MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.05

Total Repeats: 840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019736	TTA	2	6	22967	22972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308364
502	NC_019736	ATAG	2	8	22984	22991	50 %	25 %	25 %	0 %	428308364
503	NC_019736	ACT	2	6	23024	23029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308364
504	NC_019736	ATC	2	6	23065	23070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308364
505	NC_019736	AGC	2	6	23071	23076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308364
506	NC_019736	CAA	2	6	23113	23118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308364
507	NC_019736	TCA	2	6	23180	23185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308364
508	NC_019736	TAAA	2	8	23206	23213	75 %	25 %	0 %	0 %	428308364
509	NC_019736	T	6	6	23238	23243	0 %	100 %	0 %	0 %	428308364
510	NC_019736	TC	3	6	23262	23267	0 %	50 %	0 %	50 %	428308364
511	NC_019736	A	6	6	23306	23311	100 %	0 %	0 %	0 %	428308364
512	NC_019736	C	6	6	23318	23323	0 %	0 %	0 %	100 %	428308364
513	NC_019736	CAGTA	2	10	23327	23336	40 %	20 %	20 %	20 %	428308364
514	NC_019736	TTA	2	6	23456	23461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308364
515	NC_019736	A	6	6	23569	23574	100 %	0 %	0 %	0 %	428308364
516	NC_019736	TCA	2	6	23615	23620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308364
517	NC_019736	TC	3	6	23637	23642	0 %	50 %	0 %	50 %	428308364
518	NC_019736	TCT	2	6	23666	23671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308364
519	NC_019736	CTG	2	6	23686	23691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308364
520	NC_019736	GGA	2	6	23772	23777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308364
521	NC_019736	GTCAA	2	10	23828	23837	40 %	20 %	20 %	20 %	428308364
522	NC_019736	CCA	2	6	23874	23879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308364
523	NC_019736	CCG	2	6	24011	24016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308364
524	NC_019736	AGA	2	6	24077	24082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_019736	AGT	2	6	24122	24127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308365
526	NC_019736	GTT	2	6	24159	24164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308365
527	NC_019736	AGC	2	6	24255	24260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308365
528	NC_019736	GTT	2	6	24350	24355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308365
529	NC_019736	C	6	6	24415	24420	0 %	0 %	0 %	100 %	428308365
530	NC_019736	GATT	2	8	24547	24554	25 %	50 %	25 %	0 %	428308365
531	NC_019736	ACT	3	9	24589	24597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308365
532	NC_019736	GTT	2	6	24627	24632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308365
533	NC_019736	GC	3	6	24633	24638	0 %	0 %	50 %	50 %	428308365
534	NC_019736	ACC	2	6	24644	24649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308365
535	NC_019736	A	7	7	24663	24669	100 %	0 %	0 %	0 %	428308365
536	NC_019736	TCTA	2	8	24699	24706	25 %	50 %	0 %	25 %	428308365
537	NC_019736	CATC	2	8	24710	24717	25 %	25 %	0 %	50 %	428308365
538	NC_019736	ACA	2	6	24774	24779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308365
539	NC_019736	T	6	6	24837	24842	0 %	100 %	0 %	0 %	428308365
540	NC_019736	CTT	2	6	24938	24943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308365
541	NC_019736	AG	3	6	24973	24978	50 %	0 %	50 %	0 %	428308365
542	NC_019736	C	6	6	25018	25023	0 %	0 %	0 %	100 %	428308365
543	NC_019736	CTT	2	6	25034	25039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308365
544	NC_019736	TCT	2	6	25048	25053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308365
545	NC_019736	GAC	2	6	25100	25105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308365
546	NC_019736	GTG	2	6	25173	25178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308365
547	NC_019736	GATC	2	8	25190	25197	25 %	25 %	25 %	25 %	428308365
548	NC_019736	TTCCCC	2	12	25221	25232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308365
549	NC_019736	TCG	2	6	25277	25282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308365
550	NC_019736	T	6	6	25404	25409	0 %	100 %	0 %	0 %	428308365
551	NC_019736	TA	3	6	25469	25474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_019736	TCC	2	6	25512	25517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_019736	AAT	2	6	25524	25529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019736	T	6	6	25540	25545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019736	AAT	2	6	25577	25582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019736	TTA	2	6	25702	25707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_019736	TTA	2	6	25780	25785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_019736	T	6	6	25795	25800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019736	CTT	2	6	25829	25834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308366
560	NC_019736	T	6	6	25860	25865	0 %	100 %	0 %	0 %	428308366
561	NC_019736	AGC	3	9	25884	25892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308366
562	NC_019736	CAA	2	6	25900	25905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308366
563	NC_019736	GCTA	2	8	25911	25918	25 %	25 %	25 %	25 %	428308366
564	NC_019736	TG	3	6	25929	25934	0 %	50 %	50 %	0 %	428308366
565	NC_019736	CAGCTT	2	12	25966	25977	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428308366
566	NC_019736	CTA	2	6	26060	26065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308366
567	NC_019736	TCA	2	6	26105	26110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308366
568	NC_019736	GATT	2	8	26157	26164	25 %	50 %	25 %	0 %	428308366
569	NC_019736	GAAG	2	8	26250	26257	50 %	0 %	50 %	0 %	428308366
570	NC_019736	CTT	2	6	26262	26267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308366
571	NC_019736	AGG	2	6	26336	26341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308366
572	NC_019736	TGT	2	6	26400	26405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308366
573	NC_019736	TTG	2	6	26438	26443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308366
574	NC_019736	CAA	2	6	26499	26504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308366
575	NC_019736	AAAG	2	8	26511	26518	75 %	0 %	25 %	0 %	428308366
576	NC_019736	AAC	2	6	26563	26568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308366
577	NC_019736	TCC	2	6	26583	26588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308366
578	NC_019736	AAT	2	6	26627	26632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_019736	AGGGA	2	10	26651	26660	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
580	NC_019736	ATA	2	6	26721	26726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_019736	TC	4	8	26735	26742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_019736	CTT	2	6	26974	26979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_019736	ATT	2	6	27007	27012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_019736	TCT	2	6	27055	27060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_019736	TGG	2	6	27081	27086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_019736	ATTA	2	8	27108	27115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019736	GAG	2	6	27119	27124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_019736	GCT	2	6	27169	27174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_019736	AATT	2	8	27326	27333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_019736	ATT	2	6	27349	27354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019736	TAA	2	6	27356	27361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_019736	AT	3	6	27422	27427	50 %	50 %	0 %	0 %	428308367
593	NC_019736	TC	3	6	27445	27450	0 %	50 %	0 %	50 %	428308367
594	NC_019736	TTCCTT	2	12	27454	27465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308367
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596	NC_019736	TCA	2	6	27503	27508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308367
597	NC_019736	TCG	2	6	27563	27568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308367
598	NC_019736	TCT	2	6	27617	27622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308367
599	NC_019736	TGAC	2	8	27628	27635	25 %	25 %	25 %	25 %	428308367
600	NC_019736	TTC	2	6	27658	27663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308367
601	NC_019736	CAA	2	6	27675	27680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308367
602	NC_019736	GTTT	2	8	27690	27697	0 %	75 %	25 %	0 %	428308367
603	NC_019736	TCT	2	6	27710	27715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308367
604	NC_019736	TCT	2	6	27749	27754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308367
605	NC_019736	TTA	2	6	27842	27847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308367
606	NC_019736	ATC	2	6	27892	27897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308367
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610	NC_019736	TTG	2	6	28099	28104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308367
611	NC_019736	CATT	2	8	28208	28215	25 %	50 %	0 %	25 %	428308367
612	NC_019736	TGA	2	6	28220	28225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308367
613	NC_019736	CTT	2	6	28250	28255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308367
614	NC_019736	GGA	2	6	28310	28315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308367
615	NC_019736	T	7	7	28346	28352	0 %	100 %	0 %	0 %	428308367
616	NC_019736	GAA	2	6	28358	28363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308367
617	NC_019736	GCT	2	6	28413	28418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308367
618	NC_019736	T	7	7	28444	28450	0 %	100 %	0 %	0 %	428308367
619	NC_019736	TTTCT	2	10	28492	28501	0 %	80 %	0 %	20 %	428308367
620	NC_019736	TGT	2	6	28681	28686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308367
621	NC_019736	GTC	2	6	28693	28698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308367
622	NC_019736	TGA	2	6	28805	28810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308367
623	NC_019736	TCG	2	6	28816	28821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308367
624	NC_019736	CAT	2	6	28839	28844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308367
625	NC_019736	TCT	2	6	28868	28873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308367
626	NC_019736	GTCC	2	8	28886	28893	0 %	25 %	25 %	50 %	428308367
627	NC_019736	TTG	2	6	28962	28967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308367
628	NC_019736	TGT	2	6	28999	29004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308367
629	NC_019736	CGTCTG	2	12	29033	29044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308367
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631	NC_019736	TTC	2	6	29068	29073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308367
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636	NC_019736	CTG	2	6	29226	29231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308367
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752	NC_019736	AC	3	6	35019	35024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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756	NC_019736	CCG	2	6	35162	35167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308374
757	NC_019736	TGT	2	6	35235	35240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308374
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