MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019753	AGC	2	6	74148	74153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303739
1502	NC_019753	TCTT	2	8	74172	74179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_019753	GAT	2	6	74196	74201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_019753	TAG	2	6	74207	74212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_019753	TAT	2	6	74215	74220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_019753	T	6	6	74240	74245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_019753	GGTA	2	8	74261	74268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_019753	T	7	7	74299	74305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_019753	TGG	2	6	74385	74390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_019753	GGA	2	6	74420	74425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_019753	AGCA	2	8	74429	74436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_019753	CTG	2	6	74479	74484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_019753	ACC	2	6	74526	74531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_019753	GCA	2	6	74534	74539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_019753	ATC	2	6	74550	74555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_019753	CAG	2	6	74652	74657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303740
1517	NC_019753	TCC	2	6	74677	74682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303740
1518	NC_019753	TTG	2	6	74834	74839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303740
1519	NC_019753	CAA	2	6	74840	74845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303740
1520	NC_019753	AC	3	6	74848	74853	50 %	0 %	0 %	50 %	428303740
1521	NC_019753	TAA	2	6	74883	74888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303740
1522	NC_019753	TTG	2	6	74889	74894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303740
1523	NC_019753	ACC	2	6	74901	74906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303740
1524	NC_019753	TGT	2	6	75043	75048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303740
1525	NC_019753	TATCT	2	10	75268	75277	20 %	60 %	0 %	20 %	428303740
1526	NC_019753	AGTCAC	2	12	75346	75357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428303740
1527	NC_019753	TAC	2	6	75444	75449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303740
1528	NC_019753	CTT	2	6	75555	75560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303740
1529	NC_019753	ATA	2	6	75583	75588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303740
1530	NC_019753	CTA	2	6	75615	75620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303740
1531	NC_019753	AATC	2	8	75633	75640	50 %	25 %	0 %	25 %	428303740
1532	NC_019753	GAC	2	6	75708	75713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303740
1533	NC_019753	TTA	2	6	75752	75757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303740
1534	NC_019753	CAA	2	6	75805	75810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303741
1535	NC_019753	TTTTTA	2	12	75813	75824	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	428303741
1536	NC_019753	ATT	2	6	75864	75869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303741
1537	NC_019753	TCT	2	6	75891	75896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303741
1538	NC_019753	TCT	2	6	75909	75914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303741
1539	NC_019753	TAA	2	6	75922	75927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303741
1540	NC_019753	TAC	2	6	75929	75934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303741
1541	NC_019753	CA	3	6	75952	75957	50 %	0 %	0 %	50 %	428303741
1542	NC_019753	AAT	2	6	75987	75992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303741
1543	NC_019753	TC	3	6	76016	76021	0 %	50 %	0 %	50 %	428303741
1544	NC_019753	ATC	2	6	76094	76099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303741
1545	NC_019753	AAT	2	6	76100	76105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303741
1546	NC_019753	AAC	2	6	76134	76139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303741
1547	NC_019753	CTG	2	6	76222	76227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303741
1548	NC_019753	AAT	2	6	76236	76241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303741
1549	NC_019753	CCT	2	6	76310	76315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303741
1550	NC_019753	GCT	2	6	76347	76352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303741
1551	NC_019753	C	6	6	76445	76450	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1552	NC_019753	CA	3	6	76458	76463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_019753	CAT	2	6	76480	76485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_019753	AAT	2	6	76486	76491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_019753	CATAT	2	10	76535	76544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1556	NC_019753	TGT	2	6	76583	76588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_019753	T	6	6	76607	76612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_019753	GTT	2	6	76689	76694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_019753	T	7	7	76753	76759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_019753	CGT	2	6	76786	76791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_019753	ATCTAA	2	12	76841	76852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1562	NC_019753	TGC	2	6	76874	76879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_019753	AAG	2	6	76923	76928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_019753	TGC	2	6	76947	76952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_019753	CTTC	2	8	76971	76978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_019753	TAC	2	6	77120	77125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_019753	ACCCC	2	10	77151	77160	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1568	NC_019753	C	6	6	77157	77162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1569	NC_019753	AGGG	2	8	77181	77188	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_019753	TGA	2	6	77195	77200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_019753	GTT	2	6	77229	77234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_019753	TGT	2	6	77244	77249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_019753	CTT	2	6	77278	77283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_019753	TC	4	8	77297	77304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_019753	TGC	2	6	77336	77341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_019753	CAT	2	6	77410	77415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_019753	TAA	2	6	77468	77473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_019753	CA	3	6	77477	77482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_019753	TTTGC	2	10	77602	77611	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1580	NC_019753	ACC	2	6	77612	77617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_019753	T	6	6	77636	77641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_019753	AAT	2	6	77657	77662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_019753	TAA	2	6	77723	77728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_019753	TGT	2	6	77751	77756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_019753	AAT	2	6	77916	77921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_019753	CTG	2	6	77941	77946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_019753	TAGG	2	8	78014	78021	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_019753	TGA	2	6	78052	78057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_019753	AT	3	6	78365	78370	50 %	50 %	0 %	0 %	428303742
1590	NC_019753	TAA	2	6	78414	78419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303742
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1595	NC_019753	AT	3	6	78597	78602	50 %	50 %	0 %	0 %	428303742
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1599	NC_019753	GAT	2	6	78813	78818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303742
1600	NC_019753	AT	3	6	78829	78834	50 %	50 %	0 %	0 %	428303742
1601	NC_019753	TTC	2	6	78870	78875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303742
1602	NC_019753	GTT	2	6	78884	78889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303742
1603	NC_019753	AT	3	6	78907	78912	50 %	50 %	0 %	0 %	428303742
1604	NC_019753	GAT	2	6	79016	79021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_019753	TTC	2	6	79040	79045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_019753	CTT	2	6	79072	79077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_019753	A	6	6	79093	79098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_019753	TTAAC	2	10	79099	79108	40 %	40 %	0 %	20 %	428303743
1609	NC_019753	CTGC	2	8	79134	79141	0 %	25 %	25 %	50 %	428303743
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1611	NC_019753	CTT	2	6	79276	79281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303743
1612	NC_019753	ACT	2	6	79322	79327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303743
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1615	NC_019753	ATTA	2	8	79582	79589	50 %	50 %	0 %	0 %	428303743
1616	NC_019753	TGT	2	6	79591	79596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303743
1617	NC_019753	TGAG	2	8	79646	79653	25 %	25 %	50 %	0 %	428303743
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1628	NC_019753	TCTT	2	8	80066	80073	0 %	75 %	0 %	25 %	428303743
1629	NC_019753	CTT	2	6	80115	80120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303743
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