MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.03

Total Repeats: 724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019752	ACA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303527
2	NC_019752	ACA	2	6	261	266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303527
3	NC_019752	CTG	2	6	276	281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303527
4	NC_019752	AAT	2	6	398	403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
5	NC_019752	ACT	2	6	404	409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303527
6	NC_019752	GAA	2	6	494	499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303527
7	NC_019752	ATT	2	6	500	505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303527
8	NC_019752	TAA	2	6	580	585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
9	NC_019752	AAT	2	6	661	666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
10	NC_019752	ATT	2	6	689	694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303527
11	NC_019752	ATT	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303527
12	NC_019752	CAA	2	6	802	807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303527
13	NC_019752	TTA	2	6	875	880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303527
14	NC_019752	TAA	2	6	994	999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
15	NC_019752	CAA	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303527
16	NC_019752	ATA	2	6	1113	1118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
17	NC_019752	ATT	2	6	1131	1136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303527
18	NC_019752	TTG	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303527
19	NC_019752	AAT	2	6	1214	1219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303527
20	NC_019752	TGG	3	9	1514	1522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019752	CAT	2	6	1524	1529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019752	TAA	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019752	TCA	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019752	CAT	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303528
25	NC_019752	GCC	2	6	1840	1845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303528
26	NC_019752	AGC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303528
27	NC_019752	CTG	2	6	1947	1952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303528
28	NC_019752	CGA	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303528
29	NC_019752	CTC	2	6	2188	2193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303529
30	NC_019752	CAA	2	6	2195	2200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303529
31	NC_019752	CTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303529
32	NC_019752	TCA	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303529
33	NC_019752	TCA	2	6	2443	2448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019752	CTG	2	6	2450	2455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019752	CCT	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_019752	ATC	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303530
37	NC_019752	GGC	2	6	2607	2612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303530
38	NC_019752	GCC	2	6	2657	2662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303530
39	NC_019752	CGA	2	6	2668	2673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303530
40	NC_019752	CCA	2	6	2730	2735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303530
41	NC_019752	AAC	2	6	2831	2836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303530
42	NC_019752	ATG	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303530
43	NC_019752	TCT	2	6	3057	3062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303530
44	NC_019752	GCC	2	6	3185	3190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428303530
45	NC_019752	CCT	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428303530
46	NC_019752	CCA	2	6	3297	3302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303530
47	NC_019752	CAT	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303530
48	NC_019752	CAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303530
49	NC_019752	CAT	3	9	3462	3470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303530
50	NC_019752	TGC	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303531
51	NC_019752	ATG	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303531
52	NC_019752	TTC	2	6	3915	3920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303531
53	NC_019752	CGA	2	6	3927	3932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303531
54	NC_019752	GAA	2	6	3997	4002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303531
55	NC_019752	AGT	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019752	AAT	2	6	4040	4045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019752	AGA	2	6	4122	4127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
58	NC_019752	GAA	2	6	4159	4164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
59	NC_019752	AAG	2	6	4254	4259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
60	NC_019752	GTA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
61	NC_019752	ATG	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
62	NC_019752	ACA	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303532
63	NC_019752	GGA	2	6	4411	4416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303532
64	NC_019752	GGC	2	6	4509	4514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428303532
65	NC_019752	ACA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303532
66	NC_019752	AAT	2	6	4542	4547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303532
67	NC_019752	AGA	2	6	4587	4592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
68	NC_019752	TGA	2	6	4620	4625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
69	NC_019752	AAC	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303532
70	NC_019752	GGA	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303532
71	NC_019752	GTT	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303532
72	NC_019752	AGA	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
73	NC_019752	CAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303532
74	NC_019752	AGA	4	12	4887	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303532
75	NC_019752	TGA	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
76	NC_019752	TAG	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
77	NC_019752	TAA	2	6	5049	5054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303532
78	NC_019752	ATT	2	6	5122	5127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303532
79	NC_019752	TGC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303532
80	NC_019752	TGC	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303532
81	NC_019752	TAA	2	6	5334	5339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303532
82	NC_019752	GAT	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303532
83	NC_019752	GTC	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303532
84	NC_019752	GTG	2	6	5510	5515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303532
85	NC_019752	CTA	2	6	5627	5632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303532
86	NC_019752	TAA	2	6	5781	5786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303533
87	NC_019752	ACA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303533
88	NC_019752	TAT	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303533
89	NC_019752	AGA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303533
90	NC_019752	CAC	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303533
91	NC_019752	ATC	2	6	6011	6016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303533
92	NC_019752	TAA	2	6	6038	6043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019752	ATA	2	6	6107	6112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019752	GTT	2	6	6161	6166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303534
95	NC_019752	GAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303534
96	NC_019752	GTG	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303534
97	NC_019752	GTT	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303534
98	NC_019752	TGA	2	6	6474	6479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303535
99	NC_019752	ACT	2	6	6486	6491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303535
100	NC_019752	CAA	2	6	6622	6627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303535
101	NC_019752	GTC	2	6	6674	6679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303535
102	NC_019752	TCA	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303536
103	NC_019752	TTC	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303536
104	NC_019752	ATC	2	6	6848	6853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303536
105	NC_019752	ATC	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019752	AAT	2	6	6908	6913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019752	CAG	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303537
108	NC_019752	ATT	2	6	6982	6987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303537
109	NC_019752	AGA	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303537
110	NC_019752	GAT	2	6	7081	7086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303537
111	NC_019752	GCA	2	6	7114	7119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303537
112	NC_019752	GAT	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303537
113	NC_019752	AAG	2	6	7235	7240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303537
114	NC_019752	TGT	2	6	7286	7291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303537
115	NC_019752	ATT	2	6	7393	7398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303538
116	NC_019752	CAG	2	6	7400	7405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303538
117	NC_019752	TCA	2	6	7408	7413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303538
118	NC_019752	TGT	2	6	7417	7422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303538
119	NC_019752	TTG	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303538
120	NC_019752	TGA	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303538
121	NC_019752	TTA	2	6	7792	7797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303539
122	NC_019752	GTG	2	6	7852	7857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303539
123	NC_019752	ACT	2	6	7879	7884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303539
124	NC_019752	AAG	2	6	7894	7899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303539
125	NC_019752	ATG	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303539
126	NC_019752	CAA	2	6	7945	7950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303540
127	NC_019752	TAA	2	6	8010	8015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303540
128	NC_019752	TGA	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303540
129	NC_019752	ATA	2	6	8126	8131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303540
130	NC_019752	GAG	2	6	8368	8373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303540
131	NC_019752	GAA	2	6	8397	8402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303540
132	NC_019752	AAT	2	6	8491	8496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019752	GTC	2	6	8619	8624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019752	TCC	2	6	8740	8745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_019752	GTT	2	6	8747	8752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019752	CTT	2	6	8756	8761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019752	AAT	2	6	8803	8808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019752	CTG	2	6	8910	8915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019752	TAC	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019752	TTC	2	6	9007	9012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019752	GTC	2	6	9046	9051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019752	TCC	2	6	9166	9171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_019752	CTT	2	6	9182	9187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019752	TAA	2	6	9196	9201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019752	ATA	2	6	9225	9230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019752	TAA	3	9	9484	9492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019752	ATA	2	6	9717	9722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019752	TAA	2	6	9863	9868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303541
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159	NC_019752	TGA	2	6	10155	10160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303541
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187	NC_019752	AAT	2	6	12794	12799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_019752	AAT	2	6	19142	19147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_019752	CAA	2	6	19332	19337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_019752	AGC	2	6	19624	19629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303550
256	NC_019752	TTA	2	6	19696	19701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303550
257	NC_019752	ACA	2	6	19728	19733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303550
258	NC_019752	TTA	2	6	19759	19764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303550
259	NC_019752	TTA	2	6	19783	19788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303550
260	NC_019752	TTA	2	6	19816	19821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303550
261	NC_019752	AAG	2	6	19879	19884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_019752	CAA	3	9	20037	20045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_019752	TTA	2	6	20076	20081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_019752	GTA	2	6	20090	20095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_019752	CAT	2	6	20298	20303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303551
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384	NC_019752	GGA	2	6	28907	28912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303554
385	NC_019752	TGG	2	6	28929	28934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
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392	NC_019752	AAG	3	9	29344	29352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
393	NC_019752	AGA	2	6	29363	29368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
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