MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 4568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019751	TGATT	2	10	595	604	20 %	60 %	20 %	0 %	428296780
2	NC_019751	AAATT	2	10	2752	2761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019751	ATTAA	2	10	2815	2824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019751	GCTTG	2	10	2993	3002	0 %	40 %	40 %	20 %	428296782
5	NC_019751	CTATG	2	10	4478	4487	20 %	40 %	20 %	20 %	428296785
6	NC_019751	GCGGT	2	10	8710	8719	0 %	20 %	60 %	20 %	428296788
7	NC_019751	AAAGT	2	10	9265	9274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019751	TTTGG	2	10	9334	9343	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019751	AAAAC	2	10	11023	11032	80 %	0 %	0 %	20 %	428296790
10	NC_019751	GTGAT	2	10	14685	14694	20 %	40 %	40 %	0 %	428296792
11	NC_019751	TGGTA	2	10	21740	21749	20 %	40 %	40 %	0 %	428296798
12	NC_019751	CAATA	2	10	21770	21779	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019751	TTGGA	2	10	22113	22122	20 %	40 %	40 %	0 %	428296799
14	NC_019751	TATTT	2	10	25079	25088	20 %	80 %	0 %	0 %	428296802
15	NC_019751	TAAAT	2	10	26529	26538	60 %	40 %	0 %	0 %	428296802
16	NC_019751	TGGGA	2	10	29259	29268	20 %	20 %	60 %	0 %	428296804
17	NC_019751	TTTGG	2	10	30373	30382	0 %	60 %	40 %	0 %	428296805
18	NC_019751	TGGGA	2	10	30626	30635	20 %	20 %	60 %	0 %	428296805
19	NC_019751	ATTTT	2	10	34226	34235	20 %	80 %	0 %	0 %	428296810
20	NC_019751	TTTTA	2	10	34249	34258	20 %	80 %	0 %	0 %	428296810
21	NC_019751	ATCGC	2	10	34377	34386	20 %	20 %	20 %	40 %	428296810
22	NC_019751	ATTAG	2	10	34790	34799	40 %	40 %	20 %	0 %	428296810
23	NC_019751	TTTGC	2	10	38569	38578	0 %	60 %	20 %	20 %	428296814
24	NC_019751	TGCTT	2	10	38655	38664	0 %	60 %	20 %	20 %	428296814
25	NC_019751	CAATC	2	10	40157	40166	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019751	GCGGT	2	10	40768	40777	0 %	20 %	60 %	20 %	428296816
27	NC_019751	CCACA	2	10	46620	46629	40 %	0 %	0 %	60 %	428296819
28	NC_019751	AAATT	2	10	46808	46817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019751	AAAAC	2	10	48359	48368	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019751	AGCAA	2	10	51468	51477	60 %	0 %	20 %	20 %	428296824
31	NC_019751	GAATT	2	10	51742	51751	40 %	40 %	20 %	0 %	428296825
32	NC_019751	AGCCG	2	10	52556	52565	20 %	0 %	40 %	40 %	428296825
33	NC_019751	CAGAA	2	10	53078	53087	60 %	0 %	20 %	20 %	428296825
34	NC_019751	AAATG	2	10	53307	53316	60 %	20 %	20 %	0 %	428296825
35	NC_019751	GGTAA	2	10	54688	54697	40 %	20 %	40 %	0 %	428296825
36	NC_019751	GTCCA	2	10	56959	56968	20 %	20 %	20 %	40 %	428296826
37	NC_019751	GACGC	2	10	58153	58162	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_019751	ATTTG	2	10	58516	58525	20 %	60 %	20 %	0 %	428296827
39	NC_019751	CAACC	2	10	59117	59126	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_019751	GTTTA	2	10	61265	61274	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019751	TTATT	2	10	65127	65136	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019751	ACCGT	2	10	67658	67667	20 %	20 %	20 %	40 %	428296837
43	NC_019751	AGTGG	2	10	69580	69589	20 %	20 %	60 %	0 %	428296838
44	NC_019751	TTGTT	2	10	69790	69799	0 %	80 %	20 %	0 %	428296838
45	NC_019751	TTTTG	2	10	73432	73441	0 %	80 %	20 %	0 %	428296839
46	NC_019751	AGTTG	2	10	74626	74635	20 %	40 %	40 %	0 %	428296840
47	NC_019751	GAACC	2	10	75349	75358	40 %	0 %	20 %	40 %	428296840
48	NC_019751	AGAAT	2	10	76183	76192	60 %	20 %	20 %	0 %	428296840
49	NC_019751	TCAAT	2	10	78193	78202	40 %	40 %	0 %	20 %	428296841
50	NC_019751	GATTG	2	10	79173	79182	20 %	40 %	40 %	0 %	428296842
51	NC_019751	AAAAC	2	10	80380	80389	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019751	TGTTT	2	10	81197	81206	0 %	80 %	20 %	0 %	428296844
53	NC_019751	ATGTC	2	10	81686	81695	20 %	40 %	20 %	20 %	428296844
54	NC_019751	CCAAA	2	10	82617	82626	60 %	0 %	0 %	40 %	428296845
55	NC_019751	TATAT	2	10	83998	84007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019751	TAGTT	2	10	85789	85798	20 %	60 %	20 %	0 %	428296849
57	NC_019751	TATCC	2	10	86856	86865	20 %	40 %	0 %	40 %	428296850
58	NC_019751	GGAAT	2	10	90126	90135	40 %	20 %	40 %	0 %	428296853
59	NC_019751	AAAAT	2	10	90925	90934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019751	ATCAA	2	10	93766	93775	60 %	20 %	0 %	20 %	428296855
61	NC_019751	ACCAA	2	10	97061	97070	60 %	0 %	0 %	40 %	428296858
62	NC_019751	GTACA	2	10	102999	103008	40 %	20 %	20 %	20 %	428296862
63	NC_019751	CACAA	2	10	105137	105146	60 %	0 %	0 %	40 %	428296863
64	NC_019751	TGAAT	2	10	106438	106447	40 %	40 %	20 %	0 %	428296865
65	NC_019751	AATTA	2	10	108387	108396	60 %	40 %	0 %	0 %	428296867
66	NC_019751	GAGAA	2	10	112049	112058	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019751	TGGTT	2	10	112458	112467	0 %	60 %	40 %	0 %	428296870
68	NC_019751	AAGGG	2	10	113491	113500	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019751	AATCA	2	10	113747	113756	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019751	TTAAT	2	10	115114	115123	40 %	60 %	0 %	0 %	428296871
71	NC_019751	TTTAA	2	10	115575	115584	40 %	60 %	0 %	0 %	428296871
72	NC_019751	ATATC	2	10	116192	116201	40 %	40 %	0 %	20 %	428296872
73	NC_019751	TTTGT	2	10	116855	116864	0 %	80 %	20 %	0 %	428296872
74	NC_019751	GGGTA	2	10	117280	117289	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019751	AATAC	2	10	120071	120080	60 %	20 %	0 %	20 %	428296875
76	NC_019751	ACATC	2	10	121907	121916	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_019751	ATTGC	2	10	122085	122094	20 %	40 %	20 %	20 %	428296878
78	NC_019751	TCTGG	2	10	122252	122261	0 %	40 %	40 %	20 %	428296878
79	NC_019751	ATCTC	2	10	124468	124477	20 %	40 %	0 %	40 %	428296880
80	NC_019751	TGCAT	2	10	124906	124915	20 %	40 %	20 %	20 %	428296881
81	NC_019751	TAATT	2	10	124989	124998	40 %	60 %	0 %	0 %	428296881
82	NC_019751	CAACC	2	10	125126	125135	40 %	0 %	0 %	60 %	428296881
83	NC_019751	CCAAT	2	10	125417	125426	40 %	20 %	0 %	40 %	428296881
84	NC_019751	AAATA	2	10	125783	125792	80 %	20 %	0 %	0 %	428296882
85	NC_019751	ATATT	2	10	127973	127982	40 %	60 %	0 %	0 %	428296884
86	NC_019751	CGAAT	2	10	127988	127997	40 %	20 %	20 %	20 %	428296884
87	NC_019751	ATATT	2	10	128582	128591	40 %	60 %	0 %	0 %	428296884
88	NC_019751	TATTT	2	10	128795	128804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019751	GCACT	2	10	130499	130508	20 %	20 %	20 %	40 %	428296886
90	NC_019751	AATTT	2	10	130921	130930	40 %	60 %	0 %	0 %	428296886
91	NC_019751	GTTTA	2	10	134142	134151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019751	AGGTG	2	10	135136	135145	20 %	20 %	60 %	0 %	428296890
93	NC_019751	ATGTT	2	10	136280	136289	20 %	60 %	20 %	0 %	428296892
94	NC_019751	GCAAA	2	10	138146	138155	60 %	0 %	20 %	20 %	428296895
95	NC_019751	GTATG	2	10	141336	141345	20 %	40 %	40 %	0 %	428296899
96	NC_019751	CACTG	2	10	143418	143427	20 %	20 %	20 %	40 %	428296900
97	NC_019751	TTGAT	2	10	148031	148040	20 %	60 %	20 %	0 %	428296904
98	NC_019751	TGTTC	2	10	151835	151844	0 %	60 %	20 %	20 %	428296906
99	NC_019751	AATTG	2	10	152530	152539	40 %	40 %	20 %	0 %	428296906
100	NC_019751	AAATG	2	10	152799	152808	60 %	20 %	20 %	0 %	428296906
101	NC_019751	AATCC	2	10	152914	152923	40 %	20 %	0 %	40 %	428296906
102	NC_019751	GTTAA	2	10	155459	155468	40 %	40 %	20 %	0 %	428296908
103	NC_019751	TCAAC	2	10	157146	157155	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_019751	CATTC	2	10	158614	158623	20 %	40 %	0 %	40 %	428296910
105	NC_019751	TTTCC	2	10	158715	158724	0 %	60 %	0 %	40 %	428296910
106	NC_019751	GTAAA	2	10	160261	160270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019751	TTGCT	2	10	161359	161368	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019751	CCAGT	2	10	161484	161493	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_019751	AATGA	2	10	161906	161915	60 %	20 %	20 %	0 %	428296914
110	NC_019751	CTTTG	2	10	163049	163058	0 %	60 %	20 %	20 %	428296914
111	NC_019751	ACTGG	2	10	163213	163222	20 %	20 %	40 %	20 %	428296915
112	NC_019751	AAGTT	2	10	165136	165145	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019751	ATTTT	2	10	165848	165857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019751	TGGTT	2	10	166634	166643	0 %	60 %	40 %	0 %	428296917
115	NC_019751	TAGTT	2	10	168300	168309	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019751	GACGC	2	10	168805	168814	20 %	0 %	40 %	40 %	428296919
117	NC_019751	GTGAT	2	10	170832	170841	20 %	40 %	40 %	0 %	428296921
118	NC_019751	CCGTT	2	10	171330	171339	0 %	40 %	20 %	40 %	428296921
119	NC_019751	ACCTT	2	10	172911	172920	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_019751	TGTAC	2	10	174306	174315	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019751	TTGGG	2	10	175220	175229	0 %	40 %	60 %	0 %	428296926
122	NC_019751	TGGAA	2	10	175755	175764	40 %	20 %	40 %	0 %	428296926
123	NC_019751	GATGG	2	10	176577	176586	20 %	20 %	60 %	0 %	428296927
124	NC_019751	GTAGA	2	10	179288	179297	40 %	20 %	40 %	0 %	428296929
125	NC_019751	GATTA	2	10	179478	179487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019751	ATTAG	2	10	179975	179984	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019751	ACTTT	2	10	179992	180001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019751	TCAAC	2	10	182199	182208	40 %	20 %	0 %	40 %	428296931
129	NC_019751	GCGCA	2	10	182586	182595	20 %	0 %	40 %	40 %	428296931
130	NC_019751	GTAGA	2	10	183251	183260	40 %	20 %	40 %	0 %	428296931
131	NC_019751	AGATT	2	10	187619	187628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019751	TGATT	2	10	188803	188812	20 %	60 %	20 %	0 %	428296934
133	NC_019751	ACACC	2	10	190542	190551	40 %	0 %	0 %	60 %	428296937
134	NC_019751	ACAAT	2	10	192396	192405	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019751	TGATG	2	10	193237	193246	20 %	40 %	40 %	0 %	428296939
136	NC_019751	ATTTT	2	10	198554	198563	20 %	80 %	0 %	0 %	428296944
137	NC_019751	AAACC	2	10	200372	200381	60 %	0 %	0 %	40 %	428296945
138	NC_019751	ATCCT	2	10	200622	200631	20 %	40 %	0 %	40 %	428296945
139	NC_019751	TAGTG	2	10	203017	203026	20 %	40 %	40 %	0 %	428296947
140	NC_019751	TTGGA	2	10	203501	203510	20 %	40 %	40 %	0 %	428296947
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152	NC_019751	AATTC	2	10	217319	217328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_019751	TGATT	2	10	217609	217618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_019751	TTGGA	2	10	243733	243742	20 %	40 %	40 %	0 %	428296974
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237	NC_019751	CCAGT	2	10	356477	356486	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
238	NC_019751	GCAAA	2	10	356640	356649	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
239	NC_019751	ACTGG	2	10	358214	358223	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
240	NC_019751	CAAAT	2	10	362784	362793	60 %	20 %	0 %	20 %	428297064
241	NC_019751	CCAGT	2	10	363381	363390	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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243	NC_019751	TGGGT	2	10	366282	366291	0 %	40 %	60 %	0 %	428297066
244	NC_019751	GGGTC	2	10	368816	368825	0 %	20 %	60 %	20 %	428297067
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253	NC_019751	AAGAG	2	10	383791	383800	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
254	NC_019751	ATAGA	2	10	383904	383913	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_019751	TCGGT	2	10	384231	384240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
256	NC_019751	CAGTC	2	10	385412	385421	20 %	20 %	20 %	40 %	428297075
257	NC_019751	AATTT	2	10	385829	385838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_019751	TCACC	2	10	386956	386965	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
259	NC_019751	TCATC	2	10	387335	387344	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
260	NC_019751	TGGAG	2	10	388263	388272	20 %	20 %	60 %	0 %	428297077
261	NC_019751	CGTTG	2	10	392002	392011	0 %	40 %	40 %	20 %	428297081
262	NC_019751	GTAAC	2	10	393450	393459	40 %	20 %	20 %	20 %	428297082
263	NC_019751	TAATT	2	10	393982	393991	40 %	60 %	0 %	0 %	428297082
264	NC_019751	ATTTA	2	10	397332	397341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_019751	CACAG	2	10	397666	397675	40 %	0 %	20 %	40 %	428297087
266	NC_019751	GATGG	2	10	397868	397877	20 %	20 %	60 %	0 %	428297087
267	NC_019751	CGAAA	2	10	398885	398894	60 %	0 %	20 %	20 %	428297088
268	NC_019751	GATCG	2	10	399137	399146	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
269	NC_019751	GAATC	2	10	401159	401168	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_019751	CCCCA	2	10	402550	402559	20 %	0 %	0 %	80 %	428297090
271	NC_019751	GAAGG	2	10	405297	405306	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
272	NC_019751	GCAGA	2	10	408152	408161	40 %	0 %	40 %	20 %	428297095
273	NC_019751	TAATT	2	10	409591	409600	40 %	60 %	0 %	0 %	428297095
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403	NC_019751	AAGTA	2	10	605686	605695	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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