MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 8493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_020050	CTG	2	6	407573	407578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670243
8002	NC_020050	CATA	2	8	407594	407601	50 %	25 %	0 %	25 %	436670243
8003	NC_020050	CTTACA	2	12	407608	407619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670243
8004	NC_020050	A	7	7	407665	407671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_020050	TTC	2	6	407695	407700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670244
8006	NC_020050	TCC	2	6	407723	407728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670244
8007	NC_020050	TTC	2	6	407787	407792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670244
8008	NC_020050	TAA	2	6	407861	407866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670244
8009	NC_020050	T	6	6	407990	407995	0 %	100 %	0 %	0 %	436670244
8010	NC_020050	TATAG	2	10	407999	408008	40 %	40 %	20 %	0 %	436670244
8011	NC_020050	GTAG	2	8	408015	408022	25 %	25 %	50 %	0 %	436670244
8012	NC_020050	T	6	6	408112	408117	0 %	100 %	0 %	0 %	436670244
8013	NC_020050	ATT	2	6	408236	408241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670244
8014	NC_020050	TTC	2	6	408254	408259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670244
8015	NC_020050	GAA	2	6	408285	408290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_020050	AG	3	6	408351	408356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_020050	T	6	6	408373	408378	0 %	100 %	0 %	0 %	436670245
8018	NC_020050	CTT	2	6	408418	408423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670245
8019	NC_020050	GCA	2	6	408493	408498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670245
8020	NC_020050	CTAA	2	8	408516	408523	50 %	25 %	0 %	25 %	436670245
8021	NC_020050	ACC	2	6	408573	408578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670245
8022	NC_020050	CCAG	2	8	408591	408598	25 %	0 %	25 %	50 %	436670245
8023	NC_020050	AGT	2	6	408622	408627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670245
8024	NC_020050	CTT	2	6	408637	408642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670245
8025	NC_020050	CAG	3	9	408682	408690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670245
8026	NC_020050	ATC	2	6	408698	408703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670245
8027	NC_020050	A	6	6	408788	408793	100 %	0 %	0 %	0 %	436670245
8028	NC_020050	GACA	2	8	408800	408807	50 %	0 %	25 %	25 %	436670245
8029	NC_020050	AG	3	6	408818	408823	50 %	0 %	50 %	0 %	436670245
8030	NC_020050	TCT	2	6	408846	408851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670245
8031	NC_020050	T	8	8	408851	408858	0 %	100 %	0 %	0 %	436670245
8032	NC_020050	TCC	2	6	408861	408866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670245
8033	NC_020050	T	6	6	408883	408888	0 %	100 %	0 %	0 %	436670245
8034	NC_020050	T	6	6	408929	408934	0 %	100 %	0 %	0 %	436670245
8035	NC_020050	TTC	2	6	408938	408943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670245
8036	NC_020050	GTTT	2	8	408958	408965	0 %	75 %	25 %	0 %	436670245
8037	NC_020050	GAA	2	6	409074	409079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670245
8038	NC_020050	CTG	2	6	409139	409144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670245
8039	NC_020050	CT	3	6	409174	409179	0 %	50 %	0 %	50 %	436670245
8040	NC_020050	TGTT	2	8	409202	409209	0 %	75 %	25 %	0 %	436670245
8041	NC_020050	TCA	2	6	409260	409265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670245
8042	NC_020050	TGCT	2	8	409287	409294	0 %	50 %	25 %	25 %	436670245
8043	NC_020050	CTT	2	6	409375	409380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670245
8044	NC_020050	AT	3	6	409455	409460	50 %	50 %	0 %	0 %	436670245
8045	NC_020050	CTT	2	6	409504	409509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670245
8046	NC_020050	GAA	2	6	409512	409517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670245
8047	NC_020050	TCT	2	6	409593	409598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670245
8048	NC_020050	TCA	2	6	409659	409664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670245
8049	NC_020050	ATT	2	6	409683	409688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670245
8050	NC_020050	GCA	2	6	409689	409694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670245
8051	NC_020050	T	6	6	409700	409705	0 %	100 %	0 %	0 %	436670245
8052	NC_020050	ATA	2	6	409785	409790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_020050	AGC	2	6	409862	409867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_020050	CTT	2	6	409870	409875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_020050	T	7	7	409903	409909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_020050	CTT	2	6	409912	409917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_020050	AGA	2	6	409990	409995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_020050	AAC	2	6	410001	410006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_020050	CAA	2	6	410040	410045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_020050	ATC	2	6	410052	410057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_020050	AGT	2	6	410064	410069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_020050	AGG	2	6	410088	410093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_020050	ACC	2	6	410100	410105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_020050	CAC	2	6	410172	410177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8066	NC_020050	GAC	2	6	410346	410351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8070	NC_020050	TGT	2	6	410525	410530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8072	NC_020050	A	6	6	410737	410742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_020050	TAC	2	6	410792	410797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_020050	CGA	2	6	410837	410842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8076	NC_020050	CTT	2	6	410954	410959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_020050	CTA	2	6	411014	411019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8080	NC_020050	GTA	2	6	411065	411070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8082	NC_020050	CTA	2	6	411155	411160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_020050	TTC	2	6	411219	411224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_020050	GAT	2	6	411227	411232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_020050	TGG	2	6	411366	411371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_020050	TGA	3	9	411372	411380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8091	NC_020050	TAA	2	6	411408	411413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_020050	TGC	2	6	411466	411471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8094	NC_020050	T	6	6	411489	411494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_020050	CTGG	2	8	411499	411506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8097	NC_020050	TC	3	6	411607	411612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8098	NC_020050	CGG	2	6	411727	411732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_020050	CAAC	2	8	411784	411791	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_020050	TGA	2	6	411827	411832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8102	NC_020050	ACA	2	6	411876	411881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_020050	TGT	2	6	411893	411898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_020050	A	7	7	411925	411931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_020050	ACA	2	6	411944	411949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_020050	CCT	2	6	411970	411975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8107	NC_020050	GCAA	2	8	412049	412056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_020050	AGT	2	6	412109	412114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_020050	AGT	2	6	412137	412142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_020050	AAG	2	6	412212	412217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_020050	TGC	2	6	412244	412249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_020050	AG	3	6	412311	412316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_020050	A	6	6	412321	412326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_020050	A	6	6	412502	412507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_020050	GCA	2	6	412513	412518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_020050	A	7	7	412526	412532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_020050	CAA	2	6	412600	412605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_020050	TGGG	2	8	412759	412766	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_020050	A	8	8	412813	412820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_020050	AGATT	2	10	412865	412874	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_020050	CT	3	6	412990	412995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8122	NC_020050	AGT	2	6	413053	413058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_020050	AAT	2	6	413075	413080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_020050	ATGG	2	8	413084	413091	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_020050	ATT	2	6	413104	413109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_020050	AGT	3	9	413149	413157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_020050	TGG	2	6	413273	413278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_020050	TAA	2	6	413361	413366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_020050	CAA	2	6	413372	413377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_020050	TGC	2	6	413399	413404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_020050	ATA	2	6	413416	413421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_020050	ACA	2	6	413461	413466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8133	NC_020050	CTG	2	6	413475	413480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8135	NC_020050	CTC	2	6	413542	413547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8137	NC_020050	TTG	2	6	413602	413607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8152	NC_020050	TCT	2	6	414453	414458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8259	NC_020050	GAAAA	2	10	419855	419864	80 %	0 %	20 %	0 %	436670250
8260	NC_020050	T	6	6	419880	419885	0 %	100 %	0 %	0 %	436670250
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8262	NC_020050	AG	3	6	420205	420210	50 %	0 %	50 %	0 %	436670250
8263	NC_020050	GTT	2	6	420240	420245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8264	NC_020050	GCA	2	6	420310	420315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8265	NC_020050	GGCT	2	8	420340	420347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8266	NC_020050	TAA	2	6	420397	420402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8267	NC_020050	GCTT	2	8	420423	420430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8268	NC_020050	CAT	2	6	420460	420465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8269	NC_020050	CCG	2	6	420481	420486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8270	NC_020050	TC	3	6	420526	420531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8271	NC_020050	ATTT	2	8	420597	420604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8272	NC_020050	GGCTT	2	10	420616	420625	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8273	NC_020050	T	6	6	420627	420632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8274	NC_020050	CCG	2	6	420634	420639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8275	NC_020050	GCATA	2	10	420699	420708	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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8283	NC_020050	ATCC	2	8	421015	421022	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8284	NC_020050	CTG	2	6	421028	421033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8286	NC_020050	TCC	2	6	421089	421094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8381	NC_020050	T	6	6	426098	426103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8382	NC_020050	A	6	6	426137	426142	100 %	0 %	0 %	0 %	436670255
8383	NC_020050	GAA	2	6	426180	426185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670255
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8493	NC_020050	AAT	2	6	431707	431712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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