MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 41893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019791	TAA	2	6	149339	149344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216391
4002	NC_019791	ATC	2	6	149361	149366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_019791	TTTTA	2	10	149368	149377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_019791	TTATAT	2	12	149392	149403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_019791	TGAAA	2	10	149405	149414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_019791	AT	3	6	149442	149447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_019791	ACTAT	2	10	149475	149484	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4008	NC_019791	TAT	3	9	149482	149490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_019791	TTTA	2	8	149495	149502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_019791	ATA	2	6	149548	149553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216392
4011	NC_019791	AAT	2	6	149569	149574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216392
4012	NC_019791	AAT	3	9	149601	149609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216392
4013	NC_019791	TGA	2	6	149629	149634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216392
4014	NC_019791	ACT	2	6	149656	149661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216392
4015	NC_019791	AAG	2	6	149669	149674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216392
4016	NC_019791	CTGC	2	8	149693	149700	0 %	25 %	25 %	50 %	429216392
4017	NC_019791	TTTTC	2	10	149702	149711	0 %	80 %	0 %	20 %	429216392
4018	NC_019791	CAG	2	6	149724	149729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216392
4019	NC_019791	TAA	3	9	149745	149753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216392
4020	NC_019791	A	6	6	149803	149808	100 %	0 %	0 %	0 %	429216392
4021	NC_019791	ATA	2	6	149838	149843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216392
4022	NC_019791	AT	3	6	149888	149893	50 %	50 %	0 %	0 %	429216392
4023	NC_019791	TAG	2	6	149904	149909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216392
4024	NC_019791	ACC	2	6	150094	150099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429216392
4025	NC_019791	ATAA	2	8	150117	150124	75 %	25 %	0 %	0 %	429216392
4026	NC_019791	ATA	2	6	150160	150165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216392
4027	NC_019791	TCCA	2	8	150174	150181	25 %	25 %	0 %	50 %	429216392
4028	NC_019791	GAA	2	6	150201	150206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216392
4029	NC_019791	TAA	2	6	150248	150253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216392
4030	NC_019791	CTTT	2	8	150269	150276	0 %	75 %	0 %	25 %	429216392
4031	NC_019791	ATCC	2	8	150320	150327	25 %	25 %	0 %	50 %	429216392
4032	NC_019791	TA	3	6	150355	150360	50 %	50 %	0 %	0 %	429216392
4033	NC_019791	AAG	2	6	150396	150401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216392
4034	NC_019791	AAAGA	2	10	150499	150508	80 %	0 %	20 %	0 %	429216392
4035	NC_019791	AATA	2	8	150510	150517	75 %	25 %	0 %	0 %	429216392
4036	NC_019791	TTGTA	2	10	150526	150535	20 %	60 %	20 %	0 %	429216392
4037	NC_019791	AAG	2	6	150555	150560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216392
4038	NC_019791	ATG	3	9	150603	150611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216392
4039	NC_019791	ATT	2	6	150623	150628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216392
4040	NC_019791	T	7	7	150633	150639	0 %	100 %	0 %	0 %	429216392
4041	NC_019791	TA	3	6	150662	150667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_019791	AAGAT	2	10	150668	150677	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_019791	ATTAA	2	10	150694	150703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_019791	TAT	2	6	150716	150721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_019791	ATTTTT	2	12	150762	150773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_019791	ATT	2	6	150815	150820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_019791	T	6	6	150819	150824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_019791	TAA	2	6	150839	150844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_019791	A	7	7	150850	150856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_019791	TAA	2	6	150858	150863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_019791	TAA	2	6	150876	150881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_019791	AACAA	2	10	150903	150912	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4053	NC_019791	TAAA	2	8	150939	150946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_019791	T	6	6	150980	150985	0 %	100 %	0 %	0 %	429216393
4055	NC_019791	TTG	2	6	151035	151040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216393
4056	NC_019791	ACC	2	6	151098	151103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429216393
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4060	NC_019791	TATT	2	8	151262	151269	25 %	75 %	0 %	0 %	429216393
4061	NC_019791	CAT	2	6	151289	151294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216393
4062	NC_019791	TGT	2	6	151296	151301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216393
4063	NC_019791	AAT	2	6	151304	151309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216393
4064	NC_019791	ATT	2	6	151317	151322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216393
4065	NC_019791	TTC	2	6	151331	151336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216393
4066	NC_019791	TCAA	2	8	151342	151349	50 %	25 %	0 %	25 %	429216393
4067	NC_019791	AAT	2	6	151416	151421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216393
4068	NC_019791	AT	3	6	151446	151451	50 %	50 %	0 %	0 %	429216393
4069	NC_019791	TTA	2	6	151454	151459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216393
4070	NC_019791	CTTT	2	8	151467	151474	0 %	75 %	0 %	25 %	429216393
4071	NC_019791	CTG	2	6	151520	151525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216393
4072	NC_019791	ATC	2	6	151548	151553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216393
4073	NC_019791	TAA	2	6	151563	151568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216393
4074	NC_019791	ATT	3	9	151661	151669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_019791	TAA	2	6	151696	151701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_019791	TTA	2	6	151719	151724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_019791	GAA	2	6	151817	151822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_019791	T	6	6	151851	151856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_019791	TA	3	6	151860	151865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_019791	ATT	2	6	151880	151885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_019791	TCATTT	2	12	151904	151915	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4082	NC_019791	T	6	6	151913	151918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_019791	TGG	2	6	151960	151965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_019791	AAATGA	2	12	151999	152010	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429216394
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4087	NC_019791	ATT	2	6	152093	152098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216394
4088	NC_019791	TTTA	2	8	152128	152135	25 %	75 %	0 %	0 %	429216394
4089	NC_019791	A	6	6	152140	152145	100 %	0 %	0 %	0 %	429216394
4090	NC_019791	ATA	2	6	152174	152179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216394
4091	NC_019791	CATGTA	2	12	152213	152224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	429216394
4092	NC_019791	ATG	2	6	152257	152262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216394
4093	NC_019791	TAA	2	6	152321	152326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216395
4094	NC_019791	TTC	2	6	152343	152348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216395
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4096	NC_019791	TAA	2	6	152456	152461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216395
4097	NC_019791	TTC	2	6	152484	152489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216395
4098	NC_019791	TTAG	2	8	152497	152504	25 %	50 %	25 %	0 %	429216395
4099	NC_019791	A	6	6	152531	152536	100 %	0 %	0 %	0 %	429216395
4100	NC_019791	CAA	2	6	152559	152564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216395
4101	NC_019791	ATT	2	6	152574	152579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216395
4102	NC_019791	AAG	2	6	152588	152593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216395
4103	NC_019791	GTA	2	6	152597	152602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216395
4104	NC_019791	ATA	2	6	152657	152662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216395
4105	NC_019791	AG	4	8	152668	152675	50 %	0 %	50 %	0 %	429216395
4106	NC_019791	CTG	2	6	152702	152707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216395
4107	NC_019791	TGT	2	6	152751	152756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216395
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4109	NC_019791	TGG	2	6	152787	152792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429216395
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4111	NC_019791	ATG	2	6	152861	152866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216395
4112	NC_019791	GGT	2	6	152971	152976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429216395
4113	NC_019791	GAA	2	6	152989	152994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216395
4114	NC_019791	A	6	6	153072	153077	100 %	0 %	0 %	0 %	429216395
4115	NC_019791	ATG	2	6	153110	153115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216395
4116	NC_019791	TGT	2	6	153123	153128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216395
4117	NC_019791	ACA	2	6	153166	153171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216395
4118	NC_019791	A	7	7	153241	153247	100 %	0 %	0 %	0 %	429216395
4119	NC_019791	TAA	2	6	153281	153286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216395
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4121	NC_019791	TCA	2	6	153381	153386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216395
4122	NC_019791	AT	3	6	153406	153411	50 %	50 %	0 %	0 %	429216395
4123	NC_019791	TAAA	2	8	153427	153434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019791	ATT	2	6	153441	153446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_019791	TA	3	6	153450	153455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_019791	TTAA	2	8	153478	153485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4497	NC_019791	A	7	7	166369	166375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_019791	A	13	13	166384	166396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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