MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 135923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019751	ATG	2	6	122927	122932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_019751	A	8	8	122964	122971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_019751	ATT	2	6	123024	123029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296879
2504	NC_019751	TTA	2	6	123081	123086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296879
2505	NC_019751	CTT	2	6	123103	123108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296879
2506	NC_019751	ATT	2	6	123164	123169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296879
2507	NC_019751	CTT	2	6	123205	123210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296879
2508	NC_019751	TTC	2	6	123290	123295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296879
2509	NC_019751	TCT	2	6	123355	123360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296879
2510	NC_019751	GCTA	2	8	123374	123381	25 %	25 %	25 %	25 %	428296879
2511	NC_019751	ATA	2	6	123386	123391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296879
2512	NC_019751	CTT	2	6	123409	123414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296879
2513	NC_019751	TCT	2	6	123424	123429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296879
2514	NC_019751	CTG	2	6	123473	123478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296879
2515	NC_019751	CACTAC	2	12	123509	123520	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428296879
2516	NC_019751	ATAA	2	8	123527	123534	75 %	25 %	0 %	0 %	428296879
2517	NC_019751	TTAA	2	8	123558	123565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_019751	CTT	2	6	123572	123577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_019751	TAT	2	6	123582	123587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_019751	T	6	6	123608	123613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_019751	G	8	8	123637	123644	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_019751	TTCT	2	8	123718	123725	0 %	75 %	0 %	25 %	428296880
2523	NC_019751	ATT	2	6	123807	123812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296880
2524	NC_019751	AC	3	6	123813	123818	50 %	0 %	0 %	50 %	428296880
2525	NC_019751	CAG	2	6	123898	123903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296880
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2527	NC_019751	ATC	2	6	124058	124063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296880
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2529	NC_019751	AACC	2	8	124124	124131	50 %	0 %	0 %	50 %	428296880
2530	NC_019751	TGCCGT	2	12	124142	124153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296880
2531	NC_019751	GCAATA	2	12	124161	124172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428296880
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2533	NC_019751	ATCTC	2	10	124468	124477	20 %	40 %	0 %	40 %	428296880
2534	NC_019751	TAGA	2	8	124574	124581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_019751	AT	3	6	124667	124672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_019751	CT	3	6	124673	124678	0 %	50 %	0 %	50 %	428296881
2537	NC_019751	TGAT	2	8	124731	124738	25 %	50 %	25 %	0 %	428296881
2538	NC_019751	ACC	2	6	124836	124841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296881
2539	NC_019751	CTT	2	6	124857	124862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296881
2540	NC_019751	ATC	2	6	124896	124901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296881
2541	NC_019751	TGCAT	2	10	124906	124915	20 %	40 %	20 %	20 %	428296881
2542	NC_019751	TAATT	2	10	124989	124998	40 %	60 %	0 %	0 %	428296881
2543	NC_019751	TA	3	6	125010	125015	50 %	50 %	0 %	0 %	428296881
2544	NC_019751	TA	3	6	125018	125023	50 %	50 %	0 %	0 %	428296881
2545	NC_019751	CAA	2	6	125045	125050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296881
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2547	NC_019751	CAACC	2	10	125126	125135	40 %	0 %	0 %	60 %	428296881
2548	NC_019751	TTG	2	6	125154	125159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296881
2549	NC_019751	TTTC	2	8	125165	125172	0 %	75 %	0 %	25 %	428296881
2550	NC_019751	GGT	2	6	125175	125180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296881
2551	NC_019751	TTC	2	6	125255	125260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296881
2552	NC_019751	ATT	2	6	125277	125282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296881
2553	NC_019751	CTA	2	6	125333	125338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296881
2554	NC_019751	T	6	6	125348	125353	0 %	100 %	0 %	0 %	428296881
2555	NC_019751	AAT	3	9	125373	125381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296881
2556	NC_019751	CCAAT	2	10	125417	125426	40 %	20 %	0 %	40 %	428296881
2557	NC_019751	CAA	2	6	125472	125477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296881
2558	NC_019751	AAT	2	6	125499	125504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296881
2559	NC_019751	AT	3	6	125503	125508	50 %	50 %	0 %	0 %	428296881
2560	NC_019751	GCA	2	6	125512	125517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296881
2561	NC_019751	ACC	2	6	125532	125537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296881
2562	NC_019751	TGTT	2	8	125577	125584	0 %	75 %	25 %	0 %	428296881
2563	NC_019751	TCT	2	6	125660	125665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_019751	ATAA	2	8	125703	125710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_019751	ACT	2	6	125716	125721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_019751	AAATA	2	10	125783	125792	80 %	20 %	0 %	0 %	428296882
2567	NC_019751	T	6	6	125868	125873	0 %	100 %	0 %	0 %	428296882
2568	NC_019751	TCAA	2	8	125877	125884	50 %	25 %	0 %	25 %	428296882
2569	NC_019751	CCAA	2	8	125885	125892	50 %	0 %	0 %	50 %	428296882
2570	NC_019751	AT	3	6	125913	125918	50 %	50 %	0 %	0 %	428296882
2571	NC_019751	ATC	2	6	125948	125953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296882
2572	NC_019751	CTG	2	6	126016	126021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296882
2573	NC_019751	AT	3	6	126207	126212	50 %	50 %	0 %	0 %	428296882
2574	NC_019751	A	6	6	126269	126274	100 %	0 %	0 %	0 %	428296882
2575	NC_019751	ATC	2	6	126278	126283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296882
2576	NC_019751	ACCC	2	8	126460	126467	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2577	NC_019751	TCT	2	6	126513	126518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296883
2578	NC_019751	TTGG	2	8	126525	126532	0 %	50 %	50 %	0 %	428296883
2579	NC_019751	GTAA	2	8	126543	126550	50 %	25 %	25 %	0 %	428296883
2580	NC_019751	CTT	2	6	126558	126563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296883
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2582	NC_019751	ATC	2	6	126628	126633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296883
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2588	NC_019751	CAT	2	6	126936	126941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296883
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2591	NC_019751	ATC	2	6	127203	127208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_019751	ATGT	2	8	127290	127297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_019751	CTG	2	6	127313	127318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_019751	AG	3	6	127321	127326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_019751	AAG	2	6	127378	127383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_019751	TTAG	2	8	127389	127396	25 %	50 %	25 %	0 %	428296884
2597	NC_019751	ACCC	2	8	127576	127583	25 %	0 %	0 %	75 %	428296884
2598	NC_019751	GTA	2	6	127690	127695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296884
2599	NC_019751	AT	3	6	127710	127715	50 %	50 %	0 %	0 %	428296884
2600	NC_019751	AGA	2	6	127786	127791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296884
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2604	NC_019751	ATATT	2	10	127973	127982	40 %	60 %	0 %	0 %	428296884
2605	NC_019751	CGAAT	2	10	127988	127997	40 %	20 %	20 %	20 %	428296884
2606	NC_019751	CTT	2	6	128085	128090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296884
2607	NC_019751	GCA	3	9	128111	128119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296884
2608	NC_019751	TAA	2	6	128140	128145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296884
2609	NC_019751	GCA	2	6	128147	128152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296884
2610	NC_019751	T	7	7	128158	128164	0 %	100 %	0 %	0 %	428296884
2611	NC_019751	T	8	8	128172	128179	0 %	100 %	0 %	0 %	428296884
2612	NC_019751	GAC	2	6	128238	128243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296884
2613	NC_019751	TGC	2	6	128251	128256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296884
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2620	NC_019751	ATT	2	6	128594	128599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_019751	TTTA	2	8	128603	128610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_019751	ATC	2	6	128712	128717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_019751	TG	3	6	128720	128725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_019751	ACAA	2	8	128780	128787	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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