MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 135923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019751	G	6	6	49797	49802	0 %	0 %	100 %	0 %	428296822
1002	NC_019751	AGA	2	6	49803	49808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1003	NC_019751	AAG	2	6	49823	49828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1004	NC_019751	A	6	6	49852	49857	100 %	0 %	0 %	0 %	428296822
1005	NC_019751	GCT	2	6	49873	49878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296822
1006	NC_019751	CAAG	2	8	49887	49894	50 %	0 %	25 %	25 %	428296822
1007	NC_019751	AAG	2	6	49937	49942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1008	NC_019751	GCAA	2	8	49971	49978	50 %	0 %	25 %	25 %	428296822
1009	NC_019751	CAAT	2	8	49999	50006	50 %	25 %	0 %	25 %	428296822
1010	NC_019751	CAG	2	6	50019	50024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296822
1011	NC_019751	GAA	2	6	50121	50126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1012	NC_019751	GCA	2	6	50139	50144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296822
1013	NC_019751	AGA	2	6	50223	50228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1014	NC_019751	AGT	2	6	50232	50237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296822
1015	NC_019751	TTG	2	6	50243	50248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296822
1016	NC_019751	A	6	6	50402	50407	100 %	0 %	0 %	0 %	428296822
1017	NC_019751	TGA	2	6	50475	50480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296822
1018	NC_019751	AGA	2	6	50529	50534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1019	NC_019751	AAG	2	6	50558	50563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1020	NC_019751	GCA	2	6	50692	50697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296822
1021	NC_019751	GAA	2	6	50713	50718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1022	NC_019751	GAA	2	6	50731	50736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1023	NC_019751	GAA	2	6	50779	50784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1024	NC_019751	AGA	2	6	50787	50792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296822
1025	NC_019751	CAA	2	6	50809	50814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296822
1026	NC_019751	TAAG	2	8	50853	50860	50 %	25 %	25 %	0 %	428296822
1027	NC_019751	T	6	6	50878	50883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019751	ATCT	2	8	50905	50912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_019751	GTT	2	6	51067	51072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296823
1030	NC_019751	AGA	2	6	51085	51090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296823
1031	NC_019751	ATT	2	6	51204	51209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019751	AAT	2	6	51233	51238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019751	AAC	2	6	51253	51258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_019751	AAC	2	6	51308	51313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296824
1035	NC_019751	TGG	2	6	51323	51328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296824
1036	NC_019751	ACACCA	2	12	51345	51356	50 %	0 %	0 %	50 %	428296824
1037	NC_019751	CAT	2	6	51409	51414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296824
1038	NC_019751	AGCA	2	8	51416	51423	50 %	0 %	25 %	25 %	428296824
1039	NC_019751	AGCAA	2	10	51468	51477	60 %	0 %	20 %	20 %	428296824
1040	NC_019751	ACAA	2	8	51484	51491	75 %	0 %	0 %	25 %	428296824
1041	NC_019751	CAT	2	6	51535	51540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_019751	TC	3	6	51574	51579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_019751	GAATT	2	10	51742	51751	40 %	40 %	20 %	0 %	428296825
1044	NC_019751	TAG	2	6	51810	51815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296825
1045	NC_019751	AGT	2	6	51904	51909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296825
1046	NC_019751	AGCA	2	8	51926	51933	50 %	0 %	25 %	25 %	428296825
1047	NC_019751	ACC	2	6	51948	51953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296825
1048	NC_019751	CAAA	2	8	51959	51966	75 %	0 %	0 %	25 %	428296825
1049	NC_019751	ACT	2	6	51996	52001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296825
1050	NC_019751	TTC	2	6	52056	52061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296825
1051	NC_019751	TCCACC	2	12	52083	52094	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428296825
1052	NC_019751	CAC	2	6	52136	52141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296825
1053	NC_019751	CCCG	2	8	52213	52220	0 %	0 %	25 %	75 %	428296825
1054	NC_019751	CAA	2	6	52225	52230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296825
1055	NC_019751	A	6	6	52235	52240	100 %	0 %	0 %	0 %	428296825
1056	NC_019751	A	6	6	52250	52255	100 %	0 %	0 %	0 %	428296825
1057	NC_019751	CCCA	2	8	52311	52318	25 %	0 %	0 %	75 %	428296825
1058	NC_019751	CAG	2	6	52325	52330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1059	NC_019751	CAG	2	6	52338	52343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1060	NC_019751	CGT	2	6	52414	52419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1061	NC_019751	A	6	6	52421	52426	100 %	0 %	0 %	0 %	428296825
1062	NC_019751	GTC	2	6	52523	52528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1063	NC_019751	AGCCG	2	10	52556	52565	20 %	0 %	40 %	40 %	428296825
1064	NC_019751	ACC	2	6	52641	52646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296825
1065	NC_019751	CCA	2	6	52657	52662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296825
1066	NC_019751	GCT	3	9	52687	52695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1067	NC_019751	ATG	2	6	52697	52702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296825
1068	NC_019751	GAA	2	6	52779	52784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296825
1069	NC_019751	GAA	3	9	52792	52800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296825
1070	NC_019751	CGA	2	6	52803	52808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1071	NC_019751	TGA	4	12	52875	52886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296825
1072	NC_019751	GAT	2	6	52894	52899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296825
1073	NC_019751	AGC	2	6	52917	52922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1074	NC_019751	CCAAAA	2	12	52954	52965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296825
1075	NC_019751	AGC	2	6	52992	52997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1076	NC_019751	AAC	2	6	53001	53006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296825
1077	NC_019751	GCT	2	6	53035	53040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1078	NC_019751	CAAAAT	2	12	53053	53064	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428296825
1079	NC_019751	CGC	2	6	53068	53073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428296825
1080	NC_019751	CAGAA	2	10	53078	53087	60 %	0 %	20 %	20 %	428296825
1081	NC_019751	TTG	2	6	53108	53113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296825
1082	NC_019751	GTT	2	6	53155	53160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296825
1083	NC_019751	GTTGAG	2	12	53266	53277	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428296825
1084	NC_019751	AAATG	2	10	53307	53316	60 %	20 %	20 %	0 %	428296825
1085	NC_019751	CGT	2	6	53347	53352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1086	NC_019751	CCA	2	6	53353	53358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296825
1087	NC_019751	CAT	2	6	53367	53372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296825
1088	NC_019751	AAC	2	6	53394	53399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296825
1089	NC_019751	GCA	2	6	53431	53436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1090	NC_019751	TGG	2	6	53445	53450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296825
1091	NC_019751	CA	3	6	53454	53459	50 %	0 %	0 %	50 %	428296825
1092	NC_019751	AAC	2	6	53504	53509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296825
1093	NC_019751	GC	3	6	53556	53561	0 %	0 %	50 %	50 %	428296825
1094	NC_019751	GTT	2	6	53596	53601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296825
1095	NC_019751	GAC	2	6	53608	53613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1096	NC_019751	ATT	2	6	53671	53676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296825
1097	NC_019751	CAA	2	6	53685	53690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296825
1098	NC_019751	AGC	2	6	53703	53708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1099	NC_019751	GAA	2	6	53758	53763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296825
1100	NC_019751	TTG	2	6	53824	53829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296825
1101	NC_019751	TAG	2	6	53843	53848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296825
1102	NC_019751	CAAATC	2	12	53870	53881	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428296825
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1104	NC_019751	CTG	3	9	54098	54106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1105	NC_019751	TGA	2	6	54108	54113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296825
1106	NC_019751	TCT	2	6	54122	54127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296825
1107	NC_019751	AAG	2	6	54137	54142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296825
1108	NC_019751	GTCA	2	8	54179	54186	25 %	25 %	25 %	25 %	428296825
1109	NC_019751	GCTCAA	2	12	54226	54237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428296825
1110	NC_019751	TCA	2	6	54358	54363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296825
1111	NC_019751	GTG	2	6	54407	54412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296825
1112	NC_019751	ATC	2	6	54418	54423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296825
1113	NC_019751	ACC	2	6	54433	54438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296825
1114	NC_019751	GTG	2	6	54446	54451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296825
1115	NC_019751	ACA	2	6	54494	54499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296825
1116	NC_019751	AGA	2	6	54516	54521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296825
1117	NC_019751	AGC	2	6	54528	54533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1118	NC_019751	AGA	2	6	54564	54569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296825
1119	NC_019751	ACC	2	6	54580	54585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296825
1120	NC_019751	AGTT	2	8	54650	54657	25 %	50 %	25 %	0 %	428296825
1121	NC_019751	GGTAA	2	10	54688	54697	40 %	20 %	40 %	0 %	428296825
1122	NC_019751	CGT	2	6	54844	54849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296825
1123	NC_019751	GAT	2	6	54866	54871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296825
1124	NC_019751	TA	3	6	54968	54973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1126	NC_019751	AC	3	6	55064	55069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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