MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.03

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019754	AAAT	2	8	42	49	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019754	CAGT	2	8	171	178	25 %	25 %	25 %	25 %	428308169
3	NC_019754	CAAA	2	8	515	522	75 %	0 %	0 %	25 %	428308170
4	NC_019754	AATA	2	8	667	674	75 %	25 %	0 %	0 %	428308170
5	NC_019754	CACT	2	8	1080	1087	25 %	25 %	0 %	50 %	428308170
6	NC_019754	TTTG	2	8	1614	1621	0 %	75 %	25 %	0 %	428308170
7	NC_019754	AATG	2	8	2062	2069	50 %	25 %	25 %	0 %	428308170
8	NC_019754	GGCT	2	8	2403	2410	0 %	25 %	50 %	25 %	428308170
9	NC_019754	GCAC	2	8	2830	2837	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019754	TTTG	2	8	2976	2983	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019754	AACT	2	8	3475	3482	50 %	25 %	0 %	25 %	428308171
12	NC_019754	GTAA	2	8	3638	3645	50 %	25 %	25 %	0 %	428308171
13	NC_019754	CATA	2	8	4039	4046	50 %	25 %	0 %	25 %	428308171
14	NC_019754	TAAA	3	12	4150	4161	75 %	25 %	0 %	0 %	428308171
15	NC_019754	GATG	2	8	4446	4453	25 %	25 %	50 %	0 %	428308171
16	NC_019754	AACC	2	8	5264	5271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019754	TAAT	2	8	5385	5392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019754	ATCA	2	8	5656	5663	50 %	25 %	0 %	25 %	428308172
19	NC_019754	AGAT	2	8	6262	6269	50 %	25 %	25 %	0 %	428308173
20	NC_019754	TTTA	2	8	6690	6697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019754	TAAA	2	8	7387	7394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019754	ATTA	2	8	7444	7451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019754	CTTC	2	8	7847	7854	0 %	50 %	0 %	50 %	428308174
24	NC_019754	TCGC	2	8	8746	8753	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019754	AAAG	2	8	9066	9073	75 %	0 %	25 %	0 %	428308175
26	NC_019754	ATTA	2	8	10095	10102	50 %	50 %	0 %	0 %	428308176
27	NC_019754	TCAA	2	8	10621	10628	50 %	25 %	0 %	25 %	428308177
28	NC_019754	AATT	2	8	11035	11042	50 %	50 %	0 %	0 %	428308177
29	NC_019754	AAGA	2	8	11517	11524	75 %	0 %	25 %	0 %	428308178
30	NC_019754	GGCT	2	8	11841	11848	0 %	25 %	50 %	25 %	428308179
31	NC_019754	AGTG	2	8	12127	12134	25 %	25 %	50 %	0 %	428308180
32	NC_019754	AAGG	2	8	12395	12402	50 %	0 %	50 %	0 %	428308180
33	NC_019754	CTAA	2	8	13362	13369	50 %	25 %	0 %	25 %	428308181
34	NC_019754	ATGT	2	8	13524	13531	25 %	50 %	25 %	0 %	428308181
35	NC_019754	GTTT	2	8	13598	13605	0 %	75 %	25 %	0 %	428308181
36	NC_019754	CTAA	2	8	13733	13740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019754	ATTT	2	8	14371	14378	25 %	75 %	0 %	0 %	428308183
38	NC_019754	AGCA	2	8	14413	14420	50 %	0 %	25 %	25 %	428308183
39	NC_019754	TTTA	2	8	14489	14496	25 %	75 %	0 %	0 %	428308183
40	NC_019754	TTGA	2	8	14644	14651	25 %	50 %	25 %	0 %	428308183
41	NC_019754	AAAT	2	8	14837	14844	75 %	25 %	0 %	0 %	428308183
42	NC_019754	CAGG	2	8	14877	14884	25 %	0 %	50 %	25 %	428308183
43	NC_019754	TATT	2	8	15331	15338	25 %	75 %	0 %	0 %	428308183
44	NC_019754	TATT	2	8	15385	15392	25 %	75 %	0 %	0 %	428308183
45	NC_019754	AGAA	2	8	15708	15715	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019754	AGTG	2	8	15860	15867	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019754	TTTA	2	8	15976	15983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019754	TTCA	2	8	16506	16513	25 %	50 %	0 %	25 %	428308184
49	NC_019754	GATC	2	8	16652	16659	25 %	25 %	25 %	25 %	428308184
50	NC_019754	TGTT	2	8	16912	16919	0 %	75 %	25 %	0 %	428308184
51	NC_019754	GTTG	2	8	16922	16929	0 %	50 %	50 %	0 %	428308184
52	NC_019754	CCTG	2	8	17242	17249	0 %	25 %	25 %	50 %	428308184
53	NC_019754	TGTA	2	8	18275	18282	25 %	50 %	25 %	0 %	428308184
54	NC_019754	AGAC	2	8	19352	19359	50 %	0 %	25 %	25 %	428308184
55	NC_019754	ACTC	2	8	19571	19578	25 %	25 %	0 %	50 %	428308185
56	NC_019754	CATT	2	8	20094	20101	25 %	50 %	0 %	25 %	428308186
57	NC_019754	ACCG	2	8	20409	20416	25 %	0 %	25 %	50 %	428308186
58	NC_019754	GATG	2	8	20706	20713	25 %	25 %	50 %	0 %	428308186
59	NC_019754	CCAT	2	8	21799	21806	25 %	25 %	0 %	50 %	428308187
60	NC_019754	ATCA	2	8	22182	22189	50 %	25 %	0 %	25 %	428308187
61	NC_019754	GGCT	2	8	22212	22219	0 %	25 %	50 %	25 %	428308187
62	NC_019754	TTTC	2	8	22331	22338	0 %	75 %	0 %	25 %	428308187
63	NC_019754	GTCT	2	8	22503	22510	0 %	50 %	25 %	25 %	428308187
64	NC_019754	TCAA	2	8	23047	23054	50 %	25 %	0 %	25 %	428308187
65	NC_019754	TTCG	2	8	23292	23299	0 %	50 %	25 %	25 %	428308187
66	NC_019754	GTTA	2	8	23512	23519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019754	CCCT	2	8	24109	24116	0 %	25 %	0 %	75 %	428308188
68	NC_019754	GTTG	2	8	24422	24429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019754	AACT	2	8	24465	24472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019754	ATAA	2	8	24832	24839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019754	TTTG	2	8	25662	25669	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019754	TCGC	2	8	26095	26102	0 %	25 %	25 %	50 %	428308190
73	NC_019754	GTAA	2	8	26321	26328	50 %	25 %	25 %	0 %	428308191
74	NC_019754	TAAT	2	8	26487	26494	50 %	50 %	0 %	0 %	428308191
75	NC_019754	AGTA	2	8	26633	26640	50 %	25 %	25 %	0 %	428308191
76	NC_019754	TACA	2	8	27195	27202	50 %	25 %	0 %	25 %	428308192
77	NC_019754	GCTG	2	8	27260	27267	0 %	25 %	50 %	25 %	428308192
78	NC_019754	GGTT	2	8	27476	27483	0 %	50 %	50 %	0 %	428308192
79	NC_019754	TCAT	2	8	27547	27554	25 %	50 %	0 %	25 %	428308192
80	NC_019754	TATT	2	8	27561	27568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019754	TCAT	2	8	28626	28633	25 %	50 %	0 %	25 %	428308193
82	NC_019754	ATTA	2	8	28883	28890	50 %	50 %	0 %	0 %	428308193
83	NC_019754	ATTA	2	8	29478	29485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019754	TATT	2	8	29547	29554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019754	AAAC	2	8	29789	29796	75 %	0 %	0 %	25 %	428308194
86	NC_019754	CTGA	2	8	30099	30106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019754	CTGA	2	8	30497	30504	25 %	25 %	25 %	25 %	428308195
88	NC_019754	CTTT	2	8	31885	31892	0 %	75 %	0 %	25 %	428308198
89	NC_019754	TCAG	2	8	32220	32227	25 %	25 %	25 %	25 %	428308199
90	NC_019754	TCAT	2	8	32907	32914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019754	TTGA	2	8	33259	33266	25 %	50 %	25 %	0 %	428308201
92	NC_019754	CTAT	2	8	33686	33693	25 %	50 %	0 %	25 %	428308202
93	NC_019754	TGTA	2	8	34009	34016	25 %	50 %	25 %	0 %	428308202
94	NC_019754	GAGC	2	8	34576	34583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019754	GCTC	2	8	34864	34871	0 %	25 %	25 %	50 %	428308204
96	NC_019754	CAAA	2	8	35050	35057	75 %	0 %	0 %	25 %	428308204
97	NC_019754	CAAA	2	8	35779	35786	75 %	0 %	0 %	25 %	428308204
98	NC_019754	TAAA	2	8	36505	36512	75 %	25 %	0 %	0 %	428308204
99	NC_019754	ATTA	2	8	36869	36876	50 %	50 %	0 %	0 %	428308204
100	NC_019754	TTGT	2	8	37735	37742	0 %	75 %	25 %	0 %	428308204
101	NC_019754	AATC	2	8	37778	37785	50 %	25 %	0 %	25 %	428308204
102	NC_019754	GGTC	2	8	37844	37851	0 %	25 %	50 %	25 %	428308204
103	NC_019754	CTGG	2	8	38322	38329	0 %	25 %	50 %	25 %	428308205
104	NC_019754	TAGG	2	8	39042	39049	25 %	25 %	50 %	0 %	428308206
105	NC_019754	CGAG	2	8	39070	39077	25 %	0 %	50 %	25 %	428308206
106	NC_019754	CTGC	2	8	39309	39316	0 %	25 %	25 %	50 %	428308206
107	NC_019754	ACAA	2	8	40151	40158	75 %	0 %	0 %	25 %	428308207
108	NC_019754	TCAG	2	8	40909	40916	25 %	25 %	25 %	25 %	428308209
109	NC_019754	TTTA	2	8	41108	41115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019754	CTTA	2	8	41566	41573	25 %	50 %	0 %	25 %	428308210
111	NC_019754	GACT	2	8	41771	41778	25 %	25 %	25 %	25 %	428308210
112	NC_019754	AGAC	2	8	42066	42073	50 %	0 %	25 %	25 %	428308210
113	NC_019754	TATT	2	8	42145	42152	25 %	75 %	0 %	0 %	428308210
114	NC_019754	ATTT	2	8	42326	42333	25 %	75 %	0 %	0 %	428308211
115	NC_019754	AGAT	2	8	42531	42538	50 %	25 %	25 %	0 %	428308211
116	NC_019754	AGAT	2	8	43439	43446	50 %	25 %	25 %	0 %	428308211
117	NC_019754	AAAG	2	8	44042	44049	75 %	0 %	25 %	0 %	428308211
118	NC_019754	CAAA	2	8	44593	44600	75 %	0 %	0 %	25 %	428308212
119	NC_019754	GCTC	2	8	45292	45299	0 %	25 %	25 %	50 %	428308214
120	NC_019754	AAAT	2	8	45459	45466	75 %	25 %	0 %	0 %	428308214
121	NC_019754	GTAA	2	8	45904	45911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019754	AAAT	2	8	45974	45981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019754	AAAT	2	8	46106	46113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019754	ATAA	2	8	46240	46247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019754	CTTT	2	8	46568	46575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019754	TTTG	2	8	46845	46852	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019754	TGTT	2	8	47077	47084	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019754	TTTC	2	8	47453	47460	0 %	75 %	0 %	25 %	428308215
129	NC_019754	AATG	2	8	48021	48028	50 %	25 %	25 %	0 %	428308215
130	NC_019754	GTCT	2	8	48052	48059	0 %	50 %	25 %	25 %	428308215
131	NC_019754	ACAT	2	8	48447	48454	50 %	25 %	0 %	25 %	428308216
132	NC_019754	TCAT	2	8	48600	48607	25 %	50 %	0 %	25 %	428308216
133	NC_019754	AGTA	2	8	48630	48637	50 %	25 %	25 %	0 %	428308217
134	NC_019754	TAAA	2	8	48841	48848	75 %	25 %	0 %	0 %	428308217
135	NC_019754	TTGA	2	8	49040	49047	25 %	50 %	25 %	0 %	428308217
136	NC_019754	CTTC	2	8	49313	49320	0 %	50 %	0 %	50 %	428308217
137	NC_019754	AATA	2	8	49614	49621	75 %	25 %	0 %	0 %	428308217

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.