MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 8493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020050	TTCCTG	2	12	278557	278568	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	436670166
5502	NC_020050	AAT	2	6	278623	278628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670166
5503	NC_020050	GTTG	2	8	278640	278647	0 %	50 %	50 %	0 %	436670166
5504	NC_020050	TG	3	6	278646	278651	0 %	50 %	50 %	0 %	436670166
5505	NC_020050	GCTAC	2	10	278652	278661	20 %	20 %	20 %	40 %	436670166
5506	NC_020050	TAA	2	6	278671	278676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670166
5507	NC_020050	CCAA	2	8	278684	278691	50 %	0 %	0 %	50 %	436670166
5508	NC_020050	AAC	2	6	278738	278743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670166
5509	NC_020050	TGT	2	6	278749	278754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670166
5510	NC_020050	CAA	2	6	278908	278913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670166
5511	NC_020050	TCC	2	6	278921	278926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436670166
5512	NC_020050	CTT	2	6	278959	278964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670166
5513	NC_020050	CAC	2	6	278981	278986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670166
5514	NC_020050	CTT	2	6	278998	279003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670166
5515	NC_020050	TAC	2	6	279043	279048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670166
5516	NC_020050	TGA	2	6	279052	279057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670166
5517	NC_020050	GAGC	2	8	279267	279274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5518	NC_020050	CTGA	2	8	279283	279290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5519	NC_020050	CTTCT	2	10	279366	279375	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5520	NC_020050	GTG	2	6	279376	279381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_020050	ATTG	2	8	279456	279463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_020050	AAG	2	6	279506	279511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670167
5523	NC_020050	TAG	2	6	279512	279517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670167
5524	NC_020050	GCA	2	6	279625	279630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670167
5525	NC_020050	TGC	5	15	279795	279809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670167
5526	NC_020050	GCA	2	6	279816	279821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670167
5527	NC_020050	CAG	2	6	279836	279841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670167
5528	NC_020050	TGC	2	6	279935	279940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670167
5529	NC_020050	CTG	2	6	279947	279952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670167
5530	NC_020050	TC	4	8	280048	280055	0 %	50 %	0 %	50 %	436670167
5531	NC_020050	AGC	2	6	280060	280065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670167
5532	NC_020050	ACT	2	6	280087	280092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670167
5533	NC_020050	TGCAA	2	10	280138	280147	40 %	20 %	20 %	20 %	436670167
5534	NC_020050	AGC	2	6	280218	280223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670167
5535	NC_020050	CAA	2	6	280232	280237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670167
5536	NC_020050	TCT	2	6	280279	280284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670167
5537	NC_020050	TGC	2	6	280296	280301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670167
5538	NC_020050	CAT	2	6	280407	280412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670167
5539	NC_020050	TCA	2	6	280444	280449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670167
5540	NC_020050	TCA	2	6	280586	280591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670167
5541	NC_020050	TGT	2	6	280863	280868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670168
5542	NC_020050	CGTC	2	8	280871	280878	0 %	25 %	25 %	50 %	436670168
5543	NC_020050	CAG	2	6	280896	280901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670168
5544	NC_020050	CAA	2	6	280959	280964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670168
5545	NC_020050	CAA	2	6	281001	281006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670168
5546	NC_020050	GCA	2	6	281076	281081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670168
5547	NC_020050	GAT	2	6	281082	281087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670168
5548	NC_020050	TCA	2	6	281118	281123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670168
5549	NC_020050	CT	3	6	281135	281140	0 %	50 %	0 %	50 %	436670168
5550	NC_020050	TTG	2	6	281212	281217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670168
5551	NC_020050	CAT	2	6	281239	281244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670168
5552	NC_020050	CT	3	6	281286	281291	0 %	50 %	0 %	50 %	436670168
5553	NC_020050	GAG	2	6	281297	281302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670168
5554	NC_020050	AG	3	6	281301	281306	50 %	0 %	50 %	0 %	436670168
5555	NC_020050	G	6	6	281332	281337	0 %	0 %	100 %	0 %	436670168
5556	NC_020050	G	6	6	281340	281345	0 %	0 %	100 %	0 %	436670168
5557	NC_020050	AACA	2	8	281428	281435	75 %	0 %	0 %	25 %	436670168
5558	NC_020050	CAGC	2	8	281733	281740	25 %	0 %	25 %	50 %	436670168
5559	NC_020050	GAA	2	6	281742	281747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670168
5560	NC_020050	CTG	3	9	281751	281759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670168
5561	NC_020050	ACA	2	6	281805	281810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670168
5562	NC_020050	TTC	2	6	281833	281838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670168
5563	NC_020050	GGC	2	6	281842	281847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436670168
5564	NC_020050	TGG	2	6	281910	281915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670168
5565	NC_020050	TCA	3	9	281990	281998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670168
5566	NC_020050	GCCCG	2	10	282187	282196	0 %	0 %	40 %	60 %	436670168
5567	NC_020050	GCT	2	6	282302	282307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670168
5568	NC_020050	GCA	2	6	282327	282332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670168
5569	NC_020050	TCT	2	6	282416	282421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670168
5570	NC_020050	TGAC	2	8	282514	282521	25 %	25 %	25 %	25 %	436670168
5571	NC_020050	GCA	2	6	282524	282529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670168
5572	NC_020050	TCA	2	6	282548	282553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670168
5573	NC_020050	GTA	2	6	282560	282565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436670168
5574	NC_020050	CTGAT	2	10	282568	282577	20 %	40 %	20 %	20 %	436670168
5575	NC_020050	TGT	2	6	282624	282629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436670168
5576	NC_020050	GA	3	6	282839	282844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_020050	GACT	2	8	282866	282873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5578	NC_020050	ATC	2	6	282884	282889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_020050	TTG	2	6	282900	282905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_020050	GCCA	2	8	282986	282993	25 %	0 %	25 %	50 %	436670169
5581	NC_020050	GGCT	2	8	283017	283024	0 %	25 %	50 %	25 %	436670169
5582	NC_020050	CAGT	2	8	283032	283039	25 %	25 %	25 %	25 %	436670169
5583	NC_020050	CTT	2	6	283042	283047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436670169
5584	NC_020050	GAAA	2	8	283111	283118	75 %	0 %	25 %	0 %	436670169
5585	NC_020050	A	6	6	283148	283153	100 %	0 %	0 %	0 %	436670169
5586	NC_020050	AAG	2	6	283174	283179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670169
5587	NC_020050	GAA	2	6	283241	283246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670169
5588	NC_020050	TCA	2	6	283290	283295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670169
5589	NC_020050	GGGA	2	8	283309	283316	25 %	0 %	75 %	0 %	436670169
5590	NC_020050	CCA	2	6	283403	283408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436670169
5591	NC_020050	TTAA	2	8	283430	283437	50 %	50 %	0 %	0 %	436670169
5592	NC_020050	T	7	7	283439	283445	0 %	100 %	0 %	0 %	436670169
5593	NC_020050	TTA	2	6	283529	283534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670169
5594	NC_020050	ATA	2	6	283542	283547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670169
5595	NC_020050	GAA	2	6	283568	283573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670169
5596	NC_020050	ATCA	2	8	283637	283644	50 %	25 %	0 %	25 %	436670169
5597	NC_020050	AAAG	2	8	283697	283704	75 %	0 %	25 %	0 %	436670169
5598	NC_020050	ATTAAG	2	12	283726	283737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	436670169
5599	NC_020050	CAAA	2	8	283773	283780	75 %	0 %	0 %	25 %	436670169
5600	NC_020050	ATT	2	6	283821	283826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670169
5601	NC_020050	ACT	2	6	283862	283867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670169
5602	NC_020050	CTG	2	6	283893	283898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670169
5603	NC_020050	ACA	2	6	283906	283911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670169
5604	NC_020050	AGC	2	6	283950	283955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670169
5605	NC_020050	GAA	2	6	284119	284124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670169
5606	NC_020050	CAA	2	6	284141	284146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670169
5607	NC_020050	GTG	2	6	284150	284155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436670169
5608	NC_020050	GAA	2	6	284195	284200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436670169
5609	NC_020050	TAA	2	6	284227	284232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436670169
5610	NC_020050	T	7	7	284323	284329	0 %	100 %	0 %	0 %	436670169
5611	NC_020050	AG	3	6	284336	284341	50 %	0 %	50 %	0 %	436670169
5612	NC_020050	ACT	2	6	284352	284357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436670169
5613	NC_020050	AGG	2	6	284575	284580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436670169
5614	NC_020050	GCT	2	6	284614	284619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436670169
5615	NC_020050	CAA	2	6	284622	284627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436670169
5616	NC_020050	ATTT	2	8	284642	284649	25 %	75 %	0 %	0 %	436670169
5617	NC_020050	CAAA	2	8	284668	284675	75 %	0 %	0 %	25 %	436670169
5618	NC_020050	GCA	2	6	284751	284756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670169
5619	NC_020050	GCA	2	6	284877	284882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436670169
5620	NC_020050	ATT	2	6	285059	285064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436670169
5621	NC_020050	TAGC	2	8	285162	285169	25 %	25 %	25 %	25 %	436670169
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5623	NC_020050	TG	3	6	285208	285213	0 %	50 %	50 %	0 %	436670169
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5741	NC_020050	T	6	6	291977	291982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5742	NC_020050	AGTA	2	8	291983	291990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5753	NC_020050	AGTGA	2	10	292555	292564	40 %	20 %	40 %	0 %	436670172
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5995	NC_020050	GAT	2	6	306796	306801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5996	NC_020050	ATT	2	6	306824	306829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5997	NC_020050	TA	3	6	306878	306883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5998	NC_020050	TAGT	2	8	307022	307029	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5999	NC_020050	TGC	2	6	307090	307095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6000	NC_020050	TGA	2	6	307152	307157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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