MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 135923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019751	CTTA	2	8	248404	248411	25 %	50 %	0 %	25 %	428296981
5002	NC_019751	ATT	2	6	248533	248538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_019751	A	6	6	248546	248551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_019751	CA	3	6	248560	248565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_019751	T	8	8	248585	248592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_019751	AATT	2	8	248598	248605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_019751	TACA	2	8	248670	248677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_019751	TTC	2	6	248703	248708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_019751	ATT	2	6	248717	248722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_019751	ATG	2	6	248753	248758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_019751	T	9	9	248770	248778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_019751	GAT	2	6	248779	248784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_019751	TGC	2	6	248832	248837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_019751	TGT	2	6	248949	248954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_019751	GT	3	6	248953	248958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019751	ATA	3	9	249010	249018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019751	AAT	2	6	249033	249038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_019751	AGTG	2	8	249041	249048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_019751	A	9	9	249056	249064	100 %	0 %	0 %	0 %	428296982
5020	NC_019751	TGA	2	6	249073	249078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296982
5021	NC_019751	CTG	2	6	249102	249107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296982
5022	NC_019751	ATATT	2	10	249108	249117	40 %	60 %	0 %	0 %	428296982
5023	NC_019751	CAA	2	6	249122	249127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296982
5024	NC_019751	TTC	2	6	249276	249281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296982
5025	NC_019751	TCC	2	6	249346	249351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296982
5026	NC_019751	GAA	2	6	249407	249412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296982
5027	NC_019751	TCT	2	6	249472	249477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296983
5028	NC_019751	CA	4	8	249478	249485	50 %	0 %	0 %	50 %	428296983
5029	NC_019751	TGCT	2	8	249494	249501	0 %	50 %	25 %	25 %	428296983
5030	NC_019751	CCAA	2	8	249521	249528	50 %	0 %	0 %	50 %	428296983
5031	NC_019751	TCC	2	6	249595	249600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296983
5032	NC_019751	ATG	2	6	249614	249619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296983
5033	NC_019751	TCA	2	6	249669	249674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296983
5034	NC_019751	TCC	2	6	249773	249778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296983
5035	NC_019751	CAT	2	6	249865	249870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296983
5036	NC_019751	AAT	2	6	249896	249901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296983
5037	NC_019751	ATTA	2	8	249921	249928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_019751	A	7	7	249947	249953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_019751	TGC	2	6	249955	249960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_019751	TAG	2	6	249964	249969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_019751	A	8	8	250030	250037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_019751	TGT	2	6	250087	250092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_019751	AAG	2	6	250153	250158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296984
5044	NC_019751	TCG	2	6	250171	250176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296984
5045	NC_019751	TGT	2	6	250216	250221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296984
5046	NC_019751	TCC	2	6	250232	250237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428296984
5047	NC_019751	GAA	2	6	250265	250270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296984
5048	NC_019751	GAA	2	6	250325	250330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296984
5049	NC_019751	GAA	2	6	250373	250378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296984
5050	NC_019751	CAAA	2	8	250419	250426	75 %	0 %	0 %	25 %	428296984
5051	NC_019751	GAA	3	9	250490	250498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296984
5052	NC_019751	AAG	2	6	250521	250526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296984
5053	NC_019751	AGA	2	6	250552	250557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296984
5054	NC_019751	AAT	2	6	250558	250563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296984
5055	NC_019751	CGAAGA	2	12	250579	250590	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428296984
5056	NC_019751	GAA	3	9	250592	250600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296984
5057	NC_019751	A	8	8	250648	250655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_019751	CCA	2	6	250801	250806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296985
5059	NC_019751	AT	3	6	250820	250825	50 %	50 %	0 %	0 %	428296985
5060	NC_019751	TTAG	2	8	250876	250883	25 %	50 %	25 %	0 %	428296985
5061	NC_019751	CAA	2	6	250884	250889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296985
5062	NC_019751	AAAT	2	8	250892	250899	75 %	25 %	0 %	0 %	428296985
5063	NC_019751	ATTT	2	8	250937	250944	25 %	75 %	0 %	0 %	428296985
5064	NC_019751	TTC	2	6	251052	251057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296985
5065	NC_019751	TGTT	2	8	251181	251188	0 %	75 %	25 %	0 %	428296985
5066	NC_019751	GTT	2	6	251225	251230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296985
5067	NC_019751	T	7	7	251250	251256	0 %	100 %	0 %	0 %	428296985
5068	NC_019751	TTG	2	6	251259	251264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296985
5069	NC_019751	CACT	2	8	251382	251389	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_019751	ATG	2	6	251424	251429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_019751	TA	3	6	251555	251560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_019751	TGT	2	6	251630	251635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296986
5073	NC_019751	AGCT	2	8	251647	251654	25 %	25 %	25 %	25 %	428296986
5074	NC_019751	TCA	2	6	251657	251662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296986
5075	NC_019751	TTC	2	6	251678	251683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296986
5076	NC_019751	CTA	2	6	251724	251729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296986
5077	NC_019751	CTT	2	6	251763	251768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296986
5078	NC_019751	GCG	2	6	251774	251779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428296986
5079	NC_019751	TGC	2	6	251782	251787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296986
5080	NC_019751	GTT	2	6	251838	251843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296986
5081	NC_019751	CCA	2	6	251855	251860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428296986
5082	NC_019751	T	7	7	251866	251872	0 %	100 %	0 %	0 %	428296986
5083	NC_019751	CCTT	2	8	251906	251913	0 %	50 %	0 %	50 %	428296986
5084	NC_019751	TCT	2	6	251957	251962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296986
5085	NC_019751	TAA	2	6	252021	252026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_019751	ATA	2	6	252028	252033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_019751	GTTA	2	8	252049	252056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_019751	TAA	2	6	252072	252077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_019751	A	6	6	252107	252112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_019751	T	8	8	252115	252122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_019751	CCT	2	6	252232	252237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_019751	TAA	2	6	252254	252259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_019751	T	6	6	252314	252319	0 %	100 %	0 %	0 %	428296987
5094	NC_019751	TTCA	2	8	252334	252341	25 %	50 %	0 %	25 %	428296987
5095	NC_019751	TAT	2	6	252417	252422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428296987
5096	NC_019751	ACA	2	6	252444	252449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428296987
5097	NC_019751	ATA	2	6	252490	252495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296987
5098	NC_019751	ATAG	2	8	252535	252542	50 %	25 %	25 %	0 %	428296987
5099	NC_019751	AAT	2	6	252589	252594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296987
5100	NC_019751	TCA	2	6	252597	252602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296987
5101	NC_019751	TAATT	2	10	252616	252625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_019751	TTA	2	6	252645	252650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_019751	TAA	2	6	252693	252698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_019751	TC	3	6	252801	252806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_019751	ATC	2	6	252987	252992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296988
5106	NC_019751	T	6	6	252999	253004	0 %	100 %	0 %	0 %	428296988
5107	NC_019751	TTGC	2	8	253108	253115	0 %	50 %	25 %	25 %	428296988
5108	NC_019751	CTG	2	6	253145	253150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428296988
5109	NC_019751	CAT	2	6	253151	253156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296988
5110	NC_019751	GTA	2	6	253255	253260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428296988
5111	NC_019751	ATA	2	6	253265	253270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428296988
5112	NC_019751	GAA	2	6	253273	253278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296988
5113	NC_019751	AGTT	2	8	253362	253369	25 %	50 %	25 %	0 %	428296988
5114	NC_019751	TTC	2	6	253523	253528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428296989
5115	NC_019751	TC	3	6	253527	253532	0 %	50 %	0 %	50 %	428296989
5116	NC_019751	TACC	2	8	253565	253572	25 %	25 %	0 %	50 %	428296989
5117	NC_019751	TTG	2	6	253614	253619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296989
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5119	NC_019751	TGG	2	6	253667	253672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428296989
5120	NC_019751	TTTGA	2	10	253698	253707	20 %	60 %	20 %	0 %	428296989
5121	NC_019751	CAT	2	6	253775	253780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296989
5122	NC_019751	A	6	6	253792	253797	100 %	0 %	0 %	0 %	428296989
5123	NC_019751	CT	3	6	253839	253844	0 %	50 %	0 %	50 %	428296989
5124	NC_019751	CAG	2	6	253856	253861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428296989
5125	NC_019751	GTT	2	6	253913	253918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296989
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5127	NC_019751	GAA	2	6	253965	253970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428296989
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5144	NC_019751	GTG	2	6	254722	254727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5226	NC_019751	ATGA	2	8	258838	258845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5227	NC_019751	ATA	2	6	258853	258858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5228	NC_019751	ACC	2	6	258878	258883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5230	NC_019751	ATT	2	6	258972	258977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_019751	GTT	2	6	259823	259828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428296995
5254	NC_019751	TG	3	6	259865	259870	0 %	50 %	50 %	0 %	428296995
5255	NC_019751	CAT	2	6	259889	259894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428296995
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5272	NC_019751	AGA	2	6	260694	260699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5273	NC_019751	CTT	2	6	260716	260721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5274	NC_019751	CTT	2	6	260737	260742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5282	NC_019751	TGA	2	6	260930	260935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5284	NC_019751	T	6	6	261039	261044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5303	NC_019751	ATTG	2	8	261916	261923	25 %	50 %	25 %	0 %	428296996
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5345	NC_019751	TGCGCT	2	12	264041	264052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5353	NC_019751	TCAA	2	8	264365	264372	50 %	25 %	0 %	25 %	428296999
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5372	NC_019751	TA	3	6	265415	265420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_019751	CT	3	6	265459	265464	0 %	50 %	0 %	50 %	428297000
5374	NC_019751	TGG	2	6	265515	265520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428297000
5375	NC_019751	TAA	2	6	265527	265532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428297000
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5495	NC_019751	GAAA	2	8	270554	270561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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