MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 18658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019751	ATTT	2	8	242	249	25 %	75 %	0 %	0 %	428296780
2	NC_019751	GCAA	2	8	517	524	50 %	0 %	25 %	25 %	428296780
3	NC_019751	ATTA	2	8	1557	1564	50 %	50 %	0 %	0 %	428296781
4	NC_019751	CCAT	2	8	2539	2546	25 %	25 %	0 %	50 %	428296781
5	NC_019751	GCTT	2	8	3940	3947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019751	TTGT	2	8	4495	4502	0 %	75 %	25 %	0 %	428296785
7	NC_019751	GTTG	2	8	5127	5134	0 %	50 %	50 %	0 %	428296785
8	NC_019751	TTAC	2	8	5185	5192	25 %	50 %	0 %	25 %	428296785
9	NC_019751	GATG	2	8	5536	5543	25 %	25 %	50 %	0 %	428296785
10	NC_019751	TGGC	2	8	5583	5590	0 %	25 %	50 %	25 %	428296785
11	NC_019751	ATAC	2	8	5784	5791	50 %	25 %	0 %	25 %	428296785
12	NC_019751	ATTA	2	8	6210	6217	50 %	50 %	0 %	0 %	428296785
13	NC_019751	GAGT	2	8	6250	6257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019751	TAAT	2	8	6742	6749	50 %	50 %	0 %	0 %	428296786
15	NC_019751	CAAA	2	8	6859	6866	75 %	0 %	0 %	25 %	428296786
16	NC_019751	CTAT	2	8	6882	6889	25 %	50 %	0 %	25 %	428296786
17	NC_019751	TGCT	2	8	6944	6951	0 %	50 %	25 %	25 %	428296786
18	NC_019751	TAAT	2	8	7619	7626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019751	TAAA	2	8	8341	8348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019751	TCCT	2	8	8525	8532	0 %	50 %	0 %	50 %	428296788
21	NC_019751	GGAT	2	8	8738	8745	25 %	25 %	50 %	0 %	428296788
22	NC_019751	GGTG	2	8	10156	10163	0 %	25 %	75 %	0 %	428296789
23	NC_019751	CTTT	2	8	10276	10283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019751	ACCA	2	8	10783	10790	50 %	0 %	0 %	50 %	428296790
25	NC_019751	TTGG	2	8	10844	10851	0 %	50 %	50 %	0 %	428296790
26	NC_019751	TTTG	2	8	11377	11384	0 %	75 %	25 %	0 %	428296790
27	NC_019751	TTAA	2	8	11449	11456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019751	TTCA	2	8	11804	11811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019751	TGTT	2	8	12131	12138	0 %	75 %	25 %	0 %	428296791
30	NC_019751	GCAA	2	8	12532	12539	50 %	0 %	25 %	25 %	428296791
31	NC_019751	AGAC	2	8	14002	14009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019751	ATGG	2	8	16207	16214	25 %	25 %	50 %	0 %	428296794
33	NC_019751	GGAT	2	8	16264	16271	25 %	25 %	50 %	0 %	428296794
34	NC_019751	AAGT	2	8	16855	16862	50 %	25 %	25 %	0 %	428296795
35	NC_019751	TAAC	2	8	17041	17048	50 %	25 %	0 %	25 %	428296795
36	NC_019751	CTTG	2	8	17552	17559	0 %	50 %	25 %	25 %	428296795
37	NC_019751	TAGA	2	8	18195	18202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019751	GTAA	2	8	18240	18247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019751	TAAT	2	8	18312	18319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019751	AGCA	2	8	18657	18664	50 %	0 %	25 %	25 %	428296796
41	NC_019751	GGTT	2	8	18809	18816	0 %	50 %	50 %	0 %	428296796
42	NC_019751	GATG	2	8	18949	18956	25 %	25 %	50 %	0 %	428296796
43	NC_019751	TTGA	2	8	19205	19212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019751	AGTT	2	8	19514	19521	25 %	50 %	25 %	0 %	428296797
45	NC_019751	CAGT	2	8	19524	19531	25 %	25 %	25 %	25 %	428296797
46	NC_019751	ATGG	2	8	21056	21063	25 %	25 %	50 %	0 %	428296798
47	NC_019751	AAAT	2	8	21844	21851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019751	ATAA	3	12	22091	22102	75 %	25 %	0 %	0 %	428296799
49	NC_019751	AGTT	2	8	22197	22204	25 %	50 %	25 %	0 %	428296799
50	NC_019751	TTTA	2	8	22273	22280	25 %	75 %	0 %	0 %	428296799
51	NC_019751	ATTG	2	8	22434	22441	25 %	50 %	25 %	0 %	428296799
52	NC_019751	ATCA	2	8	24457	24464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019751	TTGA	2	8	25306	25313	25 %	50 %	25 %	0 %	428296802
54	NC_019751	GAAG	2	8	26592	26599	50 %	0 %	50 %	0 %	428296802
55	NC_019751	GCAA	2	8	26631	26638	50 %	0 %	25 %	25 %	428296802
56	NC_019751	AATT	2	8	26795	26802	50 %	50 %	0 %	0 %	428296802
57	NC_019751	CAAG	2	8	27036	27043	50 %	0 %	25 %	25 %	428296802
58	NC_019751	AGTA	2	8	27374	27381	50 %	25 %	25 %	0 %	428296803
59	NC_019751	CCAA	2	8	27857	27864	50 %	0 %	0 %	50 %	428296803
60	NC_019751	AAGT	2	8	28147	28154	50 %	25 %	25 %	0 %	428296803
61	NC_019751	GATT	2	8	28200	28207	25 %	50 %	25 %	0 %	428296803
62	NC_019751	CTAA	2	8	28237	28244	50 %	25 %	0 %	25 %	428296803
63	NC_019751	TTGT	2	8	28518	28525	0 %	75 %	25 %	0 %	428296803
64	NC_019751	ATTT	2	8	28643	28650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019751	CTAT	2	8	28799	28806	25 %	50 %	0 %	25 %	428296804
66	NC_019751	TAAC	2	8	28866	28873	50 %	25 %	0 %	25 %	428296804
67	NC_019751	AGCA	2	8	29121	29128	50 %	0 %	25 %	25 %	428296804
68	NC_019751	AAAG	2	8	29659	29666	75 %	0 %	25 %	0 %	428296804
69	NC_019751	CAAG	2	8	29739	29746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019751	AGTA	2	8	29914	29921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019751	TTAT	2	8	30890	30897	25 %	75 %	0 %	0 %	428296805
72	NC_019751	TGGT	2	8	31704	31711	0 %	50 %	50 %	0 %	428296806
73	NC_019751	GTAC	2	8	32580	32587	25 %	25 %	25 %	25 %	428296808
74	NC_019751	GGAG	2	8	32678	32685	25 %	0 %	75 %	0 %	428296808
75	NC_019751	AGCA	2	8	32738	32745	50 %	0 %	25 %	25 %	428296808
76	NC_019751	AAAT	2	8	33723	33730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019751	ATTT	2	8	33731	33738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019751	ATTT	2	8	33800	33807	25 %	75 %	0 %	0 %	428296810
79	NC_019751	AACT	2	8	35128	35135	50 %	25 %	0 %	25 %	428296811
80	NC_019751	GATT	2	8	35767	35774	25 %	50 %	25 %	0 %	428296812
81	NC_019751	AATT	2	8	36169	36176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019751	ACTA	2	8	36228	36235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019751	GAAC	2	8	36266	36273	50 %	0 %	25 %	25 %	428296813
84	NC_019751	TTTA	2	8	36673	36680	25 %	75 %	0 %	0 %	428296813
85	NC_019751	TTGA	2	8	37036	37043	25 %	50 %	25 %	0 %	428296813
86	NC_019751	TAAA	2	8	37280	37287	75 %	25 %	0 %	0 %	428296814
87	NC_019751	ATAC	2	8	37518	37525	50 %	25 %	0 %	25 %	428296814
88	NC_019751	TACC	2	8	37560	37567	25 %	25 %	0 %	50 %	428296814
89	NC_019751	CACC	2	8	37870	37877	25 %	0 %	0 %	75 %	428296814
90	NC_019751	TTGC	2	8	38374	38381	0 %	50 %	25 %	25 %	428296814
91	NC_019751	TAAA	2	8	38848	38855	75 %	25 %	0 %	0 %	428296814
92	NC_019751	TGTC	2	8	39055	39062	0 %	50 %	25 %	25 %	428296814
93	NC_019751	TTAG	2	8	39322	39329	25 %	50 %	25 %	0 %	428296815
94	NC_019751	TTAT	2	8	39499	39506	25 %	75 %	0 %	0 %	428296815
95	NC_019751	AGCT	2	8	39641	39648	25 %	25 %	25 %	25 %	428296815
96	NC_019751	CTTC	2	8	39716	39723	0 %	50 %	0 %	50 %	428296815
97	NC_019751	TTAG	2	8	40189	40196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019751	AATT	2	8	40421	40428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019751	TTTG	2	8	40587	40594	0 %	75 %	25 %	0 %	428296816
100	NC_019751	GGTA	2	8	40635	40642	25 %	25 %	50 %	0 %	428296816
101	NC_019751	TTCA	2	8	40858	40865	25 %	50 %	0 %	25 %	428296816
102	NC_019751	CAGT	2	8	41347	41354	25 %	25 %	25 %	25 %	428296816
103	NC_019751	AATT	2	8	42197	42204	50 %	50 %	0 %	0 %	428296816
104	NC_019751	TAGT	2	8	42395	42402	25 %	50 %	25 %	0 %	428296816
105	NC_019751	ACCA	2	8	43077	43084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019751	GATT	2	8	43491	43498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019751	CCTG	2	8	44077	44084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019751	TAGA	2	8	44739	44746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019751	TTAA	2	8	46673	46680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019751	CAAC	2	8	47360	47367	50 %	0 %	0 %	50 %	428296820
111	NC_019751	AATT	2	8	49015	49022	50 %	50 %	0 %	0 %	428296821
112	NC_019751	ATTT	2	8	49393	49400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019751	GAAG	2	8	49779	49786	50 %	0 %	50 %	0 %	428296822
114	NC_019751	CAAG	2	8	49887	49894	50 %	0 %	25 %	25 %	428296822
115	NC_019751	GCAA	2	8	49971	49978	50 %	0 %	25 %	25 %	428296822
116	NC_019751	CAAT	2	8	49999	50006	50 %	25 %	0 %	25 %	428296822
117	NC_019751	TAAG	2	8	50853	50860	50 %	25 %	25 %	0 %	428296822
118	NC_019751	ATCT	2	8	50905	50912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019751	AGCA	2	8	51416	51423	50 %	0 %	25 %	25 %	428296824
120	NC_019751	ACAA	2	8	51484	51491	75 %	0 %	0 %	25 %	428296824
121	NC_019751	AGCA	2	8	51926	51933	50 %	0 %	25 %	25 %	428296825
122	NC_019751	CAAA	2	8	51959	51966	75 %	0 %	0 %	25 %	428296825
123	NC_019751	CCCG	2	8	52213	52220	0 %	0 %	25 %	75 %	428296825
124	NC_019751	CCCA	2	8	52311	52318	25 %	0 %	0 %	75 %	428296825
125	NC_019751	TCCT	2	8	54057	54064	0 %	50 %	0 %	50 %	428296825
126	NC_019751	GTCA	2	8	54179	54186	25 %	25 %	25 %	25 %	428296825
127	NC_019751	AGTT	2	8	54650	54657	25 %	50 %	25 %	0 %	428296825
128	NC_019751	TTTA	2	8	55083	55090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019751	TTGA	2	8	55289	55296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019751	TTGC	2	8	55995	56002	0 %	50 %	25 %	25 %	428296826
131	NC_019751	GAAA	2	8	56385	56392	75 %	0 %	25 %	0 %	428296826
132	NC_019751	AACC	2	8	56424	56431	50 %	0 %	0 %	50 %	428296826
133	NC_019751	AAAC	2	8	57152	57159	75 %	0 %	0 %	25 %	428296826
134	NC_019751	GGAA	2	8	57457	57464	50 %	0 %	50 %	0 %	428296826
135	NC_019751	AATA	2	8	57984	57991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019751	CTAT	2	8	58014	58021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019751	CAAA	2	8	58304	58311	75 %	0 %	0 %	25 %	428296827
138	NC_019751	TCCT	2	8	58500	58507	0 %	50 %	0 %	50 %	428296827
139	NC_019751	TGCT	2	8	58545	58552	0 %	50 %	25 %	25 %	428296827
140	NC_019751	AAAG	2	8	58610	58617	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019751	ACGC	2	8	58709	58716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019751	TATT	2	8	58866	58873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019751	TTTA	2	8	58913	58920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019751	AATC	2	8	59131	59138	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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