MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019744	CA	3	6	11	16	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019744	TC	3	6	53	58	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019744	AT	3	6	277	282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019744	TC	3	6	2235	2240	0 %	50 %	0 %	50 %	434389958
5	NC_019744	TA	3	6	3477	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019744	GT	3	6	5094	5099	0 %	50 %	50 %	0 %	434389959
7	NC_019744	TC	4	8	6255	6262	0 %	50 %	0 %	50 %	434389961
8	NC_019744	TA	3	6	6440	6445	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
9	NC_019744	AT	3	6	7556	7561	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
10	NC_019744	GT	3	6	7671	7676	0 %	50 %	50 %	0 %	434389961
11	NC_019744	AG	3	6	8022	8027	50 %	0 %	50 %	0 %	434389961
12	NC_019744	AT	4	8	8096	8103	50 %	50 %	0 %	0 %	434389961
13	NC_019744	AC	3	6	9778	9783	50 %	0 %	0 %	50 %	434389963
14	NC_019744	CT	3	6	10554	10559	0 %	50 %	0 %	50 %	434389963
15	NC_019744	TC	3	6	11649	11654	0 %	50 %	0 %	50 %	434389964
16	NC_019744	TG	3	6	15757	15762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019744	AG	3	6	16018	16023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019744	TA	3	6	16144	16149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019744	GA	3	6	17078	17083	50 %	0 %	50 %	0 %	434389969
20	NC_019744	TC	3	6	17727	17732	0 %	50 %	0 %	50 %	434389969
21	NC_019744	GA	3	6	17854	17859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019744	AT	3	6	18966	18971	50 %	50 %	0 %	0 %	434389972
23	NC_019744	AT	3	6	21525	21530	50 %	50 %	0 %	0 %	434389973
24	NC_019744	GA	3	6	22344	22349	50 %	0 %	50 %	0 %	434389974
25	NC_019744	CT	3	6	22802	22807	0 %	50 %	0 %	50 %	434389974
26	NC_019744	TC	3	6	23320	23325	0 %	50 %	0 %	50 %	434389974
27	NC_019744	AC	3	6	24041	24046	50 %	0 %	0 %	50 %	434389974
28	NC_019744	CT	3	6	25896	25901	0 %	50 %	0 %	50 %	434389974
29	NC_019744	CA	3	6	26396	26401	50 %	0 %	0 %	50 %	434389974
30	NC_019744	GA	3	6	26837	26842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019744	TC	3	6	27245	27250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019744	AG	3	6	27813	27818	50 %	0 %	50 %	0 %	434389975
33	NC_019744	CG	3	6	29824	29829	0 %	0 %	50 %	50 %	434389977
34	NC_019744	GC	3	6	30301	30306	0 %	0 %	50 %	50 %	434389977
35	NC_019744	CG	3	6	31570	31575	0 %	0 %	50 %	50 %	434389978
36	NC_019744	AT	3	6	32013	32018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019744	GA	3	6	32057	32062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019744	AT	3	6	32510	32515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019744	CA	3	6	33907	33912	50 %	0 %	0 %	50 %	434389981
40	NC_019744	CA	3	6	36171	36176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019744	TA	3	6	36209	36214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019744	TC	3	6	37249	37254	0 %	50 %	0 %	50 %	434389984
43	NC_019744	CG	3	6	38117	38122	0 %	0 %	50 %	50 %	434389984
44	NC_019744	AT	3	6	39262	39267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019744	GA	3	6	39482	39487	50 %	0 %	50 %	0 %	434389986
46	NC_019744	GA	3	6	39725	39730	50 %	0 %	50 %	0 %	434389986
47	NC_019744	AC	3	6	40081	40086	50 %	0 %	0 %	50 %	434389987
48	NC_019744	TA	4	8	41082	41089	50 %	50 %	0 %	0 %	434389987
49	NC_019744	AT	4	8	42042	42049	50 %	50 %	0 %	0 %	434389987
50	NC_019744	AT	3	6	42214	42219	50 %	50 %	0 %	0 %	434389987
51	NC_019744	AG	3	6	43307	43312	50 %	0 %	50 %	0 %	434389987
52	NC_019744	TC	3	6	43809	43814	0 %	50 %	0 %	50 %	434389987
53	NC_019744	AC	3	6	46113	46118	50 %	0 %	0 %	50 %	434389987
54	NC_019744	AC	3	6	46155	46160	50 %	0 %	0 %	50 %	434389987
55	NC_019744	CT	3	6	47716	47721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019744	GA	3	6	48466	48471	50 %	0 %	50 %	0 %	434389989
57	NC_019744	TC	3	6	48523	48528	0 %	50 %	0 %	50 %	434389989
58	NC_019744	AT	3	6	48906	48911	50 %	50 %	0 %	0 %	434389989
59	NC_019744	AT	3	6	50192	50197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019744	GT	3	6	50633	50638	0 %	50 %	50 %	0 %	434389991
61	NC_019744	AC	3	6	50719	50724	50 %	0 %	0 %	50 %	434389991
62	NC_019744	GA	4	8	50789	50796	50 %	0 %	50 %	0 %	434389991
63	NC_019744	CT	3	6	50844	50849	0 %	50 %	0 %	50 %	434389991
64	NC_019744	CG	3	6	51471	51476	0 %	0 %	50 %	50 %	434389992
65	NC_019744	AT	3	6	53474	53479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019744	AG	3	6	54924	54929	50 %	0 %	50 %	0 %	434389994
67	NC_019744	TA	3	6	55871	55876	50 %	50 %	0 %	0 %	434389996
68	NC_019744	TC	3	6	56071	56076	0 %	50 %	0 %	50 %	434389996
69	NC_019744	AT	3	6	57296	57301	50 %	50 %	0 %	0 %	434389997
70	NC_019744	GT	4	8	58957	58964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019744	TC	3	6	61946	61951	0 %	50 %	0 %	50 %	434389999
72	NC_019744	TG	3	6	64221	64226	0 %	50 %	50 %	0 %	434389999
73	NC_019744	CT	3	6	66060	66065	0 %	50 %	0 %	50 %	434390000
74	NC_019744	TA	3	6	66747	66752	50 %	50 %	0 %	0 %	434390001
75	NC_019744	GT	3	6	68359	68364	0 %	50 %	50 %	0 %	434390003
76	NC_019744	CA	3	6	69455	69460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019744	TC	3	6	69610	69615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019744	GA	3	6	69886	69891	50 %	0 %	50 %	0 %	434390004
79	NC_019744	AT	3	6	69958	69963	50 %	50 %	0 %	0 %	434390004
80	NC_019744	GT	3	6	71673	71678	0 %	50 %	50 %	0 %	434390006
81	NC_019744	TG	3	6	73708	73713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019744	AT	3	6	74120	74125	50 %	50 %	0 %	0 %	434390008
83	NC_019744	TG	3	6	74235	74240	0 %	50 %	50 %	0 %	434390008
84	NC_019744	TG	3	6	74326	74331	0 %	50 %	50 %	0 %	434390008
85	NC_019744	GT	4	8	74419	74426	0 %	50 %	50 %	0 %	434390008
86	NC_019744	AT	3	6	75379	75384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019744	GA	3	6	76563	76568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019744	CA	3	6	76866	76871	50 %	0 %	0 %	50 %	434390010
89	NC_019744	AT	3	6	77305	77310	50 %	50 %	0 %	0 %	434390010
90	NC_019744	CT	3	6	78148	78153	0 %	50 %	0 %	50 %	434390010
91	NC_019744	TG	3	6	78248	78253	0 %	50 %	50 %	0 %	434390010
92	NC_019744	TC	3	6	79193	79198	0 %	50 %	0 %	50 %	434390010
93	NC_019744	AT	3	6	81999	82004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019744	AG	3	6	83020	83025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019744	AG	3	6	84181	84186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019744	GA	3	6	84331	84336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019744	CT	3	6	84357	84362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019744	TA	3	6	87536	87541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019744	AC	3	6	88837	88842	50 %	0 %	0 %	50 %	434390019
100	NC_019744	GA	3	6	91020	91025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019744	TA	3	6	91269	91274	50 %	50 %	0 %	0 %	434390021
102	NC_019744	GA	3	6	91295	91300	50 %	0 %	50 %	0 %	434390021
103	NC_019744	AG	3	6	91568	91573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019744	TC	4	8	92032	92039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019744	GA	3	6	92162	92167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019744	CG	3	6	93578	93583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019744	AT	3	6	93996	94001	50 %	50 %	0 %	0 %	434390022
108	NC_019744	TG	3	6	95701	95706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019744	GA	3	6	96064	96069	50 %	0 %	50 %	0 %	434390025
110	NC_019744	TC	3	6	96213	96218	0 %	50 %	0 %	50 %	434390025
111	NC_019744	AT	3	6	96893	96898	50 %	50 %	0 %	0 %	434390025
112	NC_019744	AG	4	8	97238	97245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019744	TA	3	6	97394	97399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019744	TG	3	6	97919	97924	0 %	50 %	50 %	0 %	434390026
115	NC_019744	TG	3	6	99504	99509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019744	TG	3	6	100569	100574	0 %	50 %	50 %	0 %	434390029
117	NC_019744	GA	3	6	100783	100788	50 %	0 %	50 %	0 %	434390029
118	NC_019744	AC	3	6	101527	101532	50 %	0 %	0 %	50 %	434390029
119	NC_019744	AC	3	6	102531	102536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019744	AT	3	6	102620	102625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019744	CA	3	6	102733	102738	50 %	0 %	0 %	50 %	434390031
122	NC_019744	TA	3	6	103446	103451	50 %	50 %	0 %	0 %	434390031
123	NC_019744	AG	3	6	104284	104289	50 %	0 %	50 %	0 %	434390033
124	NC_019744	TC	3	6	106221	106226	0 %	50 %	0 %	50 %	434390034
125	NC_019744	CA	3	6	106346	106351	50 %	0 %	0 %	50 %	434390034
126	NC_019744	CA	3	6	107890	107895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019744	TG	3	6	108054	108059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019744	CT	3	6	109100	109105	0 %	50 %	0 %	50 %	434390035
129	NC_019744	AG	3	6	110016	110021	50 %	0 %	50 %	0 %	434390037
130	NC_019744	CA	3	6	112632	112637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019744	CG	3	6	113187	113192	0 %	0 %	50 %	50 %	434390039
132	NC_019744	CG	3	6	113230	113235	0 %	0 %	50 %	50 %	434390039
133	NC_019744	CG	3	6	113287	113292	0 %	0 %	50 %	50 %	434390039
134	NC_019744	TG	3	6	113367	113372	0 %	50 %	50 %	0 %	434390039
135	NC_019744	GA	3	6	113624	113629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019744	AT	4	8	113916	113923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019744	GA	4	8	114591	114598	50 %	0 %	50 %	0 %	434390040
138	NC_019744	TA	3	6	115600	115605	50 %	50 %	0 %	0 %	434390041
139	NC_019744	AT	3	6	116626	116631	50 %	50 %	0 %	0 %	434390041
140	NC_019744	AG	3	6	118286	118291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019744	AT	3	6	119434	119439	50 %	50 %	0 %	0 %	434390044
142	NC_019744	GA	3	6	119553	119558	50 %	0 %	50 %	0 %	434390044
143	NC_019744	TG	3	6	120784	120789	0 %	50 %	50 %	0 %	434390044
144	NC_019744	CA	3	6	122308	122313	50 %	0 %	0 %	50 %	434390047
145	NC_019744	AT	3	6	122455	122460	50 %	50 %	0 %	0 %	434390047
146	NC_019744	GC	3	6	122668	122673	0 %	0 %	50 %	50 %	434390047
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.