MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019753	ATC	2	6	268351	268356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303899
5502	NC_019753	TTGT	2	8	268362	268369	0 %	75 %	25 %	0 %	428303899
5503	NC_019753	GGC	2	6	268396	268401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303899
5504	NC_019753	GATT	2	8	268468	268475	25 %	50 %	25 %	0 %	428303899
5505	NC_019753	ATT	2	6	268483	268488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303899
5506	NC_019753	TGT	2	6	268493	268498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303899
5507	NC_019753	TTC	2	6	268522	268527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303899
5508	NC_019753	GGCTT	2	10	268570	268579	0 %	40 %	40 %	20 %	428303899
5509	NC_019753	TGAT	2	8	268623	268630	25 %	50 %	25 %	0 %	428303899
5510	NC_019753	TTAAT	2	10	268665	268674	40 %	60 %	0 %	0 %	428303899
5511	NC_019753	AGGCT	2	10	268680	268689	20 %	20 %	40 %	20 %	428303899
5512	NC_019753	AGG	2	6	268711	268716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303899
5513	NC_019753	ATA	2	6	268726	268731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303899
5514	NC_019753	AGC	2	6	268741	268746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303899
5515	NC_019753	CTA	2	6	268758	268763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303899
5516	NC_019753	ATA	2	6	268783	268788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303899
5517	NC_019753	A	6	6	268810	268815	100 %	0 %	0 %	0 %	428303899
5518	NC_019753	T	10	10	268971	268980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_019753	TTTA	2	8	268995	269002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_019753	T	7	7	269006	269012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_019753	CTG	2	6	269017	269022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_019753	AAT	2	6	269034	269039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_019753	AAC	2	6	269053	269058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_019753	TTTA	2	8	269080	269087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_019753	AAT	2	6	269103	269108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_019753	A	6	6	269115	269120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_019753	AG	3	6	269189	269194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_019753	AAG	2	6	269229	269234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_019753	CCAG	2	8	269244	269251	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_019753	T	6	6	269261	269266	0 %	100 %	0 %	0 %	428303900
5531	NC_019753	TTTCT	2	10	269294	269303	0 %	80 %	0 %	20 %	428303900
5532	NC_019753	AAG	2	6	269338	269343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303900
5533	NC_019753	TGA	3	9	269398	269406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303900
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5535	NC_019753	CT	3	6	269521	269526	0 %	50 %	0 %	50 %	428303901
5536	NC_019753	CTG	2	6	269538	269543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303901
5537	NC_019753	GCCA	2	8	269578	269585	25 %	0 %	25 %	50 %	428303901
5538	NC_019753	T	6	6	269685	269690	0 %	100 %	0 %	0 %	428303901
5539	NC_019753	CGA	2	6	269726	269731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303901
5540	NC_019753	ATA	2	6	269847	269852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303901
5541	NC_019753	GCC	2	6	269875	269880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303901
5542	NC_019753	GAC	2	6	269907	269912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303901
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5546	NC_019753	TGG	2	6	270025	270030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303901
5547	NC_019753	T	6	6	270114	270119	0 %	100 %	0 %	0 %	428303901
5548	NC_019753	TGC	2	6	270215	270220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303901
5549	NC_019753	TTCC	2	8	270231	270238	0 %	50 %	0 %	50 %	428303901
5550	NC_019753	TCAG	2	8	270239	270246	25 %	25 %	25 %	25 %	428303901
5551	NC_019753	CTT	2	6	270315	270320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303901
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5553	NC_019753	GCA	2	6	270434	270439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303901
5554	NC_019753	TCG	2	6	270494	270499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303901
5555	NC_019753	GTG	2	6	270526	270531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303901
5556	NC_019753	GAT	2	6	270543	270548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303901
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5558	NC_019753	TAAA	2	8	270689	270696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_019753	CCA	2	6	270701	270706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_019753	ACT	2	6	270713	270718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_019753	ATT	3	9	270783	270791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303902
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5563	NC_019753	GCA	2	6	270852	270857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303902
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5566	NC_019753	ATTG	2	8	271011	271018	25 %	50 %	25 %	0 %	428303902
5567	NC_019753	TGG	2	6	271092	271097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303902
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5570	NC_019753	CTG	2	6	271233	271238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303902
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5580	NC_019753	TGA	2	6	271588	271593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_019753	AAGCAA	2	12	272268	272279	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428303903
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5607	NC_019753	TGG	2	6	272550	272555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303903
5608	NC_019753	ATG	2	6	272583	272588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5610	NC_019753	TTG	2	6	272664	272669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303904
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5614	NC_019753	T	6	6	272803	272808	0 %	100 %	0 %	0 %	428303904
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5621	NC_019753	CT	3	6	273199	273204	0 %	50 %	0 %	50 %	428303905
5622	NC_019753	TAA	2	6	273249	273254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303905
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