MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 8493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_020050	ACA	2	6	383659	383664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670231
7502	NC_020050	GATA	2	8	383684	383691	50 %	25 %	25 %	0 %	436670231
7503	NC_020050	AGT	3	9	383693	383701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670231
7504	NC_020050	ACT	2	6	383706	383711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670231
7505	NC_020050	TAAA	2	8	383731	383738	75 %	25 %	0 %	0 %	436670231
7506	NC_020050	ATT	2	6	383746	383751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670231
7507	NC_020050	ATC	2	6	383762	383767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670231
7508	NC_020050	ACG	2	6	383774	383779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670231
7509	NC_020050	GAA	2	6	383804	383809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670231
7510	NC_020050	ATG	2	6	383938	383943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670231
7511	NC_020050	GAA	2	6	383984	383989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670231
7512	NC_020050	GTA	2	6	383994	383999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670231
7513	NC_020050	ACA	2	6	384025	384030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670231
7514	NC_020050	AATT	2	8	384079	384086	50 %	50 %	0 %	0 %	436670231
7515	NC_020050	CTA	2	6	384096	384101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670231
7516	NC_020050	AT	3	6	384107	384112	50 %	50 %	0 %	0 %	436670231
7517	NC_020050	TGT	2	6	384161	384166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670231
7518	NC_020050	GTT	2	6	384173	384178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670231
7519	NC_020050	GCA	2	6	384249	384254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670231
7520	NC_020050	GAT	2	6	384276	384281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670231
7521	NC_020050	AAG	2	6	384304	384309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670231
7522	NC_020050	A	6	6	384314	384319	100 %	0 %	0 %	0 %	436670231
7523	NC_020050	ATT	2	6	384337	384342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670231
7524	NC_020050	TGGA	2	8	384461	384468	25 %	25 %	50 %	0 %	436670231
7525	NC_020050	TTAA	2	8	384474	384481	50 %	50 %	0 %	0 %	436670231
7526	NC_020050	ATT	2	6	384585	384590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670231
7527	NC_020050	GCAA	2	8	384596	384603	50 %	0 %	25 %	25 %	436670231
7528	NC_020050	AAATCT	2	12	384737	384748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	436670231
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7530	NC_020050	TTA	2	6	384841	384846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670231
7531	NC_020050	ATC	2	6	384854	384859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670231
7532	NC_020050	AAG	2	6	384901	384906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670231
7533	NC_020050	AGA	2	6	384940	384945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670231
7534	NC_020050	CAA	2	6	384957	384962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670231
7535	NC_020050	TGTC	2	8	384965	384972	0 %	50 %	25 %	25 %	436670231
7536	NC_020050	ATG	2	6	384997	385002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670231
7537	NC_020050	TCA	2	6	385016	385021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670231
7538	NC_020050	GTG	3	9	385042	385050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670231
7539	NC_020050	CTTG	2	8	385128	385135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7540	NC_020050	TAT	2	6	385222	385227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_020050	TGA	2	6	385339	385344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_020050	A	7	7	385428	385434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_020050	TTAT	2	8	385456	385463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_020050	AGA	2	6	385534	385539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_020050	T	8	8	385544	385551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_020050	CTT	2	6	385566	385571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_020050	ATTT	2	8	385599	385606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_020050	TCT	2	6	385618	385623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_020050	TAA	2	6	385666	385671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_020050	AT	3	6	385672	385677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_020050	TGC	2	6	385708	385713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670232
7552	NC_020050	AAG	2	6	385715	385720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670232
7553	NC_020050	CTG	2	6	385752	385757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670232
7554	NC_020050	T	6	6	385814	385819	0 %	100 %	0 %	0 %	436670232
7555	NC_020050	GGTA	2	8	385863	385870	25 %	25 %	50 %	0 %	436670232
7556	NC_020050	AT	3	6	385878	385883	50 %	50 %	0 %	0 %	436670232
7557	NC_020050	T	6	6	386019	386024	0 %	100 %	0 %	0 %	436670232
7558	NC_020050	T	6	6	386034	386039	0 %	100 %	0 %	0 %	436670232
7559	NC_020050	CTT	2	6	386049	386054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670232
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7561	NC_020050	TAG	2	6	386103	386108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670232
7562	NC_020050	TGG	2	6	386150	386155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_020050	A	8	8	386161	386168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_020050	TAA	2	6	386197	386202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_020050	TGAT	2	8	386219	386226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_020050	TTAT	2	8	386353	386360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_020050	TTTA	2	8	386361	386368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_020050	CT	3	6	386386	386391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7569	NC_020050	A	6	6	386420	386425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_020050	A	6	6	386446	386451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_020050	CATTG	2	10	386508	386517	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7572	NC_020050	ATT	3	9	386525	386533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_020050	CAA	2	6	386576	386581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7574	NC_020050	TCA	2	6	386590	386595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_020050	GGA	2	6	386651	386656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670233
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7577	NC_020050	TTC	2	6	387153	387158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670233
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7579	NC_020050	GA	3	6	387286	387291	50 %	0 %	50 %	0 %	436670233
7580	NC_020050	CAG	2	6	387371	387376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670233
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7583	NC_020050	GAC	2	6	387428	387433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670233
7584	NC_020050	TTG	2	6	387477	387482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670233
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7588	NC_020050	TGC	2	6	387634	387639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670233
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7590	NC_020050	A	8	8	387701	387708	100 %	0 %	0 %	0 %	436670233
7591	NC_020050	ATC	2	6	387981	387986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7593	NC_020050	AC	3	6	388142	388147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7594	NC_020050	T	6	6	388149	388154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_020050	TTC	2	6	388169	388174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7596	NC_020050	GGA	2	6	388250	388255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_020050	ATA	2	6	388277	388282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670234
7598	NC_020050	CCTT	2	8	388389	388396	0 %	50 %	0 %	50 %	436670234
7599	NC_020050	ACT	2	6	388424	388429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670234
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7602	NC_020050	TAC	2	6	388522	388527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670234
7603	NC_020050	A	6	6	388529	388534	100 %	0 %	0 %	0 %	436670234
7604	NC_020050	GTC	2	6	388547	388552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670234
7605	NC_020050	TAA	2	6	388572	388577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670234
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7607	NC_020050	ATT	2	6	388624	388629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670234
7608	NC_020050	CAA	2	6	388687	388692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670234
7609	NC_020050	GAA	2	6	388693	388698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670234
7610	NC_020050	AGC	2	6	388706	388711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670234
7611	NC_020050	TTA	2	6	388736	388741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670234
7612	NC_020050	AT	3	6	388753	388758	50 %	50 %	0 %	0 %	436670234
7613	NC_020050	AGC	2	6	388779	388784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670234
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7616	NC_020050	TA	3	6	389114	389119	50 %	50 %	0 %	0 %	436670234
7617	NC_020050	TTG	2	6	389170	389175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670234
7618	NC_020050	CAGT	2	8	389210	389217	25 %	25 %	25 %	25 %	436670234
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7621	NC_020050	CTG	2	6	389266	389271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670234
7622	NC_020050	TGA	2	6	389304	389309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670234
7623	NC_020050	AGA	2	6	389352	389357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670234
7624	NC_020050	AAGA	2	8	389378	389385	75 %	0 %	25 %	0 %	436670234
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