MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 41893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019791	ATT	2	6	18256	18261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216277
502	NC_019791	AATT	2	8	18270	18277	50 %	50 %	0 %	0 %	429216277
503	NC_019791	TAA	2	6	18316	18321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019791	T	6	6	18325	18330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019791	ATT	2	6	18358	18363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019791	TAT	2	6	18370	18375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019791	T	6	6	18394	18399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_019791	ATT	2	6	18419	18424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019791	T	6	6	18444	18449	0 %	100 %	0 %	0 %	429216278
510	NC_019791	ATT	2	6	18460	18465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216278
511	NC_019791	TAA	2	6	18519	18524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216278
512	NC_019791	CTG	2	6	18527	18532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216278
513	NC_019791	AGG	2	6	18534	18539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216278
514	NC_019791	CCT	3	9	18541	18549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216278
515	NC_019791	CAA	2	6	18560	18565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216278
516	NC_019791	CAG	2	6	18620	18625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216278
517	NC_019791	CTT	2	6	18749	18754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216278
518	NC_019791	TA	3	6	18807	18812	50 %	50 %	0 %	0 %	429216278
519	NC_019791	CCTGT	2	10	18900	18909	0 %	40 %	20 %	40 %	429216278
520	NC_019791	ATG	2	6	19011	19016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216278
521	NC_019791	CAT	2	6	19094	19099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216278
522	NC_019791	ATT	2	6	19105	19110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216278
523	NC_019791	CTT	2	6	19176	19181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216278
524	NC_019791	T	6	6	19222	19227	0 %	100 %	0 %	0 %	429216278
525	NC_019791	T	6	6	19282	19287	0 %	100 %	0 %	0 %	429216278
526	NC_019791	GCA	2	6	19318	19323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216278
527	NC_019791	CTC	2	6	19343	19348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216278
528	NC_019791	ATT	2	6	19354	19359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216278
529	NC_019791	T	6	6	19365	19370	0 %	100 %	0 %	0 %	429216278
530	NC_019791	T	7	7	19402	19408	0 %	100 %	0 %	0 %	429216278
531	NC_019791	CAT	2	6	19574	19579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216278
532	NC_019791	ATT	2	6	19645	19650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216278
533	NC_019791	TATT	2	8	19685	19692	25 %	75 %	0 %	0 %	429216278
534	NC_019791	T	6	6	19735	19740	0 %	100 %	0 %	0 %	429216278
535	NC_019791	TCC	2	6	19821	19826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216278
536	NC_019791	AATATC	2	12	19833	19844	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	429216278
537	NC_019791	TCTT	2	8	19851	19858	0 %	75 %	0 %	25 %	429216278
538	NC_019791	AAT	2	6	19871	19876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216278
539	NC_019791	TTA	2	6	19931	19936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019791	ATA	2	6	19954	19959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019791	AGAC	2	8	19970	19977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_019791	AAT	2	6	19992	19997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019791	A	6	6	20030	20035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_019791	ATAA	2	8	20054	20061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019791	AT	3	6	20104	20109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_019791	TA	3	6	20126	20131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_019791	CTT	2	6	20149	20154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_019791	ATT	2	6	20156	20161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_019791	TATTT	2	10	20168	20177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_019791	TGTT	2	8	20181	20188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019791	CTT	2	6	20189	20194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_019791	ATT	2	6	20196	20201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_019791	ATA	2	6	20213	20218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019791	AT	3	6	20223	20228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019791	T	7	7	20235	20241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019791	A	6	6	20243	20248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_019791	T	6	6	20249	20254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_019791	A	7	7	20303	20309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019791	TTA	2	6	20310	20315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_019791	TAA	2	6	20320	20325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019791	TCAA	2	8	20329	20336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_019791	GTA	2	6	20348	20353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_019791	TAG	2	6	20361	20366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_019791	T	6	6	20370	20375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019791	AATT	2	8	20401	20408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_019791	ATTT	2	8	20478	20485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_019791	TGG	2	6	20516	20521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_019791	GAA	2	6	20532	20537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_019791	T	6	6	20539	20544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_019791	TTA	2	6	20580	20585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_019791	AATT	2	8	20616	20623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_019791	T	7	7	20833	20839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_019791	GGA	2	6	20908	20913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_019791	AT	3	6	20943	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019791	AT	4	8	20965	20972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_019791	AC	3	6	21089	21094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_019791	ATT	2	6	21121	21126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_019791	TGT	2	6	21128	21133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_019791	AGA	3	9	21141	21149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_019791	TGC	2	6	21228	21233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_019791	GTT	2	6	21325	21330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_019791	CAAT	2	8	21352	21359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
583	NC_019791	ATTTT	2	10	21391	21400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_019791	T	6	6	21397	21402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_019791	TTA	2	6	21419	21424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_019791	TAAA	2	8	21446	21453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019791	TA	3	6	21495	21500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_019791	ATTT	2	8	21504	21511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_019791	TA	3	6	21515	21520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_019791	T	6	6	21540	21545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019791	TCT	2	6	21547	21552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_019791	TTCCT	2	10	21598	21607	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
593	NC_019791	TTC	2	6	21663	21668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_019791	GCT	2	6	21673	21678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_019791	TAT	2	6	21686	21691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_019791	GGA	2	6	21811	21816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_019791	ATA	2	6	21875	21880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_019791	ATA	2	6	21884	21889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_019791	TGG	2	6	21907	21912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_019791	ATTGG	2	10	21923	21932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
602	NC_019791	AAC	2	6	21948	21953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_019791	AGT	2	6	21954	21959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_019791	AT	3	6	22074	22079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_019791	TAA	3	9	22110	22118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_019791	TATT	2	8	22179	22186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_019791	TAA	2	6	22305	22310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_019791	TTA	2	6	22317	22322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_019791	ACA	2	6	22378	22383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_019791	AAT	2	6	22420	22425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_019791	CTT	2	6	22448	22453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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614	NC_019791	ATT	2	6	22556	22561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_019791	TTAAT	2	10	22754	22763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_019791	AT	3	6	22762	22767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_019791	TAA	2	6	22768	22773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_019791	TAAT	2	8	22776	22783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_019791	GAA	2	6	22878	22883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216279
622	NC_019791	ATTA	2	8	22891	22898	50 %	50 %	0 %	0 %	429216279
623	NC_019791	ATT	2	6	22940	22945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216279
624	NC_019791	ATT	2	6	22979	22984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216279
625	NC_019791	ATT	2	6	23000	23005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216279
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628	NC_019791	TGA	2	6	23047	23052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216279
629	NC_019791	TAT	2	6	23107	23112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216279
630	NC_019791	TCA	2	6	23140	23145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_019791	TTTTA	2	10	23178	23187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_019791	TTA	2	6	23248	23253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_019791	CAA	2	6	23328	23333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216280
634	NC_019791	CTG	2	6	23337	23342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216280
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636	NC_019791	TTCT	2	8	23445	23452	0 %	75 %	0 %	25 %	429216280
637	NC_019791	TCC	2	6	23503	23508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216280
638	NC_019791	TA	3	6	23611	23616	50 %	50 %	0 %	0 %	429216280
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