MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.06

Total Repeats: 601

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019755	GAAA	2	8	24620	24627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019755	GCT	2	6	24709	24714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_019755	TTC	2	6	24715	24720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_019755	TCA	2	6	24790	24795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_019755	CAG	2	6	24806	24811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_019755	TAC	2	6	24855	24860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_019755	TAC	2	6	24869	24874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_019755	CACC	2	8	24911	24918	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
509	NC_019755	TTA	2	6	25038	25043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019755	TTA	2	6	25075	25080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019755	GATA	2	8	25086	25093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019755	TTCTGA	2	12	25201	25212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428308238
513	NC_019755	TCAA	2	8	25384	25391	50 %	25 %	0 %	25 %	428308238
514	NC_019755	CAA	2	6	25400	25405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308238
515	NC_019755	TCG	2	6	25408	25413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308238
516	NC_019755	CTGG	2	8	25437	25444	0 %	25 %	50 %	25 %	428308238
517	NC_019755	GGATTA	2	12	25445	25456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308238
518	NC_019755	TAT	2	6	25534	25539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308238
519	NC_019755	A	6	6	25602	25607	100 %	0 %	0 %	0 %	428308239
520	NC_019755	ACT	2	6	25652	25657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308239
521	NC_019755	ATC	2	6	25669	25674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308239
522	NC_019755	TCA	2	6	25757	25762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308239
523	NC_019755	GAA	2	6	25815	25820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308239
524	NC_019755	TAT	2	6	25829	25834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308239
525	NC_019755	AAG	2	6	25850	25855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308239
526	NC_019755	AGCCA	2	10	25879	25888	40 %	0 %	20 %	40 %	428308239
527	NC_019755	ATC	2	6	25979	25984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308239
528	NC_019755	AAT	2	6	25998	26003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308239
529	NC_019755	AAC	2	6	26054	26059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308239
530	NC_019755	GCG	2	6	26114	26119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308239
531	NC_019755	CTA	2	6	26161	26166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_019755	TTAA	2	8	26247	26254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019755	TTG	2	6	26276	26281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019755	TAG	2	6	26333	26338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_019755	TAA	2	6	26471	26476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019755	ATT	2	6	26630	26635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_019755	GCA	2	6	26636	26641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_019755	A	6	6	26670	26675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_019755	AC	3	6	26758	26763	50 %	0 %	0 %	50 %	428308240
540	NC_019755	ACCA	2	8	26765	26772	50 %	0 %	0 %	50 %	428308240
541	NC_019755	AAT	2	6	26784	26789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308240
542	NC_019755	GCA	2	6	26815	26820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308240
543	NC_019755	ATC	3	9	26823	26831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308240
544	NC_019755	ACCA	2	8	26847	26854	50 %	0 %	0 %	50 %	428308240
545	NC_019755	TGC	2	6	26865	26870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308240
546	NC_019755	TTA	2	6	26944	26949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308240
547	NC_019755	GCA	2	6	26977	26982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308240
548	NC_019755	CGG	2	6	27083	27088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308240
549	NC_019755	TCT	2	6	27149	27154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308240
550	NC_019755	TTC	2	6	27175	27180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308240
551	NC_019755	TTG	2	6	27201	27206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308240
552	NC_019755	CTG	2	6	27219	27224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308240
553	NC_019755	CTT	2	6	27249	27254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308240
554	NC_019755	CAG	2	6	27338	27343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308240
555	NC_019755	CTC	2	6	27486	27491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308240
556	NC_019755	CAA	2	6	27598	27603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308240
557	NC_019755	ACT	2	6	27619	27624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308240
558	NC_019755	TGCT	2	8	27630	27637	0 %	50 %	25 %	25 %	428308240
559	NC_019755	T	6	6	27724	27729	0 %	100 %	0 %	0 %	428308240
560	NC_019755	CTG	2	6	27732	27737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308240
561	NC_019755	TAG	2	6	27836	27841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308240
562	NC_019755	TCAA	2	8	27880	27887	50 %	25 %	0 %	25 %	428308240
563	NC_019755	TAAGT	2	10	27909	27918	40 %	40 %	20 %	0 %	428308240
564	NC_019755	TTC	2	6	27933	27938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308240
565	NC_019755	AACC	2	8	27949	27956	50 %	0 %	0 %	50 %	428308240
566	NC_019755	A	6	6	27957	27962	100 %	0 %	0 %	0 %	428308240
567	NC_019755	T	7	7	27974	27980	0 %	100 %	0 %	0 %	428308240
568	NC_019755	GAT	2	6	28005	28010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308240
569	NC_019755	CGT	2	6	28060	28065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308240
570	NC_019755	TGT	2	6	28075	28080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308240
571	NC_019755	CTT	2	6	28081	28086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308240
572	NC_019755	AGT	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308240
573	NC_019755	T	6	6	28100	28105	0 %	100 %	0 %	0 %	428308240
574	NC_019755	TGT	2	6	28183	28188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308240
575	NC_019755	TGG	2	6	28248	28253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308240
576	NC_019755	T	6	6	28254	28259	0 %	100 %	0 %	0 %	428308240
577	NC_019755	AG	3	6	28297	28302	50 %	0 %	50 %	0 %	428308240
578	NC_019755	TTC	2	6	28314	28319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308240
579	NC_019755	GTT	2	6	28328	28333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308240
580	NC_019755	TAG	2	6	28382	28387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308240
581	NC_019755	GCT	2	6	28499	28504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308240
582	NC_019755	GTA	2	6	28510	28515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308240
583	NC_019755	GAG	2	6	28592	28597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308240
584	NC_019755	TCA	2	6	28609	28614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308240
585	NC_019755	TTG	2	6	28634	28639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308240
586	NC_019755	ATC	2	6	28720	28725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_019755	AG	3	6	28793	28798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_019755	T	6	6	28833	28838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_019755	A	7	7	28896	28902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_019755	A	6	6	28907	28912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019755	ATTT	2	8	28965	28972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_019755	T	6	6	28970	28975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_019755	ATAA	2	8	29002	29009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_019755	CTG	2	6	29120	29125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_019755	TTA	2	6	29139	29144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_019755	ACT	2	6	29159	29164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_019755	TTA	2	6	29363	29368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_019755	A	6	6	29417	29422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_019755	ATTG	2	8	29442	29449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_019755	AGAGCG	2	12	29464	29475	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
601	NC_019755	GTT	2	6	29483	29488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous 12Next >