MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 135923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
135001	NC_019751	GTA	2	6	6721868	6721873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428302132
135002	NC_019751	CGA	2	6	6721983	6721988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428302133
135003	NC_019751	CAT	2	6	6722012	6722017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428302133
135004	NC_019751	GTT	2	6	6722067	6722072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428302133
135005	NC_019751	A	6	6	6722078	6722083	100 %	0 %	0 %	0 %	428302133
135006	NC_019751	GTG	2	6	6722103	6722108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428302133
135007	NC_019751	CCA	2	6	6722328	6722333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135008	NC_019751	GGC	2	6	6722400	6722405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135009	NC_019751	T	7	7	6722521	6722527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135010	NC_019751	TTG	2	6	6722631	6722636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135011	NC_019751	T	9	9	6722693	6722701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135012	NC_019751	GCA	2	6	6722719	6722724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135013	NC_019751	CATCAA	2	12	6722742	6722753	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428302134
135014	NC_019751	CAT	2	6	6722865	6722870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428302134
135015	NC_019751	TAA	2	6	6722922	6722927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428302134
135016	NC_019751	CCA	2	6	6722953	6722958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428302134
135017	NC_019751	TGC	2	6	6722982	6722987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428302134
135018	NC_019751	ATTGA	2	10	6723006	6723015	40 %	40 %	20 %	0 %	428302134
135019	NC_019751	AAT	2	6	6723058	6723063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135020	NC_019751	AG	3	6	6723436	6723441	50 %	0 %	50 %	0 %	428302135
135021	NC_019751	GA	3	6	6723565	6723570	50 %	0 %	50 %	0 %	428302135
135022	NC_019751	ATT	2	6	6723611	6723616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428302135
135023	NC_019751	TGA	2	6	6723662	6723667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428302135
135024	NC_019751	T	6	6	6723760	6723765	0 %	100 %	0 %	0 %	428302135
135025	NC_019751	GAGTTA	2	12	6723825	6723836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428302135
135026	NC_019751	CAG	2	6	6723866	6723871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428302135
135027	NC_019751	CAA	2	6	6723911	6723916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428302135
135028	NC_019751	CGT	2	6	6723930	6723935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428302135
135029	NC_019751	CTC	2	6	6724031	6724036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135030	NC_019751	TTAA	2	8	6724051	6724058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135031	NC_019751	T	6	6	6724157	6724162	0 %	100 %	0 %	0 %	428302136
135032	NC_019751	T	6	6	6724174	6724179	0 %	100 %	0 %	0 %	428302136
135033	NC_019751	ATTA	2	8	6724368	6724375	50 %	50 %	0 %	0 %	428302136
135034	NC_019751	AAC	2	6	6724382	6724387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428302136
135035	NC_019751	TACTT	2	10	6724431	6724440	20 %	60 %	0 %	20 %	428302136
135036	NC_019751	ATG	2	6	6724469	6724474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428302136
135037	NC_019751	AGG	2	6	6724506	6724511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428302136
135038	NC_019751	GAA	2	6	6724555	6724560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428302136
135039	NC_019751	CTA	2	6	6724562	6724567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428302136
135040	NC_019751	CCA	2	6	6724568	6724573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428302136
135041	NC_019751	CAC	2	6	6724577	6724582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428302136
135042	NC_019751	CAC	2	6	6724586	6724591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428302136
135043	NC_019751	AGTTCC	2	12	6724740	6724751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428302136
135044	NC_019751	GTGAA	2	10	6724800	6724809	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135045	NC_019751	TAAATT	2	12	6724881	6724892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135046	NC_019751	ATA	2	6	6724912	6724917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135047	NC_019751	T	7	7	6724974	6724980	0 %	100 %	0 %	0 %	428302137
135048	NC_019751	TTA	2	6	6724982	6724987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428302137
135049	NC_019751	GCT	2	6	6725041	6725046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428302137
135050	NC_019751	TATCA	2	10	6725055	6725064	40 %	40 %	0 %	20 %	428302137
135051	NC_019751	TTAG	2	8	6725068	6725075	25 %	50 %	25 %	0 %	428302137
135052	NC_019751	ATT	2	6	6725079	6725084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428302137
135053	NC_019751	CTT	2	6	6725180	6725185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428302137
135054	NC_019751	TGT	2	6	6725250	6725255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428302137
135055	NC_019751	AGGA	2	8	6725310	6725317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135056	NC_019751	AGA	2	6	6725335	6725340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135057	NC_019751	TCA	2	6	6725363	6725368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135058	NC_019751	TTA	2	6	6725439	6725444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135059	NC_019751	TCA	2	6	6725480	6725485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135060	NC_019751	TTG	2	6	6725545	6725550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428302138
135061	NC_019751	T	6	6	6725566	6725571	0 %	100 %	0 %	0 %	428302138
135062	NC_019751	CTG	2	6	6725577	6725582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428302138
135063	NC_019751	CAC	2	6	6725599	6725604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428302138
135064	NC_019751	CTAA	2	8	6725696	6725703	50 %	25 %	0 %	25 %	428302138
135065	NC_019751	CAT	2	6	6725706	6725711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428302138
135066	NC_019751	GCT	2	6	6725715	6725720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428302138
135067	NC_019751	AGC	2	6	6725746	6725751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428302138
135068	NC_019751	AATCA	2	10	6725881	6725890	60 %	20 %	0 %	20 %	428302138
135069	NC_019751	GACA	2	8	6725893	6725900	50 %	0 %	25 %	25 %	428302138
135070	NC_019751	TGC	2	6	6725905	6725910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428302138
135071	NC_019751	CTT	2	6	6725931	6725936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428302138
135072	NC_019751	T	6	6	6725943	6725948	0 %	100 %	0 %	0 %	428302138
135073	NC_019751	GCT	2	6	6725988	6725993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428302138
135074	NC_019751	GTAA	2	8	6726070	6726077	50 %	25 %	25 %	0 %	428302138
135075	NC_019751	CCA	2	6	6726108	6726113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428302138
135076	NC_019751	CGG	2	6	6726131	6726136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428302138
135077	NC_019751	T	6	6	6726179	6726184	0 %	100 %	0 %	0 %	428302138
135078	NC_019751	TC	3	6	6726244	6726249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135079	NC_019751	AAT	2	6	6726318	6726323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135080	NC_019751	CTT	2	6	6726326	6726331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135081	NC_019751	ACT	2	6	6726410	6726415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135082	NC_019751	CAA	2	6	6726419	6726424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135083	NC_019751	CAT	2	6	6726430	6726435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135084	NC_019751	AAT	2	6	6726440	6726445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135085	NC_019751	TAT	2	6	6726450	6726455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428302139
135086	NC_019751	CTC	2	6	6726462	6726467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428302139
135087	NC_019751	ATA	2	6	6726509	6726514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428302139
135088	NC_019751	GCAA	2	8	6726515	6726522	50 %	0 %	25 %	25 %	428302139
135089	NC_019751	ATT	2	6	6726579	6726584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428302139
135090	NC_019751	CTTT	2	8	6726602	6726609	0 %	75 %	0 %	25 %	428302139
135091	NC_019751	TAT	2	6	6726657	6726662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428302139
135092	NC_019751	AGGT	2	8	6726674	6726681	25 %	25 %	50 %	0 %	428302139
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135094	NC_019751	A	6	6	6726768	6726773	100 %	0 %	0 %	0 %	428302139
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135097	NC_019751	ACATC	2	10	6726835	6726844	40 %	20 %	0 %	40 %	428302139
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135099	NC_019751	CT	3	6	6727048	6727053	0 %	50 %	0 %	50 %	428302139
135100	NC_019751	TAA	2	6	6727071	6727076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135101	NC_019751	GCA	2	6	6727092	6727097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135102	NC_019751	ACT	2	6	6727180	6727185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135103	NC_019751	TCAA	2	8	6727191	6727198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135104	NC_019751	AAT	2	6	6727208	6727213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428302140
135105	NC_019751	CAT	2	6	6727274	6727279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428302140
135106	NC_019751	CAA	2	6	6727366	6727371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428302140
135107	NC_019751	ATG	2	6	6727427	6727432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428302140
135108	NC_019751	GAC	2	6	6727495	6727500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428302140
135109	NC_019751	AGTC	2	8	6727956	6727963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135110	NC_019751	GGT	2	6	6728144	6728149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428302141
135111	NC_019751	GATT	2	8	6728161	6728168	25 %	50 %	25 %	0 %	428302141
135112	NC_019751	TTGA	2	8	6728286	6728293	25 %	50 %	25 %	0 %	428302141
135113	NC_019751	AAGA	2	8	6728324	6728331	75 %	0 %	25 %	0 %	428302141
135114	NC_019751	TTC	2	6	6728362	6728367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428302141
135115	NC_019751	TGG	2	6	6728380	6728385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428302141
135116	NC_019751	TGC	2	6	6728410	6728415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428302141
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