MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 chromosome

Total Repeats: 3158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019776	AAACA	2	10	15	24	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019776	AATCT	2	10	1284	1293	40 %	40 %	0 %	20 %	428768416
3	NC_019776	CAAAA	2	10	3097	3106	80 %	0 %	0 %	20 %	428768417
4	NC_019776	AATTT	2	10	4263	4272	40 %	60 %	0 %	0 %	428768418
5	NC_019776	GCGAT	2	10	5783	5792	20 %	20 %	40 %	20 %	428768418
6	NC_019776	TAATT	2	10	5880	5889	40 %	60 %	0 %	0 %	428768418
7	NC_019776	ACCTC	2	10	6346	6355	20 %	20 %	0 %	60 %	428768419
8	NC_019776	TTCTT	2	10	6591	6600	0 %	80 %	0 %	20 %	428768419
9	NC_019776	CCAAA	2	10	7055	7064	60 %	0 %	0 %	40 %	428768419
10	NC_019776	TTAAA	2	10	7659	7668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019776	GACTT	2	10	11112	11121	20 %	40 %	20 %	20 %	428768424
12	NC_019776	TCCAT	2	10	12035	12044	20 %	40 %	0 %	40 %	428768424
13	NC_019776	AATTA	2	10	13219	13228	60 %	40 %	0 %	0 %	428768424
14	NC_019776	TAAAT	2	10	14150	14159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019776	TAAAA	2	10	14240	14249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019776	CTTTC	2	10	14616	14625	0 %	60 %	0 %	40 %	428768426
17	NC_019776	TAAGA	2	10	15311	15320	60 %	20 %	20 %	0 %	428768427
18	NC_019776	AATTT	2	10	18757	18766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019776	GCGTT	2	10	19766	19775	0 %	40 %	40 %	20 %	428768430
20	NC_019776	TAACG	2	10	22536	22545	40 %	20 %	20 %	20 %	428768432
21	NC_019776	TAAGA	2	10	23977	23986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019776	ATCTT	2	10	24257	24266	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019776	TTTTA	2	10	26053	26062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019776	AATAG	2	10	26642	26651	60 %	20 %	20 %	0 %	428768435
25	NC_019776	GATGA	2	10	27587	27596	40 %	20 %	40 %	0 %	428768436
26	NC_019776	GATTA	2	10	34096	34105	40 %	40 %	20 %	0 %	428768440
27	NC_019776	TAATT	2	10	37214	37223	40 %	60 %	0 %	0 %	428768444
28	NC_019776	CTAAT	2	10	38404	38413	40 %	40 %	0 %	20 %	428768445
29	NC_019776	CAGTC	2	10	42624	42633	20 %	20 %	20 %	40 %	428768450
30	NC_019776	TTCTT	2	10	44264	44273	0 %	80 %	0 %	20 %	428768452
31	NC_019776	CAAAG	2	10	46425	46434	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019776	TGATG	2	10	49764	49773	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019776	TGAGA	2	10	50656	50665	40 %	20 %	40 %	0 %	428768458
34	NC_019776	ATTTA	2	10	52180	52189	40 %	60 %	0 %	0 %	428768459
35	NC_019776	AGTTG	2	10	52688	52697	20 %	40 %	40 %	0 %	428768459
36	NC_019776	GATGA	2	10	56266	56275	40 %	20 %	40 %	0 %	428768462
37	NC_019776	AATGT	2	10	56676	56685	40 %	40 %	20 %	0 %	428768463
38	NC_019776	ACTTT	2	10	59717	59726	20 %	60 %	0 %	20 %	428768466
39	NC_019776	TCTGG	2	10	60838	60847	0 %	40 %	40 %	20 %	428768467
40	NC_019776	AAAAT	2	10	60923	60932	80 %	20 %	0 %	0 %	428768467
41	NC_019776	AGTTT	2	10	63707	63716	20 %	60 %	20 %	0 %	428768470
42	NC_019776	TTGAT	2	10	64436	64445	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019776	TTACT	2	10	64641	64650	20 %	60 %	0 %	20 %	428768472
44	NC_019776	TTATG	2	10	66520	66529	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019776	CAACC	2	10	66547	66556	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_019776	ATCCT	2	10	67502	67511	20 %	40 %	0 %	40 %	428768475
47	NC_019776	AAAAT	2	10	70413	70422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019776	CTTTG	2	10	72032	72041	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019776	ATGGA	2	10	73104	73113	40 %	20 %	40 %	0 %	428768482
50	NC_019776	TTTCC	2	10	73545	73554	0 %	60 %	0 %	40 %	428768482
51	NC_019776	TTTCG	2	10	75431	75440	0 %	60 %	20 %	20 %	428768483
52	NC_019776	ATGAT	2	10	75895	75904	40 %	40 %	20 %	0 %	428768484
53	NC_019776	GAACA	2	10	76015	76024	60 %	0 %	20 %	20 %	428768484
54	NC_019776	GCCCT	2	10	78817	78826	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_019776	ACTGA	2	10	78885	78894	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019776	AAGAA	2	10	78972	78981	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019776	AGATT	2	10	81581	81590	40 %	40 %	20 %	0 %	428768487
58	NC_019776	TTTTG	2	10	82222	82231	0 %	80 %	20 %	0 %	428768487
59	NC_019776	TCAAA	2	10	82940	82949	60 %	20 %	0 %	20 %	428768487
60	NC_019776	ATGCT	2	10	83759	83768	20 %	40 %	20 %	20 %	428768488
61	NC_019776	TAGAG	2	10	84573	84582	40 %	20 %	40 %	0 %	428768488
62	NC_019776	GATGG	2	10	87081	87090	20 %	20 %	60 %	0 %	428768488
63	NC_019776	GCTTT	2	10	88312	88321	0 %	60 %	20 %	20 %	428768489
64	NC_019776	TGATT	2	10	89356	89365	20 %	60 %	20 %	0 %	428768490
65	NC_019776	AGACA	2	10	91717	91726	60 %	0 %	20 %	20 %	428768492
66	NC_019776	AAATT	2	10	92539	92548	60 %	40 %	0 %	0 %	428768493
67	NC_019776	AACTC	2	10	95452	95461	40 %	20 %	0 %	40 %	428768493
68	NC_019776	TAAAA	2	10	96767	96776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019776	TGATT	2	10	97684	97693	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019776	TTTGG	2	10	99431	99440	0 %	60 %	40 %	0 %	428768497
71	NC_019776	TAGTT	2	10	99442	99451	20 %	60 %	20 %	0 %	428768497
72	NC_019776	ATTCT	2	10	100495	100504	20 %	60 %	0 %	20 %	428768497
73	NC_019776	AAATT	2	10	100793	100802	60 %	40 %	0 %	0 %	428768497
74	NC_019776	CTCAA	2	10	101046	101055	40 %	20 %	0 %	40 %	428768497
75	NC_019776	TTTTG	2	10	103503	103512	0 %	80 %	20 %	0 %	428768499
76	NC_019776	GAGAA	2	10	104959	104968	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019776	TTTAT	2	10	105663	105672	20 %	80 %	0 %	0 %	428768501
78	NC_019776	AATTC	2	10	106275	106284	40 %	40 %	0 %	20 %	428768502
79	NC_019776	AGCAA	2	10	107267	107276	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019776	ATTCG	2	10	111991	112000	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019776	AACTT	2	10	112025	112034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019776	CTAAG	2	10	113025	113034	40 %	20 %	20 %	20 %	428768505
83	NC_019776	TTTGA	2	10	113143	113152	20 %	60 %	20 %	0 %	428768505
84	NC_019776	TGGCA	2	10	113861	113870	20 %	20 %	40 %	20 %	428768506
85	NC_019776	TAAAT	2	10	114936	114945	60 %	40 %	0 %	0 %	428768507
86	NC_019776	AAAGA	2	10	115079	115088	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019776	ATTTT	2	10	115412	115421	20 %	80 %	0 %	0 %	428768508
88	NC_019776	TAATA	2	10	116832	116841	60 %	40 %	0 %	0 %	428768509
89	NC_019776	TATCA	2	10	116860	116869	40 %	40 %	0 %	20 %	428768509
90	NC_019776	TTTGA	2	10	118240	118249	20 %	60 %	20 %	0 %	428768510
91	NC_019776	ATTTT	2	10	118613	118622	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019776	GTCTT	2	10	118873	118882	0 %	60 %	20 %	20 %	428768511
93	NC_019776	AAGAA	2	10	119828	119837	80 %	0 %	20 %	0 %	428768512
94	NC_019776	AAGTT	2	10	122085	122094	40 %	40 %	20 %	0 %	428768514
95	NC_019776	AATCG	2	10	122250	122259	40 %	20 %	20 %	20 %	428768514
96	NC_019776	TAAAA	2	10	123137	123146	80 %	20 %	0 %	0 %	428768514
97	NC_019776	ATTTT	2	10	125651	125660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019776	CAATT	2	10	126558	126567	40 %	40 %	0 %	20 %	428768515
99	NC_019776	ATCTC	2	10	127604	127613	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_019776	ATTAC	2	10	129224	129233	40 %	40 %	0 %	20 %	428768517
101	NC_019776	TTGGG	2	10	130244	130253	0 %	40 %	60 %	0 %	428768519
102	NC_019776	GGCAG	2	10	132530	132539	20 %	0 %	60 %	20 %	428768522
103	NC_019776	ACTTT	2	10	135190	135199	20 %	60 %	0 %	20 %	428768524
104	NC_019776	AAATA	2	10	138166	138175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019776	TAATT	2	10	138742	138751	40 %	60 %	0 %	0 %	428768527
106	NC_019776	TTTAG	2	10	139042	139051	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019776	GGTAT	2	10	141161	141170	20 %	40 %	40 %	0 %	428768529
108	NC_019776	TGATG	2	10	141282	141291	20 %	40 %	40 %	0 %	428768529
109	NC_019776	AATTT	2	10	142324	142333	40 %	60 %	0 %	0 %	428768530
110	NC_019776	CTAAA	2	10	146466	146475	60 %	20 %	0 %	20 %	428768532
111	NC_019776	ACTAA	2	10	147542	147551	60 %	20 %	0 %	20 %	428768533
112	NC_019776	TCTAT	2	10	147647	147656	20 %	60 %	0 %	20 %	428768533
113	NC_019776	TTTGT	2	10	149967	149976	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019776	CTTTC	2	10	150625	150634	0 %	60 %	0 %	40 %	428768535
115	NC_019776	GTATT	2	10	150941	150950	20 %	60 %	20 %	0 %	428768535
116	NC_019776	TATTC	2	10	152784	152793	20 %	60 %	0 %	20 %	428768537
117	NC_019776	GTTTA	2	10	153420	153429	20 %	60 %	20 %	0 %	428768537
118	NC_019776	TTAAC	2	10	155548	155557	40 %	40 %	0 %	20 %	428768539
119	NC_019776	AAACC	2	10	156047	156056	60 %	0 %	0 %	40 %	428768539
120	NC_019776	TAAAT	2	10	157097	157106	60 %	40 %	0 %	0 %	428768540
121	NC_019776	AATCA	2	10	157309	157318	60 %	20 %	0 %	20 %	428768540
122	NC_019776	ACCAA	2	10	162606	162615	60 %	0 %	0 %	40 %	428768543
123	NC_019776	ATTCA	2	10	163267	163276	40 %	40 %	0 %	20 %	428768544
124	NC_019776	CCTTC	2	10	164338	164347	0 %	40 %	0 %	60 %	428768546
125	NC_019776	TGACT	2	10	164555	164564	20 %	40 %	20 %	20 %	428768546
126	NC_019776	ACAAA	2	10	164748	164757	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_019776	TATTT	2	10	164776	164785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019776	TTCCC	2	10	166282	166291	0 %	40 %	0 %	60 %	428768547
129	NC_019776	ATGGG	2	10	167418	167427	20 %	20 %	60 %	0 %	428768548
130	NC_019776	AATAA	2	10	168854	168863	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019776	CTCTC	2	10	172105	172114	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
132	NC_019776	TAAAA	2	10	174769	174778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019776	ATTTT	2	10	176003	176012	20 %	80 %	0 %	0 %	428768555
134	NC_019776	TAAAA	2	10	176192	176201	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019776	AGATA	2	10	176645	176654	60 %	20 %	20 %	0 %	428768556
136	NC_019776	CTCAT	2	10	178389	178398	20 %	40 %	0 %	40 %	428768557
137	NC_019776	GCCCT	2	10	178963	178972	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_019776	AAATT	2	10	181056	181065	60 %	40 %	0 %	0 %	428768559
139	NC_019776	CCATT	2	10	183291	183300	20 %	40 %	0 %	40 %	428768561
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