MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 41893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019791	TGA	2	6	201552	201557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_019791	TAA	2	6	201573	201578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_019791	TTG	2	6	201596	201601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_019791	ACA	2	6	201622	201627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_019791	CAA	2	6	201659	201664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_019791	TA	3	6	201674	201679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_019791	TAA	2	6	201696	201701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_019791	TTGG	2	8	201728	201735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_019791	GAA	2	6	201757	201762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_019791	AT	3	6	201789	201794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_019791	TAT	2	6	201802	201807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_019791	AGA	2	6	201828	201833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_019791	A	6	6	201840	201845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_019791	GAA	2	6	201853	201858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_019791	A	6	6	201883	201888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_019791	A	6	6	201913	201918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_019791	CCAA	2	8	201951	201958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_019791	TGA	2	6	201968	201973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_019791	AAAG	2	8	202034	202041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_019791	ATA	2	6	202042	202047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_019791	TCTCA	2	10	202060	202069	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5522	NC_019791	GTT	2	6	202185	202190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_019791	GAA	2	6	202293	202298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_019791	AGA	2	6	202361	202366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_019791	AT	3	6	202418	202423	50 %	50 %	0 %	0 %	429216431
5526	NC_019791	TTGGT	2	10	202470	202479	0 %	60 %	40 %	0 %	429216431
5527	NC_019791	TGC	2	6	202480	202485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216431
5528	NC_019791	TCT	2	6	202532	202537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216431
5529	NC_019791	AAT	2	6	202571	202576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216431
5530	NC_019791	TAA	2	6	202641	202646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216431
5531	NC_019791	ATA	2	6	202647	202652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216431
5532	NC_019791	TTTACA	2	12	202712	202723	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429216431
5533	NC_019791	ACA	2	6	202730	202735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216431
5534	NC_019791	AAAT	2	8	202740	202747	75 %	25 %	0 %	0 %	429216431
5535	NC_019791	A	6	6	202806	202811	100 %	0 %	0 %	0 %	429216431
5536	NC_019791	ATT	2	6	202817	202822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216431
5537	NC_019791	ACA	2	6	202835	202840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216431
5538	NC_019791	ATA	2	6	202866	202871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216431
5539	NC_019791	TCA	2	6	202928	202933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216431
5540	NC_019791	AAAT	2	8	202995	203002	75 %	25 %	0 %	0 %	429216431
5541	NC_019791	ACA	3	9	203075	203083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216431
5542	NC_019791	AAC	2	6	203125	203130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216431
5543	NC_019791	TTC	2	6	203153	203158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216431
5544	NC_019791	TAG	2	6	203163	203168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216431
5545	NC_019791	AAATG	2	10	203182	203191	60 %	20 %	20 %	0 %	429216431
5546	NC_019791	ATT	2	6	203257	203262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216431
5547	NC_019791	AT	3	6	203272	203277	50 %	50 %	0 %	0 %	429216431
5548	NC_019791	CAT	2	6	203316	203321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216431
5549	NC_019791	TAG	2	6	203403	203408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216431
5550	NC_019791	TTCTC	2	10	203425	203434	0 %	60 %	0 %	40 %	429216431
5551	NC_019791	TCA	2	6	203447	203452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216431
5552	NC_019791	TAT	2	6	203484	203489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216431
5553	NC_019791	TATT	2	8	203501	203508	25 %	75 %	0 %	0 %	429216431
5554	NC_019791	ATGT	2	8	203555	203562	25 %	50 %	25 %	0 %	429216431
5555	NC_019791	GTT	2	6	203585	203590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216431
5556	NC_019791	AAT	2	6	203627	203632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216431
5557	NC_019791	AAT	2	6	203674	203679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216431
5558	NC_019791	AAT	3	9	203686	203694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216431
5559	NC_019791	ATC	2	6	203743	203748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216432
5560	NC_019791	TTTTA	2	10	203749	203758	20 %	80 %	0 %	0 %	429216432
5561	NC_019791	TTAA	2	8	203759	203766	50 %	50 %	0 %	0 %	429216432
5562	NC_019791	CCAT	2	8	203788	203795	25 %	25 %	0 %	50 %	429216432
5563	NC_019791	TAA	2	6	203876	203881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216432
5564	NC_019791	CTT	2	6	203892	203897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216432
5565	NC_019791	CT	3	6	203901	203906	0 %	50 %	0 %	50 %	429216432
5566	NC_019791	TCT	2	6	203969	203974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216432
5567	NC_019791	TAAG	2	8	204046	204053	50 %	25 %	25 %	0 %	429216432
5568	NC_019791	TTTATC	2	12	204061	204072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429216432
5569	NC_019791	TCT	2	6	204122	204127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216432
5570	NC_019791	T	7	7	204127	204133	0 %	100 %	0 %	0 %	429216432
5571	NC_019791	CTT	2	6	204194	204199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216432
5572	NC_019791	TTA	2	6	204200	204205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216432
5573	NC_019791	TAA	2	6	204216	204221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216432
5574	NC_019791	AAT	2	6	204243	204248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216432
5575	NC_019791	TCA	2	6	204255	204260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216432
5576	NC_019791	ACATA	2	10	204262	204271	60 %	20 %	0 %	20 %	429216432
5577	NC_019791	TAT	2	6	204345	204350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216433
5578	NC_019791	AATT	2	8	204394	204401	50 %	50 %	0 %	0 %	429216433
5579	NC_019791	AAGC	2	8	204405	204412	50 %	0 %	25 %	25 %	429216433
5580	NC_019791	TCA	2	6	204431	204436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216433
5581	NC_019791	ATA	2	6	204448	204453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216433
5582	NC_019791	TTGA	2	8	204547	204554	25 %	50 %	25 %	0 %	429216433
5583	NC_019791	TAT	3	9	204568	204576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216433
5584	NC_019791	TAG	2	6	204595	204600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216433
5585	NC_019791	TAA	2	6	204612	204617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216433
5586	NC_019791	AT	3	6	204630	204635	50 %	50 %	0 %	0 %	429216433
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5590	NC_019791	TAA	2	6	204678	204683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216433
5591	NC_019791	CCA	2	6	204692	204697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429216433
5592	NC_019791	ATCC	2	8	204716	204723	25 %	25 %	0 %	50 %	429216433
5593	NC_019791	ATTA	2	8	204751	204758	50 %	50 %	0 %	0 %	429216433
5594	NC_019791	TGA	2	6	204784	204789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216433
5595	NC_019791	TCA	2	6	204843	204848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216433
5596	NC_019791	AT	3	6	204930	204935	50 %	50 %	0 %	0 %	429216433
5597	NC_019791	GTTTT	2	10	205040	205049	0 %	80 %	20 %	0 %	429216433
5598	NC_019791	GTT	2	6	205069	205074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216433
5599	NC_019791	ATAAGG	2	12	205075	205086	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	429216433
5600	NC_019791	ATA	2	6	205090	205095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216433
5601	NC_019791	TGA	2	6	205159	205164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216433
5602	NC_019791	AT	3	6	205202	205207	50 %	50 %	0 %	0 %	429216433
5603	NC_019791	CTA	2	6	205227	205232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216433
5604	NC_019791	T	6	6	205272	205277	0 %	100 %	0 %	0 %	429216433
5605	NC_019791	ATT	2	6	205297	205302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216433
5606	NC_019791	ATT	2	6	205363	205368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216433
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5608	NC_019791	AAT	2	6	205385	205390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216433
5609	NC_019791	A	6	6	205482	205487	100 %	0 %	0 %	0 %	429216433
5610	NC_019791	ATA	2	6	205500	205505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216433
5611	NC_019791	TTA	2	6	205591	205596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_019791	ATT	2	6	205620	205625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216434
5613	NC_019791	T	6	6	205630	205635	0 %	100 %	0 %	0 %	429216434
5614	NC_019791	TTTAA	2	10	205709	205718	40 %	60 %	0 %	0 %	429216434
5615	NC_019791	CCT	2	6	205727	205732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216434
5616	NC_019791	TCT	2	6	205787	205792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216434
5617	NC_019791	TCA	2	6	205796	205801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216434
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5619	NC_019791	CCAT	2	8	205871	205878	25 %	25 %	0 %	50 %	429216434
5620	NC_019791	CCAT	2	8	205897	205904	25 %	25 %	0 %	50 %	429216434
5621	NC_019791	ATTTA	2	10	205933	205942	40 %	60 %	0 %	0 %	429216434
5622	NC_019791	TC	3	6	205979	205984	0 %	50 %	0 %	50 %	429216434
5623	NC_019791	ATC	2	6	206020	206025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216434
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5626	NC_019791	TCT	2	6	206293	206298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216434
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