MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.03

Total Repeats: 1070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019752	ATTT	2	8	24596	24603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019752	CAT	2	6	24633	24638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_019752	ATT	2	6	24797	24802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019752	GAT	2	6	24845	24850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019752	T	6	6	24880	24885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019752	TAT	2	6	24893	24898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019752	ATT	2	6	24997	25002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_019752	CATT	2	8	25005	25012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_019752	ATT	2	6	25082	25087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019752	TC	3	6	25110	25115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_019752	GAA	2	6	25394	25399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303552
512	NC_019752	CA	3	6	25559	25564	50 %	0 %	0 %	50 %	428303552
513	NC_019752	TTA	2	6	25577	25582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303552
514	NC_019752	AAGC	2	8	25654	25661	50 %	0 %	25 %	25 %	428303552
515	NC_019752	GAA	3	9	25774	25782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303552
516	NC_019752	TGA	2	6	25831	25836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303552
517	NC_019752	TAA	2	6	25855	25860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303552
518	NC_019752	TGTT	2	8	25889	25896	0 %	75 %	25 %	0 %	428303552
519	NC_019752	TAC	2	6	25918	25923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303552
520	NC_019752	AGT	2	6	25979	25984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303552
521	NC_019752	CTG	2	6	26015	26020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303552
522	NC_019752	ATG	2	6	26021	26026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303552
523	NC_019752	TGG	2	6	26028	26033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303552
524	NC_019752	ACC	2	6	26141	26146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428303552
525	NC_019752	GCA	2	6	26192	26197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303552
526	NC_019752	AGT	2	6	26212	26217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303552
527	NC_019752	TTAT	2	8	26284	26291	25 %	75 %	0 %	0 %	428303552
528	NC_019752	AGC	2	6	26299	26304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303552
529	NC_019752	TAT	2	6	26354	26359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303552
530	NC_019752	TGG	2	6	26361	26366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303552
531	NC_019752	TAT	2	6	26411	26416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303552
532	NC_019752	ATT	2	6	26597	26602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019752	TTG	2	6	26657	26662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303553
534	NC_019752	AAT	2	6	26677	26682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303553
535	NC_019752	TAG	2	6	26700	26705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303553
536	NC_019752	AGT	2	6	26726	26731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303553
537	NC_019752	TATGT	2	10	26806	26815	20 %	60 %	20 %	0 %	428303553
538	NC_019752	AGC	2	6	26832	26837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303553
539	NC_019752	A	6	6	26845	26850	100 %	0 %	0 %	0 %	428303553
540	NC_019752	AAT	3	9	26864	26872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303553
541	NC_019752	AAT	2	6	26906	26911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303553
542	NC_019752	GAA	2	6	26957	26962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303553
543	NC_019752	AATT	2	8	26997	27004	50 %	50 %	0 %	0 %	428303553
544	NC_019752	TAA	2	6	27158	27163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019752	T	6	6	27194	27199	0 %	100 %	0 %	0 %	428303554
546	NC_019752	A	6	6	27231	27236	100 %	0 %	0 %	0 %	428303554
547	NC_019752	AAG	2	6	27240	27245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
548	NC_019752	GA	3	6	27254	27259	50 %	0 %	50 %	0 %	428303554
549	NC_019752	TGA	2	6	27287	27292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
550	NC_019752	TGG	2	6	27317	27322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
551	NC_019752	TCA	2	6	27369	27374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303554
552	NC_019752	ATC	2	6	27463	27468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303554
553	NC_019752	TTG	2	6	27505	27510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303554
554	NC_019752	ATT	2	6	27533	27538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303554
555	NC_019752	CAG	2	6	27610	27615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
556	NC_019752	GGT	2	6	27726	27731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
557	NC_019752	AAC	2	6	27732	27737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303554
558	NC_019752	A	6	6	27842	27847	100 %	0 %	0 %	0 %	428303554
559	NC_019752	TGT	2	6	27862	27867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303554
560	NC_019752	T	6	6	27925	27930	0 %	100 %	0 %	0 %	428303554
561	NC_019752	GCT	2	6	28047	28052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303554
562	NC_019752	CAA	2	6	28101	28106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303554
563	NC_019752	GCT	3	9	28119	28127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303554
564	NC_019752	ATT	2	6	28143	28148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303554
565	NC_019752	TACC	2	8	28159	28166	25 %	25 %	0 %	50 %	428303554
566	NC_019752	TTG	2	6	28171	28176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303554
567	NC_019752	GAT	2	6	28191	28196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
568	NC_019752	TGG	2	6	28235	28240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
569	NC_019752	CAG	2	6	28243	28248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
570	NC_019752	GTT	2	6	28352	28357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303554
571	NC_019752	ATA	2	6	28507	28512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303554
572	NC_019752	CAG	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
573	NC_019752	TGA	2	6	28582	28587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
574	NC_019752	AAG	2	6	28729	28734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
575	NC_019752	CTT	2	6	28780	28785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428303554
576	NC_019752	GAG	2	6	28800	28805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303554
577	NC_019752	GAA	2	6	28883	28888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
578	NC_019752	TAT	2	6	28896	28901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303554
579	NC_019752	GGA	2	6	28907	28912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428303554
580	NC_019752	TGG	2	6	28929	28934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
581	NC_019752	CA	3	6	28941	28946	50 %	0 %	0 %	50 %	428303554
582	NC_019752	CTG	2	6	28999	29004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303554
583	NC_019752	ATTT	2	8	29036	29043	25 %	75 %	0 %	0 %	428303554
584	NC_019752	AAG	4	12	29179	29190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
585	NC_019752	AAG	2	6	29248	29253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
586	NC_019752	AGC	2	6	29287	29292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
587	NC_019752	GAA	2	6	29298	29303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
588	NC_019752	GAA	2	6	29322	29327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
589	NC_019752	AAG	3	9	29344	29352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
590	NC_019752	AGA	2	6	29363	29368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
591	NC_019752	GCA	2	6	29411	29416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
592	NC_019752	GA	3	6	29500	29505	50 %	0 %	50 %	0 %	428303554
593	NC_019752	GAT	2	6	29526	29531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
594	NC_019752	TAC	2	6	29532	29537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428303554
595	NC_019752	CTG	2	6	29586	29591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303554
596	NC_019752	TGATT	2	10	29681	29690	20 %	60 %	20 %	0 %	428303554
597	NC_019752	ACG	2	6	29733	29738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
598	NC_019752	TCAG	2	8	29777	29784	25 %	25 %	25 %	25 %	428303554
599	NC_019752	CAG	2	6	29797	29802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
600	NC_019752	TGG	3	9	29813	29821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
601	NC_019752	TGGTAA	2	12	29828	29839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
602	NC_019752	GTA	2	6	29845	29850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428303554
603	NC_019752	GTG	2	6	29851	29856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
604	NC_019752	TGG	2	6	29861	29866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
605	NC_019752	GTG	2	6	29872	29877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
606	NC_019752	CAG	2	6	29970	29975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
607	NC_019752	GA	3	6	29983	29988	50 %	0 %	50 %	0 %	428303554
608	NC_019752	AATG	2	8	30029	30036	50 %	25 %	25 %	0 %	428303554
609	NC_019752	ATAG	2	8	30132	30139	50 %	25 %	25 %	0 %	428303554
610	NC_019752	ATCA	2	8	30156	30163	50 %	25 %	0 %	25 %	428303554
611	NC_019752	CAG	2	6	30388	30393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
612	NC_019752	CAA	2	6	30396	30401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303554
613	NC_019752	AAT	2	6	30438	30443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303554
614	NC_019752	GTT	2	6	30576	30581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303554
615	NC_019752	AAT	2	6	30594	30599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428303554
616	NC_019752	GTT	2	6	30699	30704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428303554
617	NC_019752	ACA	2	6	30739	30744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428303554
618	NC_019752	AGC	2	6	30760	30765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428303554
619	NC_019752	GA	3	6	30792	30797	50 %	0 %	50 %	0 %	428303554
620	NC_019752	AGA	2	6	30866	30871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
621	NC_019752	CGT	2	6	30900	30905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303554
622	NC_019752	CTG	2	6	30916	30921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428303554
623	NC_019752	AAG	2	6	30922	30927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
624	NC_019752	GAA	2	6	30945	30950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
625	NC_019752	TTA	2	6	30952	30957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428303554
626	NC_019752	AGA	2	6	30977	30982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
627	NC_019752	GAA	2	6	31007	31012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428303554
628	NC_019752	TGG	2	6	31088	31093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428303554
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881	NC_019752	ACGA	2	8	44779	44786	50 %	0 %	25 %	25 %	428303563
882	NC_019752	AATC	2	8	44815	44822	50 %	25 %	0 %	25 %	428303563
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