MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019777	ATTG	2	8	436	443	25 %	50 %	25 %	0 %	428771776
2	NC_019777	AATT	3	12	764	775	50 %	50 %	0 %	0 %	428771776
3	NC_019777	ATTA	2	8	810	817	50 %	50 %	0 %	0 %	428771776
4	NC_019777	ATTA	2	8	1249	1256	50 %	50 %	0 %	0 %	428771777
5	NC_019777	AAAT	2	8	1616	1623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019777	TAAA	2	8	1888	1895	75 %	25 %	0 %	0 %	428771778
7	NC_019777	TAAA	2	8	2013	2020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019777	AAGA	2	8	2315	2322	75 %	0 %	25 %	0 %	428771779
9	NC_019777	AACT	2	8	2418	2425	50 %	25 %	0 %	25 %	428771779
10	NC_019777	TTAT	2	8	2503	2510	25 %	75 %	0 %	0 %	428771779
11	NC_019777	TGGT	2	8	2739	2746	0 %	50 %	50 %	0 %	428771780
12	NC_019777	AAAT	2	8	2865	2872	75 %	25 %	0 %	0 %	428771780
13	NC_019777	ATTT	2	8	3530	3537	25 %	75 %	0 %	0 %	428771780
14	NC_019777	AATC	2	8	3538	3545	50 %	25 %	0 %	25 %	428771780
15	NC_019777	GGTA	2	8	3591	3598	25 %	25 %	50 %	0 %	428771780
16	NC_019777	ATGA	2	8	3658	3665	50 %	25 %	25 %	0 %	428771780
17	NC_019777	TTAA	2	8	4348	4355	50 %	50 %	0 %	0 %	428771780
18	NC_019777	GGTT	2	8	5032	5039	0 %	50 %	50 %	0 %	428771780
19	NC_019777	AAAG	2	8	5211	5218	75 %	0 %	25 %	0 %	428771780
20	NC_019777	ACCA	2	8	5282	5289	50 %	0 %	0 %	50 %	428771780
21	NC_019777	ATCT	2	8	5768	5775	25 %	50 %	0 %	25 %	428771780
22	NC_019777	ATAA	2	8	5982	5989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019777	TCAC	2	8	5991	5998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019777	TATT	2	8	6088	6095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019777	ATAA	2	8	6168	6175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019777	TTCT	2	8	6296	6303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019777	AATA	2	8	6651	6658	75 %	25 %	0 %	0 %	428771781
28	NC_019777	AGAA	2	8	6952	6959	75 %	0 %	25 %	0 %	428771781
29	NC_019777	TATT	2	8	7214	7221	25 %	75 %	0 %	0 %	428771781
30	NC_019777	TTAA	2	8	7254	7261	50 %	50 %	0 %	0 %	428771781
31	NC_019777	ATTA	2	8	8031	8038	50 %	50 %	0 %	0 %	428771781
32	NC_019777	TTTA	2	8	8080	8087	25 %	75 %	0 %	0 %	428771782
33	NC_019777	TGAT	2	8	8421	8428	25 %	50 %	25 %	0 %	428771782
34	NC_019777	ATGA	2	8	8818	8825	50 %	25 %	25 %	0 %	428771782
35	NC_019777	CAGA	2	8	9742	9749	50 %	0 %	25 %	25 %	428771783
36	NC_019777	TAAA	2	8	9771	9778	75 %	25 %	0 %	0 %	428771783
37	NC_019777	ATTT	2	8	9940	9947	25 %	75 %	0 %	0 %	428771784
38	NC_019777	ATAA	2	8	9954	9961	75 %	25 %	0 %	0 %	428771784
39	NC_019777	TTCT	2	8	10163	10170	0 %	75 %	0 %	25 %	428771784
40	NC_019777	TTGA	2	8	10314	10321	25 %	50 %	25 %	0 %	428771784
41	NC_019777	AATT	2	8	10379	10386	50 %	50 %	0 %	0 %	428771784
42	NC_019777	TTCT	2	8	10387	10394	0 %	75 %	0 %	25 %	428771784
43	NC_019777	CAAG	2	8	10887	10894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019777	AGTA	2	8	11137	11144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019777	TAGA	2	8	11362	11369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019777	CTTA	2	8	11442	11449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019777	TAAT	2	8	11816	11823	50 %	50 %	0 %	0 %	428771785
48	NC_019777	ACTG	2	8	11952	11959	25 %	25 %	25 %	25 %	428771786
49	NC_019777	ATTT	2	8	12360	12367	25 %	75 %	0 %	0 %	428771786
50	NC_019777	TGGA	2	8	12992	12999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019777	ATTT	2	8	13002	13009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019777	CAGG	2	8	13455	13462	25 %	0 %	50 %	25 %	428771787
53	NC_019777	TTTG	2	8	13974	13981	0 %	75 %	25 %	0 %	428771788
54	NC_019777	TAAT	2	8	14075	14082	50 %	50 %	0 %	0 %	428771788
55	NC_019777	ACTA	2	8	14200	14207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019777	ATTT	2	8	15235	15242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019777	TTTG	2	8	15422	15429	0 %	75 %	25 %	0 %	428771789
58	NC_019777	CATT	2	8	15495	15502	25 %	50 %	0 %	25 %	428771789
59	NC_019777	GAAA	2	8	15805	15812	75 %	0 %	25 %	0 %	428771789
60	NC_019777	TCTG	2	8	16117	16124	0 %	50 %	25 %	25 %	428771790
61	NC_019777	AAAG	2	8	16677	16684	75 %	0 %	25 %	0 %	428771791
62	NC_019777	GTAA	2	8	16692	16699	50 %	25 %	25 %	0 %	428771791
63	NC_019777	TATT	2	8	16741	16748	25 %	75 %	0 %	0 %	428771791
64	NC_019777	AAAT	2	8	16760	16767	75 %	25 %	0 %	0 %	428771791
65	NC_019777	ACAA	2	8	17122	17129	75 %	0 %	0 %	25 %	428771791
66	NC_019777	ATTA	2	8	17289	17296	50 %	50 %	0 %	0 %	428771792
67	NC_019777	CATT	2	8	17866	17873	25 %	50 %	0 %	25 %	428771793
68	NC_019777	TGAG	2	8	17986	17993	25 %	25 %	50 %	0 %	428771793
69	NC_019777	TTTG	2	8	18454	18461	0 %	75 %	25 %	0 %	428771794
70	NC_019777	ATTT	2	8	18969	18976	25 %	75 %	0 %	0 %	428771795
71	NC_019777	GTTT	2	8	19203	19210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019777	CATC	2	8	19291	19298	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019777	TTAA	2	8	19316	19323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019777	TTTA	2	8	19356	19363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019777	AAAT	2	8	19448	19455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019777	CGAT	2	8	19904	19911	25 %	25 %	25 %	25 %	428771796
77	NC_019777	CATC	2	8	20195	20202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019777	TAAA	2	8	20656	20663	75 %	25 %	0 %	0 %	428771797
79	NC_019777	ATTT	2	8	20694	20701	25 %	75 %	0 %	0 %	428771797
80	NC_019777	ATCA	2	8	21004	21011	50 %	25 %	0 %	25 %	428771797
81	NC_019777	ATTG	2	8	21399	21406	25 %	50 %	25 %	0 %	428771797
82	NC_019777	TAAT	2	8	21590	21597	50 %	50 %	0 %	0 %	428771797
83	NC_019777	CAAT	2	8	22097	22104	50 %	25 %	0 %	25 %	428771797
84	NC_019777	CTTG	2	8	22185	22192	0 %	50 %	25 %	25 %	428771797
85	NC_019777	ACAA	2	8	22429	22436	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019777	AGTT	2	8	22547	22554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019777	AATT	2	8	22783	22790	50 %	50 %	0 %	0 %	428771798
88	NC_019777	AATT	2	8	23280	23287	50 %	50 %	0 %	0 %	428771798
89	NC_019777	TATC	2	8	23339	23346	25 %	50 %	0 %	25 %	428771798
90	NC_019777	ATTT	2	8	23892	23899	25 %	75 %	0 %	0 %	428771798
91	NC_019777	TCAA	2	8	23940	23947	50 %	25 %	0 %	25 %	428771798
92	NC_019777	ATTA	2	8	24404	24411	50 %	50 %	0 %	0 %	428771798
93	NC_019777	TAAA	2	8	24456	24463	75 %	25 %	0 %	0 %	428771798
94	NC_019777	GGTT	2	8	24554	24561	0 %	50 %	50 %	0 %	428771798
95	NC_019777	AATC	2	8	25733	25740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019777	AAAG	2	8	26275	26282	75 %	0 %	25 %	0 %	428771799
97	NC_019777	TAGT	2	8	26630	26637	25 %	50 %	25 %	0 %	428771799
98	NC_019777	TCAA	2	8	26750	26757	50 %	25 %	0 %	25 %	428771799
99	NC_019777	TTAT	2	8	26902	26909	25 %	75 %	0 %	0 %	428771800
100	NC_019777	AAAC	2	8	27755	27762	75 %	0 %	0 %	25 %	428771800
101	NC_019777	TCAA	2	8	28056	28063	50 %	25 %	0 %	25 %	428771801
102	NC_019777	AATC	2	8	28138	28145	50 %	25 %	0 %	25 %	428771801
103	NC_019777	CAAT	2	8	28161	28168	50 %	25 %	0 %	25 %	428771801
104	NC_019777	TCAA	2	8	28203	28210	50 %	25 %	0 %	25 %	428771801
105	NC_019777	ATTT	2	8	28270	28277	25 %	75 %	0 %	0 %	428771801
106	NC_019777	TAGA	2	8	28742	28749	50 %	25 %	25 %	0 %	428771802
107	NC_019777	TAAC	2	8	28988	28995	50 %	25 %	0 %	25 %	428771802
108	NC_019777	AAAT	2	8	28998	29005	75 %	25 %	0 %	0 %	428771802
109	NC_019777	AGTT	2	8	29338	29345	25 %	50 %	25 %	0 %	428771803
110	NC_019777	ATTT	2	8	29459	29466	25 %	75 %	0 %	0 %	428771804
111	NC_019777	GGTT	2	8	30205	30212	0 %	50 %	50 %	0 %	428771804
112	NC_019777	AGAA	2	8	30264	30271	75 %	0 %	25 %	0 %	428771804
113	NC_019777	AACT	2	8	30431	30438	50 %	25 %	0 %	25 %	428771804
114	NC_019777	AAAG	2	8	30902	30909	75 %	0 %	25 %	0 %	428771804
115	NC_019777	ATTT	2	8	31115	31122	25 %	75 %	0 %	0 %	428771804
116	NC_019777	AGGA	2	8	31240	31247	50 %	0 %	50 %	0 %	428771805
117	NC_019777	CAAG	2	8	31647	31654	50 %	0 %	25 %	25 %	428771805
118	NC_019777	ATTT	2	8	32045	32052	25 %	75 %	0 %	0 %	428771805
119	NC_019777	TAAA	2	8	32065	32072	75 %	25 %	0 %	0 %	428771805
120	NC_019777	TAAA	2	8	32440	32447	75 %	25 %	0 %	0 %	428771805
121	NC_019777	GAAA	2	8	33160	33167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019777	AGGC	2	8	34146	34153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019777	ATAG	2	8	34214	34221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019777	AAAT	2	8	35404	35411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019777	TAAA	2	8	35794	35801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019777	ATCA	2	8	37334	37341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019777	TACC	2	8	38061	38068	25 %	25 %	0 %	50 %	428771807
128	NC_019777	AAAG	2	8	38104	38111	75 %	0 %	25 %	0 %	428771807
129	NC_019777	TCTT	2	8	38502	38509	0 %	75 %	0 %	25 %	428771807
130	NC_019777	AGGA	2	8	38856	38863	50 %	0 %	50 %	0 %	428771808
131	NC_019777	ACCC	2	8	38881	38888	25 %	0 %	0 %	75 %	428771808
132	NC_019777	ATTT	2	8	39229	39236	25 %	75 %	0 %	0 %	428771808
133	NC_019777	TAGA	2	8	39543	39550	50 %	25 %	25 %	0 %	428771809
134	NC_019777	TTAT	2	8	39642	39649	25 %	75 %	0 %	0 %	428771810
135	NC_019777	AATT	2	8	39761	39768	50 %	50 %	0 %	0 %	428771810
136	NC_019777	ATTT	2	8	40220	40227	25 %	75 %	0 %	0 %	428771810
137	NC_019777	TTTA	2	8	40355	40362	25 %	75 %	0 %	0 %	428771810
138	NC_019777	TATT	2	8	40588	40595	25 %	75 %	0 %	0 %	428771810
139	NC_019777	ATCA	2	8	40874	40881	50 %	25 %	0 %	25 %	428771811
140	NC_019777	TAAT	2	8	41166	41173	50 %	50 %	0 %	0 %	428771812
141	NC_019777	TTAT	2	8	41289	41296	25 %	75 %	0 %	0 %	428771812
142	NC_019777	CAGG	2	8	41333	41340	25 %	0 %	50 %	25 %	428771812
143	NC_019777	TCAA	2	8	41379	41386	50 %	25 %	0 %	25 %	428771812
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145	NC_019777	ATCA	2	8	41462	41469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.