MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 137676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019757	TAT	2	6	200571	200576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402360
4002	NC_019757	TGA	2	6	200637	200642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402360
4003	NC_019757	AGG	2	6	200663	200668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402360
4004	NC_019757	CAG	2	6	200714	200719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402360
4005	NC_019757	CAGA	2	8	200767	200774	50 %	0 %	25 %	25 %	434402360
4006	NC_019757	CAT	2	6	200775	200780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402360
4007	NC_019757	TGGGT	2	10	200826	200835	0 %	40 %	60 %	0 %	434402360
4008	NC_019757	CAA	2	6	201033	201038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402360
4009	NC_019757	CCG	2	6	201039	201044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402360
4010	NC_019757	A	6	6	201206	201211	100 %	0 %	0 %	0 %	434402360
4011	NC_019757	ATG	2	6	201214	201219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402360
4012	NC_019757	TGG	3	9	201224	201232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402360
4013	NC_019757	TGG	2	6	201266	201271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402360
4014	NC_019757	ATT	2	6	201289	201294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402360
4015	NC_019757	A	6	6	201331	201336	100 %	0 %	0 %	0 %	434402360
4016	NC_019757	ATCC	2	8	201358	201365	25 %	25 %	0 %	50 %	434402360
4017	NC_019757	GAA	2	6	201376	201381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402360
4018	NC_019757	TGA	2	6	201414	201419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_019757	ATCT	2	8	201442	201449	25 %	50 %	0 %	25 %	434402361
4020	NC_019757	TAG	2	6	201462	201467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402361
4021	NC_019757	TGC	2	6	201615	201620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402361
4022	NC_019757	GCA	2	6	201777	201782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402361
4023	NC_019757	TTG	2	6	201823	201828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402361
4024	NC_019757	AGG	2	6	201872	201877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402361
4025	NC_019757	ATG	2	6	201920	201925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402361
4026	NC_019757	GGCA	2	8	202034	202041	25 %	0 %	50 %	25 %	434402361
4027	NC_019757	TTA	2	6	202098	202103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_019757	TTAA	2	8	202115	202122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_019757	TAA	2	6	202211	202216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_019757	ACCCC	2	10	202293	202302	20 %	0 %	0 %	80 %	434402362
4031	NC_019757	AGC	2	6	202303	202308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402362
4032	NC_019757	GAT	2	6	202366	202371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402362
4033	NC_019757	AAAGC	2	10	202387	202396	60 %	0 %	20 %	20 %	434402362
4034	NC_019757	TCAG	2	8	202488	202495	25 %	25 %	25 %	25 %	434402362
4035	NC_019757	CTG	2	6	202520	202525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402362
4036	NC_019757	ATT	2	6	202569	202574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402362
4037	NC_019757	GTG	2	6	202669	202674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402362
4038	NC_019757	AAC	2	6	202693	202698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402362
4039	NC_019757	GCC	2	6	202717	202722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402362
4040	NC_019757	AGA	2	6	202734	202739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402362
4041	NC_019757	GGT	2	6	202761	202766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402362
4042	NC_019757	AAG	2	6	202830	202835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402362
4043	NC_019757	GAGC	2	8	202839	202846	25 %	0 %	50 %	25 %	434402362
4044	NC_019757	TGAT	2	8	202859	202866	25 %	50 %	25 %	0 %	434402362
4045	NC_019757	AGC	2	6	202965	202970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402362
4046	NC_019757	TATTG	2	10	202984	202993	20 %	60 %	20 %	0 %	434402362
4047	NC_019757	TC	4	8	203054	203061	0 %	50 %	0 %	50 %	434402362
4048	NC_019757	GCA	2	6	203065	203070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402362
4049	NC_019757	TAG	2	6	203072	203077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402362
4050	NC_019757	TTTA	2	8	203197	203204	25 %	75 %	0 %	0 %	434402362
4051	NC_019757	TCC	2	6	203232	203237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402362
4052	NC_019757	GCT	2	6	203304	203309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402362
4053	NC_019757	GAA	2	6	203344	203349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402362
4054	NC_019757	GCT	2	6	203377	203382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402362
4055	NC_019757	ACTG	2	8	203389	203396	25 %	25 %	25 %	25 %	434402362
4056	NC_019757	ATTA	2	8	203397	203404	50 %	50 %	0 %	0 %	434402362
4057	NC_019757	ACT	2	6	203407	203412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402363
4058	NC_019757	GCA	2	6	203457	203462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402363
4059	NC_019757	CCA	2	6	203502	203507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402363
4060	NC_019757	TTTG	2	8	203583	203590	0 %	75 %	25 %	0 %	434402363
4061	NC_019757	TAA	2	6	203656	203661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402363
4062	NC_019757	GCA	2	6	203679	203684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402363
4063	NC_019757	CAT	2	6	203700	203705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402363
4064	NC_019757	CCAC	2	8	203711	203718	25 %	0 %	0 %	75 %	434402363
4065	NC_019757	TGC	2	6	203719	203724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402363
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4067	NC_019757	T	6	6	203949	203954	0 %	100 %	0 %	0 %	434402363
4068	NC_019757	GTA	2	6	203976	203981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_019757	TCAA	2	8	204011	204018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_019757	TGGC	2	8	204054	204061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4071	NC_019757	AAAT	2	8	204079	204086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_019757	GTT	2	6	204091	204096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_019757	T	6	6	204156	204161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_019757	ATA	2	6	204239	204244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_019757	AAACAA	2	12	204254	204265	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4076	NC_019757	ATA	2	6	204309	204314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_019757	A	6	6	204329	204334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_019757	C	6	6	204409	204414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4079	NC_019757	ATA	2	6	204436	204441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_019757	GAG	2	6	204526	204531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402364
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4082	NC_019757	CCA	2	6	204815	204820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402364
4083	NC_019757	GTA	2	6	204821	204826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402364
4084	NC_019757	CAAA	2	8	204841	204848	75 %	0 %	0 %	25 %	434402364
4085	NC_019757	AAT	2	6	204961	204966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402364
4086	NC_019757	AATTGC	2	12	205007	205018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434402364
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4088	NC_019757	GCA	2	6	205034	205039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402364
4089	NC_019757	TGG	2	6	205055	205060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402364
4090	NC_019757	A	6	6	205069	205074	100 %	0 %	0 %	0 %	434402364
4091	NC_019757	TAT	2	6	205095	205100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_019757	TTTA	2	8	205105	205112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_019757	TCT	2	6	205120	205125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_019757	AGA	2	6	205175	205180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402365
4095	NC_019757	TTA	2	6	205270	205275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402365
4096	NC_019757	CAAA	2	8	205328	205335	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_019757	TTTG	2	8	205345	205352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_019757	TCGT	2	8	205358	205365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_019757	CTG	2	6	205411	205416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_019757	AG	3	6	205454	205459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_019757	A	6	6	205478	205483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019757	TTGG	2	8	205484	205491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_019757	TTG	2	6	205542	205547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_019757	GCA	2	6	205591	205596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_019757	CTT	2	6	205605	205610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_019757	GCT	2	6	205612	205617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_019757	GAA	2	6	205668	205673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_019757	TAT	2	6	205732	205737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_019757	ATAG	2	8	205773	205780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_019757	TTG	2	6	205803	205808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_019757	AATA	2	8	205836	205843	75 %	25 %	0 %	0 %	434402366
4112	NC_019757	TAA	2	6	205889	205894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402366
4113	NC_019757	TGTA	2	8	205932	205939	25 %	50 %	25 %	0 %	434402366
4114	NC_019757	TCAACT	2	12	205983	205994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402366
4115	NC_019757	T	6	6	205994	205999	0 %	100 %	0 %	0 %	434402366
4116	NC_019757	CAG	2	6	206099	206104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_019757	TCT	2	6	206121	206126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_019757	TGCTC	2	10	206136	206145	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4119	NC_019757	ATT	2	6	206179	206184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_019757	GCA	2	6	206203	206208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_019757	CGA	3	9	206262	206270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402367
4122	NC_019757	ATC	2	6	206386	206391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402367
4123	NC_019757	GAT	2	6	206409	206414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402367
4124	NC_019757	ATT	2	6	206470	206475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402367
4125	NC_019757	TGG	2	6	206504	206509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402367
4126	NC_019757	GCT	2	6	206658	206663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402367
4127	NC_019757	GCAA	2	8	206715	206722	50 %	0 %	25 %	25 %	434402367
4128	NC_019757	TGG	2	6	206747	206752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402367
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4132	NC_019757	GTGAAG	2	12	206828	206839	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434402367
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4155	NC_019757	A	6	6	207854	207859	100 %	0 %	0 %	0 %	434402367
4156	NC_019757	CTG	2	6	207997	208002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402367
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4159	NC_019757	GTT	2	6	208204	208209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402367
4160	NC_019757	CTG	2	6	208216	208221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402367
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4229	NC_019757	GAC	2	6	212117	212122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402370
4230	NC_019757	CTT	2	6	212156	212161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402370
4231	NC_019757	ATT	2	6	212198	212203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_019757	T	7	7	212226	212232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_019757	TAAT	2	8	212255	212262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_019757	A	6	6	212293	212298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_019757	AAG	2	6	212317	212322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4236	NC_019757	GATA	2	8	212336	212343	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_019757	CTT	2	6	212354	212359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4238	NC_019757	TTG	2	6	212365	212370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_019757	CAAG	2	8	212376	212383	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4240	NC_019757	ATT	2	6	212513	212518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_019757	GGA	2	6	212545	212550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_019757	TGC	3	9	212590	212598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402371
4243	NC_019757	TTG	2	6	212602	212607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402371
4244	NC_019757	TTG	2	6	212612	212617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402371
4245	NC_019757	TCG	2	6	212623	212628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402371
4246	NC_019757	CCA	2	6	212633	212638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402371
4247	NC_019757	TGC	2	6	212706	212711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402371
4248	NC_019757	TTG	2	6	212712	212717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402371
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4372	NC_019757	GATT	2	8	219440	219447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4373	NC_019757	ATTT	2	8	219469	219476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4498	NC_019757	TTG	2	6	227358	227363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402386
4499	NC_019757	TTG	2	6	227411	227416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402386
4500	NC_019757	TAA	2	6	227418	227423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402386

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