MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 135923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_019751	TTG	2	6	172055	172060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296922
3503	NC_019751	AAG	2	6	172061	172066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296922
3504	NC_019751	GAA	2	6	172117	172122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296922
3505	NC_019751	T	7	7	172154	172160	0 %	100 %	0 %	0 %	428296922
3506	NC_019751	CTG	2	6	172176	172181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296922
3507	NC_019751	ACC	2	6	172225	172230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296923
3508	NC_019751	CAT	2	6	172264	172269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296923
3509	NC_019751	ATT	2	6	172309	172314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296923
3510	NC_019751	CTG	2	6	172386	172391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296923
3511	NC_019751	CAG	2	6	172443	172448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296923
3512	NC_019751	T	7	7	172478	172484	0 %	100 %	0 %	0 %	428296923
3513	NC_019751	ACC	2	6	172625	172630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296923
3514	NC_019751	TGC	2	6	172631	172636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296923
3515	NC_019751	GA	3	6	172644	172649	50 %	0 %	50 %	0 %	428296923
3516	NC_019751	CG	3	6	172652	172657	0 %	0 %	50 %	50 %	428296923
3517	NC_019751	CAC	2	6	172662	172667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296923
3518	NC_019751	ACC	2	6	172693	172698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296923
3519	NC_019751	AT	3	6	172770	172775	50 %	50 %	0 %	0 %	428296923
3520	NC_019751	ATTTTT	2	12	172841	172852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	428296923
3521	NC_019751	ACCTT	2	10	172911	172920	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3522	NC_019751	AAG	2	6	173005	173010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_019751	TAA	2	6	173030	173035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_019751	A	6	6	173055	173060	100 %	0 %	0 %	0 %	428296924
3525	NC_019751	CG	3	6	173156	173161	0 %	0 %	50 %	50 %	428296924
3526	NC_019751	TCA	2	6	173168	173173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296924
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3528	NC_019751	AT	3	6	173195	173200	50 %	50 %	0 %	0 %	428296924
3529	NC_019751	GTT	2	6	173224	173229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296924
3530	NC_019751	ATA	2	6	173391	173396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_019751	ATA	2	6	173435	173440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_019751	ATT	2	6	173448	173453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_019751	AG	3	6	173501	173506	50 %	0 %	50 %	0 %	428296925
3534	NC_019751	CAAA	2	8	173531	173538	75 %	0 %	0 %	25 %	428296925
3535	NC_019751	TA	3	6	173677	173682	50 %	50 %	0 %	0 %	428296925
3536	NC_019751	ACC	2	6	173704	173709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296925
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3538	NC_019751	CA	3	6	173811	173816	50 %	0 %	0 %	50 %	428296925
3539	NC_019751	TTC	2	6	173823	173828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296925
3540	NC_019751	TCT	2	6	173933	173938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_019751	TTG	2	6	173949	173954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_019751	AGA	2	6	173962	173967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_019751	TGT	2	6	174018	174023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_019751	TCCT	2	8	174179	174186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_019751	TGTAC	2	10	174306	174315	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3546	NC_019751	ACT	2	6	174410	174415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_019751	TTCG	2	8	174461	174468	0 %	50 %	25 %	25 %	428296926
3548	NC_019751	GGA	2	6	174493	174498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428296926
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3550	NC_019751	CCT	2	6	174605	174610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296926
3551	NC_019751	TTG	2	6	174635	174640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296926
3552	NC_019751	AGA	2	6	174673	174678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296926
3553	NC_019751	TAG	2	6	174681	174686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296926
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3555	NC_019751	TGA	2	6	174879	174884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296926
3556	NC_019751	GAA	2	6	174938	174943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296926
3557	NC_019751	CTA	2	6	174988	174993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296926
3558	NC_019751	AGAA	2	8	175003	175010	75 %	0 %	25 %	0 %	428296926
3559	NC_019751	TGG	2	6	175041	175046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296926
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3564	NC_019751	TTGGG	2	10	175220	175229	0 %	40 %	60 %	0 %	428296926
3565	NC_019751	A	6	6	175279	175284	100 %	0 %	0 %	0 %	428296926
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3572	NC_019751	GA	3	6	175735	175740	50 %	0 %	50 %	0 %	428296926
3573	NC_019751	TGA	2	6	175747	175752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296926
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3580	NC_019751	GGTT	2	8	175931	175938	0 %	50 %	50 %	0 %	428296926
3581	NC_019751	ATTA	2	8	175976	175983	50 %	50 %	0 %	0 %	428296926
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3583	NC_019751	CAG	2	6	176132	176137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_019751	TAC	2	6	176185	176190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_019751	GTA	2	6	176247	176252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_019751	GTA	2	6	176258	176263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_019751	TA	3	6	176262	176267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_019751	CATA	2	8	176310	176317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_019751	ATTT	2	8	176374	176381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_019751	GCT	2	6	176438	176443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_019751	TAAAAT	2	12	176467	176478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3594	NC_019751	GATGG	2	10	176577	176586	20 %	20 %	60 %	0 %	428296927
3595	NC_019751	AT	3	6	176672	176677	50 %	50 %	0 %	0 %	428296927
3596	NC_019751	ACT	2	6	176698	176703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296927
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3598	NC_019751	GCA	2	6	176721	176726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296927
3599	NC_019751	TGA	2	6	176768	176773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296927
3600	NC_019751	ATTA	2	8	176930	176937	50 %	50 %	0 %	0 %	428296927
3601	NC_019751	GTT	2	6	176949	176954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296927
3602	NC_019751	AACT	2	8	176975	176982	50 %	25 %	0 %	25 %	428296927
3603	NC_019751	ACC	2	6	177113	177118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296927
3604	NC_019751	AT	3	6	177141	177146	50 %	50 %	0 %	0 %	428296927
3605	NC_019751	TAG	2	6	177316	177321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296927
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3608	NC_019751	AC	3	6	177402	177407	50 %	0 %	0 %	50 %	428296927
3609	NC_019751	TAC	2	6	177454	177459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296927
3610	NC_019751	TG	3	6	177536	177541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_019751	AAG	2	6	177610	177615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296928
3612	NC_019751	A	6	6	177616	177621	100 %	0 %	0 %	0 %	428296928
3613	NC_019751	TAC	2	6	177645	177650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296928
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3615	NC_019751	AAG	2	6	177694	177699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296928
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3617	NC_019751	AAT	2	6	177750	177755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296928
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3621	NC_019751	CTG	2	6	177976	177981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296928
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3623	NC_019751	AT	3	6	178125	178130	50 %	50 %	0 %	0 %	428296929
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