MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 3111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019744	CACC	2	8	23279	23286	25 %	0 %	0 %	75 %	434389974
502	NC_019744	TC	3	6	23320	23325	0 %	50 %	0 %	50 %	434389974
503	NC_019744	AGA	2	6	23384	23389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389974
504	NC_019744	CAA	2	6	23395	23400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389974
505	NC_019744	TCT	2	6	23420	23425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389974
506	NC_019744	AAG	2	6	23495	23500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389974
507	NC_019744	TGC	2	6	23505	23510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389974
508	NC_019744	A	6	6	23520	23525	100 %	0 %	0 %	0 %	434389974
509	NC_019744	AGA	2	6	23577	23582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389974
510	NC_019744	TGCC	2	8	23592	23599	0 %	25 %	25 %	50 %	434389974
511	NC_019744	ATTG	2	8	23614	23621	25 %	50 %	25 %	0 %	434389974
512	NC_019744	AAG	2	6	23662	23667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389974
513	NC_019744	AGG	2	6	23793	23798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389974
514	NC_019744	ATT	2	6	23890	23895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389974
515	NC_019744	AGA	2	6	23943	23948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389974
516	NC_019744	CTA	2	6	24033	24038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389974
517	NC_019744	AC	3	6	24041	24046	50 %	0 %	0 %	50 %	434389974
518	NC_019744	GTA	2	6	24101	24106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389974
519	NC_019744	AGA	2	6	24159	24164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389974
520	NC_019744	CCTT	2	8	24173	24180	0 %	50 %	0 %	50 %	434389974
521	NC_019744	ATG	2	6	24185	24190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389974
522	NC_019744	TGC	2	6	24219	24224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389974
523	NC_019744	CAT	2	6	24225	24230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389974
524	NC_019744	TAA	2	6	24255	24260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389974
525	NC_019744	TAG	2	6	24269	24274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389974
526	NC_019744	AAGC	2	8	24302	24309	50 %	0 %	25 %	25 %	434389974
527	NC_019744	TTA	2	6	24337	24342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389974
528	NC_019744	CTG	2	6	24383	24388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389974
529	NC_019744	TTC	2	6	24436	24441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389974
530	NC_019744	AAGAAA	2	12	24485	24496	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434389974
531	NC_019744	CAC	2	6	24537	24542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389974
532	NC_019744	AAG	2	6	24586	24591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389974
533	NC_019744	TATC	2	8	24683	24690	25 %	50 %	0 %	25 %	434389974
534	NC_019744	ACA	2	6	24704	24709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389974
535	NC_019744	CAA	2	6	24723	24728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389974
536	NC_019744	ATT	2	6	24864	24869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389974
537	NC_019744	ACCT	2	8	24954	24961	25 %	25 %	0 %	50 %	434389974
538	NC_019744	CTG	2	6	24965	24970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389974
539	NC_019744	TTG	2	6	25058	25063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389974
540	NC_019744	CAAA	2	8	25069	25076	75 %	0 %	0 %	25 %	434389974
541	NC_019744	ATA	2	6	25223	25228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389974
542	NC_019744	GAC	2	6	25239	25244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389974
543	NC_019744	GCT	2	6	25258	25263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389974
544	NC_019744	TTG	2	6	25276	25281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389974
545	NC_019744	ACT	3	9	25354	25362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389974
546	NC_019744	TGC	2	6	25442	25447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389974
547	NC_019744	TAA	2	6	25497	25502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389974
548	NC_019744	CTG	2	6	25555	25560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389974
549	NC_019744	ACC	2	6	25622	25627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389974
550	NC_019744	CTGAC	2	10	25649	25658	20 %	20 %	20 %	40 %	434389974
551	NC_019744	GGGAG	2	10	25664	25673	20 %	0 %	80 %	0 %	434389974
552	NC_019744	CAGG	2	8	25680	25687	25 %	0 %	50 %	25 %	434389974
553	NC_019744	TTTG	2	8	25720	25727	0 %	75 %	25 %	0 %	434389974
554	NC_019744	CT	3	6	25896	25901	0 %	50 %	0 %	50 %	434389974
555	NC_019744	GAG	2	6	25909	25914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389974
556	NC_019744	GAGT	2	8	25926	25933	25 %	25 %	50 %	0 %	434389974
557	NC_019744	CAA	2	6	25951	25956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389974
558	NC_019744	GCA	2	6	25971	25976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389974
559	NC_019744	ATAG	2	8	25996	26003	50 %	25 %	25 %	0 %	434389974
560	NC_019744	CAA	2	6	26143	26148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389974
561	NC_019744	A	7	7	26147	26153	100 %	0 %	0 %	0 %	434389974
562	NC_019744	TGC	2	6	26172	26177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389974
563	NC_019744	AAG	2	6	26378	26383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389974
564	NC_019744	CA	3	6	26396	26401	50 %	0 %	0 %	50 %	434389974
565	NC_019744	AGAA	2	8	26451	26458	75 %	0 %	25 %	0 %	434389974
566	NC_019744	TGA	2	6	26460	26465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389974
567	NC_019744	GGC	2	6	26514	26519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389974
568	NC_019744	ATG	2	6	26546	26551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389974
569	NC_019744	GAT	2	6	26572	26577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389974
570	NC_019744	GAT	2	6	26587	26592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389974
571	NC_019744	ATGTT	2	10	26610	26619	20 %	60 %	20 %	0 %	434389974
572	NC_019744	CAC	2	6	26697	26702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389974
573	NC_019744	TAAG	2	8	26774	26781	50 %	25 %	25 %	0 %	434389974
574	NC_019744	AAG	2	6	26812	26817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019744	GA	3	6	26837	26842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_019744	CCA	2	6	26973	26978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_019744	ATG	2	6	27079	27084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_019744	AATC	2	8	27127	27134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_019744	AAC	2	6	27150	27155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_019744	TGC	2	6	27174	27179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_019744	TC	3	6	27245	27250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_019744	T	6	6	27277	27282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_019744	GGC	3	9	27348	27356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389975
584	NC_019744	TCG	2	6	27376	27381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389975
585	NC_019744	GTG	2	6	27436	27441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389975
586	NC_019744	CAG	2	6	27474	27479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389975
587	NC_019744	TGC	2	6	27527	27532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389975
588	NC_019744	TGC	2	6	27593	27598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389975
589	NC_019744	CATC	2	8	27629	27636	25 %	25 %	0 %	50 %	434389975
590	NC_019744	CGA	2	6	27787	27792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389975
591	NC_019744	AG	3	6	27813	27818	50 %	0 %	50 %	0 %	434389975
592	NC_019744	ACCTT	2	10	27832	27841	20 %	40 %	0 %	40 %	434389975
593	NC_019744	GAGC	2	8	27945	27952	25 %	0 %	50 %	25 %	434389975
594	NC_019744	CCGG	2	8	27977	27984	0 %	0 %	50 %	50 %	434389975
595	NC_019744	TGG	2	6	28052	28057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389975
596	NC_019744	AAAG	2	8	28143	28150	75 %	0 %	25 %	0 %	434389975
597	NC_019744	CGC	2	6	28154	28159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389975
598	NC_019744	AGA	2	6	28177	28182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389975
599	NC_019744	GGGC	2	8	28206	28213	0 %	0 %	75 %	25 %	434389975
600	NC_019744	CCG	2	6	28489	28494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389976
601	NC_019744	GCG	2	6	28515	28520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389976
602	NC_019744	GAC	2	6	28701	28706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389976
603	NC_019744	TCT	2	6	28735	28740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389976
604	NC_019744	GGT	2	6	28755	28760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389976
605	NC_019744	GAC	3	9	28764	28772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389976
606	NC_019744	CCG	2	6	28819	28824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389976
607	NC_019744	GACC	2	8	28826	28833	25 %	0 %	25 %	50 %	434389976
608	NC_019744	CTT	2	6	28842	28847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389976
609	NC_019744	TGT	2	6	28884	28889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389976
610	NC_019744	GCG	2	6	28907	28912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389976
611	NC_019744	TGG	2	6	28934	28939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389976
612	NC_019744	CGA	3	9	28964	28972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389976
613	NC_019744	GCCGA	2	10	29149	29158	20 %	0 %	40 %	40 %	434389976
614	NC_019744	GCT	2	6	29220	29225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389976
615	NC_019744	CGT	2	6	29291	29296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389976
616	NC_019744	CGC	2	6	29311	29316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389976
617	NC_019744	TGG	2	6	29324	29329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389976
618	NC_019744	GTG	2	6	29336	29341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389976
619	NC_019744	ACTG	2	8	29349	29356	25 %	25 %	25 %	25 %	434389976
620	NC_019744	ATG	2	6	29520	29525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_019744	CTG	2	6	29538	29543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_019744	TCG	2	6	29551	29556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_019744	CCT	2	6	29597	29602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_019744	TCA	2	6	29618	29623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_019744	GTT	2	6	29626	29631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_019744	TGT	2	6	29660	29665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_019744	CGA	2	6	29674	29679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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629	NC_019744	GAT	2	6	29707	29712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389977
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