MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 135923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019751	AT	3	6	25098	25103	50 %	50 %	0 %	0 %	428296802
502	NC_019751	TGA	2	6	25110	25115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296802
503	NC_019751	T	7	7	25158	25164	0 %	100 %	0 %	0 %	428296802
504	NC_019751	TTA	2	6	25189	25194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296802
505	NC_019751	TCA	2	6	25227	25232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296802
506	NC_019751	A	7	7	25234	25240	100 %	0 %	0 %	0 %	428296802
507	NC_019751	ATT	2	6	25273	25278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296802
508	NC_019751	CAA	2	6	25285	25290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296802
509	NC_019751	A	6	6	25294	25299	100 %	0 %	0 %	0 %	428296802
510	NC_019751	TTGA	2	8	25306	25313	25 %	50 %	25 %	0 %	428296802
511	NC_019751	CAC	2	6	25397	25402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296802
512	NC_019751	TG	3	6	25465	25470	0 %	50 %	50 %	0 %	428296802
513	NC_019751	AGC	2	6	25584	25589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296802
514	NC_019751	GAT	2	6	25618	25623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296802
515	NC_019751	AGG	2	6	25704	25709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428296802
516	NC_019751	G	6	6	25711	25716	0 %	0 %	100 %	0 %	428296802
517	NC_019751	TA	3	6	25751	25756	50 %	50 %	0 %	0 %	428296802
518	NC_019751	CAC	2	6	25769	25774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296802
519	NC_019751	AAT	2	6	25782	25787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296802
520	NC_019751	ATT	2	6	25805	25810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296802
521	NC_019751	A	6	6	25912	25917	100 %	0 %	0 %	0 %	428296802
522	NC_019751	A	6	6	25933	25938	100 %	0 %	0 %	0 %	428296802
523	NC_019751	AAG	2	6	25943	25948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296802
524	NC_019751	ATA	2	6	25979	25984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296802
525	NC_019751	AAC	2	6	26029	26034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296802
526	NC_019751	CTA	3	9	26078	26086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296802
527	NC_019751	GCTCAA	2	12	26137	26148	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428296802
528	NC_019751	GAT	2	6	26209	26214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296802
529	NC_019751	ATC	2	6	26251	26256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296802
530	NC_019751	AAT	2	6	26260	26265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296802
531	NC_019751	GAA	3	9	26275	26283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296802
532	NC_019751	ATT	2	6	26296	26301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296802
533	NC_019751	TAG	2	6	26400	26405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296802
534	NC_019751	AGT	2	6	26475	26480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296802
535	NC_019751	CAG	2	6	26498	26503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296802
536	NC_019751	TAAAT	2	10	26529	26538	60 %	40 %	0 %	0 %	428296802
537	NC_019751	GA	3	6	26568	26573	50 %	0 %	50 %	0 %	428296802
538	NC_019751	GAAG	2	8	26592	26599	50 %	0 %	50 %	0 %	428296802
539	NC_019751	GCAA	2	8	26631	26638	50 %	0 %	25 %	25 %	428296802
540	NC_019751	ATC	2	6	26644	26649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296802
541	NC_019751	AAC	2	6	26669	26674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296802
542	NC_019751	AAT	2	6	26776	26781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296802
543	NC_019751	AATT	2	8	26795	26802	50 %	50 %	0 %	0 %	428296802
544	NC_019751	GTT	2	6	26827	26832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296802
545	NC_019751	A	8	8	26933	26940	100 %	0 %	0 %	0 %	428296802
546	NC_019751	AAC	2	6	26958	26963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296802
547	NC_019751	ATG	2	6	26993	26998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296802
548	NC_019751	GCA	2	6	27024	27029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296802
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550	NC_019751	A	6	6	27081	27086	100 %	0 %	0 %	0 %	428296802
551	NC_019751	TTG	2	6	27095	27100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296802
552	NC_019751	CT	3	6	27290	27295	0 %	50 %	0 %	50 %	428296803
553	NC_019751	GCC	2	6	27353	27358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428296803
554	NC_019751	AGTA	2	8	27374	27381	50 %	25 %	25 %	0 %	428296803
555	NC_019751	A	6	6	27481	27486	100 %	0 %	0 %	0 %	428296803
556	NC_019751	TGT	2	6	27523	27528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296803
557	NC_019751	GGT	2	6	27554	27559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296803
558	NC_019751	CTG	2	6	27690	27695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296803
559	NC_019751	TTA	2	6	27763	27768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296803
560	NC_019751	CCAA	2	8	27857	27864	50 %	0 %	0 %	50 %	428296803
561	NC_019751	CA	3	6	27935	27940	50 %	0 %	0 %	50 %	428296803
562	NC_019751	TCA	2	6	27961	27966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296803
563	NC_019751	CAT	2	6	27986	27991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296803
564	NC_019751	A	6	6	27993	27998	100 %	0 %	0 %	0 %	428296803
565	NC_019751	TGC	2	6	28026	28031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296803
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568	NC_019751	AAGT	2	8	28147	28154	50 %	25 %	25 %	0 %	428296803
569	NC_019751	GATT	2	8	28200	28207	25 %	50 %	25 %	0 %	428296803
570	NC_019751	CTAA	2	8	28237	28244	50 %	25 %	0 %	25 %	428296803
571	NC_019751	CAC	2	6	28332	28337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296803
572	NC_019751	AAT	2	6	28350	28355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296803
573	NC_019751	TAT	2	6	28409	28414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296803
574	NC_019751	TTGT	2	8	28518	28525	0 %	75 %	25 %	0 %	428296803
575	NC_019751	AAG	2	6	28581	28586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296803
576	NC_019751	ATTT	2	8	28643	28650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_019751	TAG	2	6	28731	28736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296804
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580	NC_019751	TAAC	2	8	28866	28873	50 %	25 %	0 %	25 %	428296804
581	NC_019751	AGTATC	2	12	28981	28992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428296804
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584	NC_019751	AGCA	2	8	29121	29128	50 %	0 %	25 %	25 %	428296804
585	NC_019751	CCA	2	6	29133	29138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296804
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587	NC_019751	A	7	7	29230	29236	100 %	0 %	0 %	0 %	428296804
588	NC_019751	TGGGA	2	10	29259	29268	20 %	20 %	60 %	0 %	428296804
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591	NC_019751	CTG	2	6	29376	29381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296804
592	NC_019751	T	8	8	29456	29463	0 %	100 %	0 %	0 %	428296804
593	NC_019751	ATC	2	6	29575	29580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296804
594	NC_019751	ATC	2	6	29614	29619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296804
595	NC_019751	AAAG	2	8	29659	29666	75 %	0 %	25 %	0 %	428296804
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597	NC_019751	CAAG	2	8	29739	29746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_019751	GTC	2	6	29755	29760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_019751	AAT	2	6	29798	29803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_019751	AGTA	2	8	29914	29921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_019751	CAA	2	6	30180	30185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296805
602	NC_019751	CAG	2	6	30256	30261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296805
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604	NC_019751	TTTGG	2	10	30373	30382	0 %	60 %	40 %	0 %	428296805
605	NC_019751	TAC	2	6	30406	30411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296805
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608	NC_019751	ATG	2	6	30645	30650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296805
609	NC_019751	ATT	2	6	30701	30706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296805
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611	NC_019751	TGG	2	6	30843	30848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296805
612	NC_019751	CGT	2	6	30867	30872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296805
613	NC_019751	TTAT	2	8	30890	30897	25 %	75 %	0 %	0 %	428296805
614	NC_019751	TGG	2	6	31204	31209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296805
615	NC_019751	CTT	2	6	31310	31315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296806
616	NC_019751	AAT	2	6	31374	31379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296806
617	NC_019751	GGC	2	6	31388	31393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428296806
618	NC_019751	GAT	2	6	31524	31529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296806
619	NC_019751	T	7	7	31537	31543	0 %	100 %	0 %	0 %	428296806
620	NC_019751	CTG	2	6	31563	31568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296806
621	NC_019751	AAC	2	6	31623	31628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296806
622	NC_019751	AG	3	6	31650	31655	50 %	0 %	50 %	0 %	428296806
623	NC_019751	TGGT	2	8	31704	31711	0 %	50 %	50 %	0 %	428296806
624	NC_019751	ACC	2	6	31728	31733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296806
625	NC_019751	CGA	2	6	31813	31818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296806
626	NC_019751	TG	3	6	31905	31910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_019751	AT	3	6	31942	31947	50 %	50 %	0 %	0 %	428296807
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629	NC_019751	GAC	2	6	32003	32008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296807
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757	NC_019751	CT	3	6	37593	37598	0 %	50 %	0 %	50 %	428296814
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