MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 5081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019791	TATT	2	8	32	39	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019791	TTTA	2	8	238	245	25 %	75 %	0 %	0 %	429216256
3	NC_019791	CTAA	2	8	1535	1542	50 %	25 %	0 %	25 %	429216257
4	NC_019791	TAAA	2	8	2658	2665	75 %	25 %	0 %	0 %	429216258
5	NC_019791	AATG	2	8	3256	3263	50 %	25 %	25 %	0 %	429216260
6	NC_019791	TATT	2	8	3375	3382	25 %	75 %	0 %	0 %	429216261
7	NC_019791	TTCT	2	8	3491	3498	0 %	75 %	0 %	25 %	429216261
8	NC_019791	TAAT	2	8	3882	3889	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
9	NC_019791	ATTA	2	8	3944	3951	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
10	NC_019791	TTAA	2	8	4167	4174	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
11	NC_019791	TATC	2	8	4189	4196	25 %	50 %	0 %	25 %	429216261
12	NC_019791	TTAA	2	8	4281	4288	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
13	NC_019791	ACCA	2	8	4438	4445	50 %	0 %	0 %	50 %	429216261
14	NC_019791	TTTG	2	8	4517	4524	0 %	75 %	25 %	0 %	429216261
15	NC_019791	CATT	2	8	4674	4681	25 %	50 %	0 %	25 %	429216261
16	NC_019791	TAAA	2	8	7220	7227	75 %	25 %	0 %	0 %	429216265
17	NC_019791	AATT	2	8	7523	7530	50 %	50 %	0 %	0 %	429216265
18	NC_019791	AATT	2	8	8051	8058	50 %	50 %	0 %	0 %	429216265
19	NC_019791	CTTC	2	8	8249	8256	0 %	50 %	0 %	50 %	429216266
20	NC_019791	TTTG	2	8	8275	8282	0 %	75 %	25 %	0 %	429216266
21	NC_019791	TCTT	2	8	8305	8312	0 %	75 %	0 %	25 %	429216266
22	NC_019791	AAAT	2	8	8625	8632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019791	ATTA	2	8	9793	9800	50 %	50 %	0 %	0 %	429216267
24	NC_019791	CTAC	2	8	9914	9921	25 %	25 %	0 %	50 %	429216267
25	NC_019791	ATTT	2	8	10629	10636	25 %	75 %	0 %	0 %	429216268
26	NC_019791	AAAT	2	8	10724	10731	75 %	25 %	0 %	0 %	429216268
27	NC_019791	TAAT	2	8	10795	10802	50 %	50 %	0 %	0 %	429216268
28	NC_019791	TATT	2	8	11233	11240	25 %	75 %	0 %	0 %	429216269
29	NC_019791	TTTC	2	8	12571	12578	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019791	AATA	2	8	12639	12646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019791	AACC	2	8	12830	12837	50 %	0 %	0 %	50 %	429216270
32	NC_019791	TAAT	2	8	13064	13071	50 %	50 %	0 %	0 %	429216271
33	NC_019791	CTAT	2	8	13321	13328	25 %	50 %	0 %	25 %	429216271
34	NC_019791	TAAT	2	8	13857	13864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019791	AGCT	2	8	14087	14094	25 %	25 %	25 %	25 %	429216272
36	NC_019791	TTTA	2	8	15194	15201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019791	TAAA	2	8	15290	15297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019791	AATT	2	8	15454	15461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019791	TCAT	2	8	15688	15695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019791	GAAA	2	8	15923	15930	75 %	0 %	25 %	0 %	429216274
41	NC_019791	ATGT	2	8	15972	15979	25 %	50 %	25 %	0 %	429216274
42	NC_019791	TTTA	2	8	16101	16108	25 %	75 %	0 %	0 %	429216274
43	NC_019791	ATCT	2	8	16376	16383	25 %	50 %	0 %	25 %	429216275
44	NC_019791	TAAT	2	8	16719	16726	50 %	50 %	0 %	0 %	429216276
45	NC_019791	ATAA	2	8	16727	16734	75 %	25 %	0 %	0 %	429216276
46	NC_019791	TAAT	2	8	16989	16996	50 %	50 %	0 %	0 %	429216276
47	NC_019791	TGGA	2	8	17129	17136	25 %	25 %	50 %	0 %	429216276
48	NC_019791	ATTT	2	8	17160	17167	25 %	75 %	0 %	0 %	429216276
49	NC_019791	AAGA	2	8	17592	17599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019791	ATAA	2	8	17893	17900	75 %	25 %	0 %	0 %	429216277
51	NC_019791	AGGA	2	8	17981	17988	50 %	0 %	50 %	0 %	429216277
52	NC_019791	TTAT	2	8	18175	18182	25 %	75 %	0 %	0 %	429216277
53	NC_019791	AATT	2	8	18270	18277	50 %	50 %	0 %	0 %	429216277
54	NC_019791	TATT	2	8	19685	19692	25 %	75 %	0 %	0 %	429216278
55	NC_019791	TCTT	2	8	19851	19858	0 %	75 %	0 %	25 %	429216278
56	NC_019791	AGAC	2	8	19970	19977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019791	ATAA	2	8	20054	20061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019791	TGTT	2	8	20181	20188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019791	TCAA	2	8	20329	20336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019791	AATT	2	8	20401	20408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019791	ATTT	2	8	20478	20485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019791	AATT	2	8	20616	20623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019791	CAAT	2	8	21352	21359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019791	TAAA	2	8	21446	21453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019791	ATTT	2	8	21504	21511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019791	ATCC	2	8	22145	22152	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019791	TATT	2	8	22179	22186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019791	TAAT	2	8	22776	22783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019791	ATTA	2	8	22891	22898	50 %	50 %	0 %	0 %	429216279
70	NC_019791	TTCT	2	8	23445	23452	0 %	75 %	0 %	25 %	429216280
71	NC_019791	ATTT	2	8	23673	23680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019791	TAAT	2	8	23710	23717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019791	AATA	2	8	24161	24168	75 %	25 %	0 %	0 %	429216282
74	NC_019791	TAAT	2	8	25355	25362	50 %	50 %	0 %	0 %	429216284
75	NC_019791	TTCC	2	8	25411	25418	0 %	50 %	0 %	50 %	429216284
76	NC_019791	ATTT	2	8	26089	26096	25 %	75 %	0 %	0 %	429216285
77	NC_019791	TATT	2	8	26268	26275	25 %	75 %	0 %	0 %	429216285
78	NC_019791	TAAA	2	8	26362	26369	75 %	25 %	0 %	0 %	429216285
79	NC_019791	TTTA	2	8	27660	27667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019791	ATTA	2	8	27812	27819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019791	TCTT	2	8	28004	28011	0 %	75 %	0 %	25 %	429216287
82	NC_019791	GTAT	2	8	28493	28500	25 %	50 %	25 %	0 %	429216287
83	NC_019791	CCTT	2	8	30002	30009	0 %	50 %	0 %	50 %	429216289
84	NC_019791	CTTA	2	8	30441	30448	25 %	50 %	0 %	25 %	429216290
85	NC_019791	TTAT	2	8	30589	30596	25 %	75 %	0 %	0 %	429216290
86	NC_019791	TCTT	2	8	30756	30763	0 %	75 %	0 %	25 %	429216290
87	NC_019791	TCCT	2	8	31049	31056	0 %	50 %	0 %	50 %	429216290
88	NC_019791	CCGG	2	8	31188	31195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019791	TAAA	2	8	31524	31531	75 %	25 %	0 %	0 %	429216291
90	NC_019791	AATA	2	8	32201	32208	75 %	25 %	0 %	0 %	429216291
91	NC_019791	AAAT	2	8	32771	32778	75 %	25 %	0 %	0 %	429216291
92	NC_019791	CTAA	2	8	32924	32931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019791	TATC	2	8	33128	33135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019791	CATT	2	8	33197	33204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019791	TAAT	2	8	33364	33371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019791	TTCT	2	8	33527	33534	0 %	75 %	0 %	25 %	429216292
97	NC_019791	AAAT	2	8	34154	34161	75 %	25 %	0 %	0 %	429216292
98	NC_019791	GTTT	2	8	34255	34262	0 %	75 %	25 %	0 %	429216293
99	NC_019791	CATT	2	8	34266	34273	25 %	50 %	0 %	25 %	429216293
100	NC_019791	TTGC	2	8	34901	34908	0 %	50 %	25 %	25 %	429216293
101	NC_019791	AATG	2	8	35028	35035	50 %	25 %	25 %	0 %	429216294
102	NC_019791	GCAT	2	8	35527	35534	25 %	25 %	25 %	25 %	429216294
103	NC_019791	AATT	2	8	36039	36046	50 %	50 %	0 %	0 %	429216295
104	NC_019791	CATT	2	8	36623	36630	25 %	50 %	0 %	25 %	429216295
105	NC_019791	GATA	2	8	36989	36996	50 %	25 %	25 %	0 %	429216296
106	NC_019791	TAAT	2	8	37782	37789	50 %	50 %	0 %	0 %	429216297
107	NC_019791	TTCT	2	8	37934	37941	0 %	75 %	0 %	25 %	429216297
108	NC_019791	TTCA	2	8	38019	38026	25 %	50 %	0 %	25 %	429216297
109	NC_019791	CTTT	2	8	38281	38288	0 %	75 %	0 %	25 %	429216297
110	NC_019791	ATAA	2	8	38291	38298	75 %	25 %	0 %	0 %	429216297
111	NC_019791	ATTT	2	8	38492	38499	25 %	75 %	0 %	0 %	429216297
112	NC_019791	TGAT	2	8	38562	38569	25 %	50 %	25 %	0 %	429216297
113	NC_019791	TTTA	2	8	38952	38959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019791	TATG	2	8	39421	39428	25 %	50 %	25 %	0 %	429216298
115	NC_019791	ATTA	2	8	39897	39904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019791	TTTG	2	8	40513	40520	0 %	75 %	25 %	0 %	429216300
117	NC_019791	TTTA	2	8	40620	40627	25 %	75 %	0 %	0 %	429216300
118	NC_019791	ACCA	2	8	40760	40767	50 %	0 %	0 %	50 %	429216300
119	NC_019791	TAAT	2	8	40820	40827	50 %	50 %	0 %	0 %	429216300
120	NC_019791	TCTT	2	8	41469	41476	0 %	75 %	0 %	25 %	429216300
121	NC_019791	ATTT	2	8	42243	42250	25 %	75 %	0 %	0 %	429216300
122	NC_019791	TTTA	2	8	42411	42418	25 %	75 %	0 %	0 %	429216300
123	NC_019791	TTGC	2	8	42457	42464	0 %	50 %	25 %	25 %	429216300
124	NC_019791	ATTT	2	8	42816	42823	25 %	75 %	0 %	0 %	429216300
125	NC_019791	TATT	2	8	42881	42888	25 %	75 %	0 %	0 %	429216300
126	NC_019791	TCTT	2	8	43125	43132	0 %	75 %	0 %	25 %	429216300
127	NC_019791	ATTT	2	8	43169	43176	25 %	75 %	0 %	0 %	429216300
128	NC_019791	CTTT	2	8	43579	43586	0 %	75 %	0 %	25 %	429216300
129	NC_019791	AATT	2	8	43962	43969	50 %	50 %	0 %	0 %	429216300
130	NC_019791	ATTG	2	8	44440	44447	25 %	50 %	25 %	0 %	429216301
131	NC_019791	CTAT	2	8	44626	44633	25 %	50 %	0 %	25 %	429216301
132	NC_019791	CTTT	2	8	45422	45429	0 %	75 %	0 %	25 %	429216302
133	NC_019791	TAAA	2	8	45602	45609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019791	ATTT	2	8	45689	45696	25 %	75 %	0 %	0 %	429216303
135	NC_019791	TATT	2	8	45935	45942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019791	TAAT	2	8	45954	45961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019791	TTAA	2	8	45976	45983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019791	AAGG	2	8	46195	46202	50 %	0 %	50 %	0 %	429216304
139	NC_019791	AAAG	2	8	46278	46285	75 %	0 %	25 %	0 %	429216304
140	NC_019791	AAAG	2	8	46491	46498	75 %	0 %	25 %	0 %	429216304
141	NC_019791	CAAA	2	8	46755	46762	75 %	0 %	0 %	25 %	429216305
142	NC_019791	ATTA	2	8	46802	46809	50 %	50 %	0 %	0 %	429216305
143	NC_019791	AATA	2	8	46856	46863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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