MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019753	TAC	2	6	197000	197005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_019753	A	8	8	197013	197020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_019753	AGC	2	6	197022	197027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_019753	CAG	2	6	197322	197327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303844
4005	NC_019753	TA	3	6	197331	197336	50 %	50 %	0 %	0 %	428303844
4006	NC_019753	TTA	3	9	197435	197443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303844
4007	NC_019753	CGC	2	6	197503	197508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303844
4008	NC_019753	CAA	2	6	197561	197566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303844
4009	NC_019753	CTTA	2	8	197600	197607	25 %	50 %	0 %	25 %	428303844
4010	NC_019753	TTG	2	6	197667	197672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303844
4011	NC_019753	GAT	2	6	197720	197725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303844
4012	NC_019753	GAT	2	6	197821	197826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303844
4013	NC_019753	GTG	2	6	197856	197861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303844
4014	NC_019753	ATTT	2	8	197865	197872	25 %	75 %	0 %	0 %	428303844
4015	NC_019753	ACT	2	6	197896	197901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303844
4016	NC_019753	TAC	2	6	197925	197930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303844
4017	NC_019753	TAA	2	6	197932	197937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303844
4018	NC_019753	GAA	2	6	198020	198025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303844
4019	NC_019753	TAT	3	9	198058	198066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303844
4020	NC_019753	ATT	2	6	198168	198173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303844
4021	NC_019753	GTTT	2	8	198180	198187	0 %	75 %	25 %	0 %	428303844
4022	NC_019753	TAG	2	6	198288	198293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303844
4023	NC_019753	GAA	2	6	198335	198340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303844
4024	NC_019753	TAA	2	6	198361	198366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303844
4025	NC_019753	TTA	2	6	198386	198391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303844
4026	NC_019753	TGG	2	6	198431	198436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303844
4027	NC_019753	CAGA	2	8	198438	198445	50 %	0 %	25 %	25 %	428303844
4028	NC_019753	ATTA	2	8	198446	198453	50 %	50 %	0 %	0 %	428303844
4029	NC_019753	CTTTA	2	10	198457	198466	20 %	60 %	0 %	20 %	428303844
4030	NC_019753	ATTTT	2	10	198491	198500	20 %	80 %	0 %	0 %	428303844
4031	NC_019753	T	6	6	198497	198502	0 %	100 %	0 %	0 %	428303844
4032	NC_019753	CTC	2	6	198504	198509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303844
4033	NC_019753	AAC	2	6	198510	198515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303844
4034	NC_019753	TGG	3	9	198551	198559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303844
4035	NC_019753	TTG	2	6	198585	198590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303844
4036	NC_019753	GGA	2	6	198710	198715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303844
4037	NC_019753	T	7	7	198744	198750	0 %	100 %	0 %	0 %	428303844
4038	NC_019753	GAA	2	6	198755	198760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303844
4039	NC_019753	TGCT	2	8	198793	198800	0 %	50 %	25 %	25 %	428303844
4040	NC_019753	ATTA	2	8	198808	198815	50 %	50 %	0 %	0 %	428303844
4041	NC_019753	T	6	6	198831	198836	0 %	100 %	0 %	0 %	428303844
4042	NC_019753	GAAT	2	8	198888	198895	50 %	25 %	25 %	0 %	428303844
4043	NC_019753	GAT	2	6	198916	198921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303844
4044	NC_019753	CAA	2	6	198935	198940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303844
4045	NC_019753	CTG	2	6	198951	198956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303844
4046	NC_019753	AGA	2	6	199051	199056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303844
4047	NC_019753	TCC	2	6	199129	199134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303844
4048	NC_019753	ATC	2	6	199278	199283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303844
4049	NC_019753	TAG	2	6	199296	199301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303844
4050	NC_019753	ATT	2	6	199307	199312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303844
4051	NC_019753	TGG	2	6	199339	199344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303844
4052	NC_019753	TTG	2	6	199407	199412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303844
4053	NC_019753	T	6	6	199599	199604	0 %	100 %	0 %	0 %	428303844
4054	NC_019753	ATT	2	6	199712	199717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303844
4055	NC_019753	AAT	2	6	199863	199868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303845
4056	NC_019753	ATAG	2	8	200052	200059	50 %	25 %	25 %	0 %	428303845
4057	NC_019753	CAG	2	6	200106	200111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303845
4058	NC_019753	TTGG	2	8	200179	200186	0 %	50 %	50 %	0 %	428303845
4059	NC_019753	TGC	2	6	200197	200202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303845
4060	NC_019753	GCTG	2	8	200203	200210	0 %	25 %	50 %	25 %	428303845
4061	NC_019753	TAA	2	6	200254	200259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303845
4062	NC_019753	AGT	2	6	200293	200298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_019753	ATA	2	6	200405	200410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_019753	TA	3	6	200409	200414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_019753	AAC	2	6	200456	200461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303846
4066	NC_019753	GTT	2	6	200483	200488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303846
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4068	NC_019753	GAA	2	6	200800	200805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303846
4069	NC_019753	CAG	2	6	200819	200824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303846
4070	NC_019753	TTGG	2	8	200892	200899	0 %	50 %	50 %	0 %	428303846
4071	NC_019753	TAA	2	6	200967	200972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303846
4072	NC_019753	AGT	2	6	201006	201011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_019753	CAA	2	6	201166	201171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_019753	AC	3	6	201175	201180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_019753	AGC	2	6	201238	201243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303847
4076	NC_019753	GCA	2	6	201312	201317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303847
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4079	NC_019753	AGT	2	6	201467	201472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303847
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4081	NC_019753	T	6	6	201543	201548	0 %	100 %	0 %	0 %	428303847
4082	NC_019753	CAG	2	6	201558	201563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303847
4083	NC_019753	ACT	2	6	201645	201650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303847
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4087	NC_019753	ACC	2	6	201749	201754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303847
4088	NC_019753	CGCC	2	8	201759	201766	0 %	0 %	25 %	75 %	428303847
4089	NC_019753	GTA	2	6	201768	201773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303847
4090	NC_019753	ATT	2	6	201777	201782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303847
4091	NC_019753	CAA	2	6	201799	201804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303847
4092	NC_019753	GTTGCT	2	12	201831	201842	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428303847
4093	NC_019753	GGT	2	6	201848	201853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303847
4094	NC_019753	CAA	2	6	201888	201893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303847
4095	NC_019753	TTA	2	6	201906	201911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303847
4096	NC_019753	TAG	2	6	201916	201921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303847
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4100	NC_019753	TTGGTC	2	12	202090	202101	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428303847
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4102	NC_019753	TTAC	2	8	202155	202162	25 %	50 %	0 %	25 %	428303847
4103	NC_019753	AAC	2	6	202186	202191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303847
4104	NC_019753	ACC	2	6	202290	202295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303847
4105	NC_019753	ATA	2	6	202408	202413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303847
4106	NC_019753	ATA	2	6	202456	202461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303847
4107	NC_019753	CTC	2	6	202495	202500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303847
4108	NC_019753	CTC	2	6	202530	202535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303847
4109	NC_019753	ATA	2	6	202591	202596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303847
4110	NC_019753	TTA	2	6	202632	202637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303847
4111	NC_019753	GGT	2	6	202647	202652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303847
4112	NC_019753	TGC	2	6	202661	202666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303847
4113	NC_019753	TTTA	2	8	202697	202704	25 %	75 %	0 %	0 %	428303847
4114	NC_019753	ATG	2	6	202758	202763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303847
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4117	NC_019753	A	7	7	202935	202941	100 %	0 %	0 %	0 %	428303847
4118	NC_019753	AT	3	6	202946	202951	50 %	50 %	0 %	0 %	428303847
4119	NC_019753	TAG	2	6	202969	202974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303847
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4121	NC_019753	TGG	2	6	203007	203012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303847
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4123	NC_019753	ACAA	2	8	203080	203087	75 %	0 %	0 %	25 %	428303847
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4500	NC_019753	AGA	3	9	219960	219968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861

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