MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 137676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019757	GCT	2	6	252284	252289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402411
5002	NC_019757	TTA	2	6	252341	252346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402411
5003	NC_019757	ATT	2	6	252353	252358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402411
5004	NC_019757	AAC	2	6	252409	252414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402411
5005	NC_019757	ATT	2	6	252421	252426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402411
5006	NC_019757	T	6	6	252449	252454	0 %	100 %	0 %	0 %	434402411
5007	NC_019757	ATC	2	6	252479	252484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402411
5008	NC_019757	GCA	3	9	252488	252496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402411
5009	NC_019757	A	6	6	252535	252540	100 %	0 %	0 %	0 %	434402411
5010	NC_019757	ATT	2	6	252590	252595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402411
5011	NC_019757	T	6	6	252605	252610	0 %	100 %	0 %	0 %	434402411
5012	NC_019757	A	6	6	252726	252731	100 %	0 %	0 %	0 %	434402411
5013	NC_019757	GA	3	6	252770	252775	50 %	0 %	50 %	0 %	434402411
5014	NC_019757	T	6	6	252784	252789	0 %	100 %	0 %	0 %	434402411
5015	NC_019757	ATT	3	9	252803	252811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402411
5016	NC_019757	GGT	2	6	252812	252817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402411
5017	NC_019757	GAT	2	6	252860	252865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402411
5018	NC_019757	TTAA	2	8	252956	252963	50 %	50 %	0 %	0 %	434402411
5019	NC_019757	TGG	2	6	253045	253050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402411
5020	NC_019757	CGG	2	6	253102	253107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402411
5021	NC_019757	TCA	2	6	253165	253170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402411
5022	NC_019757	GT	3	6	253176	253181	0 %	50 %	50 %	0 %	434402411
5023	NC_019757	TCC	2	6	253315	253320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402412
5024	NC_019757	CAC	2	6	253331	253336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402412
5025	NC_019757	TTTTTC	2	12	253371	253382	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434402412
5026	NC_019757	AAC	2	6	253437	253442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402412
5027	NC_019757	CCA	2	6	253456	253461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402412
5028	NC_019757	AAG	2	6	253501	253506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402412
5029	NC_019757	TGG	2	6	253541	253546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402412
5030	NC_019757	GCC	2	6	253551	253556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402412
5031	NC_019757	ATCA	2	8	253596	253603	50 %	25 %	0 %	25 %	434402412
5032	NC_019757	CTG	2	6	253679	253684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402412
5033	NC_019757	CTT	2	6	253853	253858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402412
5034	NC_019757	A	6	6	253875	253880	100 %	0 %	0 %	0 %	434402412
5035	NC_019757	CCT	2	6	253972	253977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_019757	ATT	2	6	253987	253992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402414
5037	NC_019757	CTT	2	6	254008	254013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402414
5038	NC_019757	ACG	2	6	254088	254093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402414
5039	NC_019757	TG	3	6	254098	254103	0 %	50 %	50 %	0 %	434402414
5040	NC_019757	GCG	2	6	254114	254119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402414
5041	NC_019757	TTTGGA	2	12	254129	254140	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434402414
5042	NC_019757	TCT	2	6	254146	254151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402414
5043	NC_019757	GCG	2	6	254271	254276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_019757	TGCT	2	8	254317	254324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_019757	GAG	3	9	254347	254355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402415
5046	NC_019757	TTG	2	6	254356	254361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402415
5047	NC_019757	TTGA	2	8	254405	254412	25 %	50 %	25 %	0 %	434402415
5048	NC_019757	AAGT	2	8	254460	254467	50 %	25 %	25 %	0 %	434402415
5049	NC_019757	ATT	2	6	254565	254570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402415
5050	NC_019757	AGC	2	6	254612	254617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402415
5051	NC_019757	AGC	2	6	254624	254629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402415
5052	NC_019757	G	6	6	254722	254727	0 %	0 %	100 %	0 %	434402415
5053	NC_019757	TAA	2	6	254815	254820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402415
5054	NC_019757	GAT	2	6	254831	254836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402415
5055	NC_019757	TGA	2	6	254837	254842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402415
5056	NC_019757	TGGT	2	8	254843	254850	0 %	50 %	50 %	0 %	434402415
5057	NC_019757	G	6	6	254934	254939	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_019757	AGG	2	6	254942	254947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_019757	ATT	2	6	254963	254968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_019757	TAA	2	6	255053	255058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_019757	T	6	6	255123	255128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_019757	AGCC	2	8	255135	255142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_019757	GCAA	2	8	255153	255160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_019757	ACA	2	6	255161	255166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_019757	ATCA	2	8	255213	255220	50 %	25 %	0 %	25 %	434402416
5066	NC_019757	T	6	6	255299	255304	0 %	100 %	0 %	0 %	434402416
5067	NC_019757	CTGC	2	8	255314	255321	0 %	25 %	25 %	50 %	434402416
5068	NC_019757	CCG	2	6	255339	255344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402416
5069	NC_019757	ATC	2	6	255356	255361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402416
5070	NC_019757	CTA	2	6	255367	255372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402416
5071	NC_019757	GGA	2	6	255395	255400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402416
5072	NC_019757	GCA	2	6	255405	255410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
5073	NC_019757	ACC	2	6	255430	255435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402416
5074	NC_019757	TTC	2	6	255444	255449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402416
5075	NC_019757	GAA	2	6	255660	255665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402416
5076	NC_019757	GGC	2	6	255674	255679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402416
5077	NC_019757	ATT	2	6	255681	255686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402416
5078	NC_019757	CAG	2	6	255745	255750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
5079	NC_019757	GCA	2	6	255781	255786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
5080	NC_019757	TGG	2	6	255910	255915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402416
5081	NC_019757	TTAT	2	8	255946	255953	25 %	75 %	0 %	0 %	434402416
5082	NC_019757	AGA	2	6	255956	255961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402416
5083	NC_019757	C	7	7	255987	255993	0 %	0 %	0 %	100 %	434402416
5084	NC_019757	TGG	2	6	256035	256040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402416
5085	NC_019757	ACT	2	6	256062	256067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402416
5086	NC_019757	AAG	2	6	256092	256097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402416
5087	NC_019757	AAG	2	6	256108	256113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402416
5088	NC_019757	CTC	2	6	256217	256222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402416
5089	NC_019757	GTG	2	6	256297	256302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402416
5090	NC_019757	GCA	2	6	256303	256308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
5091	NC_019757	TGG	2	6	256309	256314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402416
5092	NC_019757	TAG	2	6	256315	256320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402416
5093	NC_019757	ACG	2	6	256395	256400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
5094	NC_019757	AGCG	2	8	256407	256414	25 %	0 %	50 %	25 %	434402416
5095	NC_019757	ACTC	2	8	256440	256447	25 %	25 %	0 %	50 %	434402416
5096	NC_019757	ACC	2	6	256458	256463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402416
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5098	NC_019757	CGA	2	6	256514	256519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
5099	NC_019757	CAAA	2	8	256568	256575	75 %	0 %	0 %	25 %	434402416
5100	NC_019757	AGA	2	6	256615	256620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402416
5101	NC_019757	ACAA	2	8	256642	256649	75 %	0 %	0 %	25 %	434402416
5102	NC_019757	GAT	2	6	256679	256684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402416
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5104	NC_019757	CAAGCA	2	12	256779	256790	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434402416
5105	NC_019757	GGC	2	6	256804	256809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402416
5106	NC_019757	CAA	2	6	256832	256837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402416
5107	NC_019757	AGC	2	6	256850	256855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402416
5108	NC_019757	CTAC	2	8	256885	256892	25 %	25 %	0 %	50 %	434402416
5109	NC_019757	A	6	6	256914	256919	100 %	0 %	0 %	0 %	434402416
5110	NC_019757	ACC	2	6	256922	256927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402416
5111	NC_019757	TGC	2	6	256946	256951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402416
5112	NC_019757	A	6	6	256978	256983	100 %	0 %	0 %	0 %	434402416
5113	NC_019757	CGC	2	6	257006	257011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402416
5114	NC_019757	GCT	2	6	257043	257048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402416
5115	NC_019757	CGC	2	6	257245	257250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402417
5116	NC_019757	CTA	2	6	257290	257295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402417
5117	NC_019757	CTT	2	6	257296	257301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402417
5118	NC_019757	ATC	2	6	257394	257399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402417
5119	NC_019757	TTG	2	6	257417	257422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402417
5120	NC_019757	TGA	2	6	257637	257642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_019757	AT	3	6	257643	257648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_019757	AAT	2	6	257674	257679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_019757	CTGA	2	8	257686	257693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_019757	ATG	2	6	257703	257708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5250	NC_019757	C	6	6	263803	263808	0 %	0 %	0 %	100 %	434402422
5251	NC_019757	CAA	2	6	263846	263851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402422
5252	NC_019757	TCC	2	6	263964	263969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5253	NC_019757	CAA	2	6	264004	264009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5254	NC_019757	AT	3	6	264011	264016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_019757	T	6	6	264022	264027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_019757	TAAA	2	8	264047	264054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_019757	ATTT	2	8	264112	264119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_019757	ACAA	2	8	264155	264162	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5259	NC_019757	TAC	2	6	264164	264169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_019757	ATA	3	9	264203	264211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_019757	TAT	3	9	264212	264220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_019757	ACA	2	6	264221	264226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_019757	GTAAA	2	10	264288	264297	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_019757	CAT	2	6	264362	264367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5265	NC_019757	CTG	2	6	264456	264461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5266	NC_019757	A	6	6	264531	264536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_019757	CT	3	6	264591	264596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5268	NC_019757	CTG	2	6	264713	264718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5269	NC_019757	GCG	2	6	264841	264846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5270	NC_019757	A	6	6	264906	264911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_019757	GCCA	2	8	265035	265042	25 %	0 %	25 %	50 %	434402423
5272	NC_019757	CAAA	2	8	265079	265086	75 %	0 %	0 %	25 %	434402423
5273	NC_019757	TTA	2	6	265099	265104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402423
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5276	NC_019757	AGCA	2	8	265237	265244	50 %	0 %	25 %	25 %	434402423
5277	NC_019757	AAG	2	6	265252	265257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402423
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5281	NC_019757	AAGTA	2	10	265414	265423	60 %	20 %	20 %	0 %	434402423
5282	NC_019757	GAA	2	6	265464	265469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402423
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5284	NC_019757	GGA	2	6	265596	265601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402423
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5289	NC_019757	CAG	2	6	265914	265919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402423
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5291	NC_019757	AAG	2	6	265984	265989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402423
5292	NC_019757	CAG	2	6	266028	266033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402423
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5295	NC_019757	GA	3	6	266085	266090	50 %	0 %	50 %	0 %	434402423
5296	NC_019757	AGA	2	6	266174	266179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402423
5297	NC_019757	GCA	2	6	266207	266212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402423
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5300	NC_019757	A	6	6	266278	266283	100 %	0 %	0 %	0 %	434402423
5301	NC_019757	ACC	2	6	266360	266365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402423
5302	NC_019757	GGACAA	2	12	266378	266389	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	434402423
5303	NC_019757	AGACG	2	10	266505	266514	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5304	NC_019757	TGC	2	6	266584	266589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5310	NC_019757	GTT	3	9	266845	266853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402424
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5323	NC_019757	CT	3	6	267780	267785	0 %	50 %	0 %	50 %	434402425
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5361	NC_019757	AT	3	6	270055	270060	50 %	50 %	0 %	0 %	434402427
5362	NC_019757	TAC	2	6	270083	270088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402427
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5364	NC_019757	T	7	7	270160	270166	0 %	100 %	0 %	0 %	434402427
5365	NC_019757	ATA	2	6	270178	270183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402427
5366	NC_019757	TTG	2	6	270240	270245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402427
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5369	NC_019757	TC	3	6	270408	270413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5370	NC_019757	CTC	2	6	270439	270444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5371	NC_019757	GCT	2	6	270567	270572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402428
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5491	NC_019757	AGA	2	6	276672	276677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_019757	TTTC	2	8	276760	276767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5493	NC_019757	TAA	2	6	276768	276773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_019757	ACA	2	6	276779	276784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5495	NC_019757	T	7	7	276789	276795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_019757	ATAGG	2	10	276799	276808	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_019757	GATT	2	8	276812	276819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_019757	TCC	2	6	276844	276849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5499	NC_019757	GATG	2	8	276889	276896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_019757	AGA	2	6	277055	277060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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