MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 8493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020050	A	6	6	50691	50696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020050	GCA	2	6	50702	50707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_020050	A	7	7	50715	50721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020050	CAA	2	6	50789	50794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_020050	TGGG	2	8	50948	50955	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020050	A	9	9	51002	51010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020050	AGATT	2	10	51055	51064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020050	CT	3	6	51180	51185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_020050	AGT	2	6	51243	51248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020050	AAT	2	6	51265	51270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020050	ATGG	2	8	51274	51281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020050	ATT	2	6	51294	51299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020050	AGT	3	9	51339	51347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020050	TGG	2	6	51463	51468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020050	TAA	2	6	51551	51556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020050	CAA	2	6	51562	51567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_020050	TGC	2	6	51589	51594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_020050	ATA	2	6	51606	51611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_020050	AGTT	2	8	51641	51648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020050	TCACA	2	10	51649	51658	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1021	NC_020050	TGA	2	6	51672	51677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020050	AAC	2	6	51701	51706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020050	A	6	6	51845	51850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020050	TTG	2	6	51890	51895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020050	GCA	2	6	51926	51931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_020050	TGG	2	6	51961	51966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020050	TAA	2	6	52019	52024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_020050	A	6	6	52030	52035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020050	GCA	2	6	52040	52045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_020050	GGC	2	6	52108	52113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_020050	ATGA	2	8	52127	52134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020050	GT	3	6	52209	52214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020050	ATA	2	6	52333	52338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020050	ATC	2	6	52412	52417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_020050	AGA	2	6	52424	52429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_020050	GCA	2	6	52443	52448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_020050	TCA	2	6	52673	52678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_020050	AC	3	6	52739	52744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_020050	TCA	2	6	52900	52905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_020050	CA	3	6	52996	53001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_020050	CAG	2	6	53014	53019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_020050	TGC	2	6	53024	53029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_020050	CCG	2	6	53048	53053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_020050	ATTT	2	8	53059	53066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020050	CAA	2	6	53103	53108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_020050	CTG	2	6	53116	53121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_020050	GAA	2	6	53191	53196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020050	A	6	6	53205	53210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_020050	TTGG	2	8	53376	53383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020050	TGT	2	6	53442	53447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020050	GGC	2	6	53475	53480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_020050	CGC	2	6	53524	53529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_020050	CA	3	6	53573	53578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_020050	AAG	2	6	53611	53616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_020050	TAT	2	6	53644	53649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020050	TC	3	6	53728	53733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_020050	ATT	2	6	53764	53769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020050	TA	3	6	53788	53793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020050	ATC	2	6	53884	53889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670020
1060	NC_020050	ATT	2	6	53891	53896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670020
1061	NC_020050	CTA	2	6	53901	53906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670020
1062	NC_020050	CTT	2	6	53940	53945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670020
1063	NC_020050	T	6	6	53960	53965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020050	ATA	2	6	54063	54068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020050	GAA	3	9	54098	54106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020050	TAG	2	6	54127	54132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_020050	TAA	2	6	54143	54148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020050	GTCG	2	8	54227	54234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_020050	TCT	2	6	54384	54389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_020050	CAA	2	6	54411	54416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_020050	AAGTC	2	10	54430	54439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1072	NC_020050	GAA	2	6	54468	54473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020050	TGAA	2	8	54509	54516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020050	ATT	2	6	54544	54549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670021
1075	NC_020050	TTC	2	6	54602	54607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670021
1076	NC_020050	ACCA	2	8	54623	54630	50 %	0 %	0 %	50 %	436670021
1077	NC_020050	CAA	2	6	54691	54696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670021
1078	NC_020050	TTC	2	6	54802	54807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670021
1079	NC_020050	GGTT	2	8	55192	55199	0 %	50 %	50 %	0 %	436670021
1080	NC_020050	TGC	2	6	55235	55240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670021
1081	NC_020050	GCTG	2	8	55307	55314	0 %	25 %	50 %	25 %	436670021
1082	NC_020050	CGA	2	6	55337	55342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670021
1083	NC_020050	GTG	2	6	55346	55351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670021
1084	NC_020050	ATT	2	6	55672	55677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670021
1085	NC_020050	CGT	2	6	55741	55746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670021
1086	NC_020050	TTC	2	6	55779	55784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670021
1087	NC_020050	TGG	2	6	55791	55796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670021
1088	NC_020050	CAA	2	6	55822	55827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670021
1089	NC_020050	GATACT	2	12	55849	55860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	436670021
1090	NC_020050	ATT	2	6	55914	55919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670021
1091	NC_020050	TAA	2	6	55943	55948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670021
1092	NC_020050	GAA	2	6	55958	55963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670021
1093	NC_020050	ATT	2	6	55964	55969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670021
1094	NC_020050	AGA	2	6	55997	56002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670021
1095	NC_020050	GTT	3	9	56071	56079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670021
1096	NC_020050	CAG	2	6	56153	56158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670021
1097	NC_020050	TGT	2	6	56277	56282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670021
1098	NC_020050	ATC	2	6	56364	56369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670021
1099	NC_020050	CAG	2	6	56373	56378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670021
1100	NC_020050	AAGT	2	8	56385	56392	50 %	25 %	25 %	0 %	436670021
1101	NC_020050	AAGT	2	8	56399	56406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020050	A	7	7	56448	56454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020050	A	6	6	56499	56504	100 %	0 %	0 %	0 %	436670022
1104	NC_020050	TAA	2	6	56551	56556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670022
1105	NC_020050	CAG	2	6	56598	56603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670022
1106	NC_020050	CCTA	2	8	56625	56632	25 %	25 %	0 %	50 %	436670022
1107	NC_020050	ACA	2	6	56691	56696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670022
1108	NC_020050	GA	3	6	56727	56732	50 %	0 %	50 %	0 %	436670022
1109	NC_020050	TTG	2	6	56973	56978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670023
1110	NC_020050	GAA	2	6	57053	57058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670023
1111	NC_020050	ATT	2	6	57069	57074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670023
1112	NC_020050	TCC	2	6	57079	57084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670023
1113	NC_020050	CTT	2	6	57095	57100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670023
1114	NC_020050	CTT	2	6	57126	57131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670023
1115	NC_020050	A	6	6	57138	57143	100 %	0 %	0 %	0 %	436670023
1116	NC_020050	ATC	2	6	57153	57158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670023
1117	NC_020050	TAA	2	6	57222	57227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670023
1118	NC_020050	CAG	2	6	57228	57233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670023
1119	NC_020050	TATTCA	2	12	57307	57318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	436670023
1120	NC_020050	T	6	6	57322	57327	0 %	100 %	0 %	0 %	436670023
1121	NC_020050	GCAA	2	8	57363	57370	50 %	0 %	25 %	25 %	436670023
1122	NC_020050	CAA	2	6	57406	57411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670023
1123	NC_020050	AAAT	2	8	57417	57424	75 %	25 %	0 %	0 %	436670023
1124	NC_020050	TC	3	6	57501	57506	0 %	50 %	0 %	50 %	436670023
1125	NC_020050	A	7	7	57515	57521	100 %	0 %	0 %	0 %	436670023
1126	NC_020050	AAAT	2	8	57532	57539	75 %	25 %	0 %	0 %	436670023
1127	NC_020050	ACT	2	6	57551	57556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670023
1128	NC_020050	T	6	6	57562	57567	0 %	100 %	0 %	0 %	436670023
1129	NC_020050	CTTC	2	8	57584	57591	0 %	50 %	0 %	50 %	436670023
1130	NC_020050	T	7	7	57592	57598	0 %	100 %	0 %	0 %	436670023
1131	NC_020050	CTT	2	6	57634	57639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670023
1132	NC_020050	TACGT	2	10	57655	57664	20 %	40 %	20 %	20 %	436670023
1133	NC_020050	GAA	2	6	57685	57690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670023
1134	NC_020050	TA	3	6	57703	57708	50 %	50 %	0 %	0 %	436670023
1135	NC_020050	A	6	6	57719	57724	100 %	0 %	0 %	0 %	436670023
1136	NC_020050	AT	3	6	57918	57923	50 %	50 %	0 %	0 %	436670023
1137	NC_020050	T	6	6	57944	57949	0 %	100 %	0 %	0 %	436670023
1138	NC_020050	GAT	2	6	57953	57958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670023
1139	NC_020050	TTTA	2	8	58000	58007	25 %	75 %	0 %	0 %	436670023
1140	NC_020050	GAA	2	6	58019	58024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670023
1141	NC_020050	TCA	2	6	58072	58077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670023
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1143	NC_020050	CTAT	2	8	58138	58145	25 %	50 %	0 %	25 %	436670023
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1146	NC_020050	AGTT	2	8	58239	58246	25 %	50 %	25 %	0 %	436670023
1147	NC_020050	ACC	2	6	58408	58413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670024
1148	NC_020050	CTA	2	6	58431	58436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670024
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1150	NC_020050	GCA	2	6	58622	58627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670024
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1154	NC_020050	CTT	2	6	58876	58881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670024
1155	NC_020050	TTGG	2	8	58941	58948	0 %	50 %	50 %	0 %	436670024
1156	NC_020050	GCAG	2	8	58994	59001	25 %	0 %	50 %	25 %	436670024
1157	NC_020050	ATG	2	6	59004	59009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670024
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1166	NC_020050	GCA	2	6	59483	59488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670024
1167	NC_020050	AT	3	6	59498	59503	50 %	50 %	0 %	0 %	436670024
1168	NC_020050	CTTTGG	2	12	59591	59602	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	436670024
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1249	NC_020050	CTA	2	6	63705	63710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670024
1250	NC_020050	TCA	2	6	63722	63727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670024
1251	NC_020050	GTC	2	6	63732	63737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670024
1252	NC_020050	AGC	2	6	63859	63864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670024
1253	NC_020050	TCGTCC	2	12	63953	63964	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	436670024
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1255	NC_020050	GTGAA	2	10	64024	64033	40 %	20 %	40 %	0 %	436670024
1256	NC_020050	TA	3	6	64084	64089	50 %	50 %	0 %	0 %	436670024
1257	NC_020050	TTC	2	6	64096	64101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670024
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1259	NC_020050	CTT	2	6	64141	64146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670024
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