MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019753	TTG	2	6	171121	171126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303820
3502	NC_019753	TTC	2	6	171163	171168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303820
3503	NC_019753	CCA	2	6	171220	171225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303820
3504	NC_019753	ATTAC	2	10	171283	171292	40 %	40 %	0 %	20 %	428303820
3505	NC_019753	GCC	2	6	171369	171374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303820
3506	NC_019753	T	6	6	171405	171410	0 %	100 %	0 %	0 %	428303820
3507	NC_019753	ACC	2	6	171441	171446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303820
3508	NC_019753	GTG	2	6	171472	171477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303820
3509	NC_019753	GTA	2	6	171478	171483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303820
3510	NC_019753	GAT	2	6	171512	171517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303820
3511	NC_019753	TAA	2	6	171558	171563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303820
3512	NC_019753	CG	3	6	171588	171593	0 %	0 %	50 %	50 %	428303820
3513	NC_019753	AAT	2	6	171609	171614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303820
3514	NC_019753	TGT	2	6	171658	171663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303820
3515	NC_019753	TTG	2	6	171709	171714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303820
3516	NC_019753	ACC	2	6	171780	171785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303820
3517	NC_019753	ATCC	2	8	171795	171802	25 %	25 %	0 %	50 %	428303820
3518	NC_019753	CTG	3	9	172028	172036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303820
3519	NC_019753	T	8	8	172243	172250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_019753	TTG	2	6	172275	172280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_019753	TAA	2	6	172324	172329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_019753	GTA	2	6	172368	172373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_019753	CAT	2	6	172468	172473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303821
3524	NC_019753	CAG	2	6	172525	172530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303821
3525	NC_019753	CTG	2	6	172584	172589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_019753	TAAA	2	8	172620	172627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_019753	T	6	6	172628	172633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_019753	TGC	2	6	172723	172728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303822
3529	NC_019753	CTGTT	2	10	172738	172747	0 %	60 %	20 %	20 %	428303822
3530	NC_019753	CTG	2	6	172770	172775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303822
3531	NC_019753	TAA	2	6	172828	172833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303822
3532	NC_019753	AGT	2	6	172856	172861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303822
3533	NC_019753	GTTTTG	2	12	172926	172937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303822
3534	NC_019753	TTA	2	6	172983	172988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303822
3535	NC_019753	GTA	2	6	173007	173012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303822
3536	NC_019753	GCT	2	6	173028	173033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303822
3537	NC_019753	AGT	2	6	173045	173050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303822
3538	NC_019753	GTTA	2	8	173122	173129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_019753	GGA	2	6	173140	173145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_019753	TGCGC	2	10	173205	173214	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3541	NC_019753	TAG	2	6	173242	173247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_019753	ATTG	2	8	173262	173269	25 %	50 %	25 %	0 %	428303823
3543	NC_019753	CAATAG	2	12	173333	173344	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428303823
3544	NC_019753	TGG	2	6	173430	173435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303823
3545	NC_019753	CAT	2	6	173615	173620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303823
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3547	NC_019753	CTG	2	6	173721	173726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303823
3548	NC_019753	A	6	6	173741	173746	100 %	0 %	0 %	0 %	428303823
3549	NC_019753	TCA	2	6	173755	173760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303823
3550	NC_019753	GTA	2	6	173770	173775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303823
3551	NC_019753	AGT	2	6	173791	173796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303823
3552	NC_019753	CGG	2	6	173825	173830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303823
3553	NC_019753	CTG	2	6	173903	173908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303823
3554	NC_019753	GGT	2	6	173944	173949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303823
3555	NC_019753	GTA	2	6	173981	173986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303823
3556	NC_019753	GTA	2	6	173991	173996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303823
3557	NC_019753	AT	3	6	174040	174045	50 %	50 %	0 %	0 %	428303823
3558	NC_019753	TGGG	2	8	174049	174056	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_019753	AAT	2	6	174088	174093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_019753	ACG	2	6	174125	174130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_019753	CTG	2	6	174161	174166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_019753	CTT	2	6	174199	174204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_019753	TGT	2	6	174208	174213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_019753	AGA	2	6	174234	174239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_019753	CG	3	6	174266	174271	0 %	0 %	50 %	50 %	428303824
3566	NC_019753	TACGAA	2	12	174283	174294	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428303824
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3571	NC_019753	ATCTGA	2	12	174570	174581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428303824
3572	NC_019753	TTTG	2	8	174650	174657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_019753	TGG	2	6	174662	174667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_019753	TAT	2	6	174719	174724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_019753	TGA	2	6	174748	174753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303825
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3579	NC_019753	GTT	2	6	174882	174887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303825
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3589	NC_019753	AATT	2	8	175253	175260	50 %	50 %	0 %	0 %	428303825
3590	NC_019753	GAG	2	6	175384	175389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303825
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3592	NC_019753	CTGT	2	8	175558	175565	0 %	50 %	25 %	25 %	428303825
3593	NC_019753	CTT	2	6	175606	175611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303825
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3600	NC_019753	TCT	2	6	175953	175958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303825
3601	NC_019753	TAC	2	6	175961	175966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303825
3602	NC_019753	GTT	2	6	176046	176051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303825
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3604	NC_019753	GATG	2	8	176081	176088	25 %	25 %	50 %	0 %	428303825
3605	NC_019753	GTGG	2	8	176130	176137	0 %	25 %	75 %	0 %	428303825
3606	NC_019753	CAA	2	6	176188	176193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303825
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3609	NC_019753	CAT	2	6	176334	176339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303825
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3611	NC_019753	TGC	2	6	176492	176497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303825
3612	NC_019753	CG	3	6	176503	176508	0 %	0 %	50 %	50 %	428303825
3613	NC_019753	AGC	2	6	176656	176661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_019753	T	6	6	176690	176695	0 %	100 %	0 %	0 %	428303826
3615	NC_019753	TCA	2	6	176707	176712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303826
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3618	NC_019753	TCA	2	6	176764	176769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303826
3619	NC_019753	TCG	2	6	176791	176796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303826
3620	NC_019753	TCG	2	6	176896	176901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303826
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