MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 41893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_019791	TGA	2	6	112760	112765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216364
3003	NC_019791	ATG	2	6	112792	112797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216364
3004	NC_019791	TGT	3	9	112828	112836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216365
3005	NC_019791	TTTAA	2	10	112898	112907	40 %	60 %	0 %	0 %	429216365
3006	NC_019791	GTA	2	6	112955	112960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216365
3007	NC_019791	AAAAT	2	10	112974	112983	80 %	20 %	0 %	0 %	429216365
3008	NC_019791	GAA	2	6	112997	113002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216365
3009	NC_019791	ATAA	2	8	113033	113040	75 %	25 %	0 %	0 %	429216365
3010	NC_019791	GTT	2	6	113123	113128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216365
3011	NC_019791	AAT	2	6	113144	113149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216365
3012	NC_019791	GGAT	2	8	113151	113158	25 %	25 %	50 %	0 %	429216365
3013	NC_019791	GGAAG	2	10	113232	113241	40 %	0 %	60 %	0 %	429216365
3014	NC_019791	ATTA	2	8	113242	113249	50 %	50 %	0 %	0 %	429216365
3015	NC_019791	CAA	2	6	113334	113339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216365
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3017	NC_019791	GAA	3	9	113420	113428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216365
3018	NC_019791	A	6	6	113427	113432	100 %	0 %	0 %	0 %	429216365
3019	NC_019791	ATG	2	6	113574	113579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216365
3020	NC_019791	AAG	2	6	113597	113602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216365
3021	NC_019791	AAAAT	2	10	113622	113631	80 %	20 %	0 %	0 %	429216365
3022	NC_019791	GAAAT	2	10	113679	113688	60 %	20 %	20 %	0 %	429216365
3023	NC_019791	TAG	3	9	113739	113747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216365
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3030	NC_019791	ATT	2	6	113870	113875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216365
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3033	NC_019791	AAT	2	6	113972	113977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216366
3034	NC_019791	CCA	2	6	114024	114029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429216366
3035	NC_019791	TA	3	6	114072	114077	50 %	50 %	0 %	0 %	429216366
3036	NC_019791	T	7	7	114210	114216	0 %	100 %	0 %	0 %	429216366
3037	NC_019791	ACT	2	6	114219	114224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216366
3038	NC_019791	TAATC	2	10	114262	114271	40 %	40 %	0 %	20 %	429216366
3039	NC_019791	TAA	2	6	114308	114313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216366
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3044	NC_019791	CTTTT	2	10	114434	114443	0 %	80 %	0 %	20 %	429216366
3045	NC_019791	AT	4	8	114450	114457	50 %	50 %	0 %	0 %	429216366
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3050	NC_019791	T	6	6	114697	114702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_019791	A	7	7	114706	114712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_019791	G	6	6	114726	114731	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_019791	A	6	6	114738	114743	100 %	0 %	0 %	0 %	429216367
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3055	NC_019791	GGT	2	6	114801	114806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429216367
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3059	NC_019791	TAT	2	6	114969	114974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216367
3060	NC_019791	TA	4	8	115019	115026	50 %	50 %	0 %	0 %	429216367
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3063	NC_019791	TTG	2	6	115246	115251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216367
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3065	NC_019791	ATA	2	6	115267	115272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216367
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3075	NC_019791	CTC	2	6	115799	115804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216367
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3082	NC_019791	CAT	2	6	115979	115984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216367
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3088	NC_019791	TTA	2	6	116186	116191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_019791	TTA	2	6	116259	116264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_019791	TAAAA	2	10	116288	116297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_019791	A	6	6	116294	116299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_019791	TAG	2	6	116325	116330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_019791	TA	3	6	116348	116353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_019791	GGGA	2	8	116365	116372	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_019791	CCT	2	6	116429	116434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216368
3098	NC_019791	AT	3	6	116445	116450	50 %	50 %	0 %	0 %	429216368
3099	NC_019791	TAA	2	6	116451	116456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216368
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3104	NC_019791	AGA	3	9	116602	116610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216368
3105	NC_019791	ACA	2	6	116684	116689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216368
3106	NC_019791	TTG	2	6	116691	116696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216368
3107	NC_019791	CAATT	2	10	116715	116724	40 %	40 %	0 %	20 %	429216368
3108	NC_019791	AAG	2	6	116727	116732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216368
3109	NC_019791	A	6	6	116742	116747	100 %	0 %	0 %	0 %	429216368
3110	NC_019791	GCT	2	6	116912	116917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216368
3111	NC_019791	TTA	2	6	116946	116951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216368
3112	NC_019791	AGG	2	6	116965	116970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216368
3113	NC_019791	TGA	2	6	117037	117042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216368
3114	NC_019791	TAA	2	6	117096	117101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216368
3115	NC_019791	ATG	2	6	117143	117148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216368
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3117	NC_019791	TTA	2	6	117221	117226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216368
3118	NC_019791	GAA	2	6	117265	117270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216368
3119	NC_019791	GGA	2	6	117359	117364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216368
3120	NC_019791	TTGT	2	8	117401	117408	0 %	75 %	25 %	0 %	429216368
3121	NC_019791	ATG	2	6	117429	117434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216368
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3123	NC_019791	A	6	6	117483	117488	100 %	0 %	0 %	0 %	429216368
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3499	NC_019791	TTA	2	6	131234	131239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216380
3500	NC_019791	ATC	2	6	131292	131297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216380

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