MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.06

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019755	CT	3	6	1716	1721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019755	GC	3	6	1843	1848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019755	TA	3	6	1905	1910	50 %	50 %	0 %	0 %	428308221
4	NC_019755	TA	3	6	2310	2315	50 %	50 %	0 %	0 %	428308222
5	NC_019755	TA	3	6	2729	2734	50 %	50 %	0 %	0 %	428308222
6	NC_019755	CA	3	6	4968	4973	50 %	0 %	0 %	50 %	428308222
7	NC_019755	TC	3	6	5198	5203	0 %	50 %	0 %	50 %	428308223
8	NC_019755	GA	3	6	5390	5395	50 %	0 %	50 %	0 %	428308223
9	NC_019755	CT	3	6	5521	5526	0 %	50 %	0 %	50 %	428308223
10	NC_019755	AT	4	8	5551	5558	50 %	50 %	0 %	0 %	428308223
11	NC_019755	TA	4	8	8163	8170	50 %	50 %	0 %	0 %	428308225
12	NC_019755	AC	3	6	9431	9436	50 %	0 %	0 %	50 %	428308226
13	NC_019755	TA	3	6	9480	9485	50 %	50 %	0 %	0 %	428308226
14	NC_019755	AT	3	6	9773	9778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019755	TA	3	6	9936	9941	50 %	50 %	0 %	0 %	428308227
16	NC_019755	TA	3	6	9970	9975	50 %	50 %	0 %	0 %	428308227
17	NC_019755	TA	3	6	10488	10493	50 %	50 %	0 %	0 %	428308228
18	NC_019755	TG	3	6	10627	10632	0 %	50 %	50 %	0 %	428308228
19	NC_019755	AG	3	6	10948	10953	50 %	0 %	50 %	0 %	428308229
20	NC_019755	GA	3	6	12113	12118	50 %	0 %	50 %	0 %	428308230
21	NC_019755	TC	3	6	13273	13278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019755	AT	3	6	14899	14904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019755	AT	3	6	15389	15394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019755	GA	3	6	16136	16141	50 %	0 %	50 %	0 %	428308231
25	NC_019755	CG	3	6	16323	16328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019755	TC	3	6	17098	17103	0 %	50 %	0 %	50 %	428308232
27	NC_019755	CT	3	6	17120	17125	0 %	50 %	0 %	50 %	428308232
28	NC_019755	TC	3	6	18198	18203	0 %	50 %	0 %	50 %	428308232
29	NC_019755	TC	3	6	18328	18333	0 %	50 %	0 %	50 %	428308232
30	NC_019755	TC	3	6	18692	18697	0 %	50 %	0 %	50 %	428308232
31	NC_019755	GA	3	6	18701	18706	50 %	0 %	50 %	0 %	428308232
32	NC_019755	TC	3	6	20445	20450	0 %	50 %	0 %	50 %	428308234
33	NC_019755	GA	3	6	21013	21018	50 %	0 %	50 %	0 %	428308234
34	NC_019755	AT	3	6	21145	21150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019755	GA	3	6	21787	21792	50 %	0 %	50 %	0 %	428308235
36	NC_019755	AG	3	6	22242	22247	50 %	0 %	50 %	0 %	428308235
37	NC_019755	TC	4	8	22434	22441	0 %	50 %	0 %	50 %	428308236
38	NC_019755	AC	3	6	26758	26763	50 %	0 %	0 %	50 %	428308240
39	NC_019755	AG	3	6	28297	28302	50 %	0 %	50 %	0 %	428308240
40	NC_019755	AG	3	6	28793	28798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.