MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii (ex Angomonas deanei ATCC 30255)

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019815	TTAGAC	2	12	7491	7502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429462520
2	NC_019815	AGGTAC	2	12	8030	8041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462520
3	NC_019815	GATTCT	2	12	9384	9395	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429462520
4	NC_019815	TTTTAT	2	12	10377	10388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019815	CAAGAT	2	12	10820	10831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429462522
6	NC_019815	TTTATA	2	12	15309	15320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429462526
7	NC_019815	TTGTGT	2	12	16576	16587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019815	GATGGA	2	12	18530	18541	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	429462530
9	NC_019815	CTATTG	2	12	31449	31460	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429462540
10	NC_019815	AATACA	2	12	44031	44042	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019815	GATGTG	2	12	44890	44901	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	429462543
12	NC_019815	TGCTAA	2	12	45693	45704	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429462544
13	NC_019815	TCTTTA	2	12	52172	52183	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429462547
14	NC_019815	CATAGC	2	12	55476	55487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462550
15	NC_019815	GGGTGA	2	12	55608	55619	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	429462550
16	NC_019815	ACTAGA	2	12	56272	56283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429462550
17	NC_019815	GTACAG	2	12	57953	57964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462552
18	NC_019815	TAATGT	2	12	58245	58256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462552
19	NC_019815	TTTTTA	2	12	59925	59936	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429462554
20	NC_019815	TAAATT	2	12	60365	60376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019815	AAAATC	2	12	60384	60395	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019815	CTTTTT	2	12	60448	60459	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	429462555
23	NC_019815	ATAGAA	2	12	62738	62749	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429462555
24	NC_019815	ATAATG	2	12	64417	64428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462557
25	NC_019815	TTGTTC	2	12	66326	66337	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	429462558
26	NC_019815	ATATCA	2	12	67184	67195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429462559
27	NC_019815	ATTTCT	2	12	72809	72820	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429462565
28	NC_019815	GCGTTT	2	12	72834	72845	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	429462565
29	NC_019815	ATTAGT	2	12	73435	73446	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462565
30	NC_019815	CATTGC	2	12	73936	73947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429462565
31	NC_019815	TTAGAA	2	12	78770	78781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462572
32	NC_019815	CTACAA	2	12	79287	79298	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	429462572
33	NC_019815	TCCTGA	2	12	81565	81576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429462572
34	NC_019815	ATTACA	2	12	81863	81874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429462572
35	NC_019815	TATCTA	2	12	82659	82670	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429462572
36	NC_019815	ATGAAA	2	12	82722	82733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429462572
37	NC_019815	GCCAGA	2	12	83419	83430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429462572
38	NC_019815	TGAGTT	2	12	88588	88599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429462577
39	NC_019815	ATATTT	2	12	88839	88850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429462577
40	NC_019815	TATTTC	2	12	91264	91275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429462579
41	NC_019815	TAAGAC	2	12	92136	92147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429462581
42	NC_019815	GCAACT	2	12	92648	92659	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462581
43	NC_019815	TCATTA	2	12	95209	95220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429462583
44	NC_019815	ATATTT	2	12	96718	96729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019815	AAATAT	2	12	96732	96743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019815	AAAATA	2	12	96795	96806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462585
47	NC_019815	TACTAA	2	12	97570	97581	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429462585
48	NC_019815	TTTTAT	2	12	103013	103024	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429462591
49	NC_019815	TCAATT	2	12	103176	103187	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429462591
50	NC_019815	AAATAA	2	12	107138	107149	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462595
51	NC_019815	AAAATA	2	12	111911	111922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462598
52	NC_019815	AAACTA	2	12	112503	112514	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429462599
53	NC_019815	CAATGG	2	12	115997	116008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462602
54	NC_019815	ATTCTG	2	12	116488	116499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429462602
55	NC_019815	TGTTTT	2	12	116747	116758	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019815	AAATAA	2	12	118176	118187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462603
57	NC_019815	TGCTAT	2	12	124503	124514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429462609
58	NC_019815	GTATTT	2	12	124996	125007	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429462609
59	NC_019815	AAACCA	2	12	126326	126337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429462611
60	NC_019815	TAGTTA	2	12	126690	126701	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462611
61	NC_019815	ATGAGT	2	12	134543	134554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429462619
62	NC_019815	GTTATG	2	12	141243	141254	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429462625
63	NC_019815	ATTGTT	2	12	141799	141810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429462626
64	NC_019815	TTGTTT	2	12	142721	142732	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	429462627
65	NC_019815	ATTGGT	2	12	152632	152643	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429462632
66	NC_019815	ATAGAG	2	12	153270	153281	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429462633
67	NC_019815	ACTTGC	2	12	154156	154167	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429462634
68	NC_019815	TTATAT	2	12	159916	159927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429462640
69	NC_019815	CAACTG	2	12	160144	160155	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462640
70	NC_019815	TTTGGA	2	12	160494	160505	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	429462640
71	NC_019815	TTCAAT	2	12	163855	163866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019815	AGTTGG	2	12	166045	166056	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	429462646
73	NC_019815	ATTTTT	2	12	167864	167875	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429462648
74	NC_019815	AAATAT	2	12	170153	170164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429462649
75	NC_019815	TCAGCA	2	12	174207	174218	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462654
76	NC_019815	TAAATA	2	12	174882	174893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019815	TGAAAT	2	12	179491	179502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462659
78	NC_019815	ATTTTT	2	12	181780	181791	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	429462661
79	NC_019815	ATTTAT	2	12	186159	186170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429462667
80	NC_019815	TATAAT	2	12	186742	186753	50 %	50 %	0 %	0 %	429462667
81	NC_019815	TTATCA	2	12	187283	187294	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429462667
82	NC_019815	ATTTAA	2	12	188922	188933	50 %	50 %	0 %	0 %	429462669
83	NC_019815	AGTGAT	2	12	190803	190814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429462671
84	NC_019815	CTTTAG	2	12	190876	190887	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429462671
85	NC_019815	GATAAT	2	12	191445	191456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462671
86	NC_019815	GAATTT	2	12	192284	192295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462672
87	NC_019815	ATTTTA	2	12	193665	193676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019815	AAAATA	2	12	194717	194728	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462673
89	NC_019815	CGTCAT	2	12	195146	195157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429462673
90	NC_019815	ATTTTT	2	12	195593	195604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019815	TTCCAC	2	12	197532	197543	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	429462675
92	NC_019815	ATTTTG	2	12	198206	198217	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429462675
93	NC_019815	GCATCA	2	12	199399	199410	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462677
94	NC_019815	GCTAGA	2	12	202741	202752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462679
95	NC_019815	AATTGA	2	12	204738	204749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	429462680
96	NC_019815	ATTTTT	2	12	205844	205855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019815	ATAAAG	2	12	206741	206752	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429462681
98	NC_019815	AGAGCA	2	12	207142	207153	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	429462681
99	NC_019815	ATCAAA	2	12	211485	211496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429462685
100	NC_019815	AAAATA	2	12	216043	216054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462688
101	NC_019815	TATATG	2	12	218679	218690	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462690
102	NC_019815	AAATAA	2	12	219522	219533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462691
103	NC_019815	GTTGAA	2	12	221995	222006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429462693
104	NC_019815	ACATAA	2	12	223993	224004	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429462695
105	NC_019815	ATCTTA	2	12	224781	224792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429462696
106	NC_019815	GGAAAA	2	12	234577	234588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429462706
107	NC_019815	CTGAAG	2	12	235032	235043	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462706
108	NC_019815	GTAAAG	2	12	236612	236623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429462706
109	NC_019815	AAAATT	2	12	241502	241513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429462710
110	NC_019815	TTAATA	2	12	245708	245719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019815	ATTAAT	2	12	246192	246203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019815	TTTTAT	2	12	248634	248645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019815	ATTTTT	2	12	248716	248727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019815	AAGGAA	2	12	250951	250962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429462716
115	NC_019815	CTGTTG	2	12	251840	251851	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	429462718
116	NC_019815	CAATGT	2	12	252155	252166	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429462719
117	NC_019815	TTTCTA	2	12	254508	254519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429462722
118	NC_019815	TTTCCA	2	12	255844	255855	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	429462722
119	NC_019815	TATTTT	2	12	256359	256370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019815	TGTTTT	2	12	256436	256447	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019815	ATTGAT	2	12	260875	260886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462727
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231	NC_019815	AAATTC	2	12	453895	453906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429462915
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233	NC_019815	ATATTT	2	12	455265	455276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_019815	CCAGAT	2	12	455571	455582	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429462916
235	NC_019815	TTTAGA	2	12	456116	456127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	429462916
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237	NC_019815	GCTACT	2	12	459178	459189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429462920
238	NC_019815	AAATAA	2	12	459528	459539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	429462921
239	NC_019815	ATAATT	2	12	463152	463163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_019815	CAGAAA	2	12	467809	467820	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
241	NC_019815	AAGTGA	2	12	468614	468625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429462925
242	NC_019815	AATGGC	2	12	468960	468971	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429462925
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244	NC_019815	AATTAT	2	12	469596	469607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_019815	ATTTAT	2	12	470092	470103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429462926
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310	NC_019815	CATCAC	2	12	599204	599215	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	429463055
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312	NC_019815	GCTCAT	2	12	600688	600699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429463058
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321	NC_019815	ATTAGA	2	12	624064	624075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
322	NC_019815	AGCTAG	2	12	624847	624858	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429463085
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338	NC_019815	GCTATA	2	12	650165	650176	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429463103
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340	NC_019815	ATATCA	2	12	655979	655990	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429463111
341	NC_019815	ATATTT	2	12	656075	656086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463111
342	NC_019815	GAAGGA	2	12	656887	656898	50 %	0 %	50 %	0 %	429463112
343	NC_019815	AGCTTC	2	12	661556	661567	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429463117
344	NC_019815	ATTGTT	2	12	669315	669326	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429463124
345	NC_019815	AGGAGC	2	12	671658	671669	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429463125
346	NC_019815	CATTAG	2	12	673560	673571	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429463126
347	NC_019815	CTAGCT	2	12	675160	675171	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429463128
348	NC_019815	TCTGGT	2	12	678284	678295	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	429463131
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350	NC_019815	CTTTTA	2	12	679965	679976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429463133
351	NC_019815	CTATTG	2	12	683698	683709	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	429463137
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353	NC_019815	TTTAAT	2	12	687684	687695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429463142
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.