MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019753	ATT	2	6	243088	243093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303878
5002	NC_019753	A	7	7	243143	243149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_019753	T	6	6	243166	243171	0 %	100 %	0 %	0 %	428303879
5004	NC_019753	T	7	7	243209	243215	0 %	100 %	0 %	0 %	428303879
5005	NC_019753	GCG	2	6	243447	243452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303879
5006	NC_019753	TGAGT	2	10	243487	243496	20 %	40 %	40 %	0 %	428303879
5007	NC_019753	TTG	2	6	243551	243556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303879
5008	NC_019753	GAC	2	6	243568	243573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303879
5009	NC_019753	AGA	2	6	243583	243588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303879
5010	NC_019753	T	6	6	243631	243636	0 %	100 %	0 %	0 %	428303879
5011	NC_019753	TTG	2	6	243656	243661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303879
5012	NC_019753	GAG	2	6	243693	243698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303879
5013	NC_019753	AT	3	6	243765	243770	50 %	50 %	0 %	0 %	428303879
5014	NC_019753	G	7	7	243793	243799	0 %	0 %	100 %	0 %	428303879
5015	NC_019753	AGA	2	6	243800	243805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303879
5016	NC_019753	ATG	2	6	243812	243817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303879
5017	NC_019753	ATTA	2	8	243824	243831	50 %	50 %	0 %	0 %	428303879
5018	NC_019753	TGTTTG	2	12	243833	243844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303879
5019	NC_019753	AATT	2	8	243908	243915	50 %	50 %	0 %	0 %	428303879
5020	NC_019753	CAC	2	6	244051	244056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303879
5021	NC_019753	CATC	2	8	244109	244116	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_019753	C	6	6	244116	244121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5023	NC_019753	ATT	2	6	244224	244229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_019753	CAG	2	6	244249	244254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303880
5025	NC_019753	CCA	2	6	244348	244353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303880
5026	NC_019753	TGA	2	6	244384	244389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303880
5027	NC_019753	GCTG	2	8	244393	244400	0 %	25 %	50 %	25 %	428303880
5028	NC_019753	GGA	2	6	244541	244546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303880
5029	NC_019753	TGG	2	6	244552	244557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303880
5030	NC_019753	GGT	2	6	244559	244564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303880
5031	NC_019753	GGA	2	6	244577	244582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303880
5032	NC_019753	TGT	2	6	244603	244608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303880
5033	NC_019753	AAGA	2	8	244652	244659	75 %	0 %	25 %	0 %	428303880
5034	NC_019753	CTTA	2	8	244827	244834	25 %	50 %	0 %	25 %	428303880
5035	NC_019753	AAC	2	6	244886	244891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303880
5036	NC_019753	GGT	2	6	244922	244927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303880
5037	NC_019753	AT	3	6	244936	244941	50 %	50 %	0 %	0 %	428303880
5038	NC_019753	AAT	2	6	245006	245011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303880
5039	NC_019753	GTG	2	6	245035	245040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303880
5040	NC_019753	AAT	2	6	245078	245083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303880
5041	NC_019753	CGG	2	6	245098	245103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303880
5042	NC_019753	AC	3	6	245105	245110	50 %	0 %	0 %	50 %	428303880
5043	NC_019753	TAC	2	6	245149	245154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303880
5044	NC_019753	TAA	2	6	245167	245172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303880
5045	NC_019753	TGG	2	6	245197	245202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303880
5046	NC_019753	ACAA	2	8	245269	245276	75 %	0 %	0 %	25 %	428303880
5047	NC_019753	AAACT	2	10	245277	245286	60 %	20 %	0 %	20 %	428303880
5048	NC_019753	TTG	2	6	245310	245315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303880
5049	NC_019753	TAG	2	6	245322	245327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303880
5050	NC_019753	TGC	2	6	245407	245412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303880
5051	NC_019753	GCT	2	6	245417	245422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303880
5052	NC_019753	GA	3	6	245431	245436	50 %	0 %	50 %	0 %	428303880
5053	NC_019753	GTA	2	6	245496	245501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303880
5054	NC_019753	AT	4	8	245525	245532	50 %	50 %	0 %	0 %	428303880
5055	NC_019753	CCG	2	6	245547	245552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303880
5056	NC_019753	TGA	2	6	245635	245640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303880
5057	NC_019753	GAA	2	6	245708	245713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303880
5058	NC_019753	GTT	3	9	245791	245799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303880
5059	NC_019753	TTC	2	6	245804	245809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303880
5060	NC_019753	TGA	2	6	245833	245838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303880
5061	NC_019753	TCC	2	6	245860	245865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303880
5062	NC_019753	ACC	2	6	245936	245941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303880
5063	NC_019753	ATG	2	6	245996	246001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303880
5064	NC_019753	CCAAC	2	10	246002	246011	40 %	0 %	0 %	60 %	428303880
5065	NC_019753	TGC	2	6	246070	246075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303880
5066	NC_019753	CGGAT	2	10	246081	246090	20 %	20 %	40 %	20 %	428303880
5067	NC_019753	TGG	2	6	246165	246170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303880
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5069	NC_019753	A	6	6	246208	246213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_019753	A	6	6	246237	246242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_019753	GA	4	8	246264	246271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_019753	CACTG	2	10	246290	246299	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5073	NC_019753	A	6	6	246304	246309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_019753	T	7	7	246312	246318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_019753	CTTAC	2	10	246438	246447	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5076	NC_019753	CAG	2	6	246573	246578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5080	NC_019753	T	6	6	246690	246695	0 %	100 %	0 %	0 %	428303881
5081	NC_019753	A	7	7	246710	246716	100 %	0 %	0 %	0 %	428303881
5082	NC_019753	GAA	2	6	246766	246771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303881
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5089	NC_019753	TGA	2	6	247149	247154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303881
5090	NC_019753	ATG	2	6	247187	247192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303881
5091	NC_019753	TAATT	2	10	247233	247242	40 %	60 %	0 %	0 %	428303881
5092	NC_019753	CTG	2	6	247313	247318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303881
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5094	NC_019753	CAT	3	9	247409	247417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5096	NC_019753	AGT	2	6	247471	247476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_019753	TAAT	2	8	247503	247510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_019753	A	7	7	247529	247535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_019753	TTA	2	6	247560	247565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_019753	ATT	2	6	247598	247603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_019753	TCA	2	6	247629	247634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303882
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5107	NC_019753	TGC	2	6	247829	247834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303882
5108	NC_019753	GAA	2	6	247844	247849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303882
5109	NC_019753	TGC	2	6	247975	247980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303882
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5111	NC_019753	AGC	2	6	248023	248028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303882
5112	NC_019753	GAA	2	6	248063	248068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303882
5113	NC_019753	CAG	2	6	248180	248185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303882
5114	NC_019753	A	6	6	248210	248215	100 %	0 %	0 %	0 %	428303882
5115	NC_019753	AGA	2	6	248299	248304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303882
5116	NC_019753	GAA	2	6	248339	248344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303882
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5119	NC_019753	CAG	2	6	248420	248425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303882
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5122	NC_019753	AGA	2	6	248560	248565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303882
5123	NC_019753	T	6	6	248692	248697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_019753	AT	3	6	248733	248738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_019753	A	7	7	268235	268241	100 %	0 %	0 %	0 %	428303899
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