MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.03

Total Repeats: 655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019754	GTT	2	6	27	32	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019754	AAG	2	6	84	89	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308169
3	NC_019754	CAA	2	6	94	99	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308169
4	NC_019754	AAG	2	6	204	209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308169
5	NC_019754	GAA	2	6	526	531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
6	NC_019754	AGA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
7	NC_019754	AAG	2	6	780	785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
8	NC_019754	AGC	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308170
9	NC_019754	ACT	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
10	NC_019754	CAA	2	6	955	960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308170
11	NC_019754	CCT	2	6	984	989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308170
12	NC_019754	GTC	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
13	NC_019754	TAA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
14	NC_019754	TAC	2	6	1292	1297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308170
15	NC_019754	TGA	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
16	NC_019754	TAG	2	6	1347	1352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
17	NC_019754	TGA	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
18	NC_019754	ATG	3	9	1367	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
19	NC_019754	GAT	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
20	NC_019754	AGC	2	6	1479	1484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308170
21	NC_019754	CGT	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
22	NC_019754	AGA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
23	NC_019754	AAT	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
24	NC_019754	AAT	2	6	1570	1575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
25	NC_019754	ATG	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
26	NC_019754	GAT	3	9	1837	1845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
27	NC_019754	AAT	2	6	1846	1851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
28	NC_019754	CTG	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
29	NC_019754	CTG	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308170
30	NC_019754	ATG	3	9	1976	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
31	NC_019754	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
32	NC_019754	TAA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308170
33	NC_019754	TGT	2	6	2307	2312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308170
34	NC_019754	TGA	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308170
35	NC_019754	AGA	2	6	2349	2354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308170
36	NC_019754	ACA	2	6	2424	2429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308170
37	NC_019754	CAC	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308170
38	NC_019754	TTG	2	6	2623	2628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019754	TTA	2	6	2766	2771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019754	TTG	2	6	3114	3119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019754	TTG	2	6	3214	3219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019754	TAA	2	6	3238	3243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019754	ACT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308171
44	NC_019754	TGA	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308171
45	NC_019754	TCT	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
46	NC_019754	TCT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
47	NC_019754	TGT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
48	NC_019754	AAG	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308171
49	NC_019754	GTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
50	NC_019754	TTA	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
51	NC_019754	GTT	2	6	3886	3891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308171
52	NC_019754	AGC	3	9	3983	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308171
53	NC_019754	CTG	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308171
54	NC_019754	GTC	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308171
55	NC_019754	TAT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
56	NC_019754	TCA	2	6	4323	4328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308171
57	NC_019754	TTA	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
58	NC_019754	ATA	2	6	4380	4385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
59	NC_019754	TAA	2	6	4457	4462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308171
60	NC_019754	TCT	2	6	4464	4469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308171
61	NC_019754	AGA	2	6	4515	4520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308171
62	NC_019754	CAG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308171
63	NC_019754	ATT	2	6	4667	4672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308171
64	NC_019754	GAT	2	6	4673	4678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308171
65	NC_019754	ACT	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019754	GTT	2	6	4906	4911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019754	CAC	2	6	4952	4957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_019754	TAT	2	6	4958	4963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019754	TTG	2	6	4989	4994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019754	TCC	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019754	TAC	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019754	TTA	3	9	5050	5058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019754	TTA	2	6	5136	5141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019754	ATT	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019754	TGT	2	6	5374	5379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019754	ACA	2	6	5429	5434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019754	CTA	2	6	5514	5519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019754	TAA	2	6	5581	5586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308172
79	NC_019754	CAA	2	6	5768	5773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019754	TTG	2	6	5808	5813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019754	TAA	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019754	ATA	2	6	6044	6049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019754	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308173
84	NC_019754	TAT	2	6	6251	6256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308173
85	NC_019754	ATC	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308173
86	NC_019754	ACA	2	6	6350	6355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308173
87	NC_019754	GTA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308173
88	NC_019754	GTT	2	6	6436	6441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019754	TGG	2	6	6460	6465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019754	GAA	2	6	6490	6495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019754	GAA	2	6	6619	6624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019754	GGT	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019754	TGA	2	6	6702	6707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019754	ATT	2	6	6718	6723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019754	TTA	2	6	6735	6740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019754	TAT	2	6	6779	6784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019754	GAA	2	6	6817	6822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019754	TTC	2	6	6836	6841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019754	TAT	2	6	7014	7019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019754	GAT	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019754	TGA	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019754	ATT	2	6	7334	7339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019754	TTA	2	6	7407	7412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019754	TGA	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
105	NC_019754	ATC	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308174
106	NC_019754	CGC	2	6	7601	7606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308174
107	NC_019754	GCA	2	6	7621	7626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308174
108	NC_019754	AGT	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
109	NC_019754	TAA	2	6	7757	7762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308174
110	NC_019754	CGT	2	6	7789	7794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308174
111	NC_019754	GAT	2	6	7924	7929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
112	NC_019754	CAA	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308174
113	NC_019754	AGT	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308174
114	NC_019754	CTC	2	6	8143	8148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308174
115	NC_019754	AGC	2	6	8151	8156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308174
116	NC_019754	TTG	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308174
117	NC_019754	GTT	2	6	8283	8288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308174
118	NC_019754	ATC	2	6	8439	8444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308174
119	NC_019754	ATT	2	6	8479	8484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308174
120	NC_019754	AAG	2	6	8501	8506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308174
121	NC_019754	AAT	2	6	8516	8521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308174
122	NC_019754	CGC	2	6	8545	8550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308174
123	NC_019754	TCT	2	6	8619	8624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019754	CTT	2	6	8690	8695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019754	TCA	2	6	8821	8826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019754	GTT	2	6	8950	8955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308175
127	NC_019754	ACT	2	6	9005	9010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308175
128	NC_019754	GTA	2	6	9081	9086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308175
129	NC_019754	AAC	2	6	9132	9137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308175
130	NC_019754	TAA	2	6	9330	9335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019754	ACT	2	6	9339	9344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019754	TAA	2	6	9356	9361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019754	GCT	2	6	9365	9370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019754	TTG	2	6	9394	9399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019754	TTG	2	6	9420	9425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019754	GAA	2	6	9710	9715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019754	CTA	2	6	9717	9722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019754	CTT	2	6	9795	9800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019754	TGC	2	6	9845	9850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_019754	TAC	2	6	9998	10003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308176
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261	NC_019754	AAG	2	6	19381	19386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308184
262	NC_019754	ACG	2	6	19583	19588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308185
263	NC_019754	GAA	2	6	19597	19602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308185
264	NC_019754	AAG	2	6	19653	19658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308185
265	NC_019754	TTC	2	6	19682	19687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308185
266	NC_019754	TGA	2	6	19692	19697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308185
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269	NC_019754	CAA	2	6	19981	19986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_019754	TTC	2	6	20036	20041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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301	NC_019754	GCT	2	6	21432	21437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308187
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373	NC_019754	TTC	2	6	27993	27998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308193
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382	NC_019754	TCA	2	6	28557	28562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308193
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385	NC_019754	AAC	2	6	28679	28684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308193
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