MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.05

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019736	TG	4	8	226	233	0 %	50 %	50 %	0 %	428308344
2	NC_019736	GT	3	6	714	719	0 %	50 %	50 %	0 %	428308345
3	NC_019736	AC	3	6	1140	1145	50 %	0 %	0 %	50 %	428308346
4	NC_019736	AT	3	6	1587	1592	50 %	50 %	0 %	0 %	428308347
5	NC_019736	CA	3	6	2353	2358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019736	AT	3	6	2372	2377	50 %	50 %	0 %	0 %	428308349
7	NC_019736	TA	3	6	3143	3148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019736	TG	3	6	4419	4424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019736	CT	3	6	4522	4527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019736	GA	3	6	4533	4538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019736	AG	3	6	4694	4699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019736	TC	3	6	6877	6882	0 %	50 %	0 %	50 %	428308353
13	NC_019736	GA	3	6	7480	7485	50 %	0 %	50 %	0 %	428308354
14	NC_019736	TA	3	6	8635	8640	50 %	50 %	0 %	0 %	428308354
15	NC_019736	TC	4	8	9890	9897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019736	GA	3	6	10043	10048	50 %	0 %	50 %	0 %	428308355
17	NC_019736	CA	3	6	10583	10588	50 %	0 %	0 %	50 %	428308355
18	NC_019736	AT	3	6	11189	11194	50 %	50 %	0 %	0 %	428308355
19	NC_019736	AG	4	8	12137	12144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019736	AG	3	6	12788	12793	50 %	0 %	50 %	0 %	428308357
21	NC_019736	TC	3	6	12798	12803	0 %	50 %	0 %	50 %	428308357
22	NC_019736	CG	3	6	13284	13289	0 %	0 %	50 %	50 %	428308358
23	NC_019736	CA	3	6	13760	13765	50 %	0 %	0 %	50 %	428308358
24	NC_019736	GT	3	6	13825	13830	0 %	50 %	50 %	0 %	428308358
25	NC_019736	TA	3	6	14265	14270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019736	TA	3	6	14277	14282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019736	TA	4	8	14289	14296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019736	TC	3	6	15084	15089	0 %	50 %	0 %	50 %	428308359
29	NC_019736	GA	3	6	15325	15330	50 %	0 %	50 %	0 %	428308360
30	NC_019736	GT	3	6	16078	16083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019736	AG	3	6	16145	16150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019736	GA	3	6	16725	16730	50 %	0 %	50 %	0 %	428308361
33	NC_019736	AG	3	6	17134	17139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019736	AG	3	6	17525	17530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019736	TC	3	6	19143	19148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019736	AG	3	6	19248	19253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019736	TA	3	6	19568	19573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019736	TC	3	6	20340	20345	0 %	50 %	0 %	50 %	428308364
39	NC_019736	AT	3	6	22151	22156	50 %	50 %	0 %	0 %	428308364
40	NC_019736	TC	3	6	23262	23267	0 %	50 %	0 %	50 %	428308364
41	NC_019736	TC	3	6	23637	23642	0 %	50 %	0 %	50 %	428308364
42	NC_019736	GC	3	6	24633	24638	0 %	0 %	50 %	50 %	428308365
43	NC_019736	AG	3	6	24973	24978	50 %	0 %	50 %	0 %	428308365
44	NC_019736	TA	3	6	25469	25474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019736	TG	3	6	25929	25934	0 %	50 %	50 %	0 %	428308366
46	NC_019736	TC	4	8	26735	26742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019736	AT	3	6	27422	27427	50 %	50 %	0 %	0 %	428308367
48	NC_019736	TC	3	6	27445	27450	0 %	50 %	0 %	50 %	428308367
49	NC_019736	GA	3	6	29082	29087	50 %	0 %	50 %	0 %	428308367
50	NC_019736	TC	3	6	30125	30130	0 %	50 %	0 %	50 %	428308367
51	NC_019736	AT	3	6	30266	30271	50 %	50 %	0 %	0 %	428308367
52	NC_019736	TC	3	6	30317	30322	0 %	50 %	0 %	50 %	428308367
53	NC_019736	TC	3	6	30592	30597	0 %	50 %	0 %	50 %	428308368
54	NC_019736	CA	3	6	30990	30995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019736	TA	3	6	31110	31115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019736	AG	3	6	31204	31209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019736	AG	3	6	33534	33539	50 %	0 %	50 %	0 %	428308371
58	NC_019736	AC	3	6	34116	34121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019736	AT	3	6	34338	34343	50 %	50 %	0 %	0 %	428308373
60	NC_019736	AC	3	6	35019	35024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019736	CG	3	6	35094	35099	0 %	0 %	50 %	50 %	428308374
62	NC_019736	TG	3	6	35592	35597	0 %	50 %	50 %	0 %	428308374
63	NC_019736	TC	3	6	35697	35702	0 %	50 %	0 %	50 %	428308374
64	NC_019736	CT	3	6	36937	36942	0 %	50 %	0 %	50 %	428308374
65	NC_019736	AG	4	8	37338	37345	50 %	0 %	50 %	0 %	428308374
66	NC_019736	TC	3	6	38089	38094	0 %	50 %	0 %	50 %	428308374
67	NC_019736	TC	5	10	38098	38107	0 %	50 %	0 %	50 %	428308374
68	NC_019736	TA	3	6	38513	38518	50 %	50 %	0 %	0 %	428308375

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.