MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 109068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019753	CTT	2	6	219986	219991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303861
4502	NC_019753	CAA	2	6	220008	220013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303861
4503	NC_019753	CTG	2	6	220039	220044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303861
4504	NC_019753	CCA	2	6	220062	220067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303861
4505	NC_019753	AAG	2	6	220082	220087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861
4506	NC_019753	TCG	2	6	220116	220121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303861
4507	NC_019753	TCT	2	6	220169	220174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303861
4508	NC_019753	TC	3	6	220213	220218	0 %	50 %	0 %	50 %	428303861
4509	NC_019753	CTT	2	6	220227	220232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303861
4510	NC_019753	AGA	2	6	220239	220244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861
4511	NC_019753	CGT	3	9	220363	220371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303861
4512	NC_019753	TGC	2	6	220433	220438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303861
4513	NC_019753	AGA	2	6	220446	220451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861
4514	NC_019753	GGC	2	6	220549	220554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303861
4515	NC_019753	GAA	2	6	220624	220629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861
4516	NC_019753	ATC	2	6	220675	220680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303861
4517	NC_019753	GA	3	6	220698	220703	50 %	0 %	50 %	0 %	428303861
4518	NC_019753	CAT	2	6	220725	220730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303861
4519	NC_019753	GTT	2	6	220740	220745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303861
4520	NC_019753	AAG	2	6	220811	220816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303861
4521	NC_019753	GCTG	2	8	220881	220888	0 %	25 %	50 %	25 %	428303861
4522	NC_019753	CT	3	6	220897	220902	0 %	50 %	0 %	50 %	428303861
4523	NC_019753	GCA	2	6	220924	220929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303861
4524	NC_019753	GTT	2	6	220930	220935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303861
4525	NC_019753	TAC	2	6	220988	220993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303861
4526	NC_019753	A	7	7	221037	221043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_019753	AG	3	6	221046	221051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_019753	TC	3	6	221057	221062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_019753	T	8	8	221066	221073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_019753	CTT	3	9	221086	221094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_019753	AGT	2	6	221103	221108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_019753	TA	3	6	221109	221114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_019753	ACAA	2	8	221172	221179	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_019753	CA	3	6	221255	221260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_019753	T	6	6	221309	221314	0 %	100 %	0 %	0 %	428303862
4536	NC_019753	CCTT	2	8	221358	221365	0 %	50 %	0 %	50 %	428303862
4537	NC_019753	TTC	2	6	221390	221395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303862
4538	NC_019753	TTG	2	6	221402	221407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303862
4539	NC_019753	GCCA	2	8	221454	221461	25 %	0 %	25 %	50 %	428303862
4540	NC_019753	TCA	2	6	221472	221477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303862
4541	NC_019753	TAGT	2	8	221511	221518	25 %	50 %	25 %	0 %	428303862
4542	NC_019753	ATTC	2	8	221522	221529	25 %	50 %	0 %	25 %	428303862
4543	NC_019753	TCC	2	6	221531	221536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303863
4544	NC_019753	CCT	2	6	221538	221543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303863
4545	NC_019753	A	6	6	221551	221556	100 %	0 %	0 %	0 %	428303863
4546	NC_019753	CTG	2	6	221557	221562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303863
4547	NC_019753	CCAT	2	8	221668	221675	25 %	25 %	0 %	50 %	428303863
4548	NC_019753	AG	3	6	221685	221690	50 %	0 %	50 %	0 %	428303863
4549	NC_019753	TCA	2	6	221699	221704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303863
4550	NC_019753	TTA	2	6	221782	221787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_019753	A	6	6	221813	221818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_019753	TAT	2	6	221829	221834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_019753	TA	3	6	221838	221843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_019753	TA	3	6	221859	221864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_019753	AT	3	6	221888	221893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_019753	CAA	2	6	221971	221976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303864
4557	NC_019753	TTG	2	6	222047	222052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303864
4558	NC_019753	AAT	2	6	222064	222069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303864
4559	NC_019753	TGA	2	6	222078	222083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303864
4560	NC_019753	GGT	2	6	222199	222204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303864
4561	NC_019753	AGA	2	6	222300	222305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303864
4562	NC_019753	AGA	2	6	222378	222383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303864
4563	NC_019753	TGC	2	6	222393	222398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303864
4564	NC_019753	GTAA	2	8	222412	222419	50 %	25 %	25 %	0 %	428303864
4565	NC_019753	CGGT	2	8	222509	222516	0 %	25 %	50 %	25 %	428303864
4566	NC_019753	CAG	2	6	222562	222567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303864
4567	NC_019753	AAGA	2	8	222817	222824	75 %	0 %	25 %	0 %	428303865
4568	NC_019753	TTA	2	6	222832	222837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303865
4569	NC_019753	TAAG	2	8	222889	222896	50 %	25 %	25 %	0 %	428303865
4570	NC_019753	GCTG	2	8	222901	222908	0 %	25 %	50 %	25 %	428303865
4571	NC_019753	GAG	2	6	222970	222975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303865
4572	NC_019753	GTA	2	6	223066	223071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303865
4573	NC_019753	TGC	3	9	223094	223102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303865
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4577	NC_019753	AAT	2	6	223291	223296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303865
4578	NC_019753	TTG	2	6	223297	223302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_019753	CTT	2	6	223327	223332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303866
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4581	NC_019753	TTTC	2	8	223501	223508	0 %	75 %	0 %	25 %	428303866
4582	NC_019753	ATT	2	6	223632	223637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303866
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4588	NC_019753	ACT	2	6	223758	223763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303866
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4590	NC_019753	TGGA	2	8	223837	223844	25 %	25 %	50 %	0 %	428303866
4591	NC_019753	T	6	6	223879	223884	0 %	100 %	0 %	0 %	428303866
4592	NC_019753	A	6	6	223994	223999	100 %	0 %	0 %	0 %	428303866
4593	NC_019753	TTG	2	6	224047	224052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303866
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4595	NC_019753	A	6	6	224108	224113	100 %	0 %	0 %	0 %	428303866
4596	NC_019753	CGCCA	2	10	224123	224132	20 %	0 %	20 %	60 %	428303866
4597	NC_019753	TAC	2	6	224141	224146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303866
4598	NC_019753	AGCA	2	8	224172	224179	50 %	0 %	25 %	25 %	428303866
4599	NC_019753	AGC	2	6	224298	224303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303866
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4601	NC_019753	AT	3	6	224342	224347	50 %	50 %	0 %	0 %	428303866
4602	NC_019753	T	6	6	224377	224382	0 %	100 %	0 %	0 %	428303866
4603	NC_019753	CTGA	2	8	224395	224402	25 %	25 %	25 %	25 %	428303866
4604	NC_019753	CCA	2	6	224414	224419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303866
4605	NC_019753	A	6	6	224465	224470	100 %	0 %	0 %	0 %	428303866
4606	NC_019753	ATT	2	6	224499	224504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303866
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4608	NC_019753	AGC	2	6	224558	224563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303866
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4610	NC_019753	GT	3	6	224608	224613	0 %	50 %	50 %	0 %	428303866
4611	NC_019753	CTT	2	6	224623	224628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303866
4612	NC_019753	GCA	2	6	224667	224672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303866
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4614	NC_019753	G	7	7	224797	224803	0 %	0 %	100 %	0 %	428303866
4615	NC_019753	GAT	3	9	224848	224856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303866
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4620	NC_019753	CAG	2	6	225130	225135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303866
4621	NC_019753	ATT	2	6	225157	225162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_019753	TAAA	2	8	225197	225204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_019753	TTA	2	6	225248	225253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4625	NC_019753	TTAAA	2	10	225290	225299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4994	NC_019753	TCA	2	6	242827	242832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303878
4995	NC_019753	AAC	2	6	242842	242847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303878
4996	NC_019753	GGT	2	6	242987	242992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303878
4997	NC_019753	TCT	2	6	242995	243000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303878
4998	NC_019753	AGC	2	6	243019	243024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303878
4999	NC_019753	AGC	2	6	243040	243045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303878
5000	NC_019753	AGA	2	6	243073	243078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303878

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