MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019753	AGG	2	6	25118	25123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303710
502	NC_019753	TGA	2	6	25256	25261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303710
503	NC_019753	GTG	2	6	25264	25269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303710
504	NC_019753	T	7	7	25407	25413	0 %	100 %	0 %	0 %	428303710
505	NC_019753	GTA	2	6	25420	25425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303710
506	NC_019753	TTC	2	6	25451	25456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303710
507	NC_019753	TTC	2	6	25484	25489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303710
508	NC_019753	TCT	2	6	25491	25496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303710
509	NC_019753	ATC	2	6	25497	25502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303710
510	NC_019753	A	7	7	25529	25535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019753	TAG	2	6	25566	25571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019753	TAT	2	6	25622	25627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019753	GAT	2	6	25644	25649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_019753	CT	3	6	25731	25736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_019753	AAT	2	6	25768	25773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019753	GTT	2	6	25821	25826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303711
517	NC_019753	CTG	2	6	25906	25911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303711
518	NC_019753	TGC	2	6	25925	25930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303711
519	NC_019753	TTG	2	6	25948	25953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303711
520	NC_019753	AGC	2	6	25960	25965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303711
521	NC_019753	CAT	2	6	26013	26018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303711
522	NC_019753	TCCT	2	8	26095	26102	0 %	50 %	0 %	50 %	428303711
523	NC_019753	T	6	6	26160	26165	0 %	100 %	0 %	0 %	428303711
524	NC_019753	T	6	6	26173	26178	0 %	100 %	0 %	0 %	428303711
525	NC_019753	CAA	2	6	26211	26216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303711
526	NC_019753	TC	3	6	26235	26240	0 %	50 %	0 %	50 %	428303711
527	NC_019753	GCT	2	6	26249	26254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303711
528	NC_019753	CTG	2	6	26259	26264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303711
529	NC_019753	TTTG	2	8	26282	26289	0 %	75 %	25 %	0 %	428303711
530	NC_019753	ATCTG	2	10	26357	26366	20 %	40 %	20 %	20 %	428303711
531	NC_019753	CATCC	2	10	26398	26407	20 %	20 %	0 %	60 %	428303711
532	NC_019753	TGA	2	6	26473	26478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303711
533	NC_019753	GCT	2	6	26534	26539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303711
534	NC_019753	AGA	2	6	26545	26550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303711
535	NC_019753	CTG	2	6	26620	26625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303711
536	NC_019753	AT	3	6	26693	26698	50 %	50 %	0 %	0 %	428303711
537	NC_019753	CAG	2	6	26701	26706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303711
538	NC_019753	GTA	2	6	26712	26717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303711
539	NC_019753	CCG	2	6	26782	26787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303711
540	NC_019753	GA	3	6	26800	26805	50 %	0 %	50 %	0 %	428303711
541	NC_019753	GCA	2	6	26828	26833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303711
542	NC_019753	TGT	2	6	26840	26845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303711
543	NC_019753	TGT	2	6	26867	26872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303711
544	NC_019753	TAA	2	6	26893	26898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303711
545	NC_019753	GCT	3	9	26900	26908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303711
546	NC_019753	GCA	3	9	26972	26980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303711
547	NC_019753	GTA	2	6	27018	27023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303711
548	NC_019753	CCTT	2	8	27032	27039	0 %	50 %	0 %	50 %	428303711
549	NC_019753	CAG	2	6	27042	27047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303711
550	NC_019753	T	7	7	27195	27201	0 %	100 %	0 %	0 %	428303711
551	NC_019753	CCT	2	6	27239	27244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303711
552	NC_019753	TGA	2	6	27354	27359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_019753	AGT	2	6	27494	27499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019753	ATT	2	6	27515	27520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019753	T	7	7	27519	27525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019753	TTAG	2	8	27567	27574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_019753	CTT	2	6	27688	27693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_019753	CAT	2	6	27730	27735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_019753	AT	4	8	27734	27741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_019753	TAAA	2	8	27836	27843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019753	ATA	2	6	27844	27849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_019753	T	6	6	27905	27910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_019753	AAT	2	6	27927	27932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_019753	TTAA	2	8	27956	27963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019753	TG	3	6	28040	28045	0 %	50 %	50 %	0 %	428303712
566	NC_019753	CTA	2	6	28113	28118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303712
567	NC_019753	TTG	2	6	28138	28143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303712
568	NC_019753	TTA	2	6	28184	28189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303712
569	NC_019753	CAA	2	6	28269	28274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303712
570	NC_019753	ATT	2	6	28279	28284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303712
571	NC_019753	CTG	2	6	28386	28391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303712
572	NC_019753	TTGGT	2	10	28409	28418	0 %	60 %	40 %	0 %	428303712
573	NC_019753	ACT	2	6	28555	28560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303712
574	NC_019753	TGCT	2	8	28606	28613	0 %	50 %	25 %	25 %	428303712
575	NC_019753	CTG	2	6	28614	28619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303712
576	NC_019753	GTA	2	6	28655	28660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303712
577	NC_019753	TTGA	2	8	28663	28670	25 %	50 %	25 %	0 %	428303712
578	NC_019753	GGC	2	6	28675	28680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303712
579	NC_019753	TTG	2	6	28702	28707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303712
580	NC_019753	AGT	2	6	28714	28719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303712
581	NC_019753	CAA	2	6	28743	28748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303712
582	NC_019753	ATG	2	6	28754	28759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303712
583	NC_019753	TTA	2	6	28760	28765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303712
584	NC_019753	GCG	2	6	28796	28801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303712
585	NC_019753	CAAT	2	8	28812	28819	50 %	25 %	0 %	25 %	428303712
586	NC_019753	AGT	2	6	28853	28858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303712
587	NC_019753	TTC	2	6	28927	28932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303712
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589	NC_019753	ACT	2	6	28958	28963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303712
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591	NC_019753	GAAA	2	8	29031	29038	75 %	0 %	25 %	0 %	428303712
592	NC_019753	ATGAT	2	10	29111	29120	40 %	40 %	20 %	0 %	428303712
593	NC_019753	T	6	6	29127	29132	0 %	100 %	0 %	0 %	428303712
594	NC_019753	TTCT	2	8	29151	29158	0 %	75 %	0 %	25 %	428303712
595	NC_019753	CGAA	2	8	29182	29189	50 %	0 %	25 %	25 %	428303712
596	NC_019753	CTTG	2	8	29310	29317	0 %	50 %	25 %	25 %	428303712
597	NC_019753	AAT	2	6	29319	29324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303712
598	NC_019753	GCT	2	6	29441	29446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303712
599	NC_019753	CTG	2	6	29452	29457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303712
600	NC_019753	AGT	2	6	29461	29466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303712
601	NC_019753	ATA	2	6	29626	29631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303712
602	NC_019753	ATT	2	6	29731	29736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303712
603	NC_019753	TA	3	6	29810	29815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_019753	A	8	8	29866	29873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_019753	ATT	2	6	29938	29943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_019753	A	6	6	29955	29960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_019753	CAA	2	6	29963	29968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_019753	ACT	2	6	30011	30016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303713
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610	NC_019753	CTA	2	6	30123	30128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303713
611	NC_019753	TGC	2	6	30149	30154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303713
612	NC_019753	AAGT	2	8	30159	30166	50 %	25 %	25 %	0 %	428303713
613	NC_019753	TGT	2	6	30173	30178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303713
614	NC_019753	CAA	2	6	30207	30212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303713
615	NC_019753	TAG	2	6	30261	30266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303713
616	NC_019753	CAA	2	6	30348	30353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303713
617	NC_019753	CAG	2	6	30396	30401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303713
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619	NC_019753	TG	3	6	30559	30564	0 %	50 %	50 %	0 %	428303713
620	NC_019753	TAC	2	6	30567	30572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303713
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