MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 90000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019757	TGG	2	6	21	26	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019757	ATG	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402185
3	NC_019757	TGA	2	6	284	289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402185
4	NC_019757	AAT	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402185
5	NC_019757	GAA	2	6	362	367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402185
6	NC_019757	GTA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402185
7	NC_019757	TAA	2	6	428	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402185
8	NC_019757	TGC	2	6	446	451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402185
9	NC_019757	TGG	2	6	506	511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402185
10	NC_019757	GGC	2	6	674	679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402185
11	NC_019757	GAT	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402185
12	NC_019757	AAG	2	6	733	738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402185
13	NC_019757	GTT	2	6	783	788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402185
14	NC_019757	CTC	2	6	805	810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402185
15	NC_019757	ACC	2	6	878	883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402185
16	NC_019757	AAT	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402185
17	NC_019757	CAG	2	6	1111	1116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402185
18	NC_019757	CGG	3	9	1182	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402185
19	NC_019757	ATT	2	6	1476	1481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019757	GTA	2	6	1765	1770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019757	TGC	3	9	1967	1975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402186
22	NC_019757	AGA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402186
23	NC_019757	AAT	2	6	2259	2264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402186
24	NC_019757	CAC	2	6	2289	2294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402186
25	NC_019757	GCA	2	6	2296	2301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402186
26	NC_019757	ATT	2	6	2325	2330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402186
27	NC_019757	CCA	2	6	2333	2338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402186
28	NC_019757	GTG	2	6	2339	2344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402186
29	NC_019757	GCC	2	6	2407	2412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402186
30	NC_019757	ACT	2	6	2443	2448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402186
31	NC_019757	AGA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402186
32	NC_019757	GCG	2	6	2694	2699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402186
33	NC_019757	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402186
34	NC_019757	ACC	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402187
35	NC_019757	GTG	2	6	3207	3212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402187
36	NC_019757	TTG	2	6	3230	3235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402187
37	NC_019757	TGA	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402187
38	NC_019757	TGC	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402187
39	NC_019757	TCA	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402187
40	NC_019757	GGA	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402187
41	NC_019757	TAA	2	6	3673	3678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402187
42	NC_019757	TTG	2	6	3731	3736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402187
43	NC_019757	GTT	2	6	3818	3823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402187
44	NC_019757	GCG	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402187
45	NC_019757	TGG	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402187
46	NC_019757	GCA	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402187
47	NC_019757	TGT	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402187
48	NC_019757	TTG	2	6	4529	4534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402187
49	NC_019757	AAC	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402187
50	NC_019757	CTG	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402187
51	NC_019757	AAT	2	6	5043	5048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402187
52	NC_019757	ACC	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402187
53	NC_019757	GCA	2	6	5088	5093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402187
54	NC_019757	TCT	2	6	5100	5105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402187
55	NC_019757	TAA	2	6	5161	5166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402187
56	NC_019757	TGC	2	6	5187	5192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402187
57	NC_019757	ACC	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402187
58	NC_019757	AGC	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402187
59	NC_019757	AGA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402187
60	NC_019757	GAT	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402187
61	NC_019757	CGG	2	6	5533	5538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402187
62	NC_019757	TCA	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402187
63	NC_019757	ATC	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402187
64	NC_019757	CCG	2	6	5680	5685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402187
65	NC_019757	TCA	2	6	5760	5765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402187
66	NC_019757	TAA	3	9	5911	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019757	TAA	2	6	6626	6631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402189
68	NC_019757	TAA	2	6	6724	6729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019757	TTC	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019757	TGA	2	6	6866	6871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019757	TAT	2	6	7365	7370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402190
72	NC_019757	GAC	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402190
73	NC_019757	TTA	2	6	7385	7390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402190
74	NC_019757	TGC	2	6	7398	7403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402190
75	NC_019757	CAA	2	6	7475	7480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402190
76	NC_019757	TGC	2	6	7497	7502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402190
77	NC_019757	CAA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402190
78	NC_019757	CAG	2	6	7640	7645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402190
79	NC_019757	CTG	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402190
80	NC_019757	TGC	2	6	7776	7781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402190
81	NC_019757	GGA	2	6	7921	7926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402190
82	NC_019757	CAG	2	6	8016	8021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402190
83	NC_019757	CAG	2	6	8142	8147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402190
84	NC_019757	ACT	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402190
85	NC_019757	GCA	2	6	8164	8169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402190
86	NC_019757	TAA	2	6	8242	8247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402190
87	NC_019757	TGC	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019757	GTG	2	6	8524	8529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402191
89	NC_019757	AGT	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402191
90	NC_019757	ACT	2	6	8547	8552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402191
91	NC_019757	CAG	2	6	8566	8571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402191
92	NC_019757	ATC	2	6	8586	8591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402191
93	NC_019757	TTG	2	6	8707	8712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402191
94	NC_019757	GAC	2	6	8730	8735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402191
95	NC_019757	TAA	2	6	8789	8794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402191
96	NC_019757	CTG	2	6	8806	8811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402191
97	NC_019757	GCT	2	6	8871	8876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402191
98	NC_019757	GTG	2	6	8887	8892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402191
99	NC_019757	CTT	2	6	8954	8959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402191
100	NC_019757	CTC	2	6	8977	8982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402191
101	NC_019757	GAT	2	6	9147	9152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402191
102	NC_019757	CAG	2	6	9185	9190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402191
103	NC_019757	GAT	2	6	9198	9203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402191
104	NC_019757	TAA	2	6	9309	9314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402191
105	NC_019757	TCA	2	6	9479	9484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019757	AGA	2	6	9630	9635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402192
107	NC_019757	CTT	2	6	9851	9856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402192
108	NC_019757	TCT	2	6	9997	10002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402192
109	NC_019757	TCT	2	6	10015	10020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402192
110	NC_019757	GCA	2	6	10039	10044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402192
111	NC_019757	AGC	2	6	10079	10084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402192
112	NC_019757	CTG	2	6	10215	10220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402192
113	NC_019757	TTC	2	6	10281	10286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402192
114	NC_019757	GTG	2	6	10318	10323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402192
115	NC_019757	GTA	2	6	10355	10360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402192
116	NC_019757	GTG	2	6	10392	10397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402192
117	NC_019757	TAA	2	6	10403	10408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402192
118	NC_019757	AAC	2	6	10419	10424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402192
119	NC_019757	CAA	2	6	10449	10454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402192
120	NC_019757	ACT	2	6	10534	10539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402192
121	NC_019757	AGC	2	6	10726	10731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402192
122	NC_019757	TAG	2	6	10815	10820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019757	AGC	2	6	10845	10850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019757	GAT	2	6	10864	10869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019757	ACA	2	6	10944	10949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019757	ACC	2	6	11040	11045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402193
127	NC_019757	AAT	2	6	11432	11437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402193
128	NC_019757	ATT	2	6	11454	11459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402193
129	NC_019757	CTG	3	9	11582	11590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402193
130	NC_019757	TTG	2	6	11637	11642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402193
131	NC_019757	GGC	2	6	11651	11656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402193
132	NC_019757	TTA	2	6	11761	11766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402194
133	NC_019757	TTA	2	6	11795	11800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402194
134	NC_019757	CTA	2	6	11801	11806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402194
135	NC_019757	CCT	2	6	11840	11845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402194
136	NC_019757	GTC	2	6	11919	11924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402194
137	NC_019757	ACC	2	6	11961	11966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402194
138	NC_019757	TCT	2	6	12043	12048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402194
139	NC_019757	GCC	2	6	12159	12164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402194
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143	NC_019757	CTT	2	6	12245	12250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402194
144	NC_019757	TAG	2	6	12448	12453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402194
145	NC_019757	TGA	2	6	12536	12541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402194
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150	NC_019757	ACG	2	6	12900	12905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402195
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153	NC_019757	CCG	2	6	13043	13048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402195
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164	NC_019757	GCT	2	6	13453	13458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402195
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168	NC_019757	GAT	2	6	13815	13820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402195
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170	NC_019757	TCA	2	6	13944	13949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402196
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195	NC_019757	ATA	2	6	15574	15579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402197
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198	NC_019757	GCT	2	6	15918	15923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_019757	ACT	2	6	15929	15934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402198
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203	NC_019757	ATA	2	6	16172	16177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402198
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217	NC_019757	TTC	2	6	17648	17653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402199
218	NC_019757	CTA	2	6	17740	17745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402199
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220	NC_019757	AAT	3	9	17901	17909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402199
221	NC_019757	CCA	2	6	17941	17946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402199
222	NC_019757	ACT	2	6	18032	18037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402199
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225	NC_019757	CGC	3	9	18616	18624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402200
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229	NC_019757	GAG	2	6	18971	18976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402200
230	NC_019757	TGC	2	6	19012	19017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402200
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232	NC_019757	GTT	2	6	19161	19166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402200
233	NC_019757	AAT	2	6	19249	19254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402200
234	NC_019757	CCG	2	6	19313	19318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402200
235	NC_019757	CAG	2	6	19495	19500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402200
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237	NC_019757	GTT	2	6	19601	19606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402200
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239	NC_019757	GGC	2	6	20043	20048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402201
240	NC_019757	GAT	2	6	20050	20055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402201
241	NC_019757	GAT	2	6	20164	20169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402201
242	NC_019757	GCG	2	6	20280	20285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402201
243	NC_019757	CAA	2	6	20297	20302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402201
244	NC_019757	CAA	2	6	20410	20415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402201
245	NC_019757	CTG	2	6	20420	20425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402201
246	NC_019757	TAG	2	6	20478	20483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402201
247	NC_019757	CAT	2	6	20500	20505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402201
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249	NC_019757	GTT	2	6	20758	20763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402201
250	NC_019757	AGC	2	6	20829	20834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402201
251	NC_019757	AAT	2	6	20846	20851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402201
252	NC_019757	CAA	2	6	20963	20968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402201
253	NC_019757	TCG	2	6	20988	20993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402201
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255	NC_019757	TTC	2	6	21048	21053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402201
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