MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 1829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019791	TAGGG	2	10	927	936	20 %	20 %	60 %	0 %	429216256
2	NC_019791	CAATA	2	10	2484	2493	60 %	20 %	0 %	20 %	429216258
3	NC_019791	CTTTC	2	10	2897	2906	0 %	60 %	0 %	40 %	429216259
4	NC_019791	TAAAA	2	10	3072	3081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019791	AATTT	2	10	4573	4582	40 %	60 %	0 %	0 %	429216261
6	NC_019791	TATAA	2	10	6644	6653	60 %	40 %	0 %	0 %	429216263
7	NC_019791	AATGG	2	10	6668	6677	40 %	20 %	40 %	0 %	429216264
8	NC_019791	ATATT	2	10	7818	7827	40 %	60 %	0 %	0 %	429216265
9	NC_019791	TCTTT	2	10	10052	10061	0 %	80 %	0 %	20 %	429216267
10	NC_019791	TGCAT	2	10	10856	10865	20 %	40 %	20 %	20 %	429216268
11	NC_019791	ATTTA	2	10	11966	11975	40 %	60 %	0 %	0 %	429216269
12	NC_019791	AGTTT	2	10	11988	11997	20 %	60 %	20 %	0 %	429216269
13	NC_019791	TTTTA	2	10	12482	12491	20 %	80 %	0 %	0 %	429216269
14	NC_019791	AACAA	2	10	17502	17511	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019791	CCTGT	2	10	18900	18909	0 %	40 %	20 %	40 %	429216278
16	NC_019791	TATTT	2	10	20168	20177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019791	ATTTT	2	10	21391	21400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019791	TTCCT	2	10	21598	21607	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_019791	ATTGG	2	10	21923	21932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019791	TAAAT	2	10	22700	22709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019791	TTAAT	2	10	22754	22763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019791	TTTTA	2	10	23178	23187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019791	TCCAT	2	10	25637	25646	20 %	40 %	0 %	40 %	429216284
24	NC_019791	TTTTC	2	10	26250	26259	0 %	80 %	0 %	20 %	429216285
25	NC_019791	ATTTG	2	10	26653	26662	20 %	60 %	20 %	0 %	429216285
26	NC_019791	AATAT	2	10	28641	28650	60 %	40 %	0 %	0 %	429216287
27	NC_019791	TTTCC	2	10	28661	28670	0 %	60 %	0 %	40 %	429216287
28	NC_019791	TTTCC	2	10	28686	28695	0 %	60 %	0 %	40 %	429216287
29	NC_019791	TTATT	2	10	28773	28782	20 %	80 %	0 %	0 %	429216287
30	NC_019791	TAAAC	2	10	29932	29941	60 %	20 %	0 %	20 %	429216289
31	NC_019791	TACTT	2	10	30126	30135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019791	ATTTT	2	10	30138	30147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019791	ATTTC	2	10	31063	31072	20 %	60 %	0 %	20 %	429216290
34	NC_019791	ATTTA	2	10	32301	32310	40 %	60 %	0 %	0 %	429216291
35	NC_019791	CATGA	2	10	33211	33220	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019791	CTAGA	2	10	33890	33899	40 %	20 %	20 %	20 %	429216292
37	NC_019791	TAGAT	2	10	37745	37754	40 %	40 %	20 %	0 %	429216296
38	NC_019791	TTCTT	2	10	38517	38526	0 %	80 %	0 %	20 %	429216297
39	NC_019791	ATTTC	2	10	40012	40021	20 %	60 %	0 %	20 %	429216300
40	NC_019791	ATAGA	2	10	41292	41301	60 %	20 %	20 %	0 %	429216300
41	NC_019791	CTTTA	2	10	42711	42720	20 %	60 %	0 %	20 %	429216300
42	NC_019791	TATAA	2	10	44090	44099	60 %	40 %	0 %	0 %	429216300
43	NC_019791	CTATT	2	10	44483	44492	20 %	60 %	0 %	20 %	429216301
44	NC_019791	ATTTT	2	10	45340	45349	20 %	80 %	0 %	0 %	429216302
45	NC_019791	TTTTA	2	10	45989	45998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019791	TAAAT	2	10	51249	51258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019791	TTTAT	2	10	51458	51467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019791	AAGTA	2	10	52076	52085	60 %	20 %	20 %	0 %	429216310
49	NC_019791	TCCTA	2	10	53041	53050	20 %	40 %	0 %	40 %	429216310
50	NC_019791	TTATC	2	10	54208	54217	20 %	60 %	0 %	20 %	429216311
51	NC_019791	CAAAT	2	10	54763	54772	60 %	20 %	0 %	20 %	429216312
52	NC_019791	ATCCA	2	10	54949	54958	40 %	20 %	0 %	40 %	429216312
53	NC_019791	TTTCT	2	10	55222	55231	0 %	80 %	0 %	20 %	429216313
54	NC_019791	AAGAA	2	10	57595	57604	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019791	TTAAT	2	10	57704	57713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019791	ATTAT	2	10	57953	57962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019791	TAATA	2	10	58700	58709	60 %	40 %	0 %	0 %	429216316
58	NC_019791	TTATT	2	10	60106	60115	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019791	CAAAA	2	10	61839	61848	80 %	0 %	0 %	20 %	429216318
60	NC_019791	AGCAG	2	10	65371	65380	40 %	0 %	40 %	20 %	429216319
61	NC_019791	TTAAT	2	10	66333	66342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019791	TTAAA	2	10	66987	66996	60 %	40 %	0 %	0 %	429216321
63	NC_019791	TATAA	2	10	67630	67639	60 %	40 %	0 %	0 %	429216321
64	NC_019791	AGAAT	2	10	67915	67924	60 %	20 %	20 %	0 %	429216321
65	NC_019791	ATTAC	2	10	68258	68267	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_019791	GAATT	2	10	70638	70647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019791	AATTT	2	10	71715	71724	40 %	60 %	0 %	0 %	429216325
68	NC_019791	TATAA	2	10	71967	71976	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019791	AGAGG	2	10	73142	73151	40 %	0 %	60 %	0 %	429216326
70	NC_019791	ATTTT	2	10	78513	78522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019791	AATTT	2	10	78698	78707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019791	TTAAT	2	10	79425	79434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019791	GCAAC	2	10	80047	80056	40 %	0 %	20 %	40 %	429216331
74	NC_019791	ATTGA	2	10	80552	80561	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019791	TATTT	2	10	81361	81370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019791	GAAAA	2	10	83410	83419	80 %	0 %	20 %	0 %	429216334
77	NC_019791	TTCTT	2	10	85013	85022	0 %	80 %	0 %	20 %	429216336
78	NC_019791	GTATT	2	10	87021	87030	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019791	AGATG	2	10	87204	87213	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019791	AGGTA	2	10	88459	88468	40 %	20 %	40 %	0 %	429216339
81	NC_019791	TAATA	2	10	88771	88780	60 %	40 %	0 %	0 %	429216339
82	NC_019791	TTAAA	2	10	89047	89056	60 %	40 %	0 %	0 %	429216340
83	NC_019791	TTGAT	2	10	89451	89460	20 %	60 %	20 %	0 %	429216341
84	NC_019791	ATAAA	2	10	90064	90073	80 %	20 %	0 %	0 %	429216341
85	NC_019791	ATTAA	2	10	90836	90845	60 %	40 %	0 %	0 %	429216342
86	NC_019791	TAAAA	2	10	90849	90858	80 %	20 %	0 %	0 %	429216342
87	NC_019791	GAATT	2	10	90924	90933	40 %	40 %	20 %	0 %	429216343
88	NC_019791	ATGTT	2	10	92188	92197	20 %	60 %	20 %	0 %	429216344
89	NC_019791	AAACA	2	10	92521	92530	80 %	0 %	0 %	20 %	429216344
90	NC_019791	AAAGA	2	10	94454	94463	80 %	0 %	20 %	0 %	429216345
91	NC_019791	AATTC	2	10	94597	94606	40 %	40 %	0 %	20 %	429216345
92	NC_019791	TTTTA	2	10	94848	94857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019791	ATTTT	2	10	94926	94935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019791	TATTC	2	10	95671	95680	20 %	60 %	0 %	20 %	429216346
95	NC_019791	TATTT	2	10	96066	96075	20 %	80 %	0 %	0 %	429216347
96	NC_019791	ATTAA	2	10	98555	98564	60 %	40 %	0 %	0 %	429216350
97	NC_019791	TTTAT	2	10	99615	99624	20 %	80 %	0 %	0 %	429216351
98	NC_019791	TTAAA	2	10	99852	99861	60 %	40 %	0 %	0 %	429216352
99	NC_019791	TTTTC	2	10	99870	99879	0 %	80 %	0 %	20 %	429216352
100	NC_019791	TTTAT	2	10	100733	100742	20 %	80 %	0 %	0 %	429216352
101	NC_019791	GAAAA	2	10	102046	102055	80 %	0 %	20 %	0 %	429216354
102	NC_019791	GTAAT	2	10	102972	102981	40 %	40 %	20 %	0 %	429216355
103	NC_019791	TAAAT	2	10	103719	103728	60 %	40 %	0 %	0 %	429216356
104	NC_019791	TAATA	2	10	103740	103749	60 %	40 %	0 %	0 %	429216356
105	NC_019791	AAGAA	2	10	106053	106062	80 %	0 %	20 %	0 %	429216358
106	NC_019791	TAAAA	2	10	106751	106760	80 %	20 %	0 %	0 %	429216359
107	NC_019791	AAGAG	2	10	107458	107467	60 %	0 %	40 %	0 %	429216360
108	NC_019791	AAATA	2	10	108394	108403	80 %	20 %	0 %	0 %	429216360
109	NC_019791	ATTAG	2	10	108642	108651	40 %	40 %	20 %	0 %	429216361
110	NC_019791	TGCTT	2	10	109738	109747	0 %	60 %	20 %	20 %	429216362
111	NC_019791	GGGAT	2	10	110105	110114	20 %	20 %	60 %	0 %	429216362
112	NC_019791	TTAAT	2	10	111495	111504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019791	TATTT	2	10	111946	111955	20 %	80 %	0 %	0 %	429216364
114	NC_019791	ATTTT	2	10	112089	112098	20 %	80 %	0 %	0 %	429216364
115	NC_019791	TTTAA	2	10	112898	112907	40 %	60 %	0 %	0 %	429216365
116	NC_019791	AAAAT	2	10	112974	112983	80 %	20 %	0 %	0 %	429216365
117	NC_019791	GGAAG	2	10	113232	113241	40 %	0 %	60 %	0 %	429216365
118	NC_019791	AAAAT	2	10	113622	113631	80 %	20 %	0 %	0 %	429216365
119	NC_019791	GAAAT	2	10	113679	113688	60 %	20 %	20 %	0 %	429216365
120	NC_019791	TAATC	2	10	114262	114271	40 %	40 %	0 %	20 %	429216366
121	NC_019791	CTTTT	2	10	114434	114443	0 %	80 %	0 %	20 %	429216366
122	NC_019791	ATTAA	2	10	116120	116129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019791	TAAAA	2	10	116288	116297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019791	CAATT	2	10	116715	116724	40 %	40 %	0 %	20 %	429216368
125	NC_019791	TTATA	2	10	118413	118422	40 %	60 %	0 %	0 %	429216369
126	NC_019791	AATAT	2	10	118608	118617	60 %	40 %	0 %	0 %	429216369
127	NC_019791	ATAAA	2	10	118854	118863	80 %	20 %	0 %	0 %	429216369
128	NC_019791	TAAGT	2	10	121046	121055	40 %	40 %	20 %	0 %	429216372
129	NC_019791	TTCTT	2	10	121310	121319	0 %	80 %	0 %	20 %	429216373
130	NC_019791	CCATA	2	10	126239	126248	40 %	20 %	0 %	40 %	429216375
131	NC_019791	AACTA	2	10	126454	126463	60 %	20 %	0 %	20 %	429216375
132	NC_019791	ATTTT	2	10	126476	126485	20 %	80 %	0 %	0 %	429216375
133	NC_019791	GATAT	2	10	126774	126783	40 %	40 %	20 %	0 %	429216376
134	NC_019791	TAATT	2	10	128249	128258	40 %	60 %	0 %	0 %	429216377
135	NC_019791	AAATG	2	10	129045	129054	60 %	20 %	20 %	0 %	429216378
136	NC_019791	TAGCT	2	10	130983	130992	20 %	40 %	20 %	20 %	429216380
137	NC_019791	TAACA	2	10	131445	131454	60 %	20 %	0 %	20 %	429216380
138	NC_019791	GCCAA	2	10	132319	132328	40 %	0 %	20 %	40 %	429216381
139	NC_019791	TTTAA	2	10	132876	132885	40 %	60 %	0 %	0 %	429216381
140	NC_019791	TCATT	2	10	133033	133042	20 %	60 %	0 %	20 %	429216381
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