MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 135923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_019751	GAT	2	6	147981	147986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296904
3003	NC_019751	TGT	2	6	147995	148000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296904
3004	NC_019751	TATT	2	8	148009	148016	25 %	75 %	0 %	0 %	428296904
3005	NC_019751	TCA	2	6	148017	148022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296904
3006	NC_019751	TTGAT	2	10	148031	148040	20 %	60 %	20 %	0 %	428296904
3007	NC_019751	T	6	6	148040	148045	0 %	100 %	0 %	0 %	428296904
3008	NC_019751	TAAG	2	8	148063	148070	50 %	25 %	25 %	0 %	428296904
3009	NC_019751	GCA	2	6	148123	148128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296904
3010	NC_019751	ACT	2	6	148173	148178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296904
3011	NC_019751	CTTT	2	8	148201	148208	0 %	75 %	0 %	25 %	428296904
3012	NC_019751	CTA	2	6	148218	148223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296904
3013	NC_019751	T	7	7	148333	148339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_019751	ATT	2	6	148348	148353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296905
3015	NC_019751	ATA	2	6	148384	148389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296905
3016	NC_019751	GTT	2	6	148394	148399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296905
3017	NC_019751	TTGA	2	8	148414	148421	25 %	50 %	25 %	0 %	428296905
3018	NC_019751	TGC	2	6	148448	148453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296905
3019	NC_019751	TGA	2	6	148530	148535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296905
3020	NC_019751	CCT	2	6	148553	148558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_019751	AAG	2	6	148685	148690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_019751	A	6	6	148717	148722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_019751	A	6	6	148751	148756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_019751	T	6	6	148807	148812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_019751	TCC	2	6	148909	148914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_019751	C	6	6	148940	148945	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3027	NC_019751	TTAA	2	8	148968	148975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_019751	GTA	2	6	149006	149011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_019751	TA	3	6	149072	149077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_019751	TAA	2	6	149097	149102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_019751	ACT	2	6	149142	149147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_019751	TTG	2	6	149148	149153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_019751	ATT	2	6	149185	149190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_019751	TTTA	2	8	149271	149278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_019751	TAGT	2	8	149301	149308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_019751	AAT	2	6	149328	149333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_019751	GAA	2	6	149360	149365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_019751	T	6	6	149403	149408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_019751	TAAT	2	8	149429	149436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_019751	ATA	2	6	149460	149465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019751	AAT	2	6	149485	149490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_019751	TCA	2	6	149507	149512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_019751	TAA	3	9	149517	149525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_019751	ATT	2	6	149526	149531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_019751	T	7	7	149530	149536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_019751	ATCT	2	8	149585	149592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_019751	A	6	6	149600	149605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_019751	TGT	2	6	149653	149658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_019751	TCA	2	6	149672	149677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_019751	TTA	2	6	149745	149750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_019751	TA	3	6	149749	149754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_019751	CAT	2	6	149774	149779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_019751	TAC	2	6	149813	149818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_019751	CCTCAA	2	12	149826	149837	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_019751	GAA	2	6	149849	149854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_019751	CTT	2	6	149934	149939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_019751	AT	3	6	150030	150035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_019751	TA	3	6	150047	150052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_019751	TACT	2	8	150055	150062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_019751	ATT	2	6	150188	150193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_019751	GTAAAA	2	12	150210	150221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_019751	A	6	6	150218	150223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_019751	CAA	2	6	150288	150293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_019751	ATAA	2	8	150294	150301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_019751	GGA	2	6	150341	150346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_019751	ACG	2	6	150347	150352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_019751	T	8	8	150532	150539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_019751	ATTT	2	8	150626	150633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_019751	TCT	2	6	150644	150649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_019751	ATT	2	6	150738	150743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_019751	AT	3	6	150745	150750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_019751	CAA	2	6	150884	150889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296906
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3075	NC_019751	CAT	2	6	151037	151042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296906
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3081	NC_019751	TAC	2	6	151638	151643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296906
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3085	NC_019751	CTG	2	6	151753	151758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296906
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3089	NC_019751	TGTTC	2	10	151835	151844	0 %	60 %	20 %	20 %	428296906
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3091	NC_019751	TTG	2	6	151983	151988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296906
3092	NC_019751	CTGG	2	8	151990	151997	0 %	25 %	50 %	25 %	428296906
3093	NC_019751	GC	3	6	152014	152019	0 %	0 %	50 %	50 %	428296906
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3097	NC_019751	ATG	2	6	152218	152223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296906
3098	NC_019751	ATTT	2	8	152276	152283	25 %	75 %	0 %	0 %	428296906
3099	NC_019751	TTG	2	6	152322	152327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296906
3100	NC_019751	GTT	2	6	152336	152341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296906
3101	NC_019751	TAA	2	6	152367	152372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296906
3102	NC_019751	GCT	2	6	152440	152445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296906
3103	NC_019751	TCA	2	6	152476	152481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296906
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3105	NC_019751	CTA	2	6	152524	152529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296906
3106	NC_019751	AATTG	2	10	152530	152539	40 %	40 %	20 %	0 %	428296906
3107	NC_019751	CAG	2	6	152567	152572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296906
3108	NC_019751	T	6	6	152577	152582	0 %	100 %	0 %	0 %	428296906
3109	NC_019751	TGC	2	6	152625	152630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296906
3110	NC_019751	AGC	2	6	152643	152648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296906
3111	NC_019751	T	7	7	152705	152711	0 %	100 %	0 %	0 %	428296906
3112	NC_019751	CAA	2	6	152720	152725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296906
3113	NC_019751	TTG	2	6	152772	152777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296906
3114	NC_019751	AAATG	2	10	152799	152808	60 %	20 %	20 %	0 %	428296906
3115	NC_019751	GGA	2	6	152809	152814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428296906
3116	NC_019751	TGG	3	9	152850	152858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296906
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3118	NC_019751	CTA	3	9	152891	152899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296906
3119	NC_019751	AGCT	2	8	152906	152913	25 %	25 %	25 %	25 %	428296906
3120	NC_019751	AATCC	2	10	152914	152923	40 %	20 %	0 %	40 %	428296906
3121	NC_019751	AAT	2	6	152992	152997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_019751	AAAT	2	8	153008	153015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_019751	GAAT	2	8	153027	153034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_019751	TAG	2	6	153039	153044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_019751	ACC	2	6	153100	153105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296907
3126	NC_019751	GTAC	2	8	153131	153138	25 %	25 %	25 %	25 %	428296907
3127	NC_019751	CAT	2	6	153213	153218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296907
3128	NC_019751	ACT	2	6	153379	153384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296907
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3240	NC_019751	CACC	2	8	158746	158753	25 %	0 %	0 %	75 %	428296910
3241	NC_019751	AC	3	6	158779	158784	50 %	0 %	0 %	50 %	428296910
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3249	NC_019751	TAA	2	6	159433	159438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296911
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3375	NC_019751	GA	3	6	165693	165698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3376	NC_019751	ATTTT	2	10	165848	165857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3377	NC_019751	A	6	6	165871	165876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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