MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 3111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019744	TGGGGA	2	12	123307	123318	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	434390048
2502	NC_019744	TGG	2	6	123322	123327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390048
2503	NC_019744	TAA	2	6	123339	123344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390048
2504	NC_019744	CAA	2	6	123415	123420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390048
2505	NC_019744	AAAG	2	8	123443	123450	75 %	0 %	25 %	0 %	434390048
2506	NC_019744	ATT	2	6	123475	123480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390048
2507	NC_019744	TTC	2	6	123506	123511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390049
2508	NC_019744	TGC	2	6	123617	123622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390049
2509	NC_019744	GCAG	2	8	123642	123649	25 %	0 %	50 %	25 %	434390049
2510	NC_019744	AAATT	2	10	123694	123703	60 %	40 %	0 %	0 %	434390049
2511	NC_019744	TTC	2	6	123728	123733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390049
2512	NC_019744	ATGACC	2	12	123838	123849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434390049
2513	NC_019744	GTA	2	6	123883	123888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2514	NC_019744	TGA	2	6	123890	123895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2515	NC_019744	CTA	2	6	123903	123908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390049
2516	NC_019744	AAAT	2	8	123962	123969	75 %	25 %	0 %	0 %	434390049
2517	NC_019744	AATC	2	8	124114	124121	50 %	25 %	0 %	25 %	434390049
2518	NC_019744	AAT	2	6	124170	124175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390049
2519	NC_019744	GAT	3	9	124284	124292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2520	NC_019744	GAA	2	6	124302	124307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390049
2521	NC_019744	T	6	6	124364	124369	0 %	100 %	0 %	0 %	434390049
2522	NC_019744	CTG	2	6	124603	124608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390049
2523	NC_019744	GCA	2	6	124659	124664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390049
2524	NC_019744	AGT	2	6	124706	124711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2525	NC_019744	GCT	2	6	124771	124776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390049
2526	NC_019744	TCCG	2	8	124780	124787	0 %	25 %	25 %	50 %	434390049
2527	NC_019744	TGT	2	6	124790	124795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390049
2528	NC_019744	AGT	2	6	124899	124904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2529	NC_019744	TGA	2	6	124973	124978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2530	NC_019744	ACA	2	6	125008	125013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390049
2531	NC_019744	TGG	2	6	125065	125070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390049
2532	NC_019744	ACTC	2	8	125078	125085	25 %	25 %	0 %	50 %	434390049
2533	NC_019744	ATC	2	6	125376	125381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390049
2534	NC_019744	T	6	6	125400	125405	0 %	100 %	0 %	0 %	434390049
2535	NC_019744	GAT	2	6	125409	125414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2536	NC_019744	AAC	2	6	125557	125562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390049
2537	NC_019744	TAG	2	6	125609	125614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2538	NC_019744	TC	4	8	125685	125692	0 %	50 %	0 %	50 %	434390049
2539	NC_019744	GCA	2	6	125706	125711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390049
2540	NC_019744	CGG	2	6	125917	125922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434390049
2541	NC_019744	ACT	2	6	125943	125948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390049
2542	NC_019744	AGT	2	6	125970	125975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2543	NC_019744	ATT	2	6	126018	126023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390049
2544	NC_019744	A	6	6	126054	126059	100 %	0 %	0 %	0 %	434390049
2545	NC_019744	GAT	2	6	126087	126092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2546	NC_019744	TTA	2	6	126116	126121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390049
2547	NC_019744	GCT	2	6	126141	126146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390049
2548	NC_019744	TAA	2	6	126152	126157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390049
2549	NC_019744	GAT	2	6	126251	126256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390049
2550	NC_019744	GAA	2	6	126264	126269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390049
2551	NC_019744	AGG	2	6	126277	126282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434390049
2552	NC_019744	A	7	7	126385	126391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_019744	AG	3	6	126403	126408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_019744	AT	3	6	126410	126415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_019744	AGC	2	6	126473	126478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390050
2556	NC_019744	AGG	2	6	126515	126520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434390050
2557	NC_019744	TTC	2	6	126534	126539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390050
2558	NC_019744	GAA	2	6	126597	126602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390050
2559	NC_019744	AGC	2	6	126641	126646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390050
2560	NC_019744	CAG	2	6	126688	126693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390050
2561	NC_019744	AGG	2	6	126728	126733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434390050
2562	NC_019744	AGC	2	6	126737	126742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390050
2563	NC_019744	TAT	2	6	126755	126760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390050
2564	NC_019744	AAC	2	6	126781	126786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390050
2565	NC_019744	CAG	2	6	126840	126845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390050
2566	NC_019744	CAA	2	6	126872	126877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390050
2567	NC_019744	CAG	2	6	126894	126899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390050
2568	NC_019744	CGC	2	6	126953	126958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434390050
2569	NC_019744	GTAC	2	8	126993	127000	25 %	25 %	25 %	25 %	434390050
2570	NC_019744	ATG	2	6	127021	127026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390050
2571	NC_019744	CAA	2	6	127029	127034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390050
2572	NC_019744	TCAA	2	8	127048	127055	50 %	25 %	0 %	25 %	434390050
2573	NC_019744	AGA	2	6	127089	127094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390050
2574	NC_019744	T	7	7	127266	127272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_019744	CTTTT	2	10	127276	127285	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2576	NC_019744	T	6	6	127282	127287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_019744	CGC	2	6	127327	127332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2578	NC_019744	AT	3	6	127363	127368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_019744	TACA	2	8	127407	127414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2580	NC_019744	ATT	2	6	127434	127439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_019744	TGA	2	6	127493	127498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_019744	A	6	6	127597	127602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_019744	TCC	2	6	127672	127677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_019744	TACC	2	8	127688	127695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2585	NC_019744	AGC	2	6	127728	127733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390051
2586	NC_019744	TAA	2	6	127734	127739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390051
2587	NC_019744	CTG	2	6	127772	127777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390051
2588	NC_019744	CAA	2	6	127816	127821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390051
2589	NC_019744	GAA	2	6	127930	127935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390051
2590	NC_019744	AATT	2	8	127952	127959	50 %	50 %	0 %	0 %	434390051
2591	NC_019744	TTC	2	6	127979	127984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390051
2592	NC_019744	CT	3	6	127998	128003	0 %	50 %	0 %	50 %	434390051
2593	NC_019744	AT	3	6	128034	128039	50 %	50 %	0 %	0 %	434390051
2594	NC_019744	AAC	2	6	128050	128055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434390051
2595	NC_019744	TA	3	6	128056	128061	50 %	50 %	0 %	0 %	434390051
2596	NC_019744	CAG	2	6	128072	128077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390051
2597	NC_019744	AGC	2	6	128094	128099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390051
2598	NC_019744	AGCA	2	8	128105	128112	50 %	0 %	25 %	25 %	434390051
2599	NC_019744	AGC	2	6	128121	128126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390051
2600	NC_019744	GGTA	2	8	128139	128146	25 %	25 %	50 %	0 %	434390051
2601	NC_019744	TTC	2	6	128166	128171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434390051
2602	NC_019744	GAA	2	6	128185	128190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434390051
2603	NC_019744	CAAG	2	8	128209	128216	50 %	0 %	25 %	25 %	434390051
2604	NC_019744	GGT	2	6	128263	128268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390051
2605	NC_019744	GCA	2	6	128281	128286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390051
2606	NC_019744	AGC	2	6	128325	128330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390051
2607	NC_019744	CCG	2	6	128393	128398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434390051
2608	NC_019744	TTA	2	6	128423	128428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390051
2609	NC_019744	CTA	2	6	128434	128439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434390051
2610	NC_019744	AAT	2	6	128449	128454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434390051
2611	NC_019744	GTA	2	6	128540	128545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434390051
2612	NC_019744	TTG	2	6	128552	128557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390051
2613	NC_019744	T	6	6	128572	128577	0 %	100 %	0 %	0 %	434390051
2614	NC_019744	CTTT	2	8	128596	128603	0 %	75 %	0 %	25 %	434390051
2615	NC_019744	ATT	2	6	128608	128613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434390051
2616	NC_019744	TGC	2	6	128715	128720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434390051
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2618	NC_019744	TGG	2	6	128775	128780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434390051
2619	NC_019744	CAG	2	6	128789	128794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434390051
2620	NC_019744	TTG	2	6	128963	128968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434390052
2621	NC_019744	TC	3	6	128975	128980	0 %	50 %	0 %	50 %	434390052
2622	NC_019744	ACC	2	6	129054	129059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434390052
2623	NC_019744	CAAT	2	8	129089	129096	50 %	25 %	0 %	25 %	434390052
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2993	NC_019744	GAC	2	6	148482	148487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2994	NC_019744	CAC	2	6	148555	148560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2995	NC_019744	TTC	2	6	148608	148613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2996	NC_019744	C	6	6	148613	148618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2997	NC_019744	TTA	2	6	148639	148644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_019744	GTC	2	6	148662	148667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2999	NC_019744	GAG	2	6	148709	148714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_019744	ACC	2	6	148732	148737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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