MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019753	TGGC	2	8	145723	145730	0 %	25 %	50 %	25 %	428303799
3002	NC_019753	TA	3	6	145793	145798	50 %	50 %	0 %	0 %	428303799
3003	NC_019753	AC	3	6	145799	145804	50 %	0 %	0 %	50 %	428303799
3004	NC_019753	ACA	2	6	145839	145844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303799
3005	NC_019753	AAAC	2	8	145885	145892	75 %	0 %	0 %	25 %	428303799
3006	NC_019753	TTAA	2	8	145963	145970	50 %	50 %	0 %	0 %	428303799
3007	NC_019753	A	6	6	145975	145980	100 %	0 %	0 %	0 %	428303799
3008	NC_019753	AT	3	6	146005	146010	50 %	50 %	0 %	0 %	428303799
3009	NC_019753	TACA	2	8	146046	146053	50 %	25 %	0 %	25 %	428303799
3010	NC_019753	TTAA	2	8	146056	146063	50 %	50 %	0 %	0 %	428303799
3011	NC_019753	AAGTC	2	10	146295	146304	40 %	20 %	20 %	20 %	428303799
3012	NC_019753	TTG	2	6	146324	146329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303799
3013	NC_019753	GTG	2	6	146351	146356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303799
3014	NC_019753	TGA	2	6	146373	146378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303799
3015	NC_019753	TG	3	6	146379	146384	0 %	50 %	50 %	0 %	428303799
3016	NC_019753	A	6	6	146624	146629	100 %	0 %	0 %	0 %	428303799
3017	NC_019753	GTA	2	6	146644	146649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303799
3018	NC_019753	CTG	2	6	146660	146665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303799
3019	NC_019753	GAA	2	6	146666	146671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303799
3020	NC_019753	GTT	2	6	146704	146709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303799
3021	NC_019753	TA	3	6	146714	146719	50 %	50 %	0 %	0 %	428303799
3022	NC_019753	GAT	2	6	146722	146727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303799
3023	NC_019753	TCC	2	6	146741	146746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303799
3024	NC_019753	CAG	2	6	146751	146756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303799
3025	NC_019753	TTG	2	6	146816	146821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303799
3026	NC_019753	GGGT	2	8	146823	146830	0 %	25 %	75 %	0 %	428303799
3027	NC_019753	A	6	6	146878	146883	100 %	0 %	0 %	0 %	428303799
3028	NC_019753	CAA	2	6	146943	146948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303799
3029	NC_019753	ACT	2	6	146986	146991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303799
3030	NC_019753	A	7	7	147034	147040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_019753	TAG	2	6	147099	147104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303800
3032	NC_019753	TTC	3	9	147107	147115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303800
3033	NC_019753	TGG	2	6	147117	147122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303800
3034	NC_019753	TCA	2	6	147192	147197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303800
3035	NC_019753	AT	3	6	147318	147323	50 %	50 %	0 %	0 %	428303800
3036	NC_019753	TCG	2	6	147327	147332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303800
3037	NC_019753	GTG	2	6	147345	147350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303800
3038	NC_019753	TTAA	2	8	147369	147376	50 %	50 %	0 %	0 %	428303800
3039	NC_019753	AGT	2	6	147400	147405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_019753	CT	3	6	147407	147412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_019753	CTT	2	6	147445	147450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_019753	CT	3	6	147474	147479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_019753	CAC	2	6	147487	147492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_019753	TTGC	2	8	147504	147511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_019753	TGA	2	6	147672	147677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_019753	CT	3	6	147759	147764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_019753	TAC	2	6	147771	147776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_019753	TAA	2	6	147830	147835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_019753	CTG	2	6	147900	147905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_019753	TA	3	6	147989	147994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_019753	TGG	2	6	148047	148052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303801
3052	NC_019753	GAG	2	6	148193	148198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303801
3053	NC_019753	TGG	2	6	148200	148205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303801
3054	NC_019753	TTG	2	6	148230	148235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303801
3055	NC_019753	TGC	2	6	148270	148275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303801
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3059	NC_019753	ACC	2	6	148512	148517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303801
3060	NC_019753	TTTG	2	8	148522	148529	0 %	75 %	25 %	0 %	428303801
3061	NC_019753	TTTG	2	8	148576	148583	0 %	75 %	25 %	0 %	428303801
3062	NC_019753	CAA	2	6	148672	148677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303801
3063	NC_019753	TTAT	2	8	148695	148702	25 %	75 %	0 %	0 %	428303801
3064	NC_019753	GAAG	2	8	148805	148812	50 %	0 %	50 %	0 %	428303801
3065	NC_019753	GCC	2	6	148833	148838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303801
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3069	NC_019753	TGC	2	6	148945	148950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303801
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3071	NC_019753	CAA	2	6	149083	149088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303802
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3089	NC_019753	AGT	2	6	150285	150290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303802
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3091	NC_019753	CT	3	6	150314	150319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_019753	ATTG	2	8	150437	150444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_019753	T	7	7	150494	150500	0 %	100 %	0 %	0 %	428303803
3094	NC_019753	GAC	2	6	150501	150506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303803
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3099	NC_019753	ATGCT	2	10	150644	150653	20 %	40 %	20 %	20 %	428303803
3100	NC_019753	GCT	2	6	150658	150663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303803
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3107	NC_019753	A	6	6	150905	150910	100 %	0 %	0 %	0 %	428303803
3108	NC_019753	TGAT	2	8	151016	151023	25 %	50 %	25 %	0 %	428303804
3109	NC_019753	TA	3	6	151052	151057	50 %	50 %	0 %	0 %	428303804
3110	NC_019753	AAT	2	6	151123	151128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303804
3111	NC_019753	TC	4	8	151237	151244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_019753	GTT	2	6	151386	151391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303805
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3115	NC_019753	ACT	2	6	151531	151536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303805
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3117	NC_019753	TGGGA	2	10	151644	151653	20 %	20 %	60 %	0 %	428303805
3118	NC_019753	TTC	2	6	151728	151733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303805
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3121	NC_019753	A	7	7	151970	151976	100 %	0 %	0 %	0 %	428303805
3122	NC_019753	ACA	2	6	152055	152060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303805
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3125	NC_019753	TAA	2	6	152328	152333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303805
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3250	NC_019753	CTC	2	6	158200	158205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303810
3251	NC_019753	T	6	6	158237	158242	0 %	100 %	0 %	0 %	428303810
3252	NC_019753	T	6	6	158278	158283	0 %	100 %	0 %	0 %	428303810
3253	NC_019753	TGA	2	6	158340	158345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303810
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3280	NC_019753	ATT	2	6	159462	159467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3281	NC_019753	TA	3	6	159468	159473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3282	NC_019753	ATACT	2	10	159485	159494	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3283	NC_019753	ATTA	2	8	159578	159585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3284	NC_019753	CAG	2	6	159643	159648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3315	NC_019753	ACT	2	6	161257	161262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3316	NC_019753	ATAGT	2	10	161275	161284	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3317	NC_019753	TAA	3	9	161308	161316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303812
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3323	NC_019753	TGA	2	6	161434	161439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303812
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3332	NC_019753	TAC	2	6	162002	162007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303812
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3344	NC_019753	TGC	2	6	162388	162393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303812
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3348	NC_019753	AGTC	2	8	162599	162606	25 %	25 %	25 %	25 %	428303812
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3352	NC_019753	GCA	2	6	162836	162841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303812
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3355	NC_019753	GCT	2	6	162905	162910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303812
3356	NC_019753	CCAG	2	8	162929	162936	25 %	0 %	25 %	50 %	428303812
3357	NC_019753	AAC	2	6	162956	162961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303812
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3359	NC_019753	CTAT	2	8	163010	163017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3360	NC_019753	AAT	2	6	163133	163138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3361	NC_019753	CTT	2	6	163175	163180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303813
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3364	NC_019753	GTT	2	6	163479	163484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303813
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3370	NC_019753	CAGTC	2	10	163731	163740	20 %	20 %	20 %	40 %	428303813
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3495	NC_019753	GAT	2	6	170307	170312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303819
3496	NC_019753	GTG	2	6	170488	170493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303819
3497	NC_019753	CGC	2	6	170555	170560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303819
3498	NC_019753	CAG	2	6	170738	170743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303819
3499	NC_019753	TGAGG	2	10	170900	170909	20 %	20 %	60 %	0 %	428303820
3500	NC_019753	AAT	2	6	171000	171005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303820

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