 %	25 %	0 %	25 %	436670027
1545	NC_020050	AGA	2	6	79537	79542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670027
1546	NC_020050	AAG	2	6	79598	79603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670027
1547	NC_020050	ATT	2	6	79681	79686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670027
1548	NC_020050	ATT	2	6	79740	79745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670027
1549	NC_020050	T	7	7	79760	79766	0 %	100 %	0 %	0 %	436670027
1550	NC_020050	TAA	3	9	79814	79822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020050	TC	3	6	79863	79868	0 %	50 %	0 %	50 %	436670028
1552	NC_020050	A	6	6	79893	79898	100 %	0 %	0 %	0 %	436670028
1553	NC_020050	CTT	2	6	79919	79924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670028
1554	NC_020050	AGC	2	6	80021	80026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1555	NC_020050	TGC	2	6	80040	80045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1556	NC_020050	ACA	2	6	80100	80105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670028
1557	NC_020050	ATC	2	6	80119	80124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670028
1558	NC_020050	CGC	2	6	80125	80130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436670028
1559	NC_020050	TAG	2	6	80216	80221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670028
1560	NC_020050	TCA	2	6	80262	80267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670028
1561	NC_020050	CAG	2	6	80276	80281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1562	NC_020050	ACAG	2	8	80346	80353	50 %	0 %	25 %	25 %	436670028
1563	NC_020050	TGTAT	2	10	80366	80375	20 %	60 %	20 %	0 %	436670028
1564	NC_020050	CAC	2	6	80377	80382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670028
1565	NC_020050	GATG	2	8	80392	80399	25 %	25 %	50 %	0 %	436670028
1566	NC_020050	GT	3	6	80408	80413	0 %	50 %	50 %	0 %	436670028
1567	NC_020050	CAG	2	6	80455	80460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1568	NC_020050	AACT	2	8	80498	80505	50 %	25 %	0 %	25 %	436670028
1569	NC_020050	ACA	2	6	80586	80591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670028
1570	NC_020050	TTA	2	6	80611	80616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670028
1571	NC_020050	CTG	2	6	80642	80647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1572	NC_020050	GAG	2	6	80660	80665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670028
1573	NC_020050	AACT	2	8	80693	80700	50 %	25 %	0 %	25 %	436670028
1574	NC_020050	ACTC	2	8	80711	80718	25 %	25 %	0 %	50 %	436670028
1575	NC_020050	AGC	2	6	80757	80762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1576	NC_020050	AT	3	6	80801	80806	50 %	50 %	0 %	0 %	436670028
1577	NC_020050	CTT	2	6	80862	80867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670028
1578	NC_020050	TCA	2	6	80964	80969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670028
1579	NC_020050	TCC	2	6	81053	81058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670028
1580	NC_020050	ACA	2	6	81119	81124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670028
1581	NC_020050	TGG	2	6	81176	81181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670028
1582	NC_020050	ACA	2	6	81194	81199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670028
1583	NC_020050	GATC	2	8	81211	81218	25 %	25 %	25 %	25 %	436670028
1584	NC_020050	A	6	6	81284	81289	100 %	0 %	0 %	0 %	436670028
1585	NC_020050	CAG	2	6	81325	81330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670028
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1587	NC_020050	GAGC	2	8	81475	81482	25 %	0 %	50 %	25 %	436670028
1588	NC_020050	TTGG	2	8	81532	81539	0 %	50 %	50 %	0 %	436670028
1589	NC_020050	TGG	3	9	81566	81574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670028
1590	NC_020050	TTG	2	6	81577	81582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670028
1591	NC_020050	TTG	2	6	81679	81684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670028
1592	NC_020050	GTC	2	6	81699	81704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1593	NC_020050	GTTT	2	8	81733	81740	0 %	75 %	25 %	0 %	436670028
1594	NC_020050	AGC	2	6	81764	81769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1595	NC_020050	GTAGT	2	10	81875	81884	20 %	40 %	40 %	0 %	436670028
1596	NC_020050	TCC	2	6	81935	81940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670028
1597	NC_020050	GCTT	2	8	81989	81996	0 %	50 %	25 %	25 %	436670028
1598	NC_020050	CAG	2	6	82094	82099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1599	NC_020050	TAG	2	6	82115	82120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670028
1600	NC_020050	CAA	2	6	82150	82155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670028
1601	NC_020050	GGA	2	6	82165	82170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670028
1602	NC_020050	CTG	2	6	82218	82223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1603	NC_020050	ACC	2	6	82258	82263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670028
1604	NC_020050	TTG	2	6	82283	82288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670028
1605	NC_020050	CAG	2	6	82303	82308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1606	NC_020050	ACTT	2	8	82449	82456	25 %	50 %	0 %	25 %	436670028
1607	NC_020050	TA	3	6	82505	82510	50 %	50 %	0 %	0 %	436670028
1608	NC_020050	CG	3	6	82524	82529	0 %	0 %	50 %	50 %	436670028
1609	NC_020050	TTAC	2	8	82530	82537	25 %	50 %	0 %	25 %	436670028
1610	NC_020050	CGA	2	6	82569	82574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1611	NC_020050	CAA	2	6	82648	82653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670028
1612	NC_020050	ATTGCT	2	12	82663	82674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436670028
1613	NC_020050	TAGA	2	8	82838	82845	50 %	25 %	25 %	0 %	436670028
1614	NC_020050	CTC	2	6	82901	82906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670028
1615	NC_020050	AGA	3	9	82914	82922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670028
1616	NC_020050	GCT	2	6	82923	82928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1617	NC_020050	TGG	2	6	82995	83000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670028
1618	NC_020050	AGA	2	6	83172	83177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670028
1619	NC_020050	TAT	2	6	83296	83301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670028
1620	NC_020050	GAC	2	6	83452	83457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1621	NC_020050	GTT	2	6	83462	83467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670028
1622	NC_020050	AG	3	6	83484	83489	50 %	0 %	50 %	0 %	436670028
1623	NC_020050	TAC	2	6	83496	83501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670028
1624	NC_020050	TTGGA	2	10	83502	83511	20 %	40 %	40 %	0 %	436670028
1625	NC_020050	TTC	2	6	83674	83679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670028
1626	NC_020050	AAGC	2	8	83875	83882	50 %	0 %	25 %	25 %	436670028
1627	NC_020050	GCT	2	6	83965	83970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670028
1628	NC_020050	GTG	2	6	84022	84027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670028
1629	NC_020050	AGCG	2	8	84055	84062	25 %	0 %	50 %	25 %	436670028
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1640	NC_020050	GTG	2	6	84800	84805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670028
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1665	NC_020050	TA	3	6	86184	86189	50 %	50 %	0 %	0 %	436670028
1666	NC_020050	T	6	6	86197	86202	0 %	100 %	0 %	0 %	436670028
1667	NC_020050	TCAT	2	8	86214	86221	25 %	50 %	0 %	25 %	436670028
1668	NC_020050	TCA	2	6	86225	86230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670028
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1671	NC_020050	ATTA	2	8	86454	86461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1997	NC_020050	TCT	2	6	102500	102505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1998	NC_020050	CTC	2	6	102617	102622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1999	NC_020050	CG	3	6	102708	102713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2000	NC_020050	TGC	2	6	102725	102730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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