MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	CTTG	2	8	47	54	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019734	AACG	2	8	145	152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019734	GAGT	2	8	202	209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019734	TTGG	2	8	710	717	0 %	50 %	50 %	0 %	428308293
5	NC_019734	GCTG	2	8	818	825	0 %	25 %	50 %	25 %	428308293
6	NC_019734	ATTT	2	8	1125	1132	25 %	75 %	0 %	0 %	428308293
7	NC_019734	TCAA	2	8	1326	1333	50 %	25 %	0 %	25 %	428308293
8	NC_019734	CTAC	2	8	1455	1462	25 %	25 %	0 %	50 %	428308293
9	NC_019734	GTTT	2	8	2045	2052	0 %	75 %	25 %	0 %	428308294
10	NC_019734	AAGC	2	8	2270	2277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019734	TAAA	2	8	2597	2604	75 %	25 %	0 %	0 %	428308295
12	NC_019734	TTTG	2	8	3816	3823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019734	CTGA	2	8	3911	3918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019734	GCAA	2	8	4019	4026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019734	AGAA	2	8	4335	4342	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019734	CTTC	2	8	4357	4364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019734	GAAA	2	8	4654	4661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019734	ATCC	2	8	4932	4939	25 %	25 %	0 %	50 %	428308296
19	NC_019734	TTCA	2	8	4973	4980	25 %	50 %	0 %	25 %	428308296
20	NC_019734	TTGC	2	8	4989	4996	0 %	50 %	25 %	25 %	428308296
21	NC_019734	GCTC	2	8	5446	5453	0 %	25 %	25 %	50 %	428308296
22	NC_019734	TGGC	2	8	5592	5599	0 %	25 %	50 %	25 %	428308296
23	NC_019734	GCTC	2	8	5673	5680	0 %	25 %	25 %	50 %	428308296
24	NC_019734	GTGA	2	8	5704	5711	25 %	25 %	50 %	0 %	428308296
25	NC_019734	AGAA	2	8	5904	5911	75 %	0 %	25 %	0 %	428308296
26	NC_019734	CTGC	2	8	6551	6558	0 %	25 %	25 %	50 %	428308297
27	NC_019734	ATAA	2	8	7065	7072	75 %	25 %	0 %	0 %	428308297
28	NC_019734	TCGC	2	8	7748	7755	0 %	25 %	25 %	50 %	428308298
29	NC_019734	GTAA	2	8	8054	8061	50 %	25 %	25 %	0 %	428308298
30	NC_019734	TAAT	2	8	8838	8845	50 %	50 %	0 %	0 %	428308299
31	NC_019734	TTGA	2	8	9562	9569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019734	ATCC	2	8	9602	9609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019734	CTCA	2	8	9874	9881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019734	TTTG	2	8	10051	10058	0 %	75 %	25 %	0 %	428308300
35	NC_019734	TACC	2	8	10378	10385	25 %	25 %	0 %	50 %	428308300
36	NC_019734	TAAA	2	8	10421	10428	75 %	25 %	0 %	0 %	428308300
37	NC_019734	TTTA	2	8	10443	10450	25 %	75 %	0 %	0 %	428308300
38	NC_019734	TAAT	2	8	10708	10715	50 %	50 %	0 %	0 %	428308300
39	NC_019734	AATT	2	8	10755	10762	50 %	50 %	0 %	0 %	428308300
40	NC_019734	ATTA	2	8	10845	10852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019734	TATT	2	8	10883	10890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019734	TAAT	2	8	10932	10939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019734	CCAT	2	8	11178	11185	25 %	25 %	0 %	50 %	428308301
44	NC_019734	TAAA	2	8	11321	11328	75 %	25 %	0 %	0 %	428308301
45	NC_019734	TTTA	2	8	11389	11396	25 %	75 %	0 %	0 %	428308301
46	NC_019734	TATT	2	8	11424	11431	25 %	75 %	0 %	0 %	428308301
47	NC_019734	ATTT	2	8	11491	11498	25 %	75 %	0 %	0 %	428308301
48	NC_019734	TTGT	2	8	11643	11650	0 %	75 %	25 %	0 %	428308301
49	NC_019734	AATT	2	8	11989	11996	50 %	50 %	0 %	0 %	428308301
50	NC_019734	ATAC	2	8	12056	12063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019734	AGAA	2	8	12097	12104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019734	ATTA	2	8	12634	12641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019734	AAGC	2	8	12670	12677	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019734	AAGC	2	8	13594	13601	50 %	0 %	25 %	25 %	428308303
55	NC_019734	GGTA	2	8	14820	14827	25 %	25 %	50 %	0 %	428308304
56	NC_019734	GCTT	2	8	15912	15919	0 %	50 %	25 %	25 %	428308304
57	NC_019734	TCTT	2	8	16251	16258	0 %	75 %	0 %	25 %	428308304
58	NC_019734	CTGC	2	8	17433	17440	0 %	25 %	25 %	50 %	428308304
59	NC_019734	TTGC	2	8	17993	18000	0 %	50 %	25 %	25 %	428308304
60	NC_019734	CCAT	2	8	18227	18234	25 %	25 %	0 %	50 %	428308304
61	NC_019734	GCTC	2	8	18449	18456	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019734	TTTC	2	8	18703	18710	0 %	75 %	0 %	25 %	428308306
63	NC_019734	TTTA	2	8	18935	18942	25 %	75 %	0 %	0 %	428308306
64	NC_019734	GGAT	2	8	19072	19079	25 %	25 %	50 %	0 %	428308306
65	NC_019734	TAAT	2	8	19665	19672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019734	ACCA	2	8	20062	20069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019734	GATC	2	8	20113	20120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019734	CTGA	2	8	20794	20801	25 %	25 %	25 %	25 %	428308309
69	NC_019734	CAAA	2	8	20848	20855	75 %	0 %	0 %	25 %	428308309
70	NC_019734	AAAG	2	8	21129	21136	75 %	0 %	25 %	0 %	428308310
71	NC_019734	TCAG	2	8	22506	22513	25 %	25 %	25 %	25 %	428308313
72	NC_019734	ATCA	2	8	22548	22555	50 %	25 %	0 %	25 %	428308313
73	NC_019734	GTTA	2	8	23342	23349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019734	GCAC	2	8	24811	24818	25 %	0 %	25 %	50 %	428308315
75	NC_019734	TTAA	2	8	24896	24903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019734	TGGT	2	8	25462	25469	0 %	50 %	50 %	0 %	428308316
77	NC_019734	AATT	2	8	25645	25652	50 %	50 %	0 %	0 %	428308316
78	NC_019734	AGCT	2	8	25666	25673	25 %	25 %	25 %	25 %	428308316
79	NC_019734	ACAT	2	8	25697	25704	50 %	25 %	0 %	25 %	428308316
80	NC_019734	TGAG	2	8	25959	25966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019734	ACTT	2	8	26291	26298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019734	TTAC	2	8	26510	26517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019734	AGTT	2	8	26563	26570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019734	TGAT	2	8	26611	26618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019734	TTGT	2	8	26772	26779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019734	AGGG	2	8	27021	27028	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019734	ATGG	2	8	29094	29101	25 %	25 %	50 %	0 %	428308319
88	NC_019734	AAAT	2	8	29716	29723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019734	TCGC	2	8	30074	30081	0 %	25 %	25 %	50 %	428308321
90	NC_019734	GATT	2	8	30369	30376	25 %	50 %	25 %	0 %	428308321
91	NC_019734	CAAA	2	8	30428	30435	75 %	0 %	0 %	25 %	428308321
92	NC_019734	CCAC	2	8	32206	32213	25 %	0 %	0 %	75 %	428308321
93	NC_019734	AAAC	2	8	32899	32906	75 %	0 %	0 %	25 %	428308321
94	NC_019734	TCAA	2	8	32991	32998	50 %	25 %	0 %	25 %	428308321
95	NC_019734	ATAA	2	8	34025	34032	75 %	25 %	0 %	0 %	428308322
96	NC_019734	CTAA	2	8	34170	34177	50 %	25 %	0 %	25 %	428308323
97	NC_019734	AATT	2	8	34501	34508	50 %	50 %	0 %	0 %	428308324
98	NC_019734	AATA	2	8	34657	34664	75 %	25 %	0 %	0 %	428308325
99	NC_019734	CTTT	2	8	35133	35140	0 %	75 %	0 %	25 %	428308326
100	NC_019734	TCCC	2	8	37260	37267	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_019734	ATCA	2	8	37671	37678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019734	CTAA	2	8	37717	37724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019734	GTAA	2	8	37772	37779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019734	AAGT	2	8	37991	37998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019734	CTCA	2	8	38323	38330	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019734	ATGT	2	8	38585	38592	25 %	50 %	25 %	0 %	428308327
107	NC_019734	AGCT	2	8	38616	38623	25 %	25 %	25 %	25 %	428308327
108	NC_019734	TAAT	2	8	38636	38643	50 %	50 %	0 %	0 %	428308327
109	NC_019734	ACCA	2	8	38820	38827	50 %	0 %	0 %	50 %	428308327
110	NC_019734	TTAA	2	8	39386	39393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019734	GTGC	2	8	39471	39478	0 %	25 %	50 %	25 %	428308328
112	NC_019734	CAAA	2	8	40944	40951	75 %	0 %	0 %	25 %	428308330
113	NC_019734	ACAT	2	8	41019	41026	50 %	25 %	0 %	25 %	428308330
114	NC_019734	TTAG	2	8	41181	41188	25 %	50 %	25 %	0 %	428308330
115	NC_019734	GAAT	2	8	41932	41939	50 %	25 %	25 %	0 %	428308332
116	NC_019734	TGCT	2	8	41940	41947	0 %	50 %	25 %	25 %	428308332
117	NC_019734	TCAA	2	8	42662	42669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019734	CCTT	2	8	43027	43034	0 %	50 %	0 %	50 %	428308334
119	NC_019734	TTAA	2	8	44037	44044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019734	CGAG	2	8	44692	44699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019734	AAAT	2	8	44728	44735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019734	ACGA	2	8	45213	45220	50 %	0 %	25 %	25 %	428308336
123	NC_019734	TTTG	2	8	45344	45351	0 %	75 %	25 %	0 %	428308336
124	NC_019734	AATG	2	8	45578	45585	50 %	25 %	25 %	0 %	428308336
125	NC_019734	ATTT	2	8	46090	46097	25 %	75 %	0 %	0 %	428308337
126	NC_019734	AAAC	2	8	46148	46155	75 %	0 %	0 %	25 %	428308337
127	NC_019734	TGGC	2	8	47219	47226	0 %	25 %	50 %	25 %	428308339
128	NC_019734	TAAT	2	8	47315	47322	50 %	50 %	0 %	0 %	428308339
129	NC_019734	AAAT	2	8	47578	47585	75 %	25 %	0 %	0 %	428308339
130	NC_019734	GCAA	2	8	47878	47885	50 %	0 %	25 %	25 %	428308339
131	NC_019734	TTAA	2	8	48092	48099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019734	TTAT	2	8	48129	48136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019734	ATGG	2	8	48192	48199	25 %	25 %	50 %	0 %	428308340
134	NC_019734	ATAA	2	8	48470	48477	75 %	25 %	0 %	0 %	428308340
135	NC_019734	TAAA	2	8	49044	49051	75 %	25 %	0 %	0 %	428308340
136	NC_019734	TAAA	2	8	49375	49382	75 %	25 %	0 %	0 %	428308340
137	NC_019734	TACA	2	8	49434	49441	50 %	25 %	0 %	25 %	428308340
138	NC_019734	ATCC	2	8	50128	50135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019734	TCTA	2	8	50211	50218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019734	AGTT	2	8	51508	51515	25 %	50 %	25 %	0 %	428308342
141	NC_019734	ACTA	2	8	52628	52635	50 %	25 %	0 %	25 %	428308342

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.